MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_015067	GC	3	6	1225788	1225793	0 %	0 %	50 %	50 %	322691235
24002	NC_015067	GGT	2	6	1226013	1226018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691236
24003	NC_015067	CGT	2	6	1226053	1226058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691236
24004	NC_015067	CGCC	2	8	1226104	1226111	0 %	0 %	25 %	75 %	322691236
24005	NC_015067	TGG	2	6	1226125	1226130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691236
24006	NC_015067	CGG	2	6	1226137	1226142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24007	NC_015067	GCG	3	9	1226160	1226168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24008	NC_015067	ACG	2	6	1226173	1226178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691236
24009	NC_015067	GCCA	2	8	1226286	1226293	25 %	0 %	25 %	50 %	322691236
24010	NC_015067	GCC	2	6	1226315	1226320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691236
24011	NC_015067	GCG	2	6	1226324	1226329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24012	NC_015067	CGG	2	6	1226410	1226415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24013	NC_015067	GCA	2	6	1226470	1226475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691236
24014	NC_015067	GGC	2	6	1226501	1226506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24015	NC_015067	CGG	2	6	1226523	1226528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24016	NC_015067	CATGC	2	10	1226618	1226627	20 %	20 %	20 %	40 %	322691236
24017	NC_015067	CGG	2	6	1226632	1226637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24018	NC_015067	CGG	3	9	1226724	1226732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24019	NC_015067	CGG	2	6	1226761	1226766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24020	NC_015067	GC	3	6	1226776	1226781	0 %	0 %	50 %	50 %	322691236
24021	NC_015067	GC	3	6	1226806	1226811	0 %	0 %	50 %	50 %	322691236
24022	NC_015067	GCC	2	6	1226817	1226822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691236
24023	NC_015067	GCC	2	6	1226841	1226846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691236
24024	NC_015067	TCA	2	6	1226853	1226858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691236
24025	NC_015067	GGC	2	6	1226861	1226866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691236
24026	NC_015067	CAC	2	6	1226903	1226908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691236
24027	NC_015067	CTCGAA	2	12	1226927	1226938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322691236
24028	NC_015067	GAC	2	6	1226953	1226958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691236
24029	NC_015067	GCC	2	6	1226986	1226991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691236
24030	NC_015067	CGC	2	6	1227008	1227013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691236
24031	NC_015067	ATG	2	6	1227963	1227968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691237
24032	NC_015067	TCG	2	6	1227973	1227978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691237
24033	NC_015067	GAT	2	6	1227981	1227986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691237
24034	NC_015067	ATC	2	6	1228027	1228032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691237
24035	NC_015067	GCCG	2	8	1228103	1228110	0 %	0 %	50 %	50 %	322691237
24036	NC_015067	CGT	2	6	1228373	1228378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691238
24037	NC_015067	GC	3	6	1228496	1228501	0 %	0 %	50 %	50 %	322691238
24038	NC_015067	TCG	2	6	1228506	1228511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691238
24039	NC_015067	CATG	2	8	1228513	1228520	25 %	25 %	25 %	25 %	322691238
24040	NC_015067	GC	3	6	1228525	1228530	0 %	0 %	50 %	50 %	322691238
24041	NC_015067	GTC	3	9	1228553	1228561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691238
24042	NC_015067	GGC	2	6	1228567	1228572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691238
24043	NC_015067	CGG	2	6	1228609	1228614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691238
24044	NC_015067	CCG	4	12	1228649	1228660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691238
24045	NC_015067	CAG	2	6	1228679	1228684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691238
24046	NC_015067	CCG	2	6	1228727	1228732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691238
24047	NC_015067	GCC	2	6	1228746	1228751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691238
24048	NC_015067	GAG	2	6	1228784	1228789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691238
24049	NC_015067	ATG	2	6	1228872	1228877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691238
24050	NC_015067	TCG	2	6	1228903	1228908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691238
24051	NC_015067	CG	3	6	1228913	1228918	0 %	0 %	50 %	50 %	322691238
24052	NC_015067	AGG	2	6	1228923	1228928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691238
24053	NC_015067	TCC	2	6	1228932	1228937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691238
24054	NC_015067	GCC	2	6	1229006	1229011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691238
