MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015067	CTC	2	6	2094246	2094251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691938
41002	NC_015067	CGG	2	6	2094314	2094319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41003	NC_015067	GGC	2	6	2094344	2094349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41004	NC_015067	ATC	2	6	2094396	2094401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41005	NC_015067	CGG	2	6	2094434	2094439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41006	NC_015067	CGG	2	6	2094476	2094481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41007	NC_015067	GTC	2	6	2094504	2094509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41008	NC_015067	CGG	3	9	2094511	2094519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41009	NC_015067	CGT	2	6	2094533	2094538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41010	NC_015067	CAT	2	6	2094539	2094544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41011	NC_015067	GCG	2	6	2094558	2094563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41012	NC_015067	GCGAC	2	10	2094567	2094576	20 %	0 %	40 %	40 %	322691938
41013	NC_015067	TCG	3	9	2094583	2094591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41014	NC_015067	TCA	2	6	2094601	2094606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41015	NC_015067	GCG	2	6	2094637	2094642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41016	NC_015067	ACG	2	6	2094786	2094791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41017	NC_015067	TCA	3	9	2094811	2094819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41018	NC_015067	TCCATA	2	12	2094820	2094831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41019	NC_015067	TCA	2	6	2094874	2094879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41020	NC_015067	TCG	2	6	2094880	2094885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41021	NC_015067	GCG	3	9	2094903	2094911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41022	NC_015067	TCG	2	6	2094925	2094930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41023	NC_015067	ATCGTC	2	12	2094933	2094944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322691938
41024	NC_015067	CGG	3	9	2094955	2094963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41025	NC_015067	CGTCAT	2	12	2094974	2094985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322691938
41026	NC_015067	ATC	2	6	2094990	2094995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41027	NC_015067	GCG	2	6	2095008	2095013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41028	NC_015067	ACG	2	6	2095017	2095022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41029	NC_015067	ATC	2	6	2095029	2095034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691938
41030	NC_015067	GCG	2	6	2095063	2095068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41031	NC_015067	CGG	3	9	2095078	2095086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41032	NC_015067	CGG	2	6	2095097	2095102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41033	NC_015067	GCA	2	6	2095240	2095245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41034	NC_015067	CGG	2	6	2095264	2095269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41035	NC_015067	ACG	3	9	2095275	2095283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41036	NC_015067	CGG	2	6	2095295	2095300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41037	NC_015067	GGC	3	9	2095308	2095316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41038	NC_015067	CGT	2	6	2095376	2095381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691938
41039	NC_015067	CTC	2	6	2095417	2095422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691938
41040	NC_015067	GCG	2	6	2095423	2095428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691938
41041	NC_015067	CCAG	2	8	2095754	2095761	25 %	0 %	25 %	50 %	322691939
41042	NC_015067	TCG	2	6	2095810	2095815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691939
41043	NC_015067	CAG	2	6	2095827	2095832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691939
41044	NC_015067	GA	3	6	2095874	2095879	50 %	0 %	50 %	0 %	322691939
41045	NC_015067	GC	3	6	2095983	2095988	0 %	0 %	50 %	50 %	322691939
41046	NC_015067	CGC	2	6	2096033	2096038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691939
41047	NC_015067	CAT	2	6	2096088	2096093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691939
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41049	NC_015067	GCC	2	6	2096284	2096289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691939
41050	NC_015067	CCAT	2	8	2096309	2096316	25 %	25 %	0 %	50 %	322691939
41051	NC_015067	ACG	2	6	2096350	2096355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691939
41052	NC_015067	TGG	2	6	2096399	2096404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691939
41053	NC_015067	GAT	2	6	2096412	2096417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691939
41054	NC_015067	CGA	2	6	2096453	2096458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691939
41055	NC_015067	CGA	2	6	2096483	2096488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691939
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41058	NC_015067	GGC	2	6	2096562	2096567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691939
41059	NC_015067	TTC	2	6	2096655	2096660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691939
41060	NC_015067	TGG	2	6	2096694	2096699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691939
41061	NC_015067	CGGCT	2	10	2096749	2096758	0 %	20 %	40 %	40 %	322691939
41062	NC_015067	CCA	2	6	2096777	2096782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691939
41063	NC_015067	CGG	2	6	2096797	2096802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691939
41064	NC_015067	AAGG	2	8	2096826	2096833	50 %	0 %	50 %	0 %	322691939
41065	NC_015067	TCG	2	6	2096842	2096847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691939
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41067	NC_015067	TGCGG	2	10	2096928	2096937	0 %	20 %	60 %	20 %	322691939
41068	NC_015067	TTCAA	2	10	2096938	2096947	40 %	40 %	0 %	20 %	322691939
41069	NC_015067	CGG	2	6	2097147	2097152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691940
