MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015067	CCA	2	6	540786	540791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690607
10502	NC_015067	GAC	2	6	540797	540802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
10503	NC_015067	CTG	3	9	540839	540847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690607
10504	NC_015067	CT	3	6	540888	540893	0 %	50 %	0 %	50 %	322690607
10505	NC_015067	CGA	2	6	540910	540915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690607
10506	NC_015067	CG	3	6	540938	540943	0 %	0 %	50 %	50 %	322690607
10507	NC_015067	CG	3	6	541233	541238	0 %	0 %	50 %	50 %	322690608
10508	NC_015067	GTC	2	6	541247	541252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10509	NC_015067	TGC	2	6	541285	541290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10510	NC_015067	ATG	2	6	541344	541349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690608
10511	NC_015067	GCC	2	6	541416	541421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690608
10512	NC_015067	TCGCCT	2	12	541531	541542	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322690608
10513	NC_015067	GCT	2	6	541571	541576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10514	NC_015067	CAT	3	9	541589	541597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690608
10515	NC_015067	GCT	2	6	541679	541684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10516	NC_015067	GCC	2	6	541707	541712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690608
10517	NC_015067	GGC	2	6	541748	541753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
10518	NC_015067	TGGC	2	8	541755	541762	0 %	25 %	50 %	25 %	322690608
10519	NC_015067	CGG	2	6	541817	541822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
10520	NC_015067	TTC	2	6	541830	541835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690608
10521	NC_015067	CTG	2	6	541906	541911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10522	NC_015067	GCG	2	6	541957	541962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
10523	NC_015067	CCA	2	6	542065	542070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690608
10524	NC_015067	GC	3	6	542140	542145	0 %	0 %	50 %	50 %	322690608
10525	NC_015067	GCT	2	6	542207	542212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10526	NC_015067	TTC	2	6	542229	542234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690608
10527	NC_015067	CTG	2	6	542259	542264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690608
10528	NC_015067	CGG	2	6	542344	542349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
10529	NC_015067	ACC	2	6	542379	542384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690608
10530	NC_015067	ATG	2	6	542460	542465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690608
10531	NC_015067	GCG	2	6	542528	542533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690608
10532	NC_015067	GGT	2	6	542890	542895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690609
10533	NC_015067	CGA	2	6	542983	542988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690609
10534	NC_015067	CAC	2	6	543001	543006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690609
10535	NC_015067	ACA	2	6	543009	543014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690609
10536	NC_015067	GTC	2	6	543023	543028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690609
10537	NC_015067	CCGT	2	8	543041	543048	0 %	25 %	25 %	50 %	322690609
10538	NC_015067	AAC	2	6	543056	543061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690609
10539	NC_015067	GTG	2	6	543092	543097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690609
10540	NC_015067	CAC	2	6	543103	543108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690609
10541	NC_015067	CGA	2	6	543118	543123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690609
10542	NC_015067	CCG	2	6	543210	543215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690609
10543	NC_015067	ACT	2	6	543225	543230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690609
10544	NC_015067	CCA	2	6	543234	543239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690609
10545	NC_015067	CCG	2	6	543261	543266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690609
10546	NC_015067	CAC	2	6	543281	543286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690609
10547	NC_015067	CCA	2	6	543288	543293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690609
10548	NC_015067	GGC	2	6	543398	543403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690609
10549	NC_015067	GGT	2	6	543415	543420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690609
10550	NC_015067	AGC	2	6	543498	543503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690609
10551	NC_015067	CCGG	2	8	543587	543594	0 %	0 %	50 %	50 %	322690609
10552	NC_015067	GAGC	2	8	543796	543803	25 %	0 %	50 %	25 %	322690610
10553	NC_015067	CTT	2	6	543815	543820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690610
10554	NC_015067	CGC	3	9	543892	543900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690610
10555	NC_015067	TCG	2	6	543921	543926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10556	NC_015067	TGG	2	6	543945	543950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690610
10557	NC_015067	CAC	2	6	543958	543963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690610
10558	NC_015067	AGG	2	6	544020	544025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690610
10559	NC_015067	TCG	2	6	544026	544031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10560	NC_015067	CA	3	6	544071	544076	50 %	0 %	0 %	50 %	322690610
10561	NC_015067	TCG	2	6	544125	544130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10562	NC_015067	TCG	2	6	544167	544172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10563	NC_015067	CGA	2	6	544189	544194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10564	NC_015067	CCG	2	6	544197	544202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690610
10565	NC_015067	ATC	2	6	544211	544216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690610
