MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_015067	TCA	2	6	1557378	1557383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691505
30502	NC_015067	ATC	2	6	1557639	1557644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691505
30503	NC_015067	TGC	2	6	1557669	1557674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691505
30504	NC_015067	TCA	2	6	1557708	1557713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691505
30505	NC_015067	CAC	2	6	1557799	1557804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691505
30506	NC_015067	TCA	2	6	1557907	1557912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691505
30507	NC_015067	TGG	2	6	1557913	1557918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691505
30508	NC_015067	CAT	2	6	1557931	1557936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691505
30509	NC_015067	TGT	2	6	1557952	1557957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691505
30510	NC_015067	CG	3	6	1557975	1557980	0 %	0 %	50 %	50 %	322691505
30511	NC_015067	TTC	2	6	1558047	1558052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691505
30512	NC_015067	CAT	2	6	1558057	1558062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691505
30513	NC_015067	TGG	2	6	1558200	1558205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691505
30514	NC_015067	GTC	2	6	1558238	1558243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691505
30515	NC_015067	CTGCGG	2	12	1558360	1558371	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322691505
30516	NC_015067	TAA	2	6	1558384	1558389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691505
30517	NC_015067	GGAT	2	8	1558402	1558409	25 %	25 %	50 %	0 %	322691505
30518	NC_015067	CAG	2	6	1558445	1558450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691505
30519	NC_015067	TGA	2	6	1558498	1558503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691505
30520	NC_015067	GA	3	6	1558536	1558541	50 %	0 %	50 %	0 %	322691505
30521	NC_015067	TGCCT	2	10	1558588	1558597	0 %	40 %	20 %	40 %	322691505
30522	NC_015067	TAT	2	6	1558608	1558613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322691506
30523	NC_015067	CTT	2	6	1558629	1558634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691506
30524	NC_015067	CTG	2	6	1558653	1558658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691506
30525	NC_015067	ATG	2	6	1558700	1558705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691506
30526	NC_015067	GGCA	2	8	1558794	1558801	25 %	0 %	50 %	25 %	322691506
30527	NC_015067	TTC	2	6	1558843	1558848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691506
30528	NC_015067	GTT	2	6	1558857	1558862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691506
30529	NC_015067	TCG	2	6	1558880	1558885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691506
30530	NC_015067	TGT	2	6	1559022	1559027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691506
30531	NC_015067	GGC	2	6	1559122	1559127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691506
30532	NC_015067	GTA	2	6	1559161	1559166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691506
30533	NC_015067	GCC	2	6	1559182	1559187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691506
30534	NC_015067	AAC	2	6	1559210	1559215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691506
30535	NC_015067	AGA	2	6	1559224	1559229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691506
30536	NC_015067	CAA	2	6	1559244	1559249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691506
30537	NC_015067	CT	3	6	1559258	1559263	0 %	50 %	0 %	50 %	322691506
30538	NC_015067	TCC	2	6	1559404	1559409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691506
30539	NC_015067	AC	3	6	1559432	1559437	50 %	0 %	0 %	50 %	322691506
30540	NC_015067	GCA	3	9	1559483	1559491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691506
30541	NC_015067	CATACG	2	12	1559536	1559547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322691506
30542	NC_015067	GCA	2	6	1559559	1559564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691506
30543	NC_015067	GGT	2	6	1559669	1559674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691506
30544	NC_015067	TCGT	2	8	1559689	1559696	0 %	50 %	25 %	25 %	322691506
30545	NC_015067	AC	3	6	1559874	1559879	50 %	0 %	0 %	50 %	322691506
30546	NC_015067	AAC	2	6	1559945	1559950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691506
30547	NC_015067	GCTC	2	8	1560013	1560020	0 %	25 %	25 %	50 %	322691506
30548	NC_015067	GAT	2	6	1560022	1560027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691506
30549	NC_015067	AT	3	6	1560065	1560070	50 %	50 %	0 %	0 %	322691506
30550	NC_015067	CTG	2	6	1560124	1560129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691506