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41071	NC_015067	TC	3	6	2097222	2097227	0 %	50 %	0 %	50 %	322691940
41072	NC_015067	TTC	2	6	2097274	2097279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691940
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41074	NC_015067	GTG	2	6	2097298	2097303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691940
41075	NC_015067	TTC	2	6	2097325	2097330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691940
41076	NC_015067	CCA	2	6	2097350	2097355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691940
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41080	NC_015067	GCT	2	6	2097561	2097566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691940
41081	NC_015067	GCT	2	6	2097576	2097581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691940
41082	NC_015067	CAG	2	6	2097730	2097735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691940
41083	NC_015067	CAT	3	9	2097780	2097788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691940
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41085	NC_015067	CG	4	8	2097930	2097937	0 %	0 %	50 %	50 %	322691940
41086	NC_015067	TGA	2	6	2097947	2097952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691940
41087	NC_015067	ATC	2	6	2097982	2097987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691940
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41089	NC_015067	CTG	2	6	2097994	2097999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691940
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41093	NC_015067	GAA	2	6	2098283	2098288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691941
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41096	NC_015067	GCC	2	6	2098355	2098360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691941
41097	NC_015067	CAC	2	6	2098370	2098375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691941
41098	NC_015067	GCG	2	6	2098524	2098529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691941
41099	NC_015067	GCC	2	6	2098547	2098552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691941
41100	NC_015067	CGG	2	6	2098606	2098611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691941
41101	NC_015067	GAA	2	6	2098619	2098624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691941
41102	NC_015067	GC	3	6	2098689	2098694	0 %	0 %	50 %	50 %	322691941
41103	NC_015067	ATC	2	6	2098725	2098730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691941
41104	NC_015067	CTTGGC	3	18	2098751	2098768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691941
41105	NC_015067	ACC	2	6	2098779	2098784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691941
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41107	NC_015067	GAT	2	6	2098832	2098837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691941
41108	NC_015067	GGCC	2	8	2098858	2098865	0 %	0 %	50 %	50 %	322691941
41109	NC_015067	GCA	2	6	2098870	2098875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691941
41110	NC_015067	GCC	2	6	2098902	2098907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691941
41111	NC_015067	ACC	2	6	2098914	2098919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691941
41112	NC_015067	GCGGTG	2	12	2098953	2098964	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322691941
41113	NC_015067	CGA	2	6	2099015	2099020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691941
41114	NC_015067	CGCC	2	8	2099041	2099048	0 %	0 %	25 %	75 %	322691941
41115	NC_015067	CCAGCG	2	12	2099059	2099070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322691941
41116	NC_015067	GCT	2	6	2099101	2099106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691941
41117	NC_015067	GC	3	6	2099167	2099172	0 %	0 %	50 %	50 %	322691941
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41144	NC_015067	GC	3	6	2099928	2099933	0 %	0 %	50 %	50 %	322691942
41145	NC_015067	TCG	2	6	2099942	2099947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691942
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41149	NC_015067	GC	4	8	2100042	2100049	0 %	0 %	50 %	50 %	322691942
41150	NC_015067	GCGGT	2	10	2100089	2100098	0 %	20 %	60 %	20 %	322691942
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41219	NC_015067	CGG	2	6	2103369	2103374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691944
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41460	NC_015067	GCT	2	6	2113557	2113562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691952
41461	NC_015067	CGTC	2	8	2113590	2113597	0 %	25 %	25 %	50 %	322691952
41462	NC_015067	CCCG	2	8	2113621	2113628	0 %	0 %	25 %	75 %	322691952
41463	NC_015067	GCC	2	6	2113669	2113674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691952
41464	NC_015067	ATC	2	6	2113703	2113708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691952
41465	NC_015067	CGTG	2	8	2113743	2113750	0 %	25 %	50 %	25 %	322691952
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41470	NC_015067	GCC	2	6	2113964	2113969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691952
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41475	NC_015067	TTC	2	6	2114432	2114437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691952
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41481	NC_015067	TGGG	2	8	2114905	2114912	0 %	25 %	75 %	0 %	322691953
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41488	NC_015067	CCG	2	6	2115127	2115132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691953
41489	NC_015067	TGC	2	6	2115158	2115163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691953
41490	NC_015067	CGCCAT	2	12	2115183	2115194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322691953
41491	NC_015067	GTG	2	6	2115226	2115231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691953
41492	NC_015067	TCGGG	2	10	2115233	2115242	0 %	20 %	60 %	20 %	322691953
41493	NC_015067	AAT	2	6	2115328	2115333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691953
41494	NC_015067	GGC	2	6	2115360	2115365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691953
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41500	NC_015067	CGA	2	6	2115567	2115572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691953

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