MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_015067	CTGGC	2	10	639604	639613	0 %	20 %	40 %	40 %	322690686
12503	NC_015067	GGT	2	6	639679	639684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690686
12504	NC_015067	TCG	2	6	639722	639727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690686
12505	NC_015067	TCG	2	6	639740	639745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690686
12506	NC_015067	GCC	2	6	639748	639753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690686
12507	NC_015067	GCA	2	6	639840	639845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690686
12508	NC_015067	GCC	2	6	639922	639927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690686
12509	NC_015067	GGGT	2	8	639932	639939	0 %	25 %	75 %	0 %	322690686
12510	NC_015067	GTT	2	6	640084	640089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690687
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12512	NC_015067	GCCG	2	8	640171	640178	0 %	0 %	50 %	50 %	322690687
12513	NC_015067	GAT	2	6	640181	640186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690687
12514	NC_015067	GAA	2	6	640204	640209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690687
12515	NC_015067	GGC	2	6	640279	640284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690687
12516	NC_015067	GCC	2	6	640285	640290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690687
12517	NC_015067	TCA	2	6	640296	640301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690687
12518	NC_015067	TCG	2	6	640325	640330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690687
12519	NC_015067	TCA	2	6	640376	640381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690687
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12526	NC_015067	GCT	2	6	640860	640865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690687
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12528	NC_015067	GC	3	6	640983	640988	0 %	0 %	50 %	50 %	322690687
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12532	NC_015067	TCT	2	6	641088	641093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690687
12533	NC_015067	ATGG	2	8	641242	641249	25 %	25 %	50 %	0 %	322690687
12534	NC_015067	GCG	2	6	641293	641298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690687
12535	NC_015067	GAT	2	6	641347	641352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690687
12536	NC_015067	GAT	2	6	641371	641376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690687
12537	NC_015067	CAT	2	6	641400	641405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690687
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12539	NC_015067	TC	3	6	641502	641507	0 %	50 %	0 %	50 %	322690688
12540	NC_015067	TCC	2	6	641552	641557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690688
12541	NC_015067	TGGC	2	8	641564	641571	0 %	25 %	50 %	25 %	322690688
12542	NC_015067	CG	3	6	641580	641585	0 %	0 %	50 %	50 %	322690688
12543	NC_015067	GC	3	6	641592	641597	0 %	0 %	50 %	50 %	322690688
12544	NC_015067	GGC	2	6	641599	641604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690688
12545	NC_015067	GGTC	2	8	641613	641620	0 %	25 %	50 %	25 %	322690688
12546	NC_015067	AGA	2	6	641669	641674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690688
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12549	NC_015067	GCGCC	2	10	641892	641901	0 %	0 %	40 %	60 %	322690688
12550	NC_015067	GC	3	6	641912	641917	0 %	0 %	50 %	50 %	322690688
12551	NC_015067	ACC	2	6	641960	641965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690688
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12553	NC_015067	GC	3	6	642075	642080	0 %	0 %	50 %	50 %	322690688
12554	NC_015067	ATGC	2	8	642147	642154	25 %	25 %	25 %	25 %	322690688
12555	NC_015067	TGG	2	6	642174	642179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690688
12556	NC_015067	CTG	2	6	642283	642288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690688
12557	NC_015067	CG	3	6	642292	642297	0 %	0 %	50 %	50 %	322690688
12558	NC_015067	CGC	2	6	642300	642305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690688
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12560	NC_015067	TCG	2	6	642389	642394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690688
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12598	NC_015067	GGTCG	2	10	644369	644378	0 %	20 %	60 %	20 %	322690689
12599	NC_015067	TCG	3	9	644400	644408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690689
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12602	NC_015067	GAT	2	6	644493	644498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690689
12603	NC_015067	GGA	2	6	644510	644515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690689
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12605	NC_015067	TGA	2	6	644558	644563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690689
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12609	NC_015067	CATGGA	2	12	644678	644689	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690689
12610	NC_015067	ACG	2	6	644766	644771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690690
12611	NC_015067	CAT	2	6	644773	644778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690690
12612	NC_015067	CCA	2	6	644824	644829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690690
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12614	NC_015067	TGT	2	6	645085	645090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690691
12615	NC_015067	CA	3	6	645125	645130	50 %	0 %	0 %	50 %	322690691
12616	NC_015067	TGC	2	6	645144	645149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690691
12617	NC_015067	CCATG	2	10	645155	645164	20 %	20 %	20 %	40 %	322690691
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12977	NC_015067	GAC	2	6	661743	661748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690702
12978	NC_015067	TCG	2	6	661783	661788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690702
12979	NC_015067	TCA	3	9	661804	661812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690702
12980	NC_015067	TCG	2	6	661882	661887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690702
12981	NC_015067	GCT	2	6	661888	661893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690702
12982	NC_015067	CCT	2	6	661906	661911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690702
12983	NC_015067	TGA	2	6	661918	661923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690702
12984	NC_015067	GTG	2	6	661936	661941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690702
12985	NC_015067	GCT	2	6	662003	662008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690702
12986	NC_015067	GCT	2	6	662015	662020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690702
12987	NC_015067	GGT	2	6	662075	662080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690702
12988	NC_015067	AAG	2	6	662127	662132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690702
12989	NC_015067	ATC	2	6	662187	662192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690702
12990	NC_015067	GCC	2	6	662205	662210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690702
12991	NC_015067	TGG	2	6	662242	662247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690702
12992	NC_015067	GGT	2	6	662255	662260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690702
12993	NC_015067	GGCTTC	2	12	662292	662303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690702
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12995	NC_015067	CCT	2	6	662416	662421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690702
12996	NC_015067	CAAC	2	8	662425	662432	50 %	0 %	0 %	50 %	322690702
12997	NC_015067	TGCCG	2	10	662441	662450	0 %	20 %	40 %	40 %	322690702
12998	NC_015067	CTT	2	6	662456	662461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690702
12999	NC_015067	TGG	2	6	662502	662507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690702
13000	NC_015067	GCC	2	6	662613	662618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690702

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