MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015067	CAT	2	6	438149	438154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690541
8502	NC_015067	CGG	2	6	438155	438160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690541
8503	NC_015067	CTT	2	6	438184	438189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690541
8504	NC_015067	GTC	2	6	438216	438221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690541
8505	NC_015067	GCT	2	6	438479	438484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8506	NC_015067	TGC	3	9	438517	438525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8507	NC_015067	CGC	2	6	438536	438541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8508	NC_015067	CA	3	6	438550	438555	50 %	0 %	0 %	50 %	322690542
8509	NC_015067	CGC	2	6	438569	438574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8510	NC_015067	CAC	2	6	438617	438622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690542
8511	NC_015067	CCA	2	6	438697	438702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690542
8512	NC_015067	CA	3	6	438701	438706	50 %	0 %	0 %	50 %	322690542
8513	NC_015067	GCC	2	6	438729	438734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8514	NC_015067	TGG	2	6	438778	438783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690542
8515	NC_015067	CG	3	6	438805	438810	0 %	0 %	50 %	50 %	322690542
8516	NC_015067	CCG	2	6	438835	438840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8517	NC_015067	CTT	2	6	438866	438871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690542
8518	NC_015067	GCCG	2	8	438950	438957	0 %	0 %	50 %	50 %	322690542
8519	NC_015067	GC	3	6	438976	438981	0 %	0 %	50 %	50 %	322690542
8520	NC_015067	ATT	3	9	438987	438995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690542
8521	NC_015067	CCG	2	6	439018	439023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8522	NC_015067	A	6	6	439035	439040	100 %	0 %	0 %	0 %	322690542
8523	NC_015067	GAA	2	6	439106	439111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690542
8524	NC_015067	CGA	2	6	439121	439126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8525	NC_015067	GCC	3	9	439131	439139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8526	NC_015067	AAG	2	6	439149	439154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690542
8527	NC_015067	TGC	2	6	439186	439191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8528	NC_015067	CGG	2	6	439235	439240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690542
8529	NC_015067	GCG	2	6	439242	439247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690542
8530	NC_015067	CCG	2	6	439285	439290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8531	NC_015067	GCC	2	6	439293	439298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8532	NC_015067	GCC	2	6	439311	439316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8533	NC_015067	CGC	2	6	439337	439342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8534	NC_015067	TGC	2	6	439444	439449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8535	NC_015067	TTC	2	6	439461	439466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690542
8536	NC_015067	CCA	2	6	439522	439527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690542
8537	NC_015067	CTG	2	6	439542	439547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8538	NC_015067	GCCC	2	8	439559	439566	0 %	0 %	25 %	75 %	322690542
8539	NC_015067	GCC	2	6	439707	439712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8540	NC_015067	CAA	2	6	439716	439721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690542
8541	NC_015067	TCG	2	6	439792	439797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8542	NC_015067	GCT	2	6	439832	439837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8543	NC_015067	GA	3	6	439906	439911	50 %	0 %	50 %	0 %	322690542
8544	NC_015067	CGC	2	6	440129	440134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8545	NC_015067	GCCAGC	2	12	440149	440160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322690542
8546	NC_015067	ATCGCC	2	12	440163	440174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690542
8547	NC_015067	GTATTC	2	12	440199	440210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322690542
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8549	NC_015067	GCA	2	6	440287	440292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8550	NC_015067	TGATCA	2	12	440299	440310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322690542
8551	NC_015067	GTG	3	9	440346	440354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690542
8552	NC_015067	GGC	2	6	440402	440407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690542
8553	NC_015067	CGG	2	6	440408	440413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690542
8554	NC_015067	GTT	2	6	440426	440431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690542
8555	NC_015067	ACT	2	6	440433	440438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690542
8556	NC_015067	ACC	2	6	440467	440472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690542
8557	NC_015067	CAGC	2	8	440475	440482	25 %	0 %	25 %	50 %	322690542
8558	NC_015067	AGCGGG	2	12	440502	440513	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	322690542
8559	NC_015067	TCA	2	6	440569	440574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690542
8560	NC_015067	ACT	2	6	440579	440584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690542
8561	NC_015067	CGGC	2	8	440629	440636	0 %	0 %	50 %	50 %	322690542
8562	NC_015067	CAT	2	6	440678	440683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690542
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8564	NC_015067	CGC	2	6	440862	440867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8565	NC_015067	GGCAAG	2	12	440889	440900	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322690542
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8569	NC_015067	GGC	2	6	441014	441019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690542
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8571	NC_015067	CAT	2	6	441074	441079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690542
8572	NC_015067	CTT	2	6	441089	441094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690542
8573	NC_015067	CGGC	2	8	441136	441143	0 %	0 %	50 %	50 %	322690542
8574	NC_015067	CGA	2	6	441164	441169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690542
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8578	NC_015067	CG	4	8	441241	441248	0 %	0 %	50 %	50 %	322690542
8579	NC_015067	CGG	2	6	441302	441307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690542
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8586	NC_015067	TGG	2	6	441523	441528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690542
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8588	NC_015067	GCA	2	6	441641	441646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690542
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8590	NC_015067	GCT	2	6	441701	441706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690542
8591	NC_015067	CGC	2	6	441754	441759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8592	NC_015067	CGC	2	6	441783	441788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690542
8593	NC_015067	ATG	2	6	441801	441806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690542
8594	NC_015067	CGAC	2	8	442001	442008	25 %	0 %	25 %	50 %	322690542
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8601	NC_015067	GTC	2	6	442363	442368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690543
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8606	NC_015067	TCG	2	6	442613	442618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690543
8607	NC_015067	CTG	2	6	442644	442649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690543
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8609	NC_015067	AGTC	2	8	442701	442708	25 %	25 %	25 %	25 %	322690543
8610	NC_015067	CCGT	2	8	442751	442758	0 %	25 %	25 %	50 %	322690543
8611	NC_015067	CGT	2	6	442767	442772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690543
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8613	NC_015067	CGC	2	6	442817	442822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690543
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8618	NC_015067	GC	3	6	442925	442930	0 %	0 %	50 %	50 %	322690543
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