MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015067	GAGG	2	8	818844	818851	25 %	0 %	75 %	0 %	322690839
16002	NC_015067	TCG	2	6	818890	818895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16003	NC_015067	CAG	2	6	818913	818918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16004	NC_015067	ACA	2	6	818924	818929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690839
16005	NC_015067	ATG	2	6	818941	818946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690839
16006	NC_015067	GCC	2	6	819031	819036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690839
16007	NC_015067	GATGC	2	10	819045	819054	20 %	20 %	40 %	20 %	322690839
16008	NC_015067	GAG	2	6	819158	819163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690839
16009	NC_015067	CCA	2	6	819171	819176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690839
16010	NC_015067	CTG	2	6	819280	819285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16011	NC_015067	CGC	2	6	819288	819293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690839
16012	NC_015067	AGC	2	6	819473	819478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16013	NC_015067	CAG	2	6	819480	819485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16014	NC_015067	TGA	2	6	819491	819496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690839
16015	NC_015067	CAGC	2	8	819534	819541	25 %	0 %	25 %	50 %	322690839
16016	NC_015067	CAG	2	6	819564	819569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16017	NC_015067	AT	3	6	819607	819612	50 %	50 %	0 %	0 %	322690839
16018	NC_015067	GAA	2	6	819687	819692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690839
16019	NC_015067	TGC	2	6	819727	819732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690839
16020	NC_015067	GCA	2	6	820018	820023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16021	NC_015067	GATGA	2	10	820064	820073	40 %	20 %	40 %	0 %	322690840
16022	NC_015067	GAA	2	6	820081	820086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690840
16023	NC_015067	TGG	2	6	820143	820148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690840
16024	NC_015067	GGC	2	6	820246	820251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16025	NC_015067	TCG	2	6	820253	820258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16026	NC_015067	CAG	2	6	820309	820314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16027	NC_015067	GCA	2	6	820371	820376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16028	NC_015067	GGC	2	6	820402	820407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16029	NC_015067	GCGG	2	8	820429	820436	0 %	0 %	75 %	25 %	322690840
16030	NC_015067	ATG	2	6	820469	820474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690840
16031	NC_015067	CGG	3	9	820527	820535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16032	NC_015067	GCG	2	6	820543	820548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16033	NC_015067	CG	3	6	820562	820567	0 %	0 %	50 %	50 %	322690840
16034	NC_015067	GGCA	2	8	820575	820582	25 %	0 %	50 %	25 %	322690840
16035	NC_015067	TCG	2	6	820583	820588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16036	NC_015067	ATG	2	6	820655	820660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690840
16037	NC_015067	CAT	2	6	820666	820671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690840
16038	NC_015067	GGT	2	6	820717	820722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690840
16039	NC_015067	GAT	2	6	820753	820758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690840
16040	NC_015067	TCG	2	6	820766	820771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16041	NC_015067	CGGGC	2	10	820927	820936	0 %	0 %	60 %	40 %	322690840
16042	NC_015067	ACG	2	6	820946	820951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16043	NC_015067	GGC	2	6	821049	821054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16044	NC_015067	GGCGGT	2	12	821076	821087	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322690840
16045	NC_015067	CGG	3	9	821094	821102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16046	NC_015067	CGA	2	6	821136	821141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16047	NC_015067	GGAAC	2	10	821152	821161	40 %	0 %	40 %	20 %	322690840
16048	NC_015067	GCA	2	6	821175	821180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16049	NC_015067	TCG	2	6	821186	821191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16050	NC_015067	CGC	2	6	821208	821213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690840
16051	NC_015067	CCA	2	6	821271	821276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690840
16052	NC_015067	GCA	2	6	821319	821324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16053	NC_015067	CG	3	6	821325	821330	0 %	0 %	50 %	50 %	322690840
16054	NC_015067	GTC	2	6	821341	821346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690840
16055	NC_015067	GCC	2	6	821380	821385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690840
16056	NC_015067	GGC	2	6	821413	821418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690840
16057	NC_015067	AG	3	6	821566	821571	50 %	0 %	50 %	0 %	322690841
