MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015067	GGT	2	6	2247812	2247817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692036
44002	NC_015067	TGC	2	6	2247836	2247841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692036
44003	NC_015067	GCGCCA	2	12	2247844	2247855	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322692036
44004	NC_015067	TTC	2	6	2247891	2247896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692036
44005	NC_015067	GA	4	8	2248061	2248068	50 %	0 %	50 %	0 %	322692037
44006	NC_015067	CAC	2	6	2248096	2248101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692037
44007	NC_015067	CGG	2	6	2248114	2248119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44008	NC_015067	CTGC	2	8	2248173	2248180	0 %	25 %	25 %	50 %	322692037
44009	NC_015067	CAC	2	6	2248241	2248246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692037
44010	NC_015067	ACG	2	6	2248249	2248254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44011	NC_015067	GTGACG	2	12	2248281	2248292	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322692037
44012	NC_015067	CGG	2	6	2248339	2248344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44013	NC_015067	TCG	2	6	2248375	2248380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44014	NC_015067	CGG	2	6	2248399	2248404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44015	NC_015067	GCTC	2	8	2248441	2248448	0 %	25 %	25 %	50 %	322692037
44016	NC_015067	CCT	2	6	2248540	2248545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692037
44017	NC_015067	GC	3	6	2248581	2248586	0 %	0 %	50 %	50 %	322692037
44018	NC_015067	GCGT	2	8	2248670	2248677	0 %	25 %	50 %	25 %	322692037
44019	NC_015067	TCA	2	6	2248704	2248709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692037
44020	NC_015067	GGCCGG	2	12	2248726	2248737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44021	NC_015067	ACG	2	6	2248804	2248809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44022	NC_015067	GGC	2	6	2248859	2248864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44023	NC_015067	CTG	2	6	2249024	2249029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44024	NC_015067	CCA	2	6	2249062	2249067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692037
44025	NC_015067	ACGTC	2	10	2249173	2249182	20 %	20 %	20 %	40 %	322692037
44026	NC_015067	GCG	2	6	2249187	2249192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44027	NC_015067	TCG	2	6	2249259	2249264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44028	NC_015067	GTT	2	6	2249288	2249293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692037
44029	NC_015067	CCA	2	6	2249345	2249350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692037
44030	NC_015067	TGA	3	9	2249455	2249463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692037
44031	NC_015067	GC	3	6	2249502	2249507	0 %	0 %	50 %	50 %	322692037
44032	NC_015067	GTT	2	6	2249540	2249545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692037
44033	NC_015067	GTA	3	9	2249588	2249596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692037
44034	NC_015067	AGA	2	6	2249614	2249619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692037
44035	NC_015067	CGT	2	6	2249638	2249643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44036	NC_015067	GGT	2	6	2249657	2249662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692037
44037	NC_015067	CTG	2	6	2249663	2249668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44038	NC_015067	CGG	2	6	2249713	2249718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44039	NC_015067	ATC	2	6	2249723	2249728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692037
44040	NC_015067	CGT	2	6	2249764	2249769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44041	NC_015067	CGG	2	6	2249818	2249823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44042	NC_015067	GCC	2	6	2249846	2249851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692037
44043	NC_015067	CGC	2	6	2250070	2250075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692037
44044	NC_015067	AGA	2	6	2250091	2250096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692037
44045	NC_015067	GGC	2	6	2250113	2250118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44046	NC_015067	GC	3	6	2250171	2250176	0 %	0 %	50 %	50 %	322692037
44047	NC_015067	GTT	2	6	2250236	2250241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692037
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44049	NC_015067	TGC	2	6	2250382	2250387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44050	NC_015067	CGG	2	6	2250391	2250396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44051	NC_015067	GGC	2	6	2250401	2250406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44052	NC_015067	CGA	2	6	2250426	2250431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44053	NC_015067	TCG	2	6	2250432	2250437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
44054	NC_015067	CGC	2	6	2250511	2250516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692037
44055	NC_015067	GTT	2	6	2250518	2250523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692037
44056	NC_015067	CGG	2	6	2250538	2250543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
44057	NC_015067	TGG	2	6	2250568	2250573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692037
44058	NC_015067	GCG	3	9	2250735	2250743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
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44060	NC_015067	GCA	2	6	2250865	2250870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692037
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44088	NC_015067	CG	3	6	2251841	2251846	0 %	0 %	50 %	50 %	322692037
44089	NC_015067	CGT	2	6	2251852	2251857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692037
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44094	NC_015067	GTCG	2	8	2252135	2252142	0 %	25 %	50 %	25 %	322692037
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44109	NC_015067	CA	3	6	2252676	2252681	50 %	0 %	0 %	50 %	322692037
44110	NC_015067	AC	3	6	2252740	2252745	50 %	0 %	0 %	50 %	322692037
44111	NC_015067	GTA	2	6	2252765	2252770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692037
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44115	NC_015067	TTG	2	6	2252925	2252930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692037
44116	NC_015067	CGGTGA	2	12	2252983	2252994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322692037
44117	NC_015067	CGG	2	6	2253004	2253009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692037
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44225	NC_015067	CGT	2	6	2259713	2259718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692039
44226	NC_015067	CACAGC	2	12	2259746	2259757	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322692039
44227	NC_015067	GCA	2	6	2259805	2259810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692039
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44229	NC_015067	TGA	2	6	2259942	2259947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692039
44230	NC_015067	GTA	2	6	2259971	2259976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692039
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44233	NC_015067	GTA	2	6	2260214	2260219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692039
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44340	NC_015067	GGT	2	6	2265288	2265293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692040
44341	NC_015067	CGT	2	6	2265299	2265304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692040
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44344	NC_015067	GTC	2	6	2265348	2265353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692040
44345	NC_015067	CGC	2	6	2265440	2265445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692040
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44446	NC_015067	CAT	2	6	2270772	2270777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692045
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44454	NC_015067	CGG	2	6	2270976	2270981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692045
44455	NC_015067	GTC	2	6	2271028	2271033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
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44457	NC_015067	ACC	2	6	2271170	2271175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692045
44458	NC_015067	TGGT	2	8	2271203	2271210	0 %	50 %	50 %	0 %	322692045
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44462	NC_015067	GTC	2	6	2271472	2271477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692045
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