MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015067	TACGA	2	10	209732	209741	40 %	20 %	20 %	20 %	322690354
4002	NC_015067	GCC	2	6	209786	209791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690354
4003	NC_015067	GGC	2	6	209899	209904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690354
4004	NC_015067	CCGT	2	8	209928	209935	0 %	25 %	25 %	50 %	322690354
4005	NC_015067	ATGCG	2	10	209956	209965	20 %	20 %	40 %	20 %	322690354
4006	NC_015067	CTG	2	6	209966	209971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690354
4007	NC_015067	GTG	2	6	209975	209980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690354
4008	NC_015067	TTGG	2	8	210005	210012	0 %	50 %	50 %	0 %	322690354
4009	NC_015067	CTG	2	6	210083	210088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690354
4010	NC_015067	GACC	2	8	210136	210143	25 %	0 %	25 %	50 %	322690354
4011	NC_015067	TGAT	2	8	210159	210166	25 %	50 %	25 %	0 %	322690354
4012	NC_015067	ACCGCC	2	12	210194	210205	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690354
4013	NC_015067	CGA	2	6	210250	210255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690354
4014	NC_015067	AAG	3	9	210281	210289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690354
4015	NC_015067	GAA	2	6	210296	210301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690354
4016	NC_015067	CAA	2	6	210313	210318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690354
4017	NC_015067	GCC	2	6	210329	210334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690354
4018	NC_015067	GAA	2	6	210469	210474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690355
4019	NC_015067	GAA	3	9	210491	210499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690355
4020	NC_015067	CGG	2	6	210544	210549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690355
4021	NC_015067	CTG	2	6	210581	210586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690355
4022	NC_015067	CGG	2	6	210597	210602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690355
4023	NC_015067	GAC	2	6	210829	210834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690355
4024	NC_015067	GT	3	6	210893	210898	0 %	50 %	50 %	0 %	322690355
4025	NC_015067	GGC	2	6	210964	210969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690355
4026	NC_015067	GC	3	6	211005	211010	0 %	0 %	50 %	50 %	322690355
4027	NC_015067	GT	3	6	211119	211124	0 %	50 %	50 %	0 %	322690355
4028	NC_015067	ATT	2	6	211125	211130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690355
4029	NC_015067	TGC	2	6	211135	211140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690355
4030	NC_015067	CGC	2	6	211197	211202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690355
4031	NC_015067	GGT	2	6	211207	211212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690355
4032	NC_015067	GGC	2	6	211232	211237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690355
4033	NC_015067	GCG	2	6	211295	211300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690355
4034	NC_015067	CGG	2	6	211534	211539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4035	NC_015067	TCG	2	6	211569	211574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690356
4036	NC_015067	CGG	2	6	211592	211597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4037	NC_015067	GGGGCC	2	12	211614	211625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4038	NC_015067	GGC	2	6	211710	211715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4039	NC_015067	GCG	2	6	211767	211772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4040	NC_015067	GCC	2	6	211833	211838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690356
4041	NC_015067	CCG	2	6	211936	211941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690356
4042	NC_015067	CCG	2	6	211950	211955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690356
4043	NC_015067	TGC	2	6	211963	211968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690356
4044	NC_015067	CCG	2	6	212004	212009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690356
4045	NC_015067	CAC	2	6	212020	212025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690356
4046	NC_015067	ATG	2	6	212037	212042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690356
4047	NC_015067	CCAG	2	8	212084	212091	25 %	0 %	25 %	50 %	322690356
4048	NC_015067	CGG	2	6	212112	212117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4049	NC_015067	TGG	2	6	212161	212166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690356
4050	NC_015067	CACC	2	8	212240	212247	25 %	0 %	0 %	75 %	322690356
4051	NC_015067	CG	3	6	212267	212272	0 %	0 %	50 %	50 %	322690356
4052	NC_015067	CTT	2	6	212291	212296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690356
4053	NC_015067	CTT	2	6	212314	212319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690356
4054	NC_015067	GTA	2	6	212333	212338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690356
4055	NC_015067	CAGTGG	2	12	212356	212367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690356
4056	NC_015067	GCG	2	6	212370	212375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4057	NC_015067	CGG	2	6	212390	212395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4058	NC_015067	GCT	2	6	212644	212649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690356
4059	NC_015067	TTG	2	6	212664	212669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690356
4060	NC_015067	GCC	2	6	212977	212982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690357
4061	NC_015067	AGC	2	6	212987	212992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690357
4062	NC_015067	CTG	2	6	213028	213033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690357
4063	NC_015067	GCCTG	2	10	213041	213050	0 %	20 %	40 %	40 %	322690357
