MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015067	GAAG	2	8	260810	260817	50 %	0 %	50 %	0 %	322690394
5002	NC_015067	CGG	2	6	260842	260847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690394
5003	NC_015067	CG	3	6	260876	260881	0 %	0 %	50 %	50 %	322690394
5004	NC_015067	GGC	2	6	260888	260893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690394
5005	NC_015067	CGG	3	9	260904	260912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690394
5006	NC_015067	ATG	2	6	260946	260951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690394
5007	NC_015067	ACG	2	6	260952	260957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5008	NC_015067	CGG	2	6	260974	260979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690394
5009	NC_015067	TGA	2	6	260985	260990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690394
5010	NC_015067	ATC	2	6	261074	261079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690394
5011	NC_015067	GTG	2	6	261110	261115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690394
5012	NC_015067	CGG	2	6	261160	261165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690394
5013	NC_015067	ACCG	2	8	261199	261206	25 %	0 %	25 %	50 %	322690394
5014	NC_015067	TAC	2	6	261221	261226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690394
5015	NC_015067	CGC	2	6	261268	261273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5016	NC_015067	CCG	2	6	261303	261308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5017	NC_015067	GCC	2	6	261392	261397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5018	NC_015067	GGT	2	6	261406	261411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690394
5019	NC_015067	ACG	2	6	261414	261419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5020	NC_015067	GCA	2	6	261442	261447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5021	NC_015067	CAA	2	6	261457	261462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690394
5022	NC_015067	CGA	2	6	261490	261495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5023	NC_015067	GTC	3	9	261527	261535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5024	NC_015067	CGC	3	9	261586	261594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5025	NC_015067	CAC	2	6	261599	261604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690394
5026	NC_015067	GCTC	2	8	261649	261656	0 %	25 %	25 %	50 %	322690394
5027	NC_015067	TAT	2	6	261661	261666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690394
5028	NC_015067	CCG	2	6	261669	261674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5029	NC_015067	GCC	2	6	261692	261697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5030	NC_015067	GCGCC	2	10	261700	261709	0 %	0 %	40 %	60 %	322690394
5031	NC_015067	GAC	2	6	261710	261715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5032	NC_015067	GAC	2	6	261785	261790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5033	NC_015067	CGT	2	6	261830	261835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690394
5034	NC_015067	TGA	2	6	261885	261890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690394
5035	NC_015067	AAG	2	6	262028	262033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690394
5036	NC_015067	GTG	2	6	262085	262090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690394
5037	NC_015067	ATC	2	6	262148	262153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690394
5038	NC_015067	CCGA	2	8	262175	262182	25 %	0 %	25 %	50 %	322690394
5039	NC_015067	TGA	2	6	262262	262267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690394
5040	NC_015067	GCAA	2	8	262270	262277	50 %	0 %	25 %	25 %	322690395
5041	NC_015067	GTG	2	6	262312	262317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690395
5042	NC_015067	ACC	4	12	262513	262524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690395
5043	NC_015067	GCG	2	6	262598	262603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690395
5044	NC_015067	CGG	2	6	262635	262640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690395
5045	NC_015067	GCTCGA	2	12	262665	262676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322690395
5046	NC_015067	TGC	2	6	262727	262732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690395
5047	NC_015067	GCG	2	6	262807	262812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690395
5048	NC_015067	CGC	2	6	262854	262859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5049	NC_015067	CGC	2	6	262863	262868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5050	NC_015067	CAC	2	6	262884	262889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690395
5051	NC_015067	CGA	2	6	262911	262916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690395
5052	NC_015067	GAC	2	6	262942	262947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690395
5053	NC_015067	GGCCG	2	10	262977	262986	0 %	0 %	60 %	40 %	322690395
5054	NC_015067	CTC	2	6	263003	263008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690395
5055	NC_015067	GAG	2	6	263030	263035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690395
5056	NC_015067	CCG	2	6	263060	263065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5057	NC_015067	CCG	2	6	263078	263083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5058	NC_015067	GCC	2	6	263173	263178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5059	NC_015067	GCC	2	6	263215	263220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5060	NC_015067	CCG	2	6	263234	263239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5061	NC_015067	CCG	2	6	263261	263266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5062	NC_015067	CGC	2	6	263277	263282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690395
5063	NC_015067	CTG	3	9	263350	263358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690395
5064	NC_015067	CTCG	2	8	263385	263392	0 %	25 %	25 %	50 %	322690395
5065	NC_015067	ACG	2	6	263435	263440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690395
5066	NC_015067	GCTG	2	8	263465	263472	0 %	25 %	50 %	25 %	322690395
5067	NC_015067	ACTTC	2	10	263483	263492	20 %	40 %	0 %	40 %	322690395
5068	NC_015067	GC	3	6	263496	263501	0 %	0 %	50 %	50 %	322690395
