MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015067	CGA	2	6	2194480	2194485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692011
43002	NC_015067	CGGC	2	8	2194515	2194522	0 %	0 %	50 %	50 %	322692011
43003	NC_015067	ACACC	2	10	2194527	2194536	40 %	0 %	0 %	60 %	322692011
43004	NC_015067	CGC	2	6	2194601	2194606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692011
43005	NC_015067	AGC	2	6	2194611	2194616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692011
43006	NC_015067	CGA	2	6	2194639	2194644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692011
43007	NC_015067	CG	3	6	2194665	2194670	0 %	0 %	50 %	50 %	322692011
43008	NC_015067	CCA	2	6	2194671	2194676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692011
43009	NC_015067	AC	3	6	2194683	2194688	50 %	0 %	0 %	50 %	322692011
43010	NC_015067	CG	3	6	2194695	2194700	0 %	0 %	50 %	50 %	322692011
43011	NC_015067	GGCG	2	8	2194918	2194925	0 %	0 %	75 %	25 %	322692012
43012	NC_015067	GCG	2	6	2194964	2194969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692012
43013	NC_015067	CAG	2	6	2195051	2195056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692012
43014	NC_015067	CG	3	6	2195059	2195064	0 %	0 %	50 %	50 %	322692012
43015	NC_015067	GAT	2	6	2195084	2195089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692012
43016	NC_015067	GC	3	6	2195159	2195164	0 %	0 %	50 %	50 %	322692012
43017	NC_015067	GTC	2	6	2195186	2195191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692012
43018	NC_015067	CATG	2	8	2195275	2195282	25 %	25 %	25 %	25 %	322692012
43019	NC_015067	TGC	2	6	2195295	2195300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692012
43020	NC_015067	GC	3	6	2195392	2195397	0 %	0 %	50 %	50 %	322692012
43021	NC_015067	CAG	3	9	2195405	2195413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692012
43022	NC_015067	CA	3	6	2195485	2195490	50 %	0 %	0 %	50 %	322692012
43023	NC_015067	CAGG	2	8	2195512	2195519	25 %	0 %	50 %	25 %	322692012
43024	NC_015067	GCA	3	9	2195533	2195541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692012
43025	NC_015067	GC	3	6	2195585	2195590	0 %	0 %	50 %	50 %	322692012
43026	NC_015067	TGA	2	6	2195635	2195640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692012
43027	NC_015067	CGG	2	6	2195666	2195671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692012
43028	NC_015067	GGCC	2	8	2195686	2195693	0 %	0 %	50 %	50 %	322692012
43029	NC_015067	CGC	2	6	2195926	2195931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692013
43030	NC_015067	GTGGCG	2	12	2195961	2195972	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322692013
43031	NC_015067	CGG	2	6	2196046	2196051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43032	NC_015067	CAG	2	6	2196055	2196060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43033	NC_015067	GCG	2	6	2196104	2196109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43034	NC_015067	GTC	2	6	2196140	2196145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43035	NC_015067	CTC	2	6	2196176	2196181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692013
43036	NC_015067	CAG	2	6	2196206	2196211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43037	NC_015067	GCA	2	6	2196229	2196234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43038	NC_015067	TTC	2	6	2196260	2196265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692013
43039	NC_015067	GGC	2	6	2196332	2196337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43040	NC_015067	CAGGTA	2	12	2196401	2196412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322692013
43041	NC_015067	CAGACT	2	12	2196454	2196465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322692013
43042	NC_015067	CGG	2	6	2196484	2196489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43043	NC_015067	CAG	2	6	2196490	2196495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43044	NC_015067	CCCA	2	8	2196507	2196514	25 %	0 %	0 %	75 %	322692013
43045	NC_015067	CAG	2	6	2196568	2196573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43046	NC_015067	CGC	2	6	2196676	2196681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692013
43047	NC_015067	CGG	2	6	2196770	2196775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43048	NC_015067	GCA	2	6	2196776	2196781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43049	NC_015067	GGC	2	6	2196826	2196831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43050	NC_015067	GGCA	2	8	2196841	2196848	25 %	0 %	50 %	25 %	322692013
43051	NC_015067	AGA	2	6	2196877	2196882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692013
43052	NC_015067	GTG	2	6	2196915	2196920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692013
43053	NC_015067	GAA	2	6	2196989	2196994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692013
43054	NC_015067	GCC	2	6	2197082	2197087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692013
43055	NC_015067	GCC	2	6	2197091	2197096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692013
43056	NC_015067	CGA	2	6	2197117	2197122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43057	NC_015067	GTC	2	6	2197163	2197168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692013
43058	NC_015067	GC	3	6	2197212	2197217	0 %	0 %	50 %	50 %	322692013
43059	NC_015067	GGCGTC	2	12	2197310	2197321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322692013
43060	NC_015067	GCCG	2	8	2197366	2197373	0 %	0 %	50 %	50 %	322692013
43061	NC_015067	GGC	2	6	2197535	2197540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43062	NC_015067	GTA	2	6	2197571	2197576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692013
43063	NC_015067	CG	3	6	2197643	2197648	0 %	0 %	50 %	50 %	322692013
43064	NC_015067	CA	3	6	2197705	2197710	50 %	0 %	0 %	50 %	322692013
43065	NC_015067	CGG	2	6	2197729	2197734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43066	NC_015067	CCAC	2	8	2197786	2197793	25 %	0 %	0 %	75 %	322692013
43067	NC_015067	CGG	2	6	2197895	2197900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692013