4064	NC_015067	CGG	2	6	213372	213377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690358
4065	NC_015067	GAA	2	6	213424	213429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690358
4066	NC_015067	GCC	2	6	213553	213558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4067	NC_015067	GCT	2	6	213561	213566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4068	NC_015067	GCC	2	6	213628	213633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4069	NC_015067	GCC	2	6	213694	213699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4070	NC_015067	TGA	2	6	213744	213749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690358
4071	NC_015067	CGA	2	6	213867	213872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4072	NC_015067	GAT	2	6	213876	213881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690358
4073	NC_015067	CGT	2	6	213891	213896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4074	NC_015067	GCG	2	6	213902	213907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690358
4075	NC_015067	CCT	2	6	213912	213917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690358
4076	NC_015067	CAA	2	6	214023	214028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690358
4077	NC_015067	ACC	2	6	214067	214072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690358
4078	NC_015067	TCGACA	2	12	214217	214228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322690358
4079	NC_015067	CCG	2	6	214325	214330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4080	NC_015067	GACC	2	8	214347	214354	25 %	0 %	25 %	50 %	322690358
4081	NC_015067	CCG	3	9	214373	214381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4082	NC_015067	CG	3	6	214397	214402	0 %	0 %	50 %	50 %	322690358
4083	NC_015067	CTG	2	6	214408	214413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4084	NC_015067	GAC	2	6	214474	214479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4085	NC_015067	AAG	2	6	214483	214488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690358
4086	NC_015067	CGC	2	6	214530	214535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4087	NC_015067	GAG	2	6	214606	214611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690358
4088	NC_015067	GGC	2	6	214612	214617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690358
4089	NC_015067	GTC	2	6	214664	214669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4090	NC_015067	CGC	2	6	214679	214684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4091	NC_015067	TCG	2	6	214703	214708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690358
4092	NC_015067	CTCG	2	8	214723	214730	0 %	25 %	25 %	50 %	322690358
4093	NC_015067	GCA	2	6	215699	215704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690359
4094	NC_015067	CAA	2	6	215726	215731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690359
4095	NC_015067	GCAA	2	8	215733	215740	50 %	0 %	25 %	25 %	322690359
4096	NC_015067	AGA	2	6	215752	215757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690359
4097	NC_015067	GGC	2	6	215771	215776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690359
4098	NC_015067	GTG	2	6	215793	215798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690359
4099	NC_015067	TCG	2	6	215812	215817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690359
4100	NC_015067	GT	3	6	215824	215829	0 %	50 %	50 %	0 %	322690359
4101	NC_015067	ACA	2	6	215860	215865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690359
4102	NC_015067	CGC	2	6	215873	215878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690359
4103	NC_015067	GCC	2	6	215883	215888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690359
4104	NC_015067	ACA	2	6	215923	215928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690359
4105	NC_015067	GCT	2	6	215955	215960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690359
4106	NC_015067	AAG	2	6	215970	215975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690359
4107	NC_015067	CAA	2	6	216008	216013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690359
4108	NC_015067	GAC	2	6	216057	216062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690359
4109	NC_015067	AAG	2	6	216168	216173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690359
4110	NC_015067	AGA	3	9	216580	216588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690360
4111	NC_015067	GCG	2	6	216808	216813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690360
4112	NC_015067	CAA	2	6	216896	216901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690360
4113	NC_015067	CCA	2	6	216964	216969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690360
4114	NC_015067	GGC	2	6	217062	217067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690360
4115	NC_015067	GCT	2	6	217128	217133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690360
4116	NC_015067	CAA	2	6	217253	217258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690360
4117	NC_015067	GCC	2	6	217341	217346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690360
4118	NC_015067	GAA	2	6	217470	217475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690360
4119	NC_015067	AC	3	6	217481	217486	50 %	0 %	0 %	50 %	322690360
4120	NC_015067	AAGG	2	8	217500	217507	50 %	0 %	50 %	0 %	322690360
4121	NC_015067	CAG	2	6	217524	217529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690360
4122	NC_015067	AAG	2	6	217614	217619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690360
4123	NC_015067	AAG	2	6	217635	217640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690360
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4233	NC_015067	GAAC	2	8	224362	224369	50 %	0 %	25 %	25 %	322690365
4234	NC_015067	CAT	2	6	224380	224385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690365