5069	NC_015067	GCGT	2	8	263525	263532	0 %	25 %	50 %	25 %	322690395
5070	NC_015067	ACC	2	6	263736	263741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690395
5071	NC_015067	CCG	3	9	263921	263929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690396
5072	NC_015067	CGA	2	6	263978	263983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690396
5073	NC_015067	GGC	3	9	264015	264023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690396
5074	NC_015067	AGA	2	6	264037	264042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690396
5075	NC_015067	ATC	2	6	264045	264050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690396
5076	NC_015067	GAC	2	6	264051	264056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690396
5077	NC_015067	TGA	2	6	264112	264117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690396
5078	NC_015067	TTG	2	6	264238	264243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690396
5079	NC_015067	CAA	2	6	264353	264358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690396
5080	NC_015067	GC	4	8	264379	264386	0 %	0 %	50 %	50 %	322690396
5081	NC_015067	TGC	2	6	264424	264429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690396
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5083	NC_015067	CCA	2	6	264553	264558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690396
5084	NC_015067	CG	3	6	264560	264565	0 %	0 %	50 %	50 %	322690396
5085	NC_015067	GCC	2	6	264573	264578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690396
5086	NC_015067	TCT	2	6	264756	264761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690397
5087	NC_015067	CTG	2	6	264784	264789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690397
5088	NC_015067	AGC	2	6	264826	264831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690397
5089	NC_015067	TCG	2	6	264836	264841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690397
5090	NC_015067	AAG	2	6	264853	264858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690397
5091	NC_015067	AAG	2	6	264937	264942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690397
5092	NC_015067	GCC	3	9	264943	264951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690397
5093	NC_015067	GCT	2	6	264967	264972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690397
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5099	NC_015067	TCG	2	6	265297	265302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5100	NC_015067	TGC	2	6	265315	265320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5101	NC_015067	CGA	2	6	265433	265438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5102	NC_015067	GC	3	6	265451	265456	0 %	0 %	50 %	50 %	322690398
5103	NC_015067	GCC	2	6	265500	265505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690398
5104	NC_015067	CGA	2	6	265523	265528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5105	NC_015067	CAT	2	6	265670	265675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690398
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5107	NC_015067	GAG	2	6	265746	265751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690398
5108	NC_015067	GACT	2	8	265775	265782	25 %	25 %	25 %	25 %	322690398
5109	NC_015067	CGC	2	6	265823	265828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690398
5110	NC_015067	TGG	2	6	265885	265890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690398
5111	NC_015067	TCG	2	6	265936	265941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5112	NC_015067	TCG	2	6	265978	265983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5113	NC_015067	CGA	2	6	266006	266011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690398
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5115	NC_015067	ATC	3	9	266046	266054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690398
5116	NC_015067	GGC	2	6	266058	266063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690398
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5118	NC_015067	GGA	2	6	266213	266218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690398
5119	NC_015067	CTG	2	6	266229	266234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5120	NC_015067	GCC	2	6	266295	266300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690398
5121	NC_015067	GGCC	2	8	266324	266331	0 %	0 %	50 %	50 %	322690398
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5144	NC_015067	CGTAGA	2	12	267424	267435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690399
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5237	NC_015067	GCTG	2	8	271884	271891	0 %	25 %	50 %	25 %	322690403
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5361	NC_015067	ACGGT	2	10	278533	278542	20 %	20 %	40 %	20 %	322690404
5362	NC_015067	CA	3	6	278545	278550	50 %	0 %	0 %	50 %	322690404
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5475	NC_015067	ATT	2	6	284898	284903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690406
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5479	NC_015067	ATCA	2	8	285112	285119	50 %	25 %	0 %	25 %	322690407
5480	NC_015067	CAG	2	6	285213	285218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690407
5481	NC_015067	GC	3	6	285299	285304	0 %	0 %	50 %	50 %	322690407
5482	NC_015067	GGCCG	2	10	285327	285336	0 %	0 %	60 %	40 %	322690407
5483	NC_015067	CGG	2	6	285419	285424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690407
5484	NC_015067	GTC	2	6	285435	285440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690407
5485	NC_015067	GGC	2	6	285558	285563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690407
5486	NC_015067	CGGC	2	8	285586	285593	0 %	0 %	50 %	50 %	322690407
5487	NC_015067	TGG	2	6	285608	285613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690407
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5491	NC_015067	GCG	2	6	285709	285714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690407
5492	NC_015067	CGG	2	6	285746	285751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690407
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5500	NC_015067	AGCT	2	8	286056	286063	25 %	25 %	25 %	25 %	322690407

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