MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015067	ACG	2	6	2273689	2273694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692048
44502	NC_015067	CCG	2	6	2273722	2273727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692048
44503	NC_015067	CT	3	6	2273762	2273767	0 %	50 %	0 %	50 %	322692048
44504	NC_015067	CAA	2	6	2273771	2273776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692048
44505	NC_015067	TTC	2	6	2273898	2273903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692048
44506	NC_015067	CGA	2	6	2273957	2273962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692048
44507	NC_015067	TAC	2	6	2273976	2273981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692048
44508	NC_015067	GCC	2	6	2274078	2274083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692048
44509	NC_015067	TGC	2	6	2274491	2274496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44510	NC_015067	CAC	2	6	2274591	2274596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44511	NC_015067	GTC	2	6	2274634	2274639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44512	NC_015067	ACG	2	6	2274656	2274661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44513	NC_015067	CGG	2	6	2274717	2274722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692049
44514	NC_015067	TGC	2	6	2274740	2274745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44515	NC_015067	GAA	3	9	2274825	2274833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692049
44516	NC_015067	CCA	3	9	2274866	2274874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44517	NC_015067	CAC	2	6	2274903	2274908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44518	NC_015067	CCA	2	6	2274914	2274919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44519	NC_015067	ACGAT	2	10	2274983	2274992	40 %	20 %	20 %	20 %	322692049
44520	NC_015067	GAT	2	6	2274994	2274999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692049
44521	NC_015067	TCAC	2	8	2275039	2275046	25 %	25 %	0 %	50 %	322692049
44522	NC_015067	ACC	2	6	2275102	2275107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44523	NC_015067	CTCA	2	8	2275110	2275117	25 %	25 %	0 %	50 %	322692049
44524	NC_015067	CCA	2	6	2275202	2275207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44525	NC_015067	GC	3	6	2275217	2275222	0 %	0 %	50 %	50 %	322692049
44526	NC_015067	CAG	2	6	2275227	2275232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44527	NC_015067	CAA	2	6	2275266	2275271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692049
44528	NC_015067	CGC	2	6	2275272	2275277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692049
44529	NC_015067	GCA	2	6	2275280	2275285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44530	NC_015067	GC	3	6	2275304	2275309	0 %	0 %	50 %	50 %	322692049
44531	NC_015067	AC	3	6	2275334	2275339	50 %	0 %	0 %	50 %	322692049
44532	NC_015067	ACC	2	6	2275420	2275425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44533	NC_015067	CAG	2	6	2275486	2275491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44534	NC_015067	CA	3	6	2275521	2275526	50 %	0 %	0 %	50 %	322692049
44535	NC_015067	TCA	2	6	2275529	2275534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692049
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44537	NC_015067	ACC	3	9	2275582	2275590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44538	NC_015067	GGC	2	6	2275591	2275596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692049
44539	NC_015067	CG	4	8	2275614	2275621	0 %	0 %	50 %	50 %	322692049
44540	NC_015067	TCA	2	6	2275657	2275662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692049
44541	NC_015067	CGC	2	6	2275674	2275679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692049
44542	NC_015067	CAAA	2	8	2275774	2275781	75 %	0 %	0 %	25 %	322692049
44543	NC_015067	ACC	2	6	2275783	2275788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44544	NC_015067	CAG	2	6	2275791	2275796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44545	NC_015067	CCG	2	6	2275871	2275876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692049
44546	NC_015067	GCTG	2	8	2276120	2276127	0 %	25 %	50 %	25 %	322692049
44547	NC_015067	CTG	3	9	2276125	2276133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44548	NC_015067	CCA	2	6	2276165	2276170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692049
44549	NC_015067	GCT	2	6	2276208	2276213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44550	NC_015067	TCT	2	6	2276231	2276236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692049
44551	NC_015067	GTTC	2	8	2276237	2276244	0 %	50 %	25 %	25 %	322692049
44552	NC_015067	ATT	2	6	2276257	2276262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322692049
44553	NC_015067	ATG	2	6	2276362	2276367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692049
44554	NC_015067	CTT	2	6	2276373	2276378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692049
44555	NC_015067	TGC	2	6	2276474	2276479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44556	NC_015067	CGG	2	6	2276498	2276503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692049
44557	NC_015067	CGT	2	6	2276563	2276568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44558	NC_015067	TGA	2	6	2276585	2276590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692049
44559	NC_015067	GAAC	2	8	2276613	2276620	50 %	0 %	25 %	25 %	322692049
44560	NC_015067	ATC	2	6	2276677	2276682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692049
