MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_015067	TTG	2	6	2222825	2222830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692027
43502	NC_015067	GCCA	2	8	2222866	2222873	25 %	0 %	25 %	50 %	322692027
43503	NC_015067	AGTCGA	2	12	2222880	2222891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322692027
43504	NC_015067	CCGG	2	8	2222921	2222928	0 %	0 %	50 %	50 %	322692027
43505	NC_015067	TGT	2	6	2222952	2222957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692027
43506	NC_015067	ACC	2	6	2222969	2222974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692027
43507	NC_015067	TCA	2	6	2223030	2223035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692027
43508	NC_015067	CTT	2	6	2223112	2223117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692027
43509	NC_015067	CG	3	6	2223138	2223143	0 %	0 %	50 %	50 %	322692027
43510	NC_015067	CGG	2	6	2223240	2223245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692027
43511	NC_015067	GAT	2	6	2223268	2223273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692027
43512	NC_015067	TCA	2	6	2223278	2223283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692027
43513	NC_015067	CTG	4	12	2223319	2223330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43514	NC_015067	CCT	2	6	2223351	2223356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692027
43515	NC_015067	CTT	2	6	2223361	2223366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692027
43516	NC_015067	AGT	2	6	2223408	2223413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692027
43517	NC_015067	AGT	2	6	2223423	2223428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692027
43518	NC_015067	ATT	2	6	2223613	2223618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322692027
43519	NC_015067	CCA	2	6	2223635	2223640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692027
43520	NC_015067	CGGAG	2	10	2223670	2223679	20 %	0 %	60 %	20 %	322692027
43521	NC_015067	CCA	2	6	2223739	2223744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692027
43522	NC_015067	GCG	2	6	2223752	2223757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692027
43523	NC_015067	GTC	2	6	2223781	2223786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43524	NC_015067	CAGC	2	8	2223804	2223811	25 %	0 %	25 %	50 %	322692027
43525	NC_015067	TGG	2	6	2223831	2223836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692027
43526	NC_015067	GCC	3	9	2223946	2223954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692027
43527	NC_015067	TCA	2	6	2223989	2223994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692027
43528	NC_015067	GCT	2	6	2224026	2224031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43529	NC_015067	AGCCTT	2	12	2224045	2224056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322692027
43530	NC_015067	TGG	2	6	2224077	2224082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692027
43531	NC_015067	CTC	2	6	2224239	2224244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692027
43532	NC_015067	GCC	2	6	2224256	2224261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692027
43533	NC_015067	GCA	2	6	2224271	2224276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43534	NC_015067	CTGTT	2	10	2224689	2224698	0 %	60 %	20 %	20 %	322692028
43535	NC_015067	TCG	2	6	2224947	2224952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43536	NC_015067	GCT	2	6	2225040	2225045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43537	NC_015067	GGAT	2	8	2225160	2225167	25 %	25 %	50 %	0 %	322692028
43538	NC_015067	CCA	2	6	2225190	2225195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692028
43539	NC_015067	CCA	2	6	2225232	2225237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692028
43540	NC_015067	ATC	2	6	2225249	2225254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692028
43541	NC_015067	AGC	2	6	2225462	2225467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43542	NC_015067	GCA	2	6	2225471	2225476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43543	NC_015067	TTC	2	6	2225539	2225544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692028
43544	NC_015067	TAG	2	6	2225666	2225671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692028
43545	NC_015067	TG	3	6	2225718	2225723	0 %	50 %	50 %	0 %	322692028
43546	NC_015067	GAA	2	6	2225774	2225779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692028
43547	NC_015067	AAT	2	6	2225803	2225808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322692028
43548	NC_015067	TCG	2	6	2225813	2225818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43549	NC_015067	CCA	2	6	2225838	2225843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692028
43550	NC_015067	TGC	2	6	2225964	2225969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43551	NC_015067	GAT	2	6	2226053	2226058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692028
43552	NC_015067	GCA	2	6	2226069	2226074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692028
43553	NC_015067	GCA	2	6	2226492	2226497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692029
43554	NC_015067	AAC	2	6	2226569	2226574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692029
43555	NC_015067	GAA	2	6	2226592	2226597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692029
43556	NC_015067	CGG	2	6	2226668	2226673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692029
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43558	NC_015067	AC	3	6	2226759	2226764	50 %	0 %	0 %	50 %	322692029
43559	NC_015067	CAG	2	6	2226790	2226795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692029
