MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_015067	CCG	2	6	2140995	2141000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691971
42003	NC_015067	TGC	2	6	2141039	2141044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691971
42004	NC_015067	AGA	2	6	2141355	2141360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691972
42005	NC_015067	CCACGA	2	12	2141399	2141410	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322691972
42006	NC_015067	CAG	2	6	2141443	2141448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691972
42007	NC_015067	TGC	2	6	2141505	2141510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691972
42008	NC_015067	TAC	2	6	2141635	2141640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691972
42009	NC_015067	CAG	2	6	2141674	2141679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691972
42010	NC_015067	GCG	2	6	2141685	2141690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691972
42011	NC_015067	CATCA	2	10	2141716	2141725	40 %	20 %	0 %	40 %	322691972
42012	NC_015067	ACCGAT	2	12	2141746	2141757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322691972
42013	NC_015067	A	6	6	2141761	2141766	100 %	0 %	0 %	0 %	322691972
42014	NC_015067	AGGAT	2	10	2141777	2141786	40 %	20 %	40 %	0 %	322691972
42015	NC_015067	GCC	2	6	2141838	2141843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691972
42016	NC_015067	TAA	2	6	2141877	2141882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691972
42017	NC_015067	ACTG	2	8	2142035	2142042	25 %	25 %	25 %	25 %	322691972
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42020	NC_015067	AAT	2	6	2142138	2142143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691972
42021	NC_015067	CGAG	2	8	2142230	2142237	25 %	0 %	50 %	25 %	322691972
42022	NC_015067	GAG	2	6	2142384	2142389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691972
42023	NC_015067	AT	3	6	2142508	2142513	50 %	50 %	0 %	0 %	322691972
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42032	NC_015067	CTTGGC	2	12	2143253	2143264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691973
42033	NC_015067	GTA	2	6	2143310	2143315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691973
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42050	NC_015067	CGGC	2	8	2143783	2143790	0 %	0 %	50 %	50 %	322691973
42051	NC_015067	GGTC	2	8	2143801	2143808	0 %	25 %	50 %	25 %	322691973
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42053	NC_015067	GCGG	2	8	2143852	2143859	0 %	0 %	75 %	25 %	322691973
42054	NC_015067	CGCC	2	8	2143915	2143922	0 %	0 %	25 %	75 %	322691973
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42063	NC_015067	TGC	2	6	2144313	2144318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691973
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42106	NC_015067	GC	3	6	2147037	2147042	0 %	0 %	50 %	50 %	322691976
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42115	NC_015067	CAT	2	6	2147487	2147492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691976
42116	NC_015067	ATG	2	6	2147499	2147504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691976
42117	NC_015067	TGGATT	2	12	2147523	2147534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322691976
42118	NC_015067	CCTTC	2	10	2147635	2147644	0 %	40 %	0 %	60 %	322691976
42119	NC_015067	CAAT	2	8	2147662	2147669	50 %	25 %	0 %	25 %	322691976
42120	NC_015067	CGA	2	6	2147717	2147722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691976
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42123	NC_015067	AAT	2	6	2147883	2147888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691976
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42126	NC_015067	TTG	2	6	2148064	2148069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691976
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42186	NC_015067	GA	3	6	2150961	2150966	50 %	0 %	50 %	0 %	322691979
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42218	NC_015067	GAT	2	6	2152628	2152633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691980
42219	NC_015067	TGA	2	6	2152666	2152671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691980
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42221	NC_015067	ACT	2	6	2152760	2152765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691981
42222	NC_015067	TCA	2	6	2152884	2152889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691981
42223	NC_015067	TCA	2	6	2152954	2152959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691981
42224	NC_015067	TTC	2	6	2152967	2152972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691981
42225	NC_015067	TCG	2	6	2152977	2152982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691981
42226	NC_015067	ACG	2	6	2153187	2153192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691981