43068	NC_015067	TGCA	2	8	2197962	2197969	25 %	25 %	25 %	25 %	322692013
43069	NC_015067	CGGTGA	2	12	2198071	2198082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322692013
43070	NC_015067	CGTA	2	8	2198392	2198399	25 %	25 %	25 %	25 %	322692014
43071	NC_015067	CAA	2	6	2198412	2198417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692014
43072	NC_015067	CGG	2	6	2198438	2198443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692014
43073	NC_015067	CGG	2	6	2198447	2198452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692014
43074	NC_015067	CGGC	2	8	2198456	2198463	0 %	0 %	50 %	50 %	322692014
43075	NC_015067	GGC	2	6	2198472	2198477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692014
43076	NC_015067	CG	3	6	2198507	2198512	0 %	0 %	50 %	50 %	322692014
43077	NC_015067	ACCT	2	8	2198650	2198657	25 %	25 %	0 %	50 %	322692014
43078	NC_015067	TTC	2	6	2198659	2198664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692014
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43080	NC_015067	CGA	2	6	2198718	2198723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692014
43081	NC_015067	TGG	2	6	2198775	2198780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692014
43082	NC_015067	TGG	2	6	2198782	2198787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692014
43083	NC_015067	CGC	2	6	2198796	2198801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692014
43084	NC_015067	CGA	2	6	2198868	2198873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692014
43085	NC_015067	GCC	2	6	2198924	2198929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692014
43086	NC_015067	TGCG	2	8	2198960	2198967	0 %	25 %	50 %	25 %	322692014
43087	NC_015067	CCG	2	6	2199025	2199030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692014
43088	NC_015067	CTT	2	6	2199042	2199047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692014
43089	NC_015067	CG	3	6	2199048	2199053	0 %	0 %	50 %	50 %	322692014
43090	NC_015067	GAT	3	9	2199061	2199069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692014
43091	NC_015067	AAG	2	6	2199076	2199081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692014
43092	NC_015067	AGGCCG	2	12	2199101	2199112	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322692014
43093	NC_015067	GCG	2	6	2199143	2199148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692014
43094	NC_015067	AAG	2	6	2199283	2199288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692014
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43096	NC_015067	CCG	2	6	2199464	2199469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692014
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43098	NC_015067	GTG	2	6	2199541	2199546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322692014
43099	NC_015067	CGA	2	6	2199654	2199659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692014
43100	NC_015067	CTA	2	6	2199723	2199728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692014
43101	NC_015067	TCA	2	6	2199770	2199775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692014
43102	NC_015067	CGA	2	6	2199792	2199797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692014
43103	NC_015067	CAC	2	6	2199816	2199821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692014
43104	NC_015067	CGA	2	6	2200089	2200094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692015
43105	NC_015067	ACC	2	6	2200098	2200103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692015
43106	NC_015067	CAA	2	6	2200113	2200118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692015
43107	NC_015067	TGC	2	6	2200134	2200139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692015
43108	NC_015067	CACG	2	8	2200143	2200150	25 %	0 %	25 %	50 %	322692015
43109	NC_015067	CAC	2	6	2200172	2200177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692015
43110	NC_015067	CGC	2	6	2200260	2200265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692015
43111	NC_015067	TCGCA	2	10	2200381	2200390	20 %	20 %	20 %	40 %	322692015
43112	NC_015067	CGT	2	6	2200404	2200409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692015
43113	NC_015067	CAA	2	6	2200415	2200420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692015
43114	NC_015067	CAA	2	6	2200467	2200472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322692015
43115	NC_015067	CGC	2	6	2200515	2200520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692015
43116	NC_015067	GC	3	6	2200576	2200581	0 %	0 %	50 %	50 %	322692015
43117	NC_015067	GGC	2	6	2200597	2200602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692015
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43227	NC_015067	TCGCCG	2	12	2207598	2207609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322692020
43228	NC_015067	GCG	2	6	2207686	2207691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692020
43229	NC_015067	CGG	2	6	2207716	2207721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692020
43230	NC_015067	ATG	2	6	2207724	2207729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692020
43231	NC_015067	CAT	2	6	2207762	2207767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692020
43232	NC_015067	TGC	2	6	2207859	2207864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692020
43233	NC_015067	GTA	2	6	2207930	2207935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692020
43234	NC_015067	CGC	2	6	2207960	2207965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692020
43235	NC_015067	ACC	2	6	2208015	2208020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692020
43236	NC_015067	GGC	2	6	2208032	2208037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692020
43237	NC_015067	CGT	2	6	2208057	2208062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692020
43238	NC_015067	GAA	2	6	2208122	2208127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322692020
43239	NC_015067	GCC	2	6	2208146	2208151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692020