30551	NC_015067	CAA	2	6	1560141	1560146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691506
30552	NC_015067	GCG	2	6	1560419	1560424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691506
30553	NC_015067	AAT	2	6	1560471	1560476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691506
30554	NC_015067	GTC	2	6	1560499	1560504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691506
30555	NC_015067	ATG	2	6	1560515	1560520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691506
30556	NC_015067	ACCA	2	8	1560574	1560581	50 %	0 %	0 %	50 %	322691506
30557	NC_015067	CGAA	2	8	1560652	1560659	50 %	0 %	25 %	25 %	322691506
30558	NC_015067	TCT	2	6	1560660	1560665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691506
30559	NC_015067	TTG	2	6	1560716	1560721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691506
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30562	NC_015067	CA	3	6	1561074	1561079	50 %	0 %	0 %	50 %	322691506
30563	NC_015067	CAT	2	6	1561131	1561136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691506
30564	NC_015067	ACCA	2	8	1561180	1561187	50 %	0 %	0 %	50 %	322691506
30565	NC_015067	GGC	2	6	1561321	1561326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691506
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30568	NC_015067	TGA	2	6	1561409	1561414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691506
30569	NC_015067	AGCA	2	8	1561423	1561430	50 %	0 %	25 %	25 %	322691506
30570	NC_015067	CAT	2	6	1561449	1561454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691506
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30572	NC_015067	CAT	2	6	1561570	1561575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691506
30573	NC_015067	TGAT	2	8	1561578	1561585	25 %	50 %	25 %	0 %	322691506
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30576	NC_015067	ATCA	2	8	1561828	1561835	50 %	25 %	0 %	25 %	322691506
30577	NC_015067	TCA	2	6	1561847	1561852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691506
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30583	NC_015067	TTA	2	6	1562380	1562385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322691507
30584	NC_015067	TCT	2	6	1562401	1562406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691507
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30587	NC_015067	TTC	2	6	1562559	1562564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691507
30588	NC_015067	CTG	2	6	1562757	1562762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691507
30589	NC_015067	TCCA	2	8	1562781	1562788	25 %	25 %	0 %	50 %	322691507
30590	NC_015067	AC	3	6	1562831	1562836	50 %	0 %	0 %	50 %	322691507
30591	NC_015067	CAC	2	6	1562916	1562921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691507
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30600	NC_015067	TGC	2	6	1563655	1563660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691507
30601	NC_015067	ATA	2	6	1563786	1563791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691507
30602	NC_015067	CTC	2	6	1563792	1563797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691507
30603	NC_015067	CCAT	2	8	1563823	1563830	25 %	25 %	0 %	50 %	322691507
30604	NC_015067	CAT	2	6	1563860	1563865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691507
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30606	NC_015067	TCA	2	6	1564057	1564062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691507
30607	NC_015067	CAA	2	6	1564074	1564079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691507
30608	NC_015067	ATG	2	6	1564136	1564141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691507
30609	NC_015067	AGACC	2	10	1564175	1564184	40 %	0 %	20 %	40 %	322691507
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30611	NC_015067	CAT	2	6	1564283	1564288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691507
30612	NC_015067	CA	3	6	1564302	1564307	50 %	0 %	0 %	50 %	322691507
30613	NC_015067	CTT	2	6	1564315	1564320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691507
30614	NC_015067	CT	3	6	1564330	1564335	0 %	50 %	0 %	50 %	322691507
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30616	NC_015067	TCAG	2	8	1564480	1564487	25 %	25 %	25 %	25 %	322691507
30617	NC_015067	GCTG	2	8	1564495	1564502	0 %	25 %	50 %	25 %	322691507
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30729	NC_015067	CAC	2	6	1570891	1570896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691514
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30962	NC_015067	GCTGT	2	10	1582695	1582704	0 %	40 %	40 %	20 %	322691525
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30999	NC_015067	GCT	2	6	1585164	1585169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691527
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