MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_015067	CGTG	2	8	1447978	1447985	0 %	25 %	50 %	25 %	322691424
28503	NC_015067	GTG	2	6	1447995	1448000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691424
28504	NC_015067	CGC	2	6	1448047	1448052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691424
28505	NC_015067	TTG	2	6	1448181	1448186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691424
28506	NC_015067	GC	3	6	1448196	1448201	0 %	0 %	50 %	50 %	322691424
28507	NC_015067	GCT	2	6	1448305	1448310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691424
28508	NC_015067	CG	3	6	1448331	1448336	0 %	0 %	50 %	50 %	322691424
28509	NC_015067	GTC	2	6	1448357	1448362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691424
28510	NC_015067	ACC	2	6	1448439	1448444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691424
28511	NC_015067	GCC	2	6	1448456	1448461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691424
28512	NC_015067	GCC	2	6	1448466	1448471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691424
28513	NC_015067	CAGG	2	8	1448512	1448519	25 %	0 %	50 %	25 %	322691424
28514	NC_015067	GCGG	2	8	1448633	1448640	0 %	0 %	75 %	25 %	322691424
28515	NC_015067	GCG	2	6	1448661	1448666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691424
28516	NC_015067	CAAT	2	8	1448730	1448737	50 %	25 %	0 %	25 %	322691424
28517	NC_015067	CAGG	2	8	1448947	1448954	25 %	0 %	50 %	25 %	322691425
28518	NC_015067	GGC	2	6	1448963	1448968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691425
28519	NC_015067	CGA	2	6	1449024	1449029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691425
28520	NC_015067	GCA	2	6	1449099	1449104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691425
28521	NC_015067	GCA	2	6	1449181	1449186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691425
28522	NC_015067	AAC	2	6	1449251	1449256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691425
28523	NC_015067	CTT	2	6	1449263	1449268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691425
28524	NC_015067	GC	3	6	1449282	1449287	0 %	0 %	50 %	50 %	322691425
28525	NC_015067	CTT	2	6	1449378	1449383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691426
28526	NC_015067	GCC	2	6	1449390	1449395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691426
28527	NC_015067	GCA	2	6	1449398	1449403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691426
28528	NC_015067	TCG	2	6	1449406	1449411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691426
28529	NC_015067	TGCCGG	2	12	1449488	1449499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322691426
28530	NC_015067	GC	3	6	1449508	1449513	0 %	0 %	50 %	50 %	322691426
28531	NC_015067	GCG	2	6	1449520	1449525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691426
28532	NC_015067	TGC	2	6	1449549	1449554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28533	NC_015067	CCT	2	6	1449555	1449560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691427
28534	NC_015067	CTT	2	6	1449571	1449576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691427
28535	NC_015067	TCT	2	6	1449585	1449590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691427
28536	NC_015067	GCCTGA	2	12	1449620	1449631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28537	NC_015067	GCC	2	6	1449656	1449661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691427
28538	NC_015067	ACG	3	9	1449697	1449705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28539	NC_015067	CTT	2	6	1449727	1449732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691427
28540	NC_015067	ATG	3	9	1449752	1449760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691427
28541	NC_015067	CCT	2	6	1449768	1449773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691427
28542	NC_015067	TCG	2	6	1449812	1449817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28543	NC_015067	GCA	2	6	1449828	1449833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28544	NC_015067	CCA	2	6	1449842	1449847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691427
28545	NC_015067	CGGG	2	8	1449850	1449857	0 %	0 %	75 %	25 %	322691427
28546	NC_015067	ATG	2	6	1449878	1449883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691427
28547	NC_015067	TGACCT	2	12	1449885	1449896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322691427
28548	NC_015067	CTT	2	6	1449931	1449936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691427
28549	NC_015067	GTC	2	6	1449952	1449957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28550	NC_015067	GCG	2	6	1450006	1450011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691427
28551	NC_015067	TCT	2	6	1450029	1450034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691427
28552	NC_015067	CGA	2	6	1450101	1450106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691427
28553	NC_015067	CCT	2	6	1450119	1450124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691427
28554	NC_015067	GC	3	6	1450546	1450551	0 %	0 %	50 %	50 %	322691428
28555	NC_015067	CCG	2	6	1450558	1450563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691428
28556	NC_015067	GGCC	2	8	1450595	1450602	0 %	0 %	50 %	50 %	322691428
28557	NC_015067	GAT	2	6	1450611	1450616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691428
28558	NC_015067	GCAT	2	8	1450627	1450634	25 %	25 %	25 %	25 %	322691428
28559	NC_015067	GTC	2	6	1450659	1450664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691428
28560	NC_015067	GTTC	2	8	1450691	1450698	0 %	50 %	25 %	25 %	322691428
28561	NC_015067	GGT	2	6	1450767	1450772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691428
28562	NC_015067	CTG	2	6	1450800	1450805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691428
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28565	NC_015067	GT	3	6	1450886	1450891	0 %	50 %	50 %	0 %	322691428
28566	NC_015067	TCATGT	2	12	1450961	1450972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322691428
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28570	NC_015067	GAA	2	6	1451019	1451024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691428
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28574	NC_015067	TCT	2	6	1451186	1451191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691428
28575	NC_015067	ATA	2	6	1451226	1451231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691428
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28577	NC_015067	GGTGCC	2	12	1451253	1451264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322691428