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4236	NC_015067	AC	3	6	224425	224430	50 %	0 %	0 %	50 %	322690365
4237	NC_015067	GGA	2	6	224434	224439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690365
4238	NC_015067	TTG	2	6	224720	224725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690366
4239	NC_015067	CGGAG	2	10	224748	224757	20 %	0 %	60 %	20 %	322690366
4240	NC_015067	GGC	2	6	224789	224794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690366
4241	NC_015067	CTT	2	6	224800	224805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690366
4242	NC_015067	ACG	2	6	224871	224876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690366
4243	NC_015067	GCAG	2	8	224892	224899	25 %	0 %	50 %	25 %	322690366
4244	NC_015067	AGC	2	6	224928	224933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690366
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4246	NC_015067	TTG	2	6	224978	224983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690366
4247	NC_015067	CG	3	6	225078	225083	0 %	0 %	50 %	50 %	322690366
4248	NC_015067	GGT	2	6	225093	225098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690366
4249	NC_015067	TGGCAG	2	12	225133	225144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690366
4250	NC_015067	GGCCA	2	10	225193	225202	20 %	0 %	40 %	40 %	322690366
4251	NC_015067	GTC	2	6	225235	225240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690366
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4255	NC_015067	CGA	2	6	225396	225401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690366
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4259	NC_015067	GCTG	2	8	225527	225534	0 %	25 %	50 %	25 %	322690366
4260	NC_015067	GCGCA	2	10	225541	225550	20 %	0 %	40 %	40 %	322690366
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4262	NC_015067	TG	3	6	225618	225623	0 %	50 %	50 %	0 %	322690366
4263	NC_015067	GTG	2	6	225833	225838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690367
4264	NC_015067	TC	3	6	225843	225848	0 %	50 %	0 %	50 %	322690367
4265	NC_015067	GA	3	6	225855	225860	50 %	0 %	50 %	0 %	322690367
4266	NC_015067	CGGC	2	8	226025	226032	0 %	0 %	50 %	50 %	322690367
4267	NC_015067	GCG	2	6	226070	226075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690367
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4271	NC_015067	AGT	2	6	226407	226412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690368
4272	NC_015067	ATTTGC	2	12	226437	226448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322690368
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4274	NC_015067	TTG	2	6	226513	226518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690368
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4343	NC_015067	CTG	2	6	231120	231125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690372
4344	NC_015067	CGAT	2	8	231180	231187	25 %	25 %	25 %	25 %	322690372
4345	NC_015067	GCT	2	6	231215	231220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690372
4346	NC_015067	CTTC	2	8	231225	231232	0 %	50 %	0 %	50 %	322690372
4347	NC_015067	CAT	2	6	231325	231330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690372
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4351	NC_015067	GTG	2	6	231592	231597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690372
4352	NC_015067	TGA	2	6	231803	231808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690373
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4355	NC_015067	GC	3	6	231921	231926	0 %	0 %	50 %	50 %	322690373
4356	NC_015067	ATCA	2	8	231937	231944	50 %	25 %	0 %	25 %	322690373
4357	NC_015067	TCG	2	6	232004	232009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690373
4358	NC_015067	TGG	2	6	232010	232015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690373
4359	NC_015067	CGC	2	6	232024	232029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690373
4360	NC_015067	CAC	2	6	232032	232037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690373
4361	NC_015067	GCA	3	9	232044	232052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690373
4362	NC_015067	GCC	2	6	232084	232089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690373
4363	NC_015067	TGC	3	9	232187	232195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690373
4364	NC_015067	GC	3	6	232194	232199	0 %	0 %	50 %	50 %	322690373
4365	NC_015067	ATT	2	6	232231	232236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690373
4366	NC_015067	GCC	2	6	232240	232245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690373
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4370	NC_015067	GAT	2	6	232428	232433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690373
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4372	NC_015067	ATG	2	6	232505	232510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690373
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4383	NC_015067	CTCG	2	8	233069	233076	0 %	25 %	25 %	50 %	322690374
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4467	NC_015067	CGA	2	6	236121	236126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690376
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4473	NC_015067	GGC	2	6	236304	236309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690376
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4479	NC_015067	GAA	2	6	236557	236562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690377
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4482	NC_015067	GC	3	6	236601	236606	0 %	0 %	50 %	50 %	322690377
4483	NC_015067	GCG	2	6	236619	236624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690377
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