MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015067	CGC	2	6	335532	335537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690450
6502	NC_015067	ACG	2	6	335589	335594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690450
6503	NC_015067	GAC	2	6	335612	335617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690450
6504	NC_015067	CGG	2	6	335768	335773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690451
6505	NC_015067	CAG	2	6	335780	335785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690451
6506	NC_015067	ACC	2	6	335946	335951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690451
6507	NC_015067	CTTGGA	2	12	336131	336142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690451
6508	NC_015067	GTG	2	6	336210	336215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690451
6509	NC_015067	GTA	2	6	336242	336247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690451
6510	NC_015067	GAG	2	6	336252	336257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690451
6511	NC_015067	CTC	2	6	336374	336379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690451
6512	NC_015067	GCA	2	6	336403	336408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690451
6513	NC_015067	CTT	2	6	336506	336511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690451
6514	NC_015067	AGA	2	6	336515	336520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690451
6515	NC_015067	GAA	2	6	336543	336548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690451
6516	NC_015067	GCAG	2	8	336578	336585	25 %	0 %	50 %	25 %	322690451
6517	NC_015067	G	6	6	336637	336642	0 %	0 %	100 %	0 %	322690451
6518	NC_015067	GAA	2	6	336760	336765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690452
6519	NC_015067	GTG	2	6	336829	336834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690452
6520	NC_015067	GGC	2	6	336861	336866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690452
6521	NC_015067	GTC	2	6	336952	336957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690452
6522	NC_015067	TTG	2	6	336979	336984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690452
6523	NC_015067	GCGT	2	8	337033	337040	0 %	25 %	50 %	25 %	322690452
6524	NC_015067	CAT	2	6	337115	337120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690452
6525	NC_015067	GAGC	2	8	337122	337129	25 %	0 %	50 %	25 %	322690452
6526	NC_015067	AGC	2	6	337147	337152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690452
6527	NC_015067	AAG	2	6	337258	337263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690452
6528	NC_015067	CGG	2	6	337380	337385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690452
6529	NC_015067	GCC	2	6	337431	337436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690452
6530	NC_015067	TGG	2	6	337457	337462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690452
6531	NC_015067	TCG	2	6	337548	337553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690452
6532	NC_015067	CA	3	6	337563	337568	50 %	0 %	0 %	50 %	322690452
6533	NC_015067	ATC	2	6	337630	337635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690452
6534	NC_015067	CAG	2	6	337666	337671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690452
6535	NC_015067	GCG	2	6	337685	337690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690452
6536	NC_015067	GAC	2	6	337795	337800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690452
6537	NC_015067	AGG	2	6	337817	337822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690452
6538	NC_015067	TGA	2	6	337828	337833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690452
6539	NC_015067	TG	4	8	337852	337859	0 %	50 %	50 %	0 %	322690453
6540	NC_015067	GCT	2	6	337926	337931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6541	NC_015067	CCA	2	6	337939	337944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690453
6542	NC_015067	GAA	2	6	337976	337981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690453
6543	NC_015067	CGAT	2	8	338005	338012	25 %	25 %	25 %	25 %	322690453
6544	NC_015067	GGGC	2	8	338057	338064	0 %	0 %	75 %	25 %	322690453
6545	NC_015067	ATCA	2	8	338097	338104	50 %	25 %	0 %	25 %	322690453
6546	NC_015067	GGC	2	6	338109	338114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690453
6547	NC_015067	GAC	2	6	338172	338177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6548	NC_015067	CTCG	2	8	338185	338192	0 %	25 %	25 %	50 %	322690453
6549	NC_015067	ACC	3	9	338208	338216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690453
6550	NC_015067	CAG	2	6	338223	338228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6551	NC_015067	CAG	2	6	338265	338270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6552	NC_015067	ATGGCT	2	12	338283	338294	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690453
6553	NC_015067	TGG	2	6	338377	338382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690453
6554	NC_015067	CCG	2	6	338389	338394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690453
6555	NC_015067	TGC	2	6	338470	338475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6556	NC_015067	GCAAC	2	10	338519	338528	40 %	0 %	20 %	40 %	322690453
6557	NC_015067	TGC	2	6	338585	338590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6558	NC_015067	TGG	2	6	338608	338613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690453
6559	NC_015067	CGA	3	9	338678	338686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690453
6560	NC_015067	GTG	2	6	338745	338750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690453
6561	NC_015067	CCG	2	6	338791	338796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690453
6562	NC_015067	GTT	2	6	338837	338842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690453
6563	NC_015067	TTG	3	9	339045	339053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690454
6564	NC_015067	AGC	2	6	339091	339096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690454