16058	NC_015067	CGA	2	6	821641	821646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690841
16059	NC_015067	CGTT	2	8	821698	821705	0 %	50 %	25 %	25 %	322690841
16060	NC_015067	CTT	2	6	821734	821739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690841
16061	NC_015067	AGT	2	6	821769	821774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690841
16062	NC_015067	TTG	2	6	821873	821878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690841
16063	NC_015067	TCA	2	6	821895	821900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690841
16064	NC_015067	GTC	2	6	821944	821949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690841
16065	NC_015067	AAG	2	6	822111	822116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690842
16066	NC_015067	AAT	2	6	822141	822146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690842
16067	NC_015067	TGC	2	6	822258	822263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690842
16068	NC_015067	CGC	2	6	822284	822289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690842
16069	NC_015067	TCGG	2	8	822330	822337	0 %	25 %	50 %	25 %	322690842
16070	NC_015067	AAG	2	6	822439	822444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690842
16071	NC_015067	GTC	2	6	822525	822530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690842
16072	NC_015067	TCG	2	6	822556	822561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690842
16073	NC_015067	GTCG	2	8	822608	822615	0 %	25 %	50 %	25 %	322690842
16074	NC_015067	CAT	2	6	822638	822643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690842
16075	NC_015067	CTG	2	6	822671	822676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690842
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16077	NC_015067	TGC	2	6	822723	822728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690842
16078	NC_015067	CGA	2	6	822755	822760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690842
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16082	NC_015067	GT	3	6	822999	823004	0 %	50 %	50 %	0 %	322690842
16083	NC_015067	GCT	2	6	823021	823026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690842
16084	NC_015067	TCTTCG	2	12	823027	823038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322690842
16085	NC_015067	AGT	2	6	823042	823047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690842
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16088	NC_015067	GAA	2	6	823249	823254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690842
16089	NC_015067	CCT	2	6	823301	823306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690842
16090	NC_015067	TGAA	2	8	823492	823499	50 %	25 %	25 %	0 %	322690843
16091	NC_015067	ATTGG	2	10	823505	823514	20 %	40 %	40 %	0 %	322690843
16092	NC_015067	GAG	2	6	823531	823536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690843
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16097	NC_015067	CA	3	6	823800	823805	50 %	0 %	0 %	50 %	322690843
16098	NC_015067	AGA	2	6	823830	823835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690843
16099	NC_015067	TGCT	2	8	823855	823862	0 %	50 %	25 %	25 %	322690843
16100	NC_015067	AT	3	6	823938	823943	50 %	50 %	0 %	0 %	322690843
16101	NC_015067	TGC	2	6	823944	823949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690843
16102	NC_015067	GCC	2	6	824002	824007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690843
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16105	NC_015067	TCT	2	6	824343	824348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690844
16106	NC_015067	GCC	2	6	824354	824359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690844
16107	NC_015067	GGCA	2	8	824826	824833	25 %	0 %	50 %	25 %	322690845
16108	NC_015067	CAC	2	6	824842	824847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690845
16109	NC_015067	CG	3	6	824943	824948	0 %	0 %	50 %	50 %	322690845
16110	NC_015067	GAT	2	6	824971	824976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690845
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16113	NC_015067	TCT	2	6	825054	825059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690845
16114	NC_015067	CTG	2	6	825169	825174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690845
16115	NC_015067	TCT	2	6	825228	825233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690845
16116	NC_015067	CCCG	2	8	825467	825474	0 %	0 %	25 %	75 %	322690845
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16118	NC_015067	TTGGCC	2	12	825854	825865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690846
16119	NC_015067	GTG	3	9	825866	825874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690846
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16122	NC_015067	CG	3	6	825906	825911	0 %	0 %	50 %	50 %	322690846
16123	NC_015067	ACG	2	6	825944	825949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690846
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16473	NC_015067	CGA	2	6	844098	844103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690859
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16499	NC_015067	GCG	2	6	845645	845650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690861
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