24055	NC_015067	GCG	2	6	1229019	1229024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691238
24056	NC_015067	GTC	2	6	1229101	1229106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691239
24057	NC_015067	GGC	2	6	1229116	1229121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691239
24058	NC_015067	GGCG	2	8	1229193	1229200	0 %	0 %	75 %	25 %	322691239
24059	NC_015067	ATGCG	2	10	1229232	1229241	20 %	20 %	40 %	20 %	322691239
24060	NC_015067	CGTC	2	8	1229298	1229305	0 %	25 %	25 %	50 %	322691239
24061	NC_015067	GTC	2	6	1229335	1229340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691239
24062	NC_015067	ATGCG	2	10	1229373	1229382	20 %	20 %	40 %	20 %	322691239
24063	NC_015067	ATGC	2	8	1229398	1229405	25 %	25 %	25 %	25 %	322691240
24064	NC_015067	ATT	2	6	1229437	1229442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322691240
24065	NC_015067	GCCCCG	2	12	1229448	1229459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691240
24066	NC_015067	TA	4	8	1229567	1229574	50 %	50 %	0 %	0 %	322691240
24067	NC_015067	TTC	2	6	1229632	1229637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691240
24068	NC_015067	GAAGA	2	10	1229730	1229739	60 %	0 %	40 %	0 %	322691240
24069	NC_015067	CCG	2	6	1229811	1229816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691240
24070	NC_015067	GGA	2	6	1229858	1229863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691240
24071	NC_015067	TCC	2	6	1229874	1229879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691240
24072	NC_015067	TA	4	8	1230025	1230032	50 %	50 %	0 %	0 %	322691240
24073	NC_015067	TGA	2	6	1230976	1230981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691241
24074	NC_015067	CCGT	2	8	1230983	1230990	0 %	25 %	25 %	50 %	322691241
24075	NC_015067	GCG	2	6	1231014	1231019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691241
24076	NC_015067	TGG	2	6	1231069	1231074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691241
24077	NC_015067	GAT	2	6	1231079	1231084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691241
24078	NC_015067	CTG	2	6	1231128	1231133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691241
24079	NC_015067	CTC	2	6	1231136	1231141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691241
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24081	NC_015067	ATG	2	6	1231170	1231175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691241
24082	NC_015067	CTG	2	6	1231226	1231231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691241
24083	NC_015067	GGCGC	2	10	1231232	1231241	0 %	0 %	60 %	40 %	322691241
24084	NC_015067	GAA	2	6	1231268	1231273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322691241
24085	NC_015067	CGA	2	6	1231378	1231383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691241
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24087	NC_015067	CGG	2	6	1231417	1231422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691241
24088	NC_015067	CGG	2	6	1231465	1231470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691241
24089	NC_015067	GCAGGC	2	12	1231489	1231500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322691241
24090	NC_015067	TCGC	2	8	1231508	1231515	0 %	25 %	25 %	50 %	322691241
24091	NC_015067	CGAGT	2	10	1231517	1231526	20 %	20 %	40 %	20 %	322691241
24092	NC_015067	GTCAGG	2	12	1231605	1231616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322691241
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24094	NC_015067	CGT	2	6	1231725	1231730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24095	NC_015067	TGA	2	6	1231740	1231745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691242
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24098	NC_015067	CGC	2	6	1231878	1231883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691242
24099	NC_015067	GCC	2	6	1231910	1231915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691242
24100	NC_015067	CG	3	6	1231981	1231986	0 %	0 %	50 %	50 %	322691242
24101	NC_015067	TCG	2	6	1231991	1231996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24102	NC_015067	CG	3	6	1232029	1232034	0 %	0 %	50 %	50 %	322691242
24103	NC_015067	TCC	2	6	1232072	1232077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691242
24104	NC_015067	CCGT	2	8	1232089	1232096	0 %	25 %	25 %	50 %	322691242
24105	NC_015067	GGCG	2	8	1232131	1232138	0 %	0 %	75 %	25 %	322691242
24106	NC_015067	ACGGCA	2	12	1232289	1232300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24107	NC_015067	CTC	2	6	1232314	1232319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691242
24108	NC_015067	CAG	2	6	1232395	1232400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24109	NC_015067	CG	3	6	1232428	1232433	0 %	0 %	50 %	50 %	322691242
24110	NC_015067	GGC	2	6	1232438	1232443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691242
24111	NC_015067	GCCG	2	8	1232595	1232602	0 %	0 %	50 %	50 %	322691242
24112	NC_015067	ATCACG	2	12	1232621	1232632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322691242