10566	NC_015067	AAGGTC	2	12	544247	544258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690610
10567	NC_015067	CGAC	2	8	544267	544274	25 %	0 %	25 %	50 %	322690610
10568	NC_015067	AGC	3	9	544341	544349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10569	NC_015067	CAT	2	6	544420	544425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690610
10570	NC_015067	GCA	2	6	544459	544464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10571	NC_015067	CAC	2	6	544495	544500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690610
10572	NC_015067	TCGCC	2	10	544507	544516	0 %	20 %	20 %	60 %	322690610
10573	NC_015067	C	6	6	544527	544532	0 %	0 %	0 %	100 %	322690610
10574	NC_015067	TCAAGG	2	12	544587	544598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690610
10575	NC_015067	CCA	3	9	544611	544619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690610
10576	NC_015067	GC	3	6	544678	544683	0 %	0 %	50 %	50 %	322690610
10577	NC_015067	CTG	2	6	544691	544696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690610
10578	NC_015067	CAAG	2	8	544806	544813	50 %	0 %	25 %	25 %	322690611
10579	NC_015067	CG	4	8	544840	544847	0 %	0 %	50 %	50 %	322690611
10580	NC_015067	CAG	2	6	544922	544927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10581	NC_015067	CCG	2	6	544946	544951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690611
10582	NC_015067	CGC	2	6	544980	544985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690611
10583	NC_015067	CGG	2	6	544987	544992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690611
10584	NC_015067	CTG	2	6	545042	545047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10585	NC_015067	GCG	2	6	545058	545063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690611
10586	NC_015067	GAG	3	9	545075	545083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690611
10587	NC_015067	CGG	2	6	545185	545190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690611
10588	NC_015067	ACC	2	6	545280	545285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690611
10589	NC_015067	AGGTTG	2	12	545298	545309	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322690611
10590	NC_015067	CGGC	2	8	545406	545413	0 %	0 %	50 %	50 %	322690611
10591	NC_015067	ACC	2	6	545460	545465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690611
10592	NC_015067	TCG	2	6	545478	545483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10593	NC_015067	CTG	2	6	545516	545521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10594	NC_015067	ATG	2	6	545522	545527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690611
10595	NC_015067	CCA	2	6	545532	545537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690611
10596	NC_015067	CGGCC	2	10	545578	545587	0 %	0 %	40 %	60 %	322690611
10597	NC_015067	ATC	2	6	545621	545626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690611
10598	NC_015067	TCC	2	6	545639	545644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690611
10599	NC_015067	GCA	2	6	545659	545664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10600	NC_015067	GGT	2	6	545665	545670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690611
10601	NC_015067	CGC	2	6	545674	545679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690611
10602	NC_015067	TCG	2	6	545706	545711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10603	NC_015067	CGC	2	6	545740	545745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690611
10604	NC_015067	CGT	2	6	545779	545784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10605	NC_015067	GAC	2	6	545813	545818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10606	NC_015067	ACC	2	6	545889	545894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690611
10607	NC_015067	CAA	2	6	545980	545985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690611
10608	NC_015067	GTC	2	6	546008	546013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10609	NC_015067	CGC	2	6	546025	546030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690611
10610	NC_015067	GCT	2	6	546064	546069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10611	NC_015067	ACA	2	6	546078	546083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690611
10612	NC_015067	TGG	2	6	546132	546137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690611
10613	NC_015067	GTC	2	6	546236	546241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
10614	NC_015067	CCGTG	2	10	546246	546255	0 %	20 %	40 %	40 %	322690611
10615	NC_015067	GTG	2	6	546356	546361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690611
10616	NC_015067	GTC	2	6	546383	546388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690611
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10618	NC_015067	GAT	2	6	546481	546486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690611
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10853	NC_015067	CGTG	2	8	557058	557065	0 %	25 %	50 %	25 %	322690620
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10974	NC_015067	ATC	2	6	563186	563191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690626
10975	NC_015067	CAT	2	6	563209	563214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690626
10976	NC_015067	TGC	2	6	563235	563240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690626
10977	NC_015067	GCG	2	6	563241	563246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690626
10978	NC_015067	TTC	2	6	563255	563260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690626
10979	NC_015067	TTC	2	6	563267	563272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690626
10980	NC_015067	GTG	2	6	563390	563395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690626
10981	NC_015067	CGC	2	6	563410	563415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690626
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10993	NC_015067	CGCC	2	8	563803	563810	0 %	0 %	25 %	75 %	322690626
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