MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_015067	TCG	2	6	1251487	1251492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691262
24502	NC_015067	GGC	2	6	1251540	1251545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24503	NC_015067	GTG	2	6	1251661	1251666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691262
24504	NC_015067	GGA	2	6	1251705	1251710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691262
24505	NC_015067	GGC	3	9	1251738	1251746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24506	NC_015067	TCG	2	6	1251793	1251798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691262
24507	NC_015067	GCG	2	6	1251886	1251891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24508	NC_015067	GGC	2	6	1251936	1251941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24509	NC_015067	ACA	2	6	1252031	1252036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691262
24510	NC_015067	CAT	2	6	1252348	1252353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691263
24511	NC_015067	ACGTC	2	10	1252355	1252364	20 %	20 %	20 %	40 %	322691263
24512	NC_015067	TCG	2	6	1252436	1252441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691263
24513	NC_015067	GTA	2	6	1252459	1252464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691263
24514	NC_015067	TGG	2	6	1252566	1252571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691263
24515	NC_015067	GGAA	2	8	1252580	1252587	50 %	0 %	50 %	0 %	322691263
24516	NC_015067	CGGCAA	2	12	1252720	1252731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691263
24517	NC_015067	ATC	2	6	1252837	1252842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691263
24518	NC_015067	CTC	2	6	1253050	1253055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691263
24519	NC_015067	TGG	2	6	1253085	1253090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691263
24520	NC_015067	CGGG	2	8	1253109	1253116	0 %	0 %	75 %	25 %	322691263
24521	NC_015067	GGC	2	6	1253164	1253169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691263
24522	NC_015067	GAT	2	6	1253194	1253199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691263
24523	NC_015067	GCTG	2	8	1253217	1253224	0 %	25 %	50 %	25 %	322691263
24524	NC_015067	GAT	2	6	1253232	1253237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691263
24525	NC_015067	CCG	2	6	1253259	1253264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691263
24526	NC_015067	GAT	3	9	1253338	1253346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691263
24527	NC_015067	CGT	2	6	1253505	1253510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691263
24528	NC_015067	GTC	2	6	1253542	1253547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691263
24529	NC_015067	CTT	2	6	1253568	1253573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691263
24530	NC_015067	TGG	2	6	1253597	1253602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691263
24531	NC_015067	GGC	2	6	1253647	1253652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691263
24532	NC_015067	TTC	2	6	1253695	1253700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691263
24533	NC_015067	GTC	2	6	1253728	1253733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691263
24534	NC_015067	GCG	3	9	1253735	1253743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691263
24535	NC_015067	CTT	3	9	1254142	1254150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691264
24536	NC_015067	GCG	2	6	1254226	1254231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24537	NC_015067	CGG	2	6	1254274	1254279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24538	NC_015067	GCT	2	6	1254315	1254320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24539	NC_015067	CCA	2	6	1254323	1254328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691264
24540	NC_015067	CGGGTG	2	12	1254334	1254345	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322691264
24541	NC_015067	GGC	2	6	1254346	1254351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24542	NC_015067	GCT	2	6	1254531	1254536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24543	NC_015067	GGC	2	6	1254685	1254690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24544	NC_015067	TGCG	2	8	1254692	1254699	0 %	25 %	50 %	25 %	322691264
24545	NC_015067	AG	3	6	1254701	1254706	50 %	0 %	50 %	0 %	322691264
24546	NC_015067	AAT	2	6	1254708	1254713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322691264
24547	NC_015067	GCCG	2	8	1254751	1254758	0 %	0 %	50 %	50 %	322691264
24548	NC_015067	TCG	2	6	1254800	1254805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24549	NC_015067	CG	3	6	1254813	1254818	0 %	0 %	50 %	50 %	322691264
24550	NC_015067	TTC	2	6	1254850	1254855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691264
24551	NC_015067	GC	3	6	1254856	1254861	0 %	0 %	50 %	50 %	322691264
24552	NC_015067	GAC	2	6	1254878	1254883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24553	NC_015067	GGC	2	6	1254897	1254902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24554	NC_015067	CCA	2	6	1254903	1254908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691264
24555	NC_015067	TCT	2	6	1254951	1254956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691264
