MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_015067	AGC	2	6	1939063	1939068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691815
38003	NC_015067	CTTC	2	8	1939134	1939141	0 %	50 %	0 %	50 %	322691815
38004	NC_015067	TTC	2	6	1939154	1939159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691815
38005	NC_015067	CACGGC	2	12	1939162	1939173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322691815
38006	NC_015067	ACC	2	6	1939177	1939182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691815
38007	NC_015067	GGA	2	6	1939261	1939266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691815
38008	NC_015067	GCG	2	6	1939292	1939297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
38009	NC_015067	GATG	2	8	1939327	1939334	25 %	25 %	50 %	0 %	322691815
38010	NC_015067	TGG	3	9	1939362	1939370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691815
38011	NC_015067	AGC	2	6	1939385	1939390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691815
38012	NC_015067	GAC	2	6	1939438	1939443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691815
38013	NC_015067	ACCA	2	8	1939467	1939474	50 %	0 %	0 %	50 %	322691815
38014	NC_015067	GCCA	2	8	1939483	1939490	25 %	0 %	25 %	50 %	322691815
38015	NC_015067	TCA	2	6	1939514	1939519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691815
38016	NC_015067	ATG	2	6	1939532	1939537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691815
38017	NC_015067	GCG	2	6	1939547	1939552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
38018	NC_015067	GCG	2	6	1939568	1939573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
38019	NC_015067	CGG	2	6	1939584	1939589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691815
38020	NC_015067	TTG	2	6	1939631	1939636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691815
38021	NC_015067	GCC	2	6	1939684	1939689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691815
38022	NC_015067	GCA	2	6	1939761	1939766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691815
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38024	NC_015067	TGG	2	6	1939887	1939892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691815
38025	NC_015067	TGC	2	6	1939913	1939918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691815
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38027	NC_015067	GGT	2	6	1940014	1940019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691815
38028	NC_015067	CCCATT	2	12	1940060	1940071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322691815
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38034	NC_015067	GC	3	6	1941175	1941180	0 %	0 %	50 %	50 %	322691817
38035	NC_015067	CTG	2	6	1941213	1941218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691817
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38045	NC_015067	GTGCTC	2	12	1941510	1941521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691817
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38050	NC_015067	AGG	2	6	1941635	1941640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691817
38051	NC_015067	TCTCGT	2	12	1941683	1941694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322691817
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38054	NC_015067	CGC	2	6	1941947	1941952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691817
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38099	NC_015067	GCG	2	6	1943953	1943958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691819
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38102	NC_015067	TGA	2	6	1944053	1944058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691819
38103	NC_015067	CGTATA	2	12	1944147	1944158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322691819
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38105	NC_015067	GGTA	2	8	1944323	1944330	25 %	25 %	50 %	0 %	322691819
38106	NC_015067	GCCGC	2	10	1944339	1944348	0 %	0 %	40 %	60 %	322691819
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38226	NC_015067	ACG	2	6	1950063	1950068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691822
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38230	NC_015067	CGG	2	6	1950262	1950267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691822
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38337	NC_015067	CCGT	2	8	1956153	1956160	0 %	25 %	25 %	50 %	322691826
38338	NC_015067	CG	3	6	1956218	1956223	0 %	0 %	50 %	50 %	322691826
38339	NC_015067	GGC	2	6	1956249	1956254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691826
38340	NC_015067	TGGAT	2	10	1956255	1956264	20 %	40 %	40 %	0 %	322691826
38341	NC_015067	GCG	2	6	1956315	1956320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691826
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38459	NC_015067	CAC	2	6	1962602	1962607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691832
38460	NC_015067	CAT	2	6	1962616	1962621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691832
38461	NC_015067	CCA	2	6	1962637	1962642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691832
38462	NC_015067	TGA	2	6	1962660	1962665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691832
38463	NC_015067	CAC	2	6	1962698	1962703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691832
38464	NC_015067	CTT	2	6	1962707	1962712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691832
38465	NC_015067	TGA	2	6	1962910	1962915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691833
38466	NC_015067	CGC	2	6	1962936	1962941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691833
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38470	NC_015067	CCT	2	6	1963025	1963030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691833
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38474	NC_015067	TCT	2	6	1963193	1963198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691833
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38476	NC_015067	GC	3	6	1963361	1963366	0 %	0 %	50 %	50 %	322691833
38477	NC_015067	CGGG	2	8	1963521	1963528	0 %	0 %	75 %	25 %	322691833
38478	NC_015067	TGG	2	6	1963637	1963642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691833
38479	NC_015067	CGC	2	6	1963697	1963702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691833
38480	NC_015067	TCAG	2	8	1963714	1963721	25 %	25 %	25 %	25 %	322691833
38481	NC_015067	AGCGGG	2	12	1963742	1963753	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	322691833
38482	NC_015067	TCG	2	6	1963786	1963791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691833
38483	NC_015067	GTG	2	6	1963795	1963800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691833
38484	NC_015067	GTGGC	2	10	1963867	1963876	0 %	20 %	60 %	20 %	322691833
38485	NC_015067	GACC	2	8	1963928	1963935	25 %	0 %	25 %	50 %	322691833
38486	NC_015067	CGCGC	2	10	1963950	1963959	0 %	0 %	40 %	60 %	322691833
38487	NC_015067	CGG	2	6	1963961	1963966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691833
38488	NC_015067	GAT	2	6	1964004	1964009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691833
38489	NC_015067	ACT	2	6	1964040	1964045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691834
38490	NC_015067	GTC	2	6	1964056	1964061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691834
38491	NC_015067	GTC	2	6	1964068	1964073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691834
38492	NC_015067	TCG	2	6	1964081	1964086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691834
38493	NC_015067	TTC	2	6	1964146	1964151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691834
38494	NC_015067	CTT	2	6	1964158	1964163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691834
38495	NC_015067	CCA	2	6	1964262	1964267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691834
38496	NC_015067	CTG	2	6	1964302	1964307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691834
38497	NC_015067	GC	3	6	1964309	1964314	0 %	0 %	50 %	50 %	322691834
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