42227	NC_015067	TCG	2	6	2153196	2153201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691981
42228	NC_015067	GAA	2	6	2153239	2153244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691981
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42230	NC_015067	TTCTCG	2	12	2153307	2153318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322691981
42231	NC_015067	CGA	2	6	2153338	2153343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691981
42232	NC_015067	CTT	2	6	2153368	2153373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691981
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42342	NC_015067	GC	4	8	2161293	2161300	0 %	0 %	50 %	50 %	322691988
42343	NC_015067	CGCC	2	8	2161320	2161327	0 %	0 %	25 %	75 %	322691988
42344	NC_015067	CGCC	2	8	2161398	2161405	0 %	0 %	25 %	75 %	322691988
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42348	NC_015067	GTA	2	6	2161615	2161620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691988
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42460	NC_015067	CGCC	2	8	2167946	2167953	0 %	0 %	25 %	75 %	322691993
42461	NC_015067	GCA	2	6	2167958	2167963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691993
42462	NC_015067	CAC	2	6	2167968	2167973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691993
42463	NC_015067	GAT	2	6	2168118	2168123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691993
42464	NC_015067	TTC	2	6	2168143	2168148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691993
42465	NC_015067	CTG	2	6	2168205	2168210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691993
42466	NC_015067	GTT	2	6	2168220	2168225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691993
42467	NC_015067	GC	3	6	2168226	2168231	0 %	0 %	50 %	50 %	322691993
42468	NC_015067	GAA	2	6	2168235	2168240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691993
42469	NC_015067	CG	4	8	2168322	2168329	0 %	0 %	50 %	50 %	322691993
42470	NC_015067	GAG	2	6	2168335	2168340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691993
42471	NC_015067	CCG	2	6	2168356	2168361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691993
42472	NC_015067	GCT	2	6	2168441	2168446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691993
42473	NC_015067	ACC	2	6	2168542	2168547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691993
42474	NC_015067	CGG	2	6	2168567	2168572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691993
42475	NC_015067	GC	3	6	2168694	2168699	0 %	0 %	50 %	50 %	322691993
42476	NC_015067	TCCG	2	8	2168712	2168719	0 %	25 %	25 %	50 %	322691993
42477	NC_015067	GGC	2	6	2168721	2168726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691993
42478	NC_015067	CGGAC	2	10	2168750	2168759	20 %	0 %	40 %	40 %	322691993
42479	NC_015067	CGCGTC	2	12	2168766	2168777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322691993
42480	NC_015067	GC	3	6	2168795	2168800	0 %	0 %	50 %	50 %	322691993
42481	NC_015067	CATCGC	2	12	2168829	2168840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322691993
42482	NC_015067	GACG	2	8	2168844	2168851	25 %	0 %	50 %	25 %	322691993
42483	NC_015067	CGC	2	6	2168856	2168861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691993
42484	NC_015067	GCACGC	2	12	2168893	2168904	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322691993
42485	NC_015067	ACGC	2	8	2168906	2168913	25 %	0 %	25 %	50 %	322691993
42486	NC_015067	CTT	2	6	2168955	2168960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691993
42487	NC_015067	CCA	2	6	2168963	2168968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691993
42488	NC_015067	GCG	3	9	2169223	2169231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691994
42489	NC_015067	CGT	2	6	2169281	2169286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42490	NC_015067	CCG	2	6	2169340	2169345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691994
42491	NC_015067	CTC	2	6	2169404	2169409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691994
42492	NC_015067	GTC	2	6	2169500	2169505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42493	NC_015067	CAA	2	6	2169563	2169568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691994
42494	NC_015067	CTG	2	6	2169635	2169640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42495	NC_015067	CAT	2	6	2169772	2169777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691994
42496	NC_015067	TGA	2	6	2169798	2169803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691994
42497	NC_015067	AGC	2	6	2169804	2169809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42498	NC_015067	GCA	2	6	2169830	2169835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691994
42499	NC_015067	CGC	2	6	2169841	2169846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691994
42500	NC_015067	ACCCC	2	10	2169867	2169876	20 %	0 %	0 %	80 %	322691994

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