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28583	NC_015067	CCGG	2	8	1451832	1451839	0 %	0 %	50 %	50 %	322691429
28584	NC_015067	TGG	3	9	1451905	1451913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691429
28585	NC_015067	GCCG	2	8	1451935	1451942	0 %	0 %	50 %	50 %	322691429
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28587	NC_015067	GGC	2	6	1452063	1452068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691429
28588	NC_015067	ATT	2	6	1452107	1452112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322691429
28589	NC_015067	GGT	2	6	1452314	1452319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691429
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28597	NC_015067	CAT	2	6	1452968	1452973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691430
28598	NC_015067	CAA	2	6	1453016	1453021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691430
28599	NC_015067	ACG	2	6	1453039	1453044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691430
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28603	NC_015067	CCG	2	6	1453222	1453227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691430
28604	NC_015067	CAC	2	6	1453235	1453240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691430
28605	NC_015067	GCC	2	6	1453251	1453256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691430
28606	NC_015067	GCT	2	6	1453265	1453270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691430
28607	NC_015067	ACC	2	6	1453305	1453310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691430
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28609	NC_015067	GC	3	6	1453379	1453384	0 %	0 %	50 %	50 %	322691430
28610	NC_015067	CGC	3	9	1453382	1453390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691430
28611	NC_015067	TCCG	2	8	1453445	1453452	0 %	25 %	25 %	50 %	322691430
28612	NC_015067	ACC	2	6	1453518	1453523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691430
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28614	NC_015067	CGA	2	6	1453547	1453552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691430
28615	NC_015067	CGC	2	6	1453559	1453564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691430
28616	NC_015067	TAC	2	6	1453593	1453598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691430
28617	NC_015067	TCC	2	6	1453623	1453628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691430
28618	NC_015067	CGACC	2	10	1453661	1453670	20 %	0 %	20 %	60 %	322691430
28619	NC_015067	CTG	2	6	1453767	1453772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691430
28620	NC_015067	AGCA	2	8	1453902	1453909	50 %	0 %	25 %	25 %	322691431
28621	NC_015067	GGCG	2	8	1453955	1453962	0 %	0 %	75 %	25 %	322691431
28622	NC_015067	GGC	2	6	1454027	1454032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691431
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28624	NC_015067	GTG	2	6	1454100	1454105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691431
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28627	NC_015067	AGA	2	6	1454245	1454250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691431
28628	NC_015067	CGG	2	6	1454309	1454314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691431
28629	NC_015067	CTGT	2	8	1454325	1454332	0 %	50 %	25 %	25 %	322691431
28630	NC_015067	GTG	2	6	1454393	1454398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691431
28631	NC_015067	ACT	2	6	1454438	1454443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691432
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28634	NC_015067	GAG	2	6	1454581	1454586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691432
28635	NC_015067	CAT	2	6	1454636	1454641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691432
28636	NC_015067	CCT	2	6	1454675	1454680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691432
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28640	NC_015067	CCA	2	6	1454756	1454761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691432
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28642	NC_015067	CGG	2	6	1454861	1454866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691432
28643	NC_015067	AGC	2	6	1454896	1454901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691432
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28646	NC_015067	CCA	2	6	1455080	1455085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691432
28647	NC_015067	CCA	2	6	1455101	1455106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691432
28648	NC_015067	CATG	2	8	1455107	1455114	25 %	25 %	25 %	25 %	322691432
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28650	NC_015067	ACC	2	6	1455169	1455174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691432
28651	NC_015067	GCA	3	9	1455190	1455198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691432
28652	NC_015067	TTG	2	6	1455265	1455270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691432
28653	NC_015067	CG	3	6	1455314	1455319	0 %	0 %	50 %	50 %	322691432
28654	NC_015067	ATT	2	6	1455774	1455779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322691433
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28658	NC_015067	GC	3	6	1455954	1455959	0 %	0 %	50 %	50 %	322691433
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28673	NC_015067	AGT	2	6	1456674	1456679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691433
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28684	NC_015067	CGA	2	6	1457462	1457467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691434
28685	NC_015067	GCA	2	6	1457503	1457508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691434
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28688	NC_015067	GCA	2	6	1458028	1458033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691435
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28706	NC_015067	CTTGGC	2	12	1458855	1458866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691436
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28723	NC_015067	CCG	2	6	1459579	1459584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691437
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28726	NC_015067	GGC	2	6	1459805	1459810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691437
28727	NC_015067	TCC	2	6	1459845	1459850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691437
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