MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015067	TCGGCG	2	12	491796	491807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690581
9502	NC_015067	CCCG	2	8	491859	491866	0 %	0 %	25 %	75 %	322690581
9503	NC_015067	GCT	2	6	491908	491913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690581
9504	NC_015067	GT	3	6	491967	491972	0 %	50 %	50 %	0 %	322690581
9505	NC_015067	CG	4	8	491980	491987	0 %	0 %	50 %	50 %	322690581
9506	NC_015067	TCC	2	6	492083	492088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690581
9507	NC_015067	TC	3	6	492105	492110	0 %	50 %	0 %	50 %	322690581
9508	NC_015067	GGC	3	9	492161	492169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
9509	NC_015067	AAG	2	6	492212	492217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690581
9510	NC_015067	CG	3	6	492248	492253	0 %	0 %	50 %	50 %	322690581
9511	NC_015067	CGG	2	6	492298	492303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
9512	NC_015067	GGC	2	6	492311	492316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
9513	NC_015067	CTG	2	6	492317	492322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690581
9514	NC_015067	ACG	2	6	492543	492548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690581
9515	NC_015067	GGC	2	6	492577	492582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
9516	NC_015067	CGC	3	9	492595	492603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690581
9517	NC_015067	ACC	2	6	492626	492631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690581
9518	NC_015067	TGGC	2	8	492674	492681	0 %	25 %	50 %	25 %	322690581
9519	NC_015067	CCG	2	6	492693	492698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690581
9520	NC_015067	CGG	2	6	492739	492744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690581
9521	NC_015067	GCTC	2	8	492814	492821	0 %	25 %	25 %	50 %	322690581
9522	NC_015067	ACG	2	6	493090	493095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690582
9523	NC_015067	CTG	2	6	493155	493160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690582
9524	NC_015067	TCGACC	2	12	493174	493185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690582
9525	NC_015067	CGC	2	6	493231	493236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
9526	NC_015067	GTG	2	6	493263	493268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690582
9527	NC_015067	CGG	2	6	493304	493309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690582
9528	NC_015067	AGG	2	6	493333	493338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690582
9529	NC_015067	GTG	2	6	493383	493388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690582
9530	NC_015067	AAG	2	6	493419	493424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690582
9531	NC_015067	AAG	2	6	493443	493448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690582
9532	NC_015067	TCG	2	6	493486	493491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690582
9533	NC_015067	CCA	2	6	493549	493554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690582
9534	NC_015067	GTG	2	6	493641	493646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690582
9535	NC_015067	GGC	2	6	493647	493652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690582
9536	NC_015067	CGA	2	6	493688	493693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690582
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9538	NC_015067	CCG	2	6	493780	493785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
9539	NC_015067	TGC	2	6	493789	493794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690582
9540	NC_015067	TGA	2	6	493811	493816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690582
9541	NC_015067	AAG	2	6	493824	493829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690582
9542	NC_015067	CCG	2	6	493837	493842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690582
9543	NC_015067	GAG	2	6	493857	493862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690582
9544	NC_015067	TGCA	2	8	493977	493984	25 %	25 %	25 %	25 %	322690583
9545	NC_015067	GCA	2	6	494014	494019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
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9547	NC_015067	TTG	2	6	494127	494132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690583
9548	NC_015067	GAT	2	6	494160	494165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690583
9549	NC_015067	AGCCG	2	10	494244	494253	20 %	0 %	40 %	40 %	322690583
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9552	NC_015067	GGTGGG	2	12	494297	494308	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	322690583
9553	NC_015067	CATC	2	8	494335	494342	25 %	25 %	0 %	50 %	322690583
9554	NC_015067	AGC	2	6	494356	494361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
9555	NC_015067	GCA	2	6	494487	494492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
9556	NC_015067	GGGC	2	8	494527	494534	0 %	0 %	75 %	25 %	322690583
9557	NC_015067	AGC	2	6	494596	494601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690583
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9560	NC_015067	CTTGG	2	10	494769	494778	0 %	40 %	40 %	20 %	322690583
9561	NC_015067	GCG	2	6	494835	494840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
9562	NC_015067	GCG	2	6	494843	494848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
9563	NC_015067	GGC	2	6	494865	494870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690583
9564	NC_015067	TGC	2	6	494875	494880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690583
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9570	NC_015067	CTT	2	6	495515	495520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690584
9571	NC_015067	GCT	2	6	495537	495542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690584
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9573	NC_015067	TGG	2	6	495597	495602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690584
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9575	NC_015067	CTGG	2	8	495651	495658	0 %	25 %	50 %	25 %	322690584
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9582	NC_015067	CGAT	2	8	495970	495977	25 %	25 %	25 %	25 %	322690584
9583	NC_015067	CAT	2	6	495978	495983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690584
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9588	NC_015067	GCC	2	6	496265	496270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690585
9589	NC_015067	CGA	2	6	496338	496343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
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9591	NC_015067	TCG	2	6	496398	496403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
9592	NC_015067	GAA	2	6	496411	496416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690585
9593	NC_015067	GCA	2	6	496432	496437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
9594	NC_015067	GTG	2	6	496442	496447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690585
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9596	NC_015067	TGCG	2	8	496503	496510	0 %	25 %	50 %	25 %	322690585
9597	NC_015067	ACCT	2	8	496520	496527	25 %	25 %	0 %	50 %	322690585
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9601	NC_015067	CAG	2	6	496565	496570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690585
9602	NC_015067	TGC	2	6	496584	496589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690585
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9604	NC_015067	CAA	2	6	496750	496755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690585
9605	NC_015067	CCG	3	9	496800	496808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690585
9606	NC_015067	GTG	2	6	496817	496822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690585
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9609	NC_015067	AGGA	2	8	496938	496945	50 %	0 %	50 %	0 %	322690585
9610	NC_015067	GCATC	2	10	497071	497080	20 %	20 %	20 %	40 %	322690585
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9617	NC_015067	CCA	2	6	497334	497339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690585
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9982	NC_015067	GCCG	2	8	515213	515220	0 %	0 %	50 %	50 %	322690597
9983	NC_015067	TAC	2	6	515268	515273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690597
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