MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_015067	AAC	2	6	2365386	2365391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692101
46002	NC_015067	AGC	2	6	2365392	2365397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692101
46003	NC_015067	CAA	2	6	2365403	2365408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692101
46004	NC_015067	CAA	3	9	2365424	2365432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692101
46005	NC_015067	CGG	2	6	2365445	2365450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692101
46006	NC_015067	CAA	2	6	2365451	2365456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692101
46007	NC_015067	CGG	3	9	2365514	2365522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692101
46008	NC_015067	AAC	2	6	2365527	2365532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692101
46009	NC_015067	ACC	2	6	2365566	2365571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692101
46010	NC_015067	GCC	2	6	2365582	2365587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692101
46011	NC_015067	GCC	2	6	2365623	2365628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692101
46012	NC_015067	GCC	2	6	2365632	2365637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692101
46013	NC_015067	CAG	2	6	2365762	2365767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692101
46014	NC_015067	GCC	2	6	2365806	2365811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692101
46015	NC_015067	GCC	2	6	2365976	2365981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692102
46016	NC_015067	CGT	2	6	2365988	2365993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692102
46017	NC_015067	CCA	2	6	2366019	2366024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692102
46018	NC_015067	CGT	2	6	2366066	2366071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692102
46019	NC_015067	TCATG	2	10	2366104	2366113	20 %	40 %	20 %	20 %	322692102
46020	NC_015067	CCA	2	6	2366166	2366171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692102
46021	NC_015067	CCG	2	6	2366192	2366197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692102
46022	NC_015067	CGT	2	6	2366260	2366265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692102
46023	NC_015067	CGC	2	6	2366449	2366454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692102
46024	NC_015067	CCG	2	6	2366511	2366516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692102
46025	NC_015067	GAC	2	6	2366639	2366644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692102
46026	NC_015067	CA	3	6	2366647	2366652	50 %	0 %	0 %	50 %	322692102
46027	NC_015067	GAG	2	6	2366778	2366783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692102
46028	NC_015067	ACG	2	6	2366984	2366989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692103
46029	NC_015067	TC	3	6	2367083	2367088	0 %	50 %	0 %	50 %	322692103
46030	NC_015067	CCT	2	6	2367122	2367127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692103
46031	NC_015067	GGC	2	6	2367183	2367188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692103
46032	NC_015067	GGC	2	6	2367250	2367255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692103
46033	NC_015067	CGC	2	6	2367267	2367272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692103
46034	NC_015067	TGC	2	6	2367339	2367344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692103
46035	NC_015067	GCG	2	6	2367473	2367478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692103
46036	NC_015067	ATC	2	6	2367569	2367574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692103
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46038	NC_015067	GCCA	2	8	2367643	2367650	25 %	0 %	25 %	50 %	322692103
46039	NC_015067	CGC	2	6	2367690	2367695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692103
46040	NC_015067	CGA	2	6	2367696	2367701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692103
46041	NC_015067	TAT	2	6	2367756	2367761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322692103
46042	NC_015067	TGA	2	6	2367868	2367873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692104
46043	NC_015067	GCC	3	9	2367900	2367908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692104
46044	NC_015067	GCG	2	6	2367930	2367935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692104
46045	NC_015067	AGT	2	6	2367946	2367951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692104
46046	NC_015067	GCCA	2	8	2368013	2368020	25 %	0 %	25 %	50 %	322692104
46047	NC_015067	CAG	2	6	2368060	2368065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692104
46048	NC_015067	TCGG	2	8	2368094	2368101	0 %	25 %	50 %	25 %	322692104
46049	NC_015067	TGA	2	6	2368110	2368115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692104
46050	NC_015067	CAC	2	6	2368222	2368227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692104
46051	NC_015067	CCA	2	6	2368290	2368295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692104
46052	NC_015067	CTC	2	6	2368372	2368377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692104
46053	NC_015067	GCC	2	6	2368421	2368426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692104
46054	NC_015067	CCG	2	6	2368446	2368451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692104
46055	NC_015067	ACG	2	6	2368461	2368466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692104
46056	NC_015067	ACT	2	6	2368567	2368572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692105
46057	NC_015067	TTC	2	6	2368598	2368603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692105
46058	NC_015067	ATC	2	6	2368674	2368679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692105
46059	NC_015067	TCT	2	6	2368756	2368761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692105
46060	NC_015067	CTC	2	6	2368778	2368783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692105
46061	NC_015067	ATC	2	6	2368809	2368814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692105
46062	NC_015067	GTTT	2	8	2368822	2368829	0 %	75 %	25 %	0 %	322692105
46063	NC_015067	TG	3	6	2368830	2368835	0 %	50 %	50 %	0 %	322692105
46064	NC_015067	TGG	2	6	2368989	2368994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692105
46065	NC_015067	CACC	2	8	2369035	2369042	25 %	0 %	0 %	75 %	322692105
46066	NC_015067	TGG	3	9	2369049	2369057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692105
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46069	NC_015067	CGG	2	6	2369119	2369124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692105
46070	NC_015067	GGGC	2	8	2369146	2369153	0 %	0 %	75 %	25 %	322692105