24113	NC_015067	GGA	2	6	1232633	1232638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691242
24114	NC_015067	ACC	2	6	1232744	1232749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691242
24115	NC_015067	CCGGGC	2	12	1232782	1232793	0 %	0 %	50 %	50 %	322691242
24116	NC_015067	TGC	2	6	1232814	1232819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24117	NC_015067	CCG	2	6	1232820	1232825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691242
24118	NC_015067	CGC	2	6	1232862	1232867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691242
24119	NC_015067	CGT	2	6	1232919	1232924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24120	NC_015067	CAG	2	6	1232938	1232943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24121	NC_015067	GCT	2	6	1232973	1232978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24122	NC_015067	GCA	2	6	1232985	1232990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691242
24123	NC_015067	CCA	2	6	1233015	1233020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691242
24124	NC_015067	TCC	2	6	1233083	1233088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691242
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24128	NC_015067	AAC	2	6	1233400	1233405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691243
24129	NC_015067	CGG	3	9	1233427	1233435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691243
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24132	NC_015067	GC	3	6	1233488	1233493	0 %	0 %	50 %	50 %	322691243
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24136	NC_015067	GAC	3	9	1233613	1233621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691243
24137	NC_015067	TGA	2	6	1233635	1233640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691243
24138	NC_015067	GGC	2	6	1233673	1233678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691243
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24141	NC_015067	GC	3	6	1233864	1233869	0 %	0 %	50 %	50 %	322691243
24142	NC_015067	CTG	2	6	1233903	1233908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691243
24143	NC_015067	CGT	2	6	1233912	1233917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691243
24144	NC_015067	GGCGTC	2	12	1234000	1234011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322691243
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24147	NC_015067	CCGAA	2	10	1234073	1234082	40 %	0 %	20 %	40 %	322691243
24148	NC_015067	CTG	2	6	1234141	1234146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691243
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24155	NC_015067	CGG	3	9	1234733	1234741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691244
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24218	NC_015067	GCA	2	6	1237354	1237359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691248
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24221	NC_015067	CGGC	2	8	1237687	1237694	0 %	0 %	50 %	50 %	322691248
24222	NC_015067	CCG	2	6	1237816	1237821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691248
24223	NC_015067	GGA	2	6	1237856	1237861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691248
24224	NC_015067	CCG	2	6	1237867	1237872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691248
24225	NC_015067	CGC	2	6	1237913	1237918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691248
24226	NC_015067	CGCC	2	8	1237936	1237943	0 %	0 %	25 %	75 %	322691248
24227	NC_015067	CGG	2	6	1237949	1237954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691248
24228	NC_015067	CGA	2	6	1237955	1237960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691248
24229	NC_015067	GGAC	2	8	1238038	1238045	25 %	0 %	50 %	25 %	322691248
24230	NC_015067	GC	3	6	1238110	1238115	0 %	0 %	50 %	50 %	322691248
24231	NC_015067	CGC	2	6	1238120	1238125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691248
24232	NC_015067	GCT	2	6	1238135	1238140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691248
24233	NC_015067	GAC	2	6	1238208	1238213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691248
24234	NC_015067	CGG	2	6	1238321	1238326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691248
24235	NC_015067	CGTA	2	8	1238331	1238338	25 %	25 %	25 %	25 %	322691248
24236	NC_015067	TCCGA	2	10	1238397	1238406	20 %	20 %	20 %	40 %	322691248
24237	NC_015067	GGC	2	6	1238415	1238420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691248
24238	NC_015067	CCCGG	2	10	1238433	1238442	0 %	0 %	40 %	60 %	322691248
24239	NC_015067	CGA	2	6	1238504	1238509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691248
24240	NC_015067	GGC	2	6	1238526	1238531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691248
24241	NC_015067	ACCT	2	8	1238667	1238674	25 %	25 %	0 %	50 %	322691248
24242	NC_015067	GGGC	2	8	1238692	1238699	0 %	0 %	75 %	25 %	322691248
24243	NC_015067	CGT	2	6	1238803	1238808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691248
24244	NC_015067	ACG	2	6	1238859	1238864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691248
