MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015067	CTA	2	6	663403	663408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690703
13002	NC_015067	GAA	2	6	663446	663451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690703
13003	NC_015067	ACC	3	9	663513	663521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690703
13004	NC_015067	GAA	2	6	663524	663529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690703
13005	NC_015067	TCGTGC	2	12	663634	663645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690703
13006	NC_015067	GCG	2	6	663646	663651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690703
13007	NC_015067	CGTG	2	8	663689	663696	0 %	25 %	50 %	25 %	322690703
13008	NC_015067	GC	3	6	663697	663702	0 %	0 %	50 %	50 %	322690703
13009	NC_015067	AAG	2	6	663756	663761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690703
13010	NC_015067	AAG	2	6	663797	663802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690704
13011	NC_015067	CGT	2	6	663805	663810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690704
13012	NC_015067	CGATC	2	10	663817	663826	20 %	20 %	20 %	40 %	322690704
13013	NC_015067	GTG	2	6	663839	663844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690704
13014	NC_015067	TCA	2	6	663852	663857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690704
13015	NC_015067	AAG	2	6	663878	663883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690704
13016	NC_015067	GC	3	6	663964	663969	0 %	0 %	50 %	50 %	322690704
13017	NC_015067	ACA	2	6	663975	663980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690704
13018	NC_015067	TCCG	2	8	663981	663988	0 %	25 %	25 %	50 %	322690704
13019	NC_015067	CCG	2	6	664006	664011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690704
13020	NC_015067	CGCTG	2	10	664074	664083	0 %	20 %	40 %	40 %	322690704
13021	NC_015067	CGT	2	6	664106	664111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690704
13022	NC_015067	ACG	2	6	664303	664308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13023	NC_015067	CAT	2	6	664322	664327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690705
13024	NC_015067	ACC	2	6	664350	664355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690705
13025	NC_015067	ACG	2	6	664411	664416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13026	NC_015067	CCA	2	6	664423	664428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690705
13027	NC_015067	GCAGGA	2	12	664442	664453	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322690705
13028	NC_015067	GCT	2	6	664476	664481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13029	NC_015067	ACC	2	6	664482	664487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690705
13030	NC_015067	CAT	2	6	664538	664543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690705
13031	NC_015067	TGCCGT	2	12	664607	664618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13032	NC_015067	AAGG	2	8	664629	664636	50 %	0 %	50 %	0 %	322690705
13033	NC_015067	TCA	2	6	664702	664707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690705
13034	NC_015067	CTA	2	6	664736	664741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690705
13035	NC_015067	GAG	2	6	664872	664877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690705
13036	NC_015067	GAC	2	6	664911	664916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13037	NC_015067	CGA	3	9	664973	664981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13038	NC_015067	TTC	2	6	664995	665000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690705
13039	NC_015067	GCGT	2	8	665038	665045	0 %	25 %	50 %	25 %	322690705
13040	NC_015067	TCT	2	6	665077	665082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690705
13041	NC_015067	CCAC	2	8	665260	665267	25 %	0 %	0 %	75 %	322690705
13042	NC_015067	GAA	2	6	665351	665356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690705
13043	NC_015067	GAA	2	6	665450	665455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690705
13044	NC_015067	ACC	2	6	665460	665465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690705
13045	NC_015067	CGA	2	6	665486	665491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13046	NC_015067	CGAC	2	8	665629	665636	25 %	0 %	25 %	50 %	322690705
13047	NC_015067	CAT	2	6	665687	665692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690705
13048	NC_015067	AAG	2	6	665802	665807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690705
13049	NC_015067	GGT	2	6	665814	665819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690705
13050	NC_015067	TGA	2	6	665842	665847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690705
13051	NC_015067	ACC	2	6	665865	665870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690705
13052	NC_015067	TTCGAG	2	12	665883	665894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690705
13053	NC_015067	CGG	2	6	665906	665911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690705
13054	NC_015067	CCG	2	6	665920	665925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690705
13055	NC_015067	AGG	2	6	665956	665961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690705
13056	NC_015067	TCC	2	6	666045	666050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690705
13057	NC_015067	ACG	2	6	666343	666348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690705
13058	NC_015067	GAG	2	6	666369	666374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690705
13059	NC_015067	ATC	2	6	666375	666380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690705
13060	NC_015067	GCG	2	6	666391	666396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690705
13061	NC_015067	GCC	2	6	666661	666666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690706
13062	NC_015067	TGC	2	6	666677	666682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13063	NC_015067	GAG	2	6	666685	666690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690706