44561	NC_015067	CG	3	6	2276689	2276694	0 %	0 %	50 %	50 %	322692049
44562	NC_015067	TTC	2	6	2276701	2276706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692049
44563	NC_015067	GAT	2	6	2276721	2276726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692049
44564	NC_015067	TGC	2	6	2276774	2276779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44565	NC_015067	CCT	2	6	2276813	2276818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692049
44566	NC_015067	ATT	2	6	2276830	2276835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322692049
44567	NC_015067	ACGC	2	8	2276867	2276874	25 %	0 %	25 %	50 %	322692049
44568	NC_015067	CGA	2	6	2276916	2276921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44569	NC_015067	TG	3	6	2276949	2276954	0 %	50 %	50 %	0 %	322692049
44570	NC_015067	GCG	2	6	2276955	2276960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692049
44571	NC_015067	CCACGG	2	12	2276964	2276975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322692049
44572	NC_015067	GCG	2	6	2276986	2276991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692049
44573	NC_015067	GCA	2	6	2276996	2277001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692049
44574	NC_015067	GCC	2	6	2277052	2277057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692049
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44580	NC_015067	ATG	2	6	2277501	2277506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692050
44581	NC_015067	AATC	2	8	2277563	2277570	50 %	25 %	0 %	25 %	322692050
44582	NC_015067	ACC	2	6	2277603	2277608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692050
44583	NC_015067	CAA	2	6	2277719	2277724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692050
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44585	NC_015067	GTC	2	6	2277749	2277754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44586	NC_015067	GCC	2	6	2277807	2277812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692050
44587	NC_015067	CAT	2	6	2277818	2277823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692050
44588	NC_015067	GCT	2	6	2277839	2277844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44589	NC_015067	GCA	2	6	2277962	2277967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44590	NC_015067	GCC	2	6	2278110	2278115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692050
44591	NC_015067	GCA	2	6	2278214	2278219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44592	NC_015067	GCA	2	6	2278226	2278231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44593	NC_015067	GCC	2	6	2278233	2278238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692050
44594	NC_015067	TGCCGA	2	12	2278280	2278291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44595	NC_015067	GCC	2	6	2278326	2278331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692050
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44597	NC_015067	GGC	2	6	2278485	2278490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692050
44598	NC_015067	TGAC	2	8	2278525	2278532	25 %	25 %	25 %	25 %	322692050
44599	NC_015067	GAA	2	6	2278559	2278564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692050
44600	NC_015067	GGC	2	6	2278605	2278610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692050
44601	NC_015067	GGC	2	6	2278667	2278672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692050
44602	NC_015067	GCC	2	6	2278908	2278913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692050
44603	NC_015067	GAA	2	6	2278928	2278933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692050
44604	NC_015067	CAC	2	6	2278983	2278988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692050
44605	NC_015067	TTGCT	2	10	2279023	2279032	0 %	60 %	20 %	20 %	322692050
44606	NC_015067	GGT	2	6	2279113	2279118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692050
44607	NC_015067	GTA	2	6	2279193	2279198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692050
44608	NC_015067	CTG	2	6	2279199	2279204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692050
44609	NC_015067	CGG	2	6	2279225	2279230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692050
44610	NC_015067	TTC	2	6	2279259	2279264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692050
44611	NC_015067	GATGC	2	10	2279304	2279313	20 %	20 %	40 %	20 %	322692050
44612	NC_015067	GAT	2	6	2279983	2279988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692051
44613	NC_015067	TCC	2	6	2280065	2280070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692051
44614	NC_015067	TGC	2	6	2280269	2280274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692051
44615	NC_015067	GGA	2	6	2280605	2280610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692052
44616	NC_015067	TGG	2	6	2280673	2280678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692052
44617	NC_015067	CTG	2	6	2280702	2280707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44618	NC_015067	AGC	2	6	2280715	2280720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44619	NC_015067	CTG	2	6	2280750	2280755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44620	NC_015067	ACG	2	6	2280769	2280774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44621	NC_015067	GCG	2	6	2280867	2280872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692052
44622	NC_015067	GCA	2	6	2280874	2280879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44623	NC_015067	GGCCCG	2	12	2280899	2280910	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