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24246	NC_015067	CGC	2	6	1238936	1238941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691248
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24251	NC_015067	GGGC	2	8	1239588	1239595	0 %	0 %	75 %	25 %	322691249
24252	NC_015067	GCC	3	9	1239601	1239609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691249
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24259	NC_015067	GCC	2	6	1239870	1239875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691250
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24334	NC_015067	ATG	2	6	1242816	1242821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691253
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24336	NC_015067	ACA	2	6	1242837	1242842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322691253
24337	NC_015067	CGC	2	6	1242853	1242858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691253
24338	NC_015067	GCG	2	6	1242900	1242905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691253
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24340	NC_015067	G	6	6	1242966	1242971	0 %	0 %	100 %	0 %	322691253
24341	NC_015067	CTG	2	6	1242977	1242982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691253
24342	NC_015067	CG	3	6	1242986	1242991	0 %	0 %	50 %	50 %	322691253
24343	NC_015067	GGCC	3	12	1242997	1243008	0 %	0 %	50 %	50 %	322691253
24344	NC_015067	TGG	2	6	1243022	1243027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691253
24345	NC_015067	CGA	2	6	1243042	1243047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691253
24346	NC_015067	TCG	2	6	1243125	1243130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691253
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24348	NC_015067	CG	3	6	1243214	1243219	0 %	0 %	50 %	50 %	322691253
24349	NC_015067	CG	3	6	1243241	1243246	0 %	0 %	50 %	50 %	322691253
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24464	NC_015067	CCA	2	6	1250174	1250179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322691261
24465	NC_015067	CCG	2	6	1250270	1250275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322691262
24466	NC_015067	CG	3	6	1250284	1250289	0 %	0 %	50 %	50 %	322691262
24467	NC_015067	GGA	2	6	1250322	1250327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322691262
24468	NC_015067	TGA	2	6	1250390	1250395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691262
24469	NC_015067	TGA	2	6	1250417	1250422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691262
24470	NC_015067	TGG	2	6	1250498	1250503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691262
24471	NC_015067	GCA	2	6	1250540	1250545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691262
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24474	NC_015067	GCG	2	6	1250623	1250628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24475	NC_015067	CGG	2	6	1250648	1250653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
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24479	NC_015067	TAC	2	6	1250711	1250716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322691262
24480	NC_015067	CG	3	6	1250763	1250768	0 %	0 %	50 %	50 %	322691262
24481	NC_015067	GGC	2	6	1250846	1250851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24482	NC_015067	GCT	2	6	1250885	1250890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691262
24483	NC_015067	GCG	2	6	1250954	1250959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24484	NC_015067	TGG	2	6	1250993	1250998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691262
24485	NC_015067	CAG	2	6	1251021	1251026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691262
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24487	NC_015067	GCCA	2	8	1251054	1251061	25 %	0 %	25 %	50 %	322691262
24488	NC_015067	TCG	2	6	1251070	1251075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691262
24489	NC_015067	GGT	2	6	1251081	1251086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322691262
24490	NC_015067	ATGA	2	8	1251105	1251112	50 %	25 %	25 %	0 %	322691262
24491	NC_015067	TCG	3	9	1251133	1251141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322691262
24492	NC_015067	TTC	2	6	1251142	1251147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691262
24493	NC_015067	GCTC	2	8	1251173	1251180	0 %	25 %	25 %	50 %	322691262
24494	NC_015067	CGA	2	6	1251232	1251237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322691262
24495	NC_015067	TTC	2	6	1251271	1251276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322691262
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24497	NC_015067	GGC	2	6	1251396	1251401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24498	NC_015067	GGC	2	6	1251407	1251412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322691262
24499	NC_015067	GAT	2	6	1251413	1251418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322691262
24500	NC_015067	CCT	2	6	1251431	1251436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322691262

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