13064	NC_015067	GCC	2	6	666748	666753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690706
13065	NC_015067	GAA	2	6	666846	666851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690706
13066	NC_015067	TGC	2	6	666864	666869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13067	NC_015067	GATG	2	8	666873	666880	25 %	25 %	50 %	0 %	322690706
13068	NC_015067	GCC	2	6	666898	666903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690706
13069	NC_015067	TGC	2	6	666938	666943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13070	NC_015067	TCG	2	6	666974	666979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13071	NC_015067	CGA	2	6	667002	667007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13072	NC_015067	TCG	2	6	667025	667030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13073	NC_015067	AAG	2	6	667031	667036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690706
13074	NC_015067	CCT	2	6	667047	667052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690706
13075	NC_015067	CGA	2	6	667053	667058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13076	NC_015067	ACG	3	9	667115	667123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13077	NC_015067	CGA	2	6	667176	667181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13078	NC_015067	TCCG	2	8	667331	667338	0 %	25 %	25 %	50 %	322690706
13079	NC_015067	CAG	2	6	667342	667347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690706
13080	NC_015067	ACC	2	6	667348	667353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690706
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13082	NC_015067	GGC	2	6	667537	667542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690706
13083	NC_015067	TTC	2	6	667555	667560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690706
13084	NC_015067	CAC	2	6	667590	667595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690706
13085	NC_015067	GGA	2	6	667695	667700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690706
13086	NC_015067	GAT	2	6	667980	667985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690707
13087	NC_015067	AGC	2	6	668126	668131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690707
13088	NC_015067	CGAA	2	8	668267	668274	50 %	0 %	25 %	25 %	322690707
13089	NC_015067	TCGTGT	2	12	668312	668323	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322690707
13090	NC_015067	GCA	2	6	668348	668353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690707
13091	NC_015067	GCGCC	2	10	668379	668388	0 %	0 %	40 %	60 %	322690707
13092	NC_015067	CGG	2	6	668447	668452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690707
13093	NC_015067	AGCTGG	2	12	668462	668473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690707
13094	NC_015067	CTA	2	6	668480	668485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690707
13095	NC_015067	TGA	2	6	668487	668492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690707
13096	NC_015067	GC	3	6	668554	668559	0 %	0 %	50 %	50 %	322690707
13097	NC_015067	GCTCG	2	10	668581	668590	0 %	20 %	40 %	40 %	322690707
13098	NC_015067	CAAGGC	2	12	668673	668684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690707
13099	NC_015067	GCC	2	6	668906	668911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690708
13100	NC_015067	GTC	2	6	668941	668946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690708
13101	NC_015067	GC	3	6	668976	668981	0 %	0 %	50 %	50 %	322690708
13102	NC_015067	GTGAC	2	10	669006	669015	20 %	20 %	40 %	20 %	322690708
13103	NC_015067	CA	3	6	669019	669024	50 %	0 %	0 %	50 %	322690708
13104	NC_015067	AGG	2	6	669105	669110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690708
13105	NC_015067	CTG	2	6	669158	669163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690708
13106	NC_015067	TGA	2	6	669222	669227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690708
13107	NC_015067	GTG	2	6	669278	669283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690708
13108	NC_015067	GCAC	2	8	669443	669450	25 %	0 %	25 %	50 %	322690708
13109	NC_015067	GCG	2	6	669470	669475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690708
13110	NC_015067	GGC	2	6	669481	669486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690708
13111	NC_015067	CCG	2	6	669492	669497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690708
13112	NC_015067	GCC	2	6	669524	669529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690708
13113	NC_015067	CGG	2	6	669534	669539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690708
13114	NC_015067	GCG	2	6	669577	669582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690708
13115	NC_015067	ATT	2	6	669644	669649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690708
13116	NC_015067	GCTGC	2	10	669650	669659	0 %	20 %	40 %	40 %	322690708
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13118	NC_015067	GA	3	6	669839	669844	50 %	0 %	50 %	0 %	322690709
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13350	NC_015067	GAT	2	6	682231	682236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690723
13351	NC_015067	T	6	6	682246	682251	0 %	100 %	0 %	0 %	322690723
13352	NC_015067	ACGCC	2	10	682292	682301	20 %	0 %	20 %	60 %	322690723
13353	NC_015067	TTC	2	6	682342	682347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690723
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13355	NC_015067	TGG	2	6	682451	682456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690723
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13470	NC_015067	CGT	2	6	690932	690937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690734
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13474	NC_015067	GCG	2	6	691120	691125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690734
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13479	NC_015067	CAG	2	6	691644	691649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690735
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