MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_015067	CAT	2	6	2169952	2169957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691994
42502	NC_015067	CGA	2	6	2169982	2169987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42503	NC_015067	GCA	2	6	2169994	2169999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42504	NC_015067	CCT	2	6	2170000	2170005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691994
42505	NC_015067	ACG	2	6	2170041	2170046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42506	NC_015067	CCG	2	6	2170153	2170158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691994
42507	NC_015067	CGA	2	6	2170180	2170185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42508	NC_015067	CTG	2	6	2170211	2170216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42509	NC_015067	CGG	2	6	2170228	2170233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691994
42510	NC_015067	GTC	2	6	2170478	2170483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42511	NC_015067	CGG	2	6	2170488	2170493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691994
42512	NC_015067	GGA	2	6	2170617	2170622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691994
42513	NC_015067	CCAT	2	8	2170662	2170669	25 %	25 %	0 %	50 %	322691994
42514	NC_015067	CAA	2	6	2170739	2170744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691994
42515	NC_015067	CGC	2	6	2170750	2170755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691994
42516	NC_015067	CAT	3	9	2170898	2170906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691994
42517	NC_015067	CAT	2	6	2171045	2171050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691995
42518	NC_015067	ACCGA	2	10	2171159	2171168	40 %	0 %	20 %	40 %	322691995
42519	NC_015067	CACG	2	8	2171175	2171182	25 %	0 %	25 %	50 %	322691995
42520	NC_015067	GAT	2	6	2171273	2171278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691996
42521	NC_015067	GC	3	6	2171339	2171344	0 %	0 %	50 %	50 %	322691996
42522	NC_015067	CCG	2	6	2171348	2171353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691996
42523	NC_015067	GCC	2	6	2171430	2171435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691996
42524	NC_015067	CGGA	2	8	2171459	2171466	25 %	0 %	50 %	25 %	322691996
42525	NC_015067	CAAA	2	8	2171471	2171478	75 %	0 %	0 %	25 %	322691996
42526	NC_015067	TCG	2	6	2171491	2171496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691996
42527	NC_015067	ACG	2	6	2171497	2171502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691996
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42529	NC_015067	CAT	2	6	2171525	2171530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691996
42530	NC_015067	CGG	2	6	2171564	2171569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691996
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42532	NC_015067	CG	4	8	2171627	2171634	0 %	0 %	50 %	50 %	322691996
42533	NC_015067	CGC	2	6	2171648	2171653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691996
42534	NC_015067	CGA	2	6	2171696	2171701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691996
42535	NC_015067	GCAACG	2	12	2171719	2171730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691996
42536	NC_015067	CGCA	2	8	2171753	2171760	25 %	0 %	25 %	50 %	322691996
42537	NC_015067	CAC	2	6	2171783	2171788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691996
42538	NC_015067	ACCAG	2	10	2171944	2171953	40 %	0 %	20 %	40 %	322691996
42539	NC_015067	CTA	2	6	2171960	2171965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691996
42540	NC_015067	GCG	2	6	2171971	2171976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691996
42541	NC_015067	GGCG	2	8	2171984	2171991	0 %	0 %	75 %	25 %	322691996
42542	NC_015067	GAA	2	6	2172008	2172013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691996
42543	NC_015067	GAT	2	6	2172014	2172019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691996
42544	NC_015067	CTG	2	6	2172087	2172092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691996
42545	NC_015067	ATG	2	6	2172174	2172179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691996
42546	NC_015067	CGG	2	6	2172197	2172202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691996
42547	NC_015067	TCA	2	6	2172205	2172210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691996
42548	NC_015067	TCG	2	6	2172226	2172231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691996
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42550	NC_015067	GGT	2	6	2172469	2172474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691997
42551	NC_015067	GCG	2	6	2172488	2172493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691997
42552	NC_015067	ACA	2	6	2172522	2172527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691997
42553	NC_015067	ACCG	2	8	2172533	2172540	25 %	0 %	25 %	50 %	322691997
42554	NC_015067	CGC	3	9	2172553	2172561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691997
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42557	NC_015067	CAT	2	6	2172721	2172726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691997
42558	NC_015067	CG	3	6	2172737	2172742	0 %	0 %	50 %	50 %	322691997
42559	NC_015067	CG	3	6	2172780	2172785	0 %	0 %	50 %	50 %	322691997
42560	NC_015067	AAC	3	9	2172824	2172832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691997
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42589	NC_015067	GTA	3	9	2174974	2174982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691998
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42591	NC_015067	GCT	2	6	2175001	2175006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691998
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42593	NC_015067	CAGAGC	2	12	2175045	2175056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691998
42594	NC_015067	CCGG	2	8	2175087	2175094	0 %	0 %	50 %	50 %	322691998
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42597	NC_015067	GCA	2	6	2175273	2175278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691998
42598	NC_015067	CG	3	6	2175294	2175299	0 %	0 %	50 %	50 %	322691998
42599	NC_015067	TCA	2	6	2175336	2175341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691998
42600	NC_015067	GGCC	2	8	2175413	2175420	0 %	0 %	50 %	50 %	322691999
42601	NC_015067	GGA	2	6	2175429	2175434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691999
42602	NC_015067	CGT	2	6	2175449	2175454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691999
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42607	NC_015067	GCT	2	6	2175621	2175626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691999
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42615	NC_015067	CTGG	2	8	2176002	2176009	0 %	25 %	50 %	25 %	322691999
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42731	NC_015067	CGG	2	6	2181476	2181481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692003
42732	NC_015067	GTC	2	6	2181492	2181497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692003
42733	NC_015067	CGG	2	6	2181530	2181535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322692003
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42955	NC_015067	GTCGGC	2	12	2192371	2192382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322692010
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42961	NC_015067	GCC	2	6	2192530	2192535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322692010
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42965	NC_015067	TCG	2	6	2192612	2192617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322692010
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