MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015067	CGC	2	6	2115603	2115608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691953
41502	NC_015067	CCA	2	6	2115668	2115673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691953
41503	NC_015067	CTG	2	6	2115691	2115696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691953
41504	NC_015067	CCG	2	6	2115752	2115757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691953
41505	NC_015067	TC	3	6	2115771	2115776	0 %	50 %	0 %	50 %	322691953
41506	NC_015067	CGC	2	6	2115780	2115785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691953
41507	NC_015067	CGC	2	6	2115814	2115819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691953
41508	NC_015067	CAC	3	9	2115876	2115884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691953
41509	NC_015067	GGC	2	6	2115934	2115939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691953
41510	NC_015067	GGC	3	9	2116095	2116103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691953
41511	NC_015067	CGGC	2	8	2116421	2116428	0 %	0 %	50 %	50 %	322691954
41512	NC_015067	CGC	2	6	2116436	2116441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691954
41513	NC_015067	CAC	2	6	2116517	2116522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691954
41514	NC_015067	CA	3	6	2116535	2116540	50 %	0 %	0 %	50 %	322691954
41515	NC_015067	AGC	2	6	2116765	2116770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691954
41516	NC_015067	TCA	2	6	2116820	2116825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691954
41517	NC_015067	GGCG	2	8	2116856	2116863	0 %	0 %	75 %	25 %	322691954
41518	NC_015067	TCC	2	6	2116888	2116893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691954
41519	NC_015067	GACCGG	2	12	2116943	2116954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322691954
41520	NC_015067	GGC	2	6	2116965	2116970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691954
41521	NC_015067	GC	3	6	2116969	2116974	0 %	0 %	50 %	50 %	322691954
41522	NC_015067	CCG	2	6	2117108	2117113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691954
41523	NC_015067	GC	3	6	2117161	2117166	0 %	0 %	50 %	50 %	322691954
41524	NC_015067	GGC	2	6	2117211	2117216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691954
41525	NC_015067	GTG	2	6	2117218	2117223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691954
41526	NC_015067	AGC	2	6	2117236	2117241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691954
41527	NC_015067	AGGA	2	8	2117284	2117291	50 %	0 %	50 %	0 %	322691954
41528	NC_015067	TGG	2	6	2117309	2117314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691954
41529	NC_015067	CGG	2	6	2117318	2117323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691954
41530	NC_015067	CGT	2	6	2117408	2117413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691954
41531	NC_015067	AAT	2	6	2117921	2117926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691955
41532	NC_015067	TTCT	2	8	2117986	2117993	0 %	75 %	0 %	25 %	322691955
41533	NC_015067	GC	3	6	2118045	2118050	0 %	0 %	50 %	50 %	322691955
41534	NC_015067	GGC	2	6	2118062	2118067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691955
41535	NC_015067	GTC	2	6	2118071	2118076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691955
41536	NC_015067	TGC	2	6	2118081	2118086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691955
41537	NC_015067	TCG	2	6	2118102	2118107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691955
41538	NC_015067	TCA	2	6	2118115	2118120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691955
41539	NC_015067	CGC	2	6	2118166	2118171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691955
41540	NC_015067	TCC	2	6	2118222	2118227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691955
41541	NC_015067	AGA	2	6	2118304	2118309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691955
41542	NC_015067	GAG	2	6	2118381	2118386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691955
41543	NC_015067	TTG	2	6	2118444	2118449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691955
41544	NC_015067	GCG	2	6	2118563	2118568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691955
41545	NC_015067	CACGCC	2	12	2118575	2118586	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322691955
41546	NC_015067	GTG	2	6	2118594	2118599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691955
41547	NC_015067	CGG	2	6	2118701	2118706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691956
41548	NC_015067	TGGCGG	2	12	2118728	2118739	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322691956
41549	NC_015067	CGGC	2	8	2118746	2118753	0 %	0 %	50 %	50 %	322691956
41550	NC_015067	TGCG	2	8	2118763	2118770	0 %	25 %	50 %	25 %	322691956
41551	NC_015067	GGC	2	6	2118785	2118790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691956
41552	NC_015067	AGC	2	6	2118869	2118874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691956
41553	NC_015067	CCTT	2	8	2118922	2118929	0 %	50 %	0 %	50 %	322691956
41554	NC_015067	ACGC	2	8	2118942	2118949	25 %	0 %	25 %	50 %	322691956
41555	NC_015067	GAG	2	6	2118952	2118957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691956