6565	NC_015067	GGCG	2	8	339119	339126	0 %	0 %	75 %	25 %	322690454
6566	NC_015067	TGG	2	6	339197	339202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690454
6567	NC_015067	ACC	2	6	339216	339221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690454
6568	NC_015067	CTG	2	6	339270	339275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690454
6569	NC_015067	ACCG	2	8	339287	339294	25 %	0 %	25 %	50 %	322690454
6570	NC_015067	TGCAGG	2	12	339409	339420	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690454
6571	NC_015067	GC	3	6	339421	339426	0 %	0 %	50 %	50 %	322690454
6572	NC_015067	GCCG	2	8	339447	339454	0 %	0 %	50 %	50 %	322690454
6573	NC_015067	GAC	2	6	339486	339491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690454
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6575	NC_015067	GCC	2	6	339537	339542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690454
6576	NC_015067	GCC	2	6	339597	339602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690454
6577	NC_015067	GCC	2	6	339647	339652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690454
6578	NC_015067	GAG	2	6	339681	339686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690454
6579	NC_015067	GCC	3	9	339702	339710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690454
6580	NC_015067	ACGTG	2	10	339809	339818	20 %	20 %	40 %	20 %	322690454
6581	NC_015067	TGCCGC	2	12	339821	339832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690454
6582	NC_015067	TGGCTG	2	12	339862	339873	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322690454
6583	NC_015067	GCC	2	6	339933	339938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690454
6584	NC_015067	GCCCGC	2	12	340020	340031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690454
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6586	NC_015067	TCC	2	6	340199	340204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690455
6587	NC_015067	ATC	2	6	340210	340215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690455
6588	NC_015067	ACGG	2	8	340230	340237	25 %	0 %	50 %	25 %	322690455
6589	NC_015067	GCG	2	6	340350	340355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690455
6590	NC_015067	CCG	2	6	340364	340369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690455
6591	NC_015067	TGA	2	6	340422	340427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690455
6592	NC_015067	GCC	2	6	340435	340440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690455
6593	NC_015067	TGA	2	6	340446	340451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690455
6594	NC_015067	GCC	2	6	340501	340506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690455
6595	NC_015067	ACGG	2	8	340508	340515	25 %	0 %	50 %	25 %	322690455
6596	NC_015067	GTA	2	6	340657	340662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690455
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6598	NC_015067	CGT	3	9	340692	340700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690455
6599	NC_015067	CCG	2	6	340704	340709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690455
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6601	NC_015067	GCG	2	6	340729	340734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690455
6602	NC_015067	GCTGGT	2	12	340994	341005	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322690456
6603	NC_015067	GCCG	2	8	341354	341361	0 %	0 %	50 %	50 %	322690457
6604	NC_015067	GGCG	2	8	341450	341457	0 %	0 %	75 %	25 %	322690457
6605	NC_015067	GAA	2	6	341489	341494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690457
6606	NC_015067	TG	3	6	341537	341542	0 %	50 %	50 %	0 %	322690457
6607	NC_015067	CCA	2	6	341548	341553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690457
6608	NC_015067	GAA	2	6	341561	341566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690457
6609	NC_015067	GCCC	2	8	341627	341634	0 %	0 %	25 %	75 %	322690457
6610	NC_015067	CAA	2	6	341648	341653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690457
6611	NC_015067	GC	3	6	341668	341673	0 %	0 %	50 %	50 %	322690457
6612	NC_015067	GGT	2	6	341863	341868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690458
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6616	NC_015067	CCA	2	6	342054	342059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690458
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6618	NC_015067	TCA	2	6	342150	342155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690458
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6982	NC_015067	TCT	2	6	360368	360373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690473
6983	NC_015067	GC	3	6	360377	360382	0 %	0 %	50 %	50 %	322690473
6984	NC_015067	CAC	2	6	360393	360398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690473
6985	NC_015067	TCA	2	6	360415	360420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690473
6986	NC_015067	TCGG	2	8	360514	360521	0 %	25 %	50 %	25 %	322690473
6987	NC_015067	GCC	2	6	360538	360543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690473
6988	NC_015067	GCA	2	6	360545	360550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690473
6989	NC_015067	GCC	2	6	360561	360566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690473
6990	NC_015067	GAT	2	6	360581	360586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690473
6991	NC_015067	CAT	2	6	361124	361129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690474
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6993	NC_015067	CAC	2	6	361238	361243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690474
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6995	NC_015067	TCGCT	2	10	361447	361456	0 %	40 %	20 %	40 %	322690475
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7000	NC_015067	GTG	2	6	361629	361634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690475

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