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43242	NC_015067	TAT	2	6	2208621	2208626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322692021
43243	NC_015067	GAT	2	6	2208638	2208643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692021
43244	NC_015067	TCG	2	6	2208648	2208653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692021
43245	NC_015067	GGC	2	6	2208677	2208682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692021
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43247	NC_015067	ACG	2	6	2208798	2208803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692021
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43249	NC_015067	CGGCA	2	10	2208890	2208899	20 %	0 %	40 %	40 %	322692021
43250	NC_015067	GTGC	2	8	2208939	2208946	0 %	25 %	50 %	25 %	322692021
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43253	NC_015067	GCC	3	9	2209158	2209166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692021
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43259	NC_015067	TCG	2	6	2209346	2209351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692021
43260	NC_015067	GCA	2	6	2209361	2209366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692021
43261	NC_015067	GCC	2	6	2209421	2209426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692021
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43264	NC_015067	CA	3	6	2209516	2209521	50 %	0 %	0 %	50 %	322692021
43265	NC_015067	GTCA	2	8	2209676	2209683	25 %	25 %	25 %	25 %	322692022
43266	NC_015067	TGT	2	6	2209700	2209705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692022
43267	NC_015067	CCGC	2	8	2209723	2209730	0 %	0 %	25 %	75 %	322692022
43268	NC_015067	CAG	2	6	2209734	2209739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692022
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43272	NC_015067	AGAATC	2	12	2209921	2209932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322692022
43273	NC_015067	CG	3	6	2209950	2209955	0 %	0 %	50 %	50 %	322692022
43274	NC_015067	CAG	2	6	2209965	2209970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692022
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43302	NC_015067	GC	3	6	2210972	2210977	0 %	0 %	50 %	50 %	322692022
43303	NC_015067	CGAGC	2	10	2211006	2211015	20 %	0 %	40 %	40 %	322692022
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43329	NC_015067	CCGG	2	8	2212216	2212223	0 %	0 %	50 %	50 %	322692023
43330	NC_015067	CCG	2	6	2212250	2212255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692023
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43335	NC_015067	CGG	3	9	2212598	2212606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692023
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43338	NC_015067	GC	3	6	2212675	2212680	0 %	0 %	50 %	50 %	322692023
43339	NC_015067	ATG	2	6	2212720	2212725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692023
43340	NC_015067	AGT	2	6	2212736	2212741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692023
43341	NC_015067	ACC	2	6	2212750	2212755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322692023
43342	NC_015067	CGG	2	6	2212790	2212795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692023
43343	NC_015067	AGGT	2	8	2212804	2212811	25 %	25 %	50 %	0 %	322692023
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43345	NC_015067	TCA	2	6	2212856	2212861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692023
43346	NC_015067	CAT	2	6	2212866	2212871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692023
43347	NC_015067	TTG	2	6	2212918	2212923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692023
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43460	NC_015067	CGG	3	9	2220303	2220311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692027
43461	NC_015067	GCA	2	6	2220333	2220338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43462	NC_015067	GCTG	2	8	2220452	2220459	0 %	25 %	50 %	25 %	322692027
43463	NC_015067	TGGCCT	2	12	2220552	2220563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43464	NC_015067	CGG	3	9	2220603	2220611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692027
43465	NC_015067	GTA	2	6	2220745	2220750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692027
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43468	NC_015067	CCT	2	6	2220894	2220899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322692027
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43473	NC_015067	GCT	2	6	2221186	2221191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692027
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43479	NC_015067	TGT	2	6	2221464	2221469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322692027
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43481	NC_015067	GC	3	6	2221659	2221664	0 %	0 %	50 %	50 %	322692027
43482	NC_015067	CCTT	2	8	2221739	2221746	0 %	50 %	0 %	50 %	322692027
43483	NC_015067	GCCTT	2	10	2221787	2221796	0 %	40 %	20 %	40 %	322692027
43484	NC_015067	GTA	2	6	2221807	2221812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322692027
43485	NC_015067	CGG	2	6	2221851	2221856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692027
43486	NC_015067	TCT	2	6	2221872	2221877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692027
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43488	NC_015067	GCT	2	6	2222199	2222204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43489	NC_015067	CTT	2	6	2222230	2222235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322692027
43490	NC_015067	GCA	2	6	2222357	2222362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322692027
43491	NC_015067	TGGA	2	8	2222393	2222400	25 %	25 %	50 %	0 %	322692027
43492	NC_015067	CGGG	2	8	2222411	2222418	0 %	0 %	75 %	25 %	322692027
43493	NC_015067	ATC	2	6	2222453	2222458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322692027
43494	NC_015067	GCTT	2	8	2222471	2222478	0 %	50 %	25 %	25 %	322692027
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