MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_015067	ATCC	2	8	1611812	1611819	25 %	25 %	0 %	50 %	322691548
31503	NC_015067	ATC	2	6	1611876	1611881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691548
31504	NC_015067	CGG	2	6	1611974	1611979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691548
31505	NC_015067	GT	3	6	1612035	1612040	0 %	50 %	50 %	0 %	322691548
31506	NC_015067	ATTCG	2	10	1612201	1612210	20 %	40 %	20 %	20 %	322691549
31507	NC_015067	GCCG	2	8	1612255	1612262	0 %	0 %	50 %	50 %	322691549
31508	NC_015067	CCG	2	6	1612410	1612415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691549
31509	NC_015067	ATC	2	6	1612451	1612456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691549
31510	NC_015067	GTG	2	6	1612491	1612496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691549
31511	NC_015067	CAT	2	6	1612514	1612519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691549
31512	NC_015067	GGC	2	6	1612540	1612545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691549
31513	NC_015067	TCGAT	2	10	1612591	1612600	20 %	40 %	20 %	20 %	322691549
31514	NC_015067	CAA	2	6	1612603	1612608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691549
31515	NC_015067	TGG	2	6	1612638	1612643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691549
31516	NC_015067	GGC	2	6	1612659	1612664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691549
31517	NC_015067	GGT	2	6	1612738	1612743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691549
31518	NC_015067	ACT	2	6	1612776	1612781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691549
31519	NC_015067	GCT	2	6	1612789	1612794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691549
31520	NC_015067	GCT	2	6	1612805	1612810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691549
31521	NC_015067	GTG	2	6	1612850	1612855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691549
31522	NC_015067	CGG	2	6	1612894	1612899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691549
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31524	NC_015067	GAT	2	6	1613112	1613117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691550
31525	NC_015067	CGG	3	9	1613124	1613132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691550
31526	NC_015067	CG	3	6	1613137	1613142	0 %	0 %	50 %	50 %	322691550
31527	NC_015067	GGA	2	6	1613175	1613180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691550
31528	NC_015067	CCG	2	6	1613213	1613218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691550
31529	NC_015067	TCAT	2	8	1613236	1613243	25 %	50 %	0 %	25 %	322691550
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31532	NC_015067	CG	3	6	1613486	1613491	0 %	0 %	50 %	50 %	322691550
31533	NC_015067	TGA	2	6	1613499	1613504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691550
31534	NC_015067	CAT	2	6	1613511	1613516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691550
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31537	NC_015067	GGC	2	6	1613584	1613589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691550
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31539	NC_015067	GGA	2	6	1613622	1613627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691550
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31550	NC_015067	GTT	2	6	1614109	1614114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691551
31551	NC_015067	AGCG	2	8	1614125	1614132	25 %	0 %	50 %	25 %	322691551
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31554	NC_015067	CGT	2	6	1614174	1614179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691551
31555	NC_015067	CGA	2	6	1614219	1614224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691551
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31564	NC_015067	CCGG	2	8	1614581	1614588	0 %	0 %	50 %	50 %	322691551
31565	NC_015067	GTA	2	6	1614601	1614606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691551
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31589	NC_015067	GA	3	6	1616161	1616166	50 %	0 %	50 %	0 %	322691555
31590	NC_015067	CA	3	6	1616173	1616178	50 %	0 %	0 %	50 %	322691555
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31601	NC_015067	CGAT	2	8	1616998	1617005	25 %	25 %	25 %	25 %	322691557
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31603	NC_015067	GTT	2	6	1617216	1617221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691557
31604	NC_015067	CAG	2	6	1617363	1617368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691557
31605	NC_015067	TGGCAT	2	12	1617380	1617391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322691557
31606	NC_015067	CTG	2	6	1617396	1617401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691557
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31608	NC_015067	AC	3	6	1617467	1617472	50 %	0 %	0 %	50 %	322691557
31609	NC_015067	ACC	2	6	1617529	1617534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691557
31610	NC_015067	TGG	2	6	1617572	1617577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691557
31611	NC_015067	CAC	2	6	1617588	1617593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691557
31612	NC_015067	AAGC	2	8	1617605	1617612	50 %	0 %	25 %	25 %	322691557
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31961	NC_015067	CGC	2	6	1634722	1634727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691572
31962	NC_015067	CGC	2	6	1634758	1634763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691572
31963	NC_015067	CTG	2	6	1634771	1634776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691572
31964	NC_015067	CCG	2	6	1634820	1634825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691572
31965	NC_015067	CCGC	2	8	1634836	1634843	0 %	0 %	25 %	75 %	322691572
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31980	NC_015067	GGT	2	6	1635834	1635839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691574
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31982	NC_015067	GTA	2	6	1635940	1635945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691574
31983	NC_015067	GCC	2	6	1636015	1636020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691574
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31985	NC_015067	GTG	2	6	1636091	1636096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691574
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31989	NC_015067	ATG	2	6	1636520	1636525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691575
31990	NC_015067	TG	3	6	1636538	1636543	0 %	50 %	50 %	0 %	322691575
31991	NC_015067	CTT	2	6	1636585	1636590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691575
31992	NC_015067	CGT	2	6	1636599	1636604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691575
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31994	NC_015067	AGC	2	6	1636727	1636732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691575
31995	NC_015067	GCG	2	6	1636746	1636751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691575
31996	NC_015067	TGC	2	6	1636772	1636777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691575
31997	NC_015067	ACC	2	6	1636813	1636818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691575
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31999	NC_015067	CTC	2	6	1636837	1636842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691575
32000	NC_015067	CAGC	2	8	1636863	1636870	25 %	0 %	25 %	50 %	322691575

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