44624	NC_015067	TGG	2	6	2280943	2280948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692052
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44627	NC_015067	GCCG	2	8	2281089	2281096	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
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44629	NC_015067	GCC	2	6	2281250	2281255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692052
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44631	NC_015067	CTG	2	6	2281293	2281298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44632	NC_015067	CGA	2	6	2281370	2281375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44633	NC_015067	TGCCGT	2	12	2281393	2281404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44634	NC_015067	CGCC	2	8	2281555	2281562	0 %	0 %	25 %	75 %	322692052
44635	NC_015067	ACGG	2	8	2281597	2281604	25 %	0 %	50 %	25 %	322692052
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44638	NC_015067	CGA	2	6	2281697	2281702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692052
44639	NC_015067	CG	3	6	2281707	2281712	0 %	0 %	50 %	50 %	322692052
44640	NC_015067	GGC	2	6	2281778	2281783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692052
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44642	NC_015067	CGG	2	6	2281907	2281912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692052
44643	NC_015067	GAG	2	6	2281917	2281922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322692052
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44647	NC_015067	CCTGAC	2	12	2282077	2282088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322692053
44648	NC_015067	ACTCG	2	10	2282167	2282176	20 %	20 %	20 %	40 %	322692053
44649	NC_015067	CG	3	6	2282175	2282180	0 %	0 %	50 %	50 %	322692053
44650	NC_015067	CGCCTG	2	12	2282192	2282203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322692053
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44654	NC_015067	TCG	2	6	2282310	2282315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692053
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44839	NC_015067	GATCA	2	10	2304601	2304610	40 %	20 %	20 %	20 %	322692060
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44845	NC_015067	AGA	2	6	2304846	2304851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692060
44846	NC_015067	CAC	2	6	2304853	2304858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692060
44847	NC_015067	AGC	3	9	2304896	2304904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692060
44848	NC_015067	AGA	2	6	2305038	2305043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692060
44849	NC_015067	TGC	2	6	2305094	2305099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692060
44850	NC_015067	CGA	2	6	2305142	2305147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692061
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44852	NC_015067	ATC	2	6	2305162	2305167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692061
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44854	NC_015067	CTG	2	6	2305203	2305208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692061
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44857	NC_015067	GAT	2	6	2305311	2305316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692061
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44873	NC_015067	GTT	2	6	2306271	2306276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692062
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44875	NC_015067	CGG	2	6	2306379	2306384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692062
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44880	NC_015067	GAA	2	6	2306607	2306612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692062
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44934	NC_015067	AAAT	2	8	2309720	2309727	75 %	25 %	0 %	0 %	322692064
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44943	NC_015067	TGC	2	6	2310599	2310604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692065
44944	NC_015067	CTGG	3	12	2310649	2310660	0 %	25 %	50 %	25 %	322692065
44945	NC_015067	TCA	2	6	2310800	2310805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692065
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44947	NC_015067	AG	3	6	2310831	2310836	50 %	0 %	50 %	0 %	322692065
44948	NC_015067	AAC	2	6	2310848	2310853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692065
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44952	NC_015067	CAT	2	6	2311101	2311106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692065
44953	NC_015067	CCG	2	6	2311178	2311183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692065
44954	NC_015067	TGC	2	6	2311186	2311191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692065
44955	NC_015067	CGA	2	6	2311197	2311202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692065
44956	NC_015067	AT	3	6	2311307	2311312	50 %	50 %	0 %	0 %	322692065
44957	NC_015067	GTT	2	6	2311408	2311413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692065
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44959	NC_015067	CAC	2	6	2311437	2311442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692065
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44989	NC_015067	GGC	2	6	2313146	2313151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692067
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