MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015067	CAAGG	2	10	793523	793532	40 %	0 %	40 %	20 %	322690821
15502	NC_015067	AGCGC	2	10	793540	793549	20 %	0 %	40 %	40 %	322690821
15503	NC_015067	CAC	2	6	793561	793566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690821
15504	NC_015067	GCCGC	2	10	793638	793647	0 %	0 %	40 %	60 %	322690821
15505	NC_015067	CGC	2	6	793656	793661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690821
15506	NC_015067	GCT	2	6	793666	793671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15507	NC_015067	CTT	2	6	793675	793680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690821
15508	NC_015067	GAC	2	6	793685	793690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15509	NC_015067	CTG	2	6	793694	793699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15510	NC_015067	CGA	2	6	793705	793710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15511	NC_015067	CGCCA	2	10	793873	793882	20 %	0 %	20 %	60 %	322690821
15512	NC_015067	GGT	2	6	793912	793917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690821
15513	NC_015067	CTG	2	6	793943	793948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15514	NC_015067	CGA	2	6	793987	793992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15515	NC_015067	GC	4	8	794032	794039	0 %	0 %	50 %	50 %	322690821
15516	NC_015067	CAC	2	6	794044	794049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690821
15517	NC_015067	AAG	2	6	794057	794062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690821
15518	NC_015067	CTG	2	6	794087	794092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15519	NC_015067	CTG	2	6	794153	794158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15520	NC_015067	CTG	2	6	794204	794209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15521	NC_015067	TGG	2	6	794241	794246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690821
15522	NC_015067	AAGG	2	8	794264	794271	50 %	0 %	50 %	0 %	322690821
15523	NC_015067	CGA	2	6	794353	794358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15524	NC_015067	ACC	2	6	794360	794365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690821
15525	NC_015067	CGA	2	6	794386	794391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15526	NC_015067	CGC	2	6	794402	794407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690821
15527	NC_015067	AAG	2	6	794462	794467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690821
15528	NC_015067	AGG	2	6	794496	794501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690821
15529	NC_015067	CTTG	2	8	794518	794525	0 %	50 %	25 %	25 %	322690821
15530	NC_015067	GAG	2	6	794612	794617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690821
15531	NC_015067	GGCC	2	8	794626	794633	0 %	0 %	50 %	50 %	322690821
15532	NC_015067	CCG	3	9	794688	794696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690821
15533	NC_015067	AAC	2	6	794697	794702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690821
15534	NC_015067	CGA	2	6	794731	794736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690821
15535	NC_015067	A	6	6	794750	794755	100 %	0 %	0 %	0 %	322690821
15536	NC_015067	CAA	2	6	794779	794784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690821
15537	NC_015067	ATC	2	6	794986	794991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690822
15538	NC_015067	GTG	2	6	794998	795003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690822
15539	NC_015067	GTT	2	6	795009	795014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690822
15540	NC_015067	TCG	2	6	795020	795025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690822
15541	NC_015067	CCA	2	6	795062	795067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690822
15542	NC_015067	GCA	2	6	795078	795083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690822
15543	NC_015067	CTT	2	6	795090	795095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690822
15544	NC_015067	CGG	2	6	795117	795122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690822
15545	NC_015067	TTC	2	6	795133	795138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690822
15546	NC_015067	GGCT	2	8	795172	795179	0 %	25 %	50 %	25 %	322690822
15547	NC_015067	TTC	2	6	795358	795363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690822
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15550	NC_015067	CAT	2	6	795444	795449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690822
15551	NC_015067	ATC	2	6	795466	795471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690822
15552	NC_015067	CGA	2	6	795480	795485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690822
15553	NC_015067	ACG	2	6	795488	795493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690822
15554	NC_015067	CAC	2	6	795507	795512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690822
15555	NC_015067	GCGT	2	8	795521	795528	0 %	25 %	50 %	25 %	322690822
15556	NC_015067	CAC	2	6	795567	795572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690822
15557	NC_015067	GCA	2	6	795672	795677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690822
15558	NC_015067	CTG	2	6	795688	795693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690822
15559	NC_015067	TGCTC	2	10	795696	795705	0 %	40 %	20 %	40 %	322690822
15560	NC_015067	CCTG	2	8	795720	795727	0 %	25 %	25 %	50 %	322690822
15561	NC_015067	GTG	2	6	795739	795744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690822
15562	NC_015067	TCA	2	6	795767	795772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690822
15563	NC_015067	TCA	2	6	795803	795808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690822
15564	NC_015067	CGG	2	6	795810	795815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690822
15565	NC_015067	GCTG	2	8	795858	795865	0 %	25 %	50 %	25 %	322690822
15566	NC_015067	GGC	2	6	795883	795888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690822
15567	NC_015067	CCT	2	6	796169	796174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690823
15568	NC_015067	ACA	2	6	796252	796257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690823
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15570	NC_015067	AAG	2	6	796344	796349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690823
15571	NC_015067	TCA	2	6	796399	796404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690823
15572	NC_015067	TGA	2	6	796409	796414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690823
15573	NC_015067	CGA	2	6	796424	796429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690823
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15576	NC_015067	GTC	2	6	796557	796562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690823
15577	NC_015067	TCC	2	6	796578	796583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690823
15578	NC_015067	CAT	2	6	796682	796687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690823
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15583	NC_015067	CCA	2	6	797095	797100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690823
15584	NC_015067	TCC	2	6	797172	797177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690823
15585	NC_015067	TCC	2	6	797190	797195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690823
15586	NC_015067	GCC	2	6	797292	797297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690823
15587	NC_015067	CTGG	2	8	797336	797343	0 %	25 %	50 %	25 %	322690823
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15590	NC_015067	ACC	2	6	797785	797790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690824
15591	NC_015067	GAA	2	6	797886	797891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690824
15592	NC_015067	TGG	2	6	797954	797959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690824
15593	NC_015067	TCGG	2	8	798001	798008	0 %	25 %	50 %	25 %	322690824
15594	NC_015067	GTT	2	6	798021	798026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690824
15595	NC_015067	CCGG	2	8	798034	798041	0 %	0 %	50 %	50 %	322690824
15596	NC_015067	GCGAT	2	10	798067	798076	20 %	20 %	40 %	20 %	322690824
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15599	NC_015067	GAA	2	6	798660	798665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690825
15600	NC_015067	GAA	2	6	798670	798675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690825
15601	NC_015067	CGA	2	6	798705	798710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690825
15602	NC_015067	CTG	2	6	798743	798748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690825
15603	NC_015067	GCC	2	6	798868	798873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690825
15604	NC_015067	CGT	2	6	798999	799004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690825
15605	NC_015067	GAA	2	6	799038	799043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690825
15606	NC_015067	GCT	2	6	799098	799103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690825
15607	NC_015067	ACC	2	6	799192	799197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690825
15608	NC_015067	AAG	2	6	799228	799233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690825
15609	NC_015067	GAG	2	6	799249	799254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690825
15610	NC_015067	TCG	2	6	799262	799267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690825
15611	NC_015067	CTG	2	6	799282	799287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690825
15612	NC_015067	AGA	2	6	799334	799339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690825
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15614	NC_015067	CAT	2	6	799383	799388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690825
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