MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015067	AGC	2	6	917507	917512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18003	NC_015067	CG	3	6	917525	917530	0 %	0 %	50 %	50 %	322690920
18004	NC_015067	CCG	2	6	917531	917536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690920
18005	NC_015067	GCC	2	6	917557	917562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690920
18006	NC_015067	ATG	2	6	917566	917571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690920
18007	NC_015067	CCAG	2	8	917573	917580	25 %	0 %	25 %	50 %	322690920
18008	NC_015067	CGA	2	6	917586	917591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18009	NC_015067	TGAT	2	8	917606	917613	25 %	50 %	25 %	0 %	322690920
18010	NC_015067	GC	3	6	917646	917651	0 %	0 %	50 %	50 %	322690920
18011	NC_015067	CGA	2	6	917676	917681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18012	NC_015067	GGC	2	6	917686	917691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690920
18013	NC_015067	GAT	2	6	917695	917700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690920
18014	NC_015067	CGG	2	6	917709	917714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690920
18015	NC_015067	CGC	2	6	917715	917720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690920
18016	NC_015067	GTC	2	6	917730	917735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18017	NC_015067	GGTTCG	2	12	917761	917772	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322690920
18018	NC_015067	GTCGCG	2	12	917781	917792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690920
18019	NC_015067	GTC	2	6	917799	917804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18020	NC_015067	TCG	2	6	917827	917832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18021	NC_015067	TCG	2	6	917848	917853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18022	NC_015067	TCC	2	6	917875	917880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690920
18023	NC_015067	TTC	2	6	917916	917921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690920
18024	NC_015067	GTC	2	6	917937	917942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690920
18025	NC_015067	CGTTCC	2	12	917953	917964	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322690920
18026	NC_015067	TTC	2	6	917967	917972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690920
18027	NC_015067	TGG	2	6	917985	917990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690920
18028	NC_015067	GGC	2	6	917998	918003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690920
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18031	NC_015067	GAA	2	6	918405	918410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690921
18032	NC_015067	GC	3	6	918446	918451	0 %	0 %	50 %	50 %	322690921
18033	NC_015067	TGCC	2	8	918510	918517	0 %	25 %	25 %	50 %	322690921
18034	NC_015067	ACT	2	6	918518	918523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690921
18035	NC_015067	GCA	2	6	918525	918530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690921
18036	NC_015067	GGC	2	6	918531	918536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690921
18037	NC_015067	CGT	2	6	918549	918554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690921
18038	NC_015067	CGT	2	6	918570	918575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690921
18039	NC_015067	TCG	2	6	918584	918589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690921
18040	NC_015067	CGC	3	9	918618	918626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690921
18041	NC_015067	CTA	2	6	918640	918645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690921
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18043	NC_015067	TGC	2	6	918710	918715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690921
18044	NC_015067	GCCATC	2	12	918757	918768	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690921
18045	NC_015067	CGC	2	6	918783	918788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690921
18046	NC_015067	CGT	2	6	918972	918977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690922
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18049	NC_015067	GCT	2	6	919113	919118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690922
18050	NC_015067	CGA	2	6	919164	919169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690922
18051	NC_015067	TA	3	6	919213	919218	50 %	50 %	0 %	0 %	322690922
18052	NC_015067	GCC	3	9	919228	919236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690922
18053	NC_015067	ATC	2	6	919258	919263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690922
18054	NC_015067	GAT	2	6	919341	919346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690922
18055	NC_015067	GTC	2	6	919411	919416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690922
18056	NC_015067	TCA	2	6	919460	919465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690922
18057	NC_015067	CGC	2	6	919491	919496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690922
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18059	NC_015067	TGA	2	6	919559	919564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690922
18060	NC_015067	GCA	2	6	919572	919577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690922
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18062	NC_015067	ACCT	2	8	919702	919709	25 %	25 %	0 %	50 %	322690922
18063	NC_015067	TGC	2	6	919751	919756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690922
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18066	NC_015067	CAT	2	6	919812	919817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690922
18067	NC_015067	CG	3	6	919826	919831	0 %	0 %	50 %	50 %	322690922
18068	NC_015067	CAT	2	6	919845	919850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690922
18069	NC_015067	CAT	2	6	919866	919871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690922
18070	NC_015067	TCGGCG	2	12	919892	919903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690922
18071	NC_015067	AGCC	2	8	919971	919978	25 %	0 %	25 %	50 %	322690922
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18076	NC_015067	CGC	2	6	920127	920132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690923
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18086	NC_015067	CGG	2	6	920836	920841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690923
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18088	NC_015067	CG	3	6	920867	920872	0 %	0 %	50 %	50 %	322690923
18089	NC_015067	TGA	2	6	920874	920879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690923
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18091	NC_015067	AG	3	6	920929	920934	50 %	0 %	50 %	0 %	322690923
18092	NC_015067	CAA	2	6	920971	920976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690923
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18100	NC_015067	TGC	2	6	921579	921584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690924
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18115	NC_015067	ACC	2	6	922296	922301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690925
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18118	NC_015067	TGA	2	6	922540	922545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690925
18119	NC_015067	GGC	2	6	922548	922553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690925
18120	NC_015067	AGA	2	6	922619	922624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690925
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18474	NC_015067	ACC	2	6	940726	940731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690939
18475	NC_015067	AAC	2	6	940747	940752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690939
18476	NC_015067	GGC	2	6	940792	940797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690939
18477	NC_015067	CCA	2	6	940835	940840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690939
18478	NC_015067	CCA	2	6	940886	940891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690939
18479	NC_015067	GAT	2	6	940941	940946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690939
18480	NC_015067	CCA	2	6	940970	940975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690939
18481	NC_015067	TCG	2	6	940976	940981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690939
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18483	NC_015067	CTG	2	6	941083	941088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690939
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18485	NC_015067	TACC	2	8	941112	941119	25 %	25 %	0 %	50 %	322690939
18486	NC_015067	GAC	2	6	941140	941145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690939
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18489	NC_015067	TCG	2	6	941258	941263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690939
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18492	NC_015067	TTC	2	6	941547	941552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690940
18493	NC_015067	CCGCA	2	10	941717	941726	20 %	0 %	20 %	60 %	322690940
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18497	NC_015067	ACG	2	6	941860	941865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690940
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18499	NC_015067	CCA	2	6	941923	941928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690940
18500	NC_015067	CGTT	2	8	941929	941936	0 %	50 %	25 %	25 %	322690940

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