43560	NC_015067	GGC	2	6	2226906	2226911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692029
43561	NC_015067	CAG	2	6	2226922	2226927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692029
43562	NC_015067	GCG	2	6	2226947	2226952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692029
43563	NC_015067	CAC	2	6	2226958	2226963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692029
43564	NC_015067	GAA	2	6	2226964	2226969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692029
43565	NC_015067	ATG	2	6	2227079	2227084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692029
43566	NC_015067	CCA	2	6	2227086	2227091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692029
43567	NC_015067	AGA	2	6	2227104	2227109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692029
43568	NC_015067	GCA	2	6	2227146	2227151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692029
43569	NC_015067	ATC	2	6	2227199	2227204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692029
43570	NC_015067	GAA	2	6	2227213	2227218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692029
43571	NC_015067	GGCC	2	8	2227302	2227309	0 %	0 %	50 %	50 %	322692029
43572	NC_015067	CGATCA	2	12	2227359	2227370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322692029
43573	NC_015067	CGG	2	6	2227377	2227382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692029
43574	NC_015067	ATC	2	6	2227388	2227393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692029
43575	NC_015067	ATC	2	6	2227415	2227420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692029
43576	NC_015067	GAA	2	6	2227543	2227548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692029
43577	NC_015067	TGA	2	6	2227551	2227556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692029
43578	NC_015067	CAG	2	6	2227591	2227596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692029
43579	NC_015067	TGA	2	6	2227659	2227664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692029
43580	NC_015067	TGA	2	6	2227668	2227673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692029
43581	NC_015067	GCTG	2	8	2227680	2227687	0 %	25 %	50 %	25 %	322692029
43582	NC_015067	CAT	2	6	2227699	2227704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692029
43583	NC_015067	GC	3	6	2227715	2227720	0 %	0 %	50 %	50 %	322692029
43584	NC_015067	GAA	2	6	2227726	2227731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692029
43585	NC_015067	ATG	2	6	2227733	2227738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692029
43586	NC_015067	GAT	2	6	2227762	2227767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692029
43587	NC_015067	GCC	2	6	2227828	2227833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692029
43588	NC_015067	TGGTC	2	10	2227884	2227893	0 %	40 %	40 %	20 %	322692029
43589	NC_015067	CTG	2	6	2227927	2227932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692029
43590	NC_015067	ACC	2	6	2227936	2227941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692029
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43592	NC_015067	CAG	2	6	2228219	2228224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692030
43593	NC_015067	CCA	2	6	2228242	2228247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692030
43594	NC_015067	CACTTC	2	12	2228273	2228284	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322692030
43595	NC_015067	GCA	2	6	2228310	2228315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692030
43596	NC_015067	ACCA	2	8	2228351	2228358	50 %	0 %	0 %	50 %	322692030
43597	NC_015067	ATC	3	9	2228379	2228387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692030
43598	NC_015067	CAC	2	6	2228495	2228500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692030
43599	NC_015067	GCC	2	6	2228510	2228515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692030
43600	NC_015067	CCA	2	6	2228536	2228541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692030
43601	NC_015067	GGC	2	6	2228570	2228575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692030
43602	NC_015067	CGA	2	6	2228606	2228611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692030
43603	NC_015067	CCGAAG	2	12	2228713	2228724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692030
43604	NC_015067	CCG	2	6	2228806	2228811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692030
43605	NC_015067	GCCC	2	8	2228826	2228833	0 %	0 %	25 %	75 %	322692030
43606	NC_015067	GCC	2	6	2228837	2228842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692030
43607	NC_015067	CAC	2	6	2228911	2228916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692030
43608	NC_015067	GCC	2	6	2228936	2228941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692030
43609	NC_015067	ACC	2	6	2228974	2228979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692030
43610	NC_015067	TTG	2	6	2229033	2229038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692030
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43612	NC_015067	CGC	2	6	2229091	2229096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692030
43613	NC_015067	CGG	2	6	2229160	2229165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692030
43614	NC_015067	CGTCAT	2	12	2229166	2229177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322692030
43615	NC_015067	CCA	3	9	2229181	2229189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692030
43616	NC_015067	CGC	2	6	2229292	2229297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692030
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43725	NC_015067	TCG	2	6	2234094	2234099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692033
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