41556	NC_015067	CAC	2	6	2118963	2118968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691956
41557	NC_015067	CGG	2	6	2119016	2119021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691956
41558	NC_015067	TCG	2	6	2119033	2119038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691956
41559	NC_015067	ATGT	2	8	2119117	2119124	25 %	50 %	25 %	0 %	322691956
41560	NC_015067	CGG	3	9	2119136	2119144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691956
41561	NC_015067	TGG	2	6	2119151	2119156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691956
41562	NC_015067	CGG	3	9	2119184	2119192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691956
41563	NC_015067	TGG	2	6	2119247	2119252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691956
41564	NC_015067	CCA	2	6	2119262	2119267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691956
41565	NC_015067	CAC	2	6	2119478	2119483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691956
41566	NC_015067	GCC	3	9	2119506	2119514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691956
41567	NC_015067	GAT	2	6	2119530	2119535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691956
41568	NC_015067	ATG	2	6	2119543	2119548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691956
41569	NC_015067	CGTTGA	2	12	2119580	2119591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322691956
41570	NC_015067	TG	3	6	2119627	2119632	0 %	50 %	50 %	0 %	322691956
41571	NC_015067	TGCCGA	2	12	2119658	2119669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322691956
41572	NC_015067	GC	3	6	2119676	2119681	0 %	0 %	50 %	50 %	322691956
41573	NC_015067	TTC	2	6	2119828	2119833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691956
41574	NC_015067	GTC	2	6	2119840	2119845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691956
41575	NC_015067	CGAT	2	8	2119879	2119886	25 %	25 %	25 %	25 %	322691956
41576	NC_015067	CGGC	2	8	2119948	2119955	0 %	0 %	50 %	50 %	322691956
41577	NC_015067	CATG	2	8	2119994	2120001	25 %	25 %	25 %	25 %	322691956
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41582	NC_015067	ACC	2	6	2120453	2120458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691957
41583	NC_015067	GCC	2	6	2120564	2120569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41584	NC_015067	CGAC	2	8	2120582	2120589	25 %	0 %	25 %	50 %	322691957
41585	NC_015067	GCC	2	6	2120684	2120689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
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41587	NC_015067	CTG	2	6	2120708	2120713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691957
41588	NC_015067	CCG	3	9	2120715	2120723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41589	NC_015067	CCG	2	6	2120776	2120781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41590	NC_015067	CGC	2	6	2120806	2120811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41591	NC_015067	ATTCC	2	10	2120838	2120847	20 %	40 %	0 %	40 %	322691957
41592	NC_015067	GGTG	2	8	2120848	2120855	0 %	25 %	75 %	0 %	322691957
41593	NC_015067	CCG	2	6	2120880	2120885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
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41598	NC_015067	GAAC	2	8	2121001	2121008	50 %	0 %	25 %	25 %	322691957
41599	NC_015067	CGC	2	6	2121067	2121072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41600	NC_015067	GCC	2	6	2121107	2121112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41601	NC_015067	CGC	2	6	2121119	2121124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41602	NC_015067	GCC	2	6	2121143	2121148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691957
41603	NC_015067	GCA	2	6	2121401	2121406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691958
41604	NC_015067	ATC	2	6	2121408	2121413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691958
41605	NC_015067	CCCTCG	2	12	2121415	2121426	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	322691958
41606	NC_015067	CCA	2	6	2121482	2121487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691958
41607	NC_015067	CGTA	2	8	2121581	2121588	25 %	25 %	25 %	25 %	322691958
41608	NC_015067	CGA	2	6	2121638	2121643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691958
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41610	NC_015067	ACG	2	6	2121670	2121675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691958
41611	NC_015067	GCA	2	6	2121692	2121697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691958
41612	NC_015067	CCG	2	6	2121748	2121753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691958
41613	NC_015067	GTA	2	6	2121780	2121785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691958
41614	NC_015067	CGC	2	6	2121822	2121827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691958
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41616	NC_015067	GCC	3	9	2121960	2121968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691958
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41732	NC_015067	GCGAT	2	10	2128062	2128071	20 %	20 %	40 %	20 %	322691962
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