24556	NC_015067	CAG	2	6	1254988	1254993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24557	NC_015067	GCCGAG	2	12	1255039	1255050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322691264
24558	NC_015067	CGG	2	6	1255062	1255067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24559	NC_015067	GTC	2	6	1255087	1255092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24560	NC_015067	TTG	2	6	1255097	1255102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322691264
24561	NC_015067	CGG	2	6	1255125	1255130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24562	NC_015067	GCA	2	6	1255134	1255139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24563	NC_015067	GGT	3	9	1255159	1255167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691264
24564	NC_015067	CCTGTG	2	12	1255224	1255235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24565	NC_015067	GCC	2	6	1255276	1255281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691264
24566	NC_015067	CCA	2	6	1255287	1255292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691264
24567	NC_015067	CGG	2	6	1255368	1255373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24568	NC_015067	CGG	2	6	1255376	1255381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24569	NC_015067	GAT	2	6	1255403	1255408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691264
24570	NC_015067	ACA	2	6	1255430	1255435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691264
24571	NC_015067	CACC	2	8	1255443	1255450	25 %	0 %	0 %	75 %	322691264
24572	NC_015067	GC	4	8	1255468	1255475	0 %	0 %	50 %	50 %	322691264
24573	NC_015067	GGC	2	6	1255543	1255548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24574	NC_015067	GTA	2	6	1255643	1255648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691264
24575	NC_015067	CGG	3	9	1255656	1255664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24576	NC_015067	CG	3	6	1255698	1255703	0 %	0 %	50 %	50 %	322691264
24577	NC_015067	CCT	2	6	1255764	1255769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691264
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24579	NC_015067	GGT	2	6	1255816	1255821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691264
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24581	NC_015067	GCG	2	6	1255904	1255909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24582	NC_015067	GGA	2	6	1255969	1255974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691264
24583	NC_015067	TCG	3	9	1255997	1256005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691264
24584	NC_015067	GAA	2	6	1256059	1256064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691264
24585	NC_015067	TGA	2	6	1256082	1256087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691264
24586	NC_015067	ACC	2	6	1256136	1256141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691264
24587	NC_015067	TGGACG	2	12	1256208	1256219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322691264
24588	NC_015067	CGG	2	6	1256232	1256237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691264
24589	NC_015067	CCT	2	6	1256270	1256275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691265
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24591	NC_015067	GAG	2	6	1256464	1256469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691265
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24597	NC_015067	CGT	2	6	1256633	1256638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691265
24598	NC_015067	GTC	2	6	1256745	1256750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691265
24599	NC_015067	CG	3	6	1256816	1256821	0 %	0 %	50 %	50 %	322691265
24600	NC_015067	CTG	2	6	1256838	1256843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691265
24601	NC_015067	GCG	2	6	1256931	1256936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691265
24602	NC_015067	AGC	2	6	1256959	1256964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691265
24603	NC_015067	TGGAAT	2	12	1256978	1256989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691265
24604	NC_015067	GAA	2	6	1257228	1257233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691266
24605	NC_015067	CTG	2	6	1257288	1257293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691266
24606	NC_015067	TTC	2	6	1257354	1257359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691266
24607	NC_015067	TCT	2	6	1257400	1257405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691266
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24609	NC_015067	GCT	2	6	1257545	1257550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691266
24610	NC_015067	GCT	2	6	1257632	1257637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691266
24611	NC_015067	GTC	2	6	1257678	1257683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691266
24612	NC_015067	CT	3	6	1257695	1257700	0 %	50 %	0 %	50 %	322691266
24613	NC_015067	TCT	2	6	1257723	1257728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691266
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24615	NC_015067	CCCG	2	8	1257834	1257841	0 %	0 %	25 %	75 %	322691266
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