MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_015067	GAT	2	6	2313590	2313595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692068
45002	NC_015067	GAA	2	6	2313608	2313613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692068
45003	NC_015067	AGGT	2	8	2313675	2313682	25 %	25 %	50 %	0 %	322692068
45004	NC_015067	GGA	2	6	2313695	2313700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692068
45005	NC_015067	CGA	2	6	2313724	2313729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692068
45006	NC_015067	TTC	2	6	2313753	2313758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692068
45007	NC_015067	GAA	2	6	2313782	2313787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692068
45008	NC_015067	GGC	3	9	2313848	2313856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692068
45009	NC_015067	TCG	3	9	2313867	2313875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692068
45010	NC_015067	GAA	2	6	2314091	2314096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692068
45011	NC_015067	CAG	2	6	2314136	2314141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692068
45012	NC_015067	TGA	2	6	2314180	2314185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692068
45013	NC_015067	TTC	2	6	2314254	2314259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692068
45014	NC_015067	GAA	2	6	2314340	2314345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692068
45015	NC_015067	GAT	2	6	2314352	2314357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692068
45016	NC_015067	GCC	2	6	2314359	2314364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692068
45017	NC_015067	ACC	2	6	2314368	2314373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692068
45018	NC_015067	AGT	2	6	2314378	2314383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692068
45019	NC_015067	CTT	3	9	2314421	2314429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692068
45020	NC_015067	GGTTGC	2	12	2314454	2314465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322692068
45021	NC_015067	ATG	2	6	2314473	2314478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692068
45022	NC_015067	CGGT	2	8	2314554	2314561	0 %	25 %	50 %	25 %	322692069
45023	NC_015067	GCC	2	6	2314592	2314597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692069
45024	NC_015067	GAA	2	6	2314655	2314660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692069
45025	NC_015067	GCG	2	6	2314708	2314713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692069
45026	NC_015067	CGA	2	6	2314771	2314776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692069
45027	NC_015067	CGT	2	6	2314828	2314833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692069
45028	NC_015067	CGG	2	6	2314837	2314842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692069
45029	NC_015067	CAG	2	6	2314913	2314918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692069
45030	NC_015067	GAT	2	6	2314949	2314954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692069
45031	NC_015067	GCCTT	2	10	2314959	2314968	0 %	40 %	20 %	40 %	322692069
45032	NC_015067	CTG	2	6	2314988	2314993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692069
45033	NC_015067	CTTGC	2	10	2315081	2315090	0 %	40 %	20 %	40 %	322692069
45034	NC_015067	GGT	2	6	2315153	2315158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692069
45035	NC_015067	GGT	2	6	2315240	2315245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692069
45036	NC_015067	CGG	2	6	2315246	2315251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692069
45037	NC_015067	TTG	2	6	2315289	2315294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692069
45038	NC_015067	CTT	2	6	2315342	2315347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692069
45039	NC_015067	GGA	2	6	2315348	2315353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692069
45040	NC_015067	GGT	2	6	2315357	2315362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692069
45041	NC_015067	AC	3	6	2315440	2315445	50 %	0 %	0 %	50 %	322692069
45042	NC_015067	GGC	2	6	2315450	2315455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692069
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45047	NC_015067	GGC	3	9	2316018	2316026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692070
45048	NC_015067	GATCT	2	10	2316112	2316121	20 %	40 %	20 %	20 %	322692070
45049	NC_015067	GAG	2	6	2316136	2316141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692070
45050	NC_015067	GGCC	2	8	2316153	2316160	0 %	0 %	50 %	50 %	322692070
45051	NC_015067	TCG	2	6	2316207	2316212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692070
45052	NC_015067	GTGTT	2	10	2316235	2316244	0 %	60 %	40 %	0 %	322692070
45053	NC_015067	ACGC	2	8	2316248	2316255	25 %	0 %	25 %	50 %	322692070
45054	NC_015067	GGT	2	6	2316321	2316326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692070
45055	NC_015067	CCGG	2	8	2316329	2316336	0 %	0 %	50 %	50 %	322692070
45056	NC_015067	CCG	2	6	2316413	2316418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692070
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45058	NC_015067	CTG	2	6	2316601	2316606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692070
45059	NC_015067	CCT	2	6	2316614	2316619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692070
45060	NC_015067	GTG	2	6	2316655	2316660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692070
45061	NC_015067	TGG	2	6	2316737	2316742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692070
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45063	NC_015067	CG	3	6	2316853	2316858	0 %	0 %	50 %	50 %	322692070
45064	NC_015067	GC	3	6	2316877	2316882	0 %	0 %	50 %	50 %	322692070
45065	NC_015067	TGG	2	6	2316950	2316955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692070
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45070	NC_015067	CTGG	2	8	2317569	2317576	0 %	25 %	50 %	25 %	322692071
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45073	NC_015067	CCAC	2	8	2317715	2317722	25 %	0 %	0 %	75 %	322692071
45074	NC_015067	GAA	2	6	2317788	2317793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692071
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45108	NC_015067	CGGAC	2	10	2319205	2319214	20 %	0 %	40 %	40 %	322692071
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45117	NC_015067	GGC	2	6	2319459	2319464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692071
45118	NC_015067	CAG	2	6	2319465	2319470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692071
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45335	NC_015067	CGT	2	6	2330078	2330083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692079
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45343	NC_015067	GCC	2	6	2330569	2330574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692079
45344	NC_015067	CTT	2	6	2330585	2330590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692079
45345	NC_015067	GAT	2	6	2330628	2330633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692079
45346	NC_015067	GCA	2	6	2330651	2330656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692079
45347	NC_015067	CGC	2	6	2330660	2330665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692079
45348	NC_015067	ATA	2	6	2330719	2330724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322692079
45349	NC_015067	CAG	2	6	2330736	2330741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692079
45350	NC_015067	TTC	2	6	2330776	2330781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692079
45351	NC_015067	CGGG	2	8	2330792	2330799	0 %	0 %	75 %	25 %	322692079
45352	NC_015067	CTT	2	6	2330846	2330851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692079
45353	NC_015067	CGT	2	6	2330897	2330902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692079
45354	NC_015067	GC	3	6	2330950	2330955	0 %	0 %	50 %	50 %	322692079
45355	NC_015067	CGTT	2	8	2330978	2330985	0 %	50 %	25 %	25 %	322692079
45356	NC_015067	ATC	2	6	2331018	2331023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692079
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45358	NC_015067	CGG	2	6	2331364	2331369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692080
45359	NC_015067	CGT	2	6	2331415	2331420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692080
45360	NC_015067	CGG	2	6	2331559	2331564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692080
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45453	NC_015067	GGC	2	6	2336826	2336831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692084
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45462	NC_015067	CGC	2	6	2337305	2337310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692085
45463	NC_015067	CAAT	2	8	2337348	2337355	50 %	25 %	0 %	25 %	322692085
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