46071	NC_015067	ATC	2	6	2369202	2369207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692105
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46074	NC_015067	GC	3	6	2369322	2369327	0 %	0 %	50 %	50 %	322692105
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46079	NC_015067	TCG	2	6	2369490	2369495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692105
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46085	NC_015067	GCC	2	6	2369900	2369905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692105
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46087	NC_015067	CGG	2	6	2370119	2370124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692106
46088	NC_015067	ACC	2	6	2370140	2370145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692106
46089	NC_015067	CAT	2	6	2370169	2370174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692106
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46091	NC_015067	TTC	2	6	2370192	2370197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692106
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46095	NC_015067	CGCC	2	8	2370305	2370312	0 %	0 %	25 %	75 %	322692106
46096	NC_015067	ATCCGA	2	12	2370324	2370335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322692106
46097	NC_015067	CCA	2	6	2370347	2370352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692106
46098	NC_015067	GAT	2	6	2370375	2370380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692106
46099	NC_015067	GCAT	2	8	2370404	2370411	25 %	25 %	25 %	25 %	322692106
46100	NC_015067	ACGA	2	8	2370547	2370554	50 %	0 %	25 %	25 %	322692106
46101	NC_015067	TGC	2	6	2370585	2370590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692106
46102	NC_015067	GCC	3	9	2370607	2370615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692106
46103	NC_015067	CAC	2	6	2370621	2370626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692106
46104	NC_015067	CG	3	6	2370641	2370646	0 %	0 %	50 %	50 %	322692106
46105	NC_015067	GCC	2	6	2370657	2370662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692106
46106	NC_015067	GCA	2	6	2370721	2370726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692106
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46108	NC_015067	ATG	2	6	2370859	2370864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692106
46109	NC_015067	GCA	2	6	2371062	2371067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692106
46110	NC_015067	CCA	2	6	2371130	2371135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692106
46111	NC_015067	ACT	2	6	2371139	2371144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692106
46112	NC_015067	CGG	2	6	2371206	2371211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692106
46113	NC_015067	AACG	2	8	2371303	2371310	50 %	0 %	25 %	25 %	322692106
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46327	NC_015067	AG	3	6	2381717	2381722	50 %	0 %	50 %	0 %	322692113
46328	NC_015067	ACA	2	6	2381754	2381759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692113
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46331	NC_015067	ATTCG	2	10	2381869	2381878	20 %	40 %	20 %	20 %	322692113
46332	NC_015067	CCA	2	6	2381932	2381937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692113
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46337	NC_015067	CTC	2	6	2382423	2382428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692114
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46339	NC_015067	TCT	2	6	2382632	2382637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692114
46340	NC_015067	TGC	2	6	2382661	2382666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692114
46341	NC_015067	TCA	2	6	2382721	2382726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692114
46342	NC_015067	ACGC	2	8	2382756	2382763	25 %	0 %	25 %	50 %	322692114
46343	NC_015067	TCGA	2	8	2382850	2382857	25 %	25 %	25 %	25 %	322692114
46344	NC_015067	GTC	2	6	2382998	2383003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692115
46345	NC_015067	CTT	2	6	2383005	2383010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692115
46346	NC_015067	CCTTGG	2	12	2383073	2383084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692115
46347	NC_015067	CTT	3	9	2383091	2383099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692115
46348	NC_015067	AG	3	6	2383102	2383107	50 %	0 %	50 %	0 %	322692115
46349	NC_015067	GGCC	2	8	2383112	2383119	0 %	0 %	50 %	50 %	322692115
46350	NC_015067	GCG	2	6	2383125	2383130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692115
46351	NC_015067	GAT	2	6	2383145	2383150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692115
46352	NC_015067	CCG	2	6	2383166	2383171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692115
46353	NC_015067	GTT	2	6	2383236	2383241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692115
46354	NC_015067	AGC	2	6	2383356	2383361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692115
46355	NC_015067	GCA	2	6	2383456	2383461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692115
46356	NC_015067	AGCC	2	8	2383643	2383650	25 %	0 %	25 %	50 %	322692115
46357	NC_015067	CAC	2	6	2383827	2383832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692115
46358	NC_015067	GAT	2	6	2383842	2383847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692115
46359	NC_015067	GAA	2	6	2383896	2383901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692115
46360	NC_015067	CTG	2	6	2384368	2384373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692116
46361	NC_015067	AGCGA	2	10	2384378	2384387	40 %	0 %	40 %	20 %	322692116
46362	NC_015067	GC	3	6	2384414	2384419	0 %	0 %	50 %	50 %	322692116
46363	NC_015067	GCA	2	6	2384442	2384447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692116
46364	NC_015067	GTC	2	6	2384560	2384565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692116
46365	NC_015067	ATC	2	6	2384566	2384571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692116
46366	NC_015067	ATG	2	6	2384572	2384577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692116
46367	NC_015067	GTC	2	6	2384578	2384583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692116
46368	NC_015067	ACG	2	6	2384600	2384605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692116
46369	NC_015067	TGCGCA	2	12	2384777	2384788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322692117
46370	NC_015067	CGA	2	6	2384812	2384817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692117
46371	NC_015067	GTT	2	6	2384820	2384825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692117

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