MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014722	GC	3	6	195148	195153	0 %	0 %	50 %	50 %	312794954
4002	NC_014722	CAG	2	6	195161	195166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794954
4003	NC_014722	GCC	2	6	195201	195206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794954
4004	NC_014722	AAT	2	6	195266	195271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794954
4005	NC_014722	CG	3	6	195320	195325	0 %	0 %	50 %	50 %	312794954
4006	NC_014722	CG	3	6	195330	195335	0 %	0 %	50 %	50 %	312794954
4007	NC_014722	CGG	2	6	195339	195344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794954
4008	NC_014722	GCAC	2	8	195355	195362	25 %	0 %	25 %	50 %	312794954
4009	NC_014722	AGC	2	6	195363	195368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794954
4010	NC_014722	TGA	2	6	195482	195487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794955
4011	NC_014722	GCG	2	6	195514	195519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794955
4012	NC_014722	CAG	2	6	195591	195596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794955
4013	NC_014722	CGA	2	6	195630	195635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794955
4014	NC_014722	ACG	2	6	195637	195642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794955
4015	NC_014722	CCG	2	6	195731	195736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794955
4016	NC_014722	GGT	2	6	195738	195743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794955
4017	NC_014722	GGTTC	2	10	195746	195755	0 %	40 %	40 %	20 %	312794955
4018	NC_014722	GGC	2	6	195766	195771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794955
4019	NC_014722	TCAA	2	8	195779	195786	50 %	25 %	0 %	25 %	312794955
4020	NC_014722	CGG	2	6	195820	195825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794956
4021	NC_014722	CAA	2	6	195838	195843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794956
4022	NC_014722	ACG	2	6	195861	195866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794956
4023	NC_014722	CAG	2	6	196765	196770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794957
4024	NC_014722	TGC	2	6	196813	196818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794957
4025	NC_014722	TGCG	2	8	196830	196837	0 %	25 %	50 %	25 %	312794957
4026	NC_014722	GCC	2	6	196851	196856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794957
4027	NC_014722	TATC	2	8	196859	196866	25 %	50 %	0 %	25 %	312794957
4028	NC_014722	CCA	2	6	196875	196880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794957
4029	NC_014722	AGA	2	6	196910	196915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794957
4030	NC_014722	CAA	2	6	196976	196981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794957
4031	NC_014722	GC	3	6	196990	196995	0 %	0 %	50 %	50 %	312794957
4032	NC_014722	CGTG	2	8	197000	197007	0 %	25 %	50 %	25 %	312794957
4033	NC_014722	GACCTG	2	12	197046	197057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312794957
4034	NC_014722	GGCGC	2	10	197094	197103	0 %	0 %	60 %	40 %	312794957
4035	NC_014722	CCAG	2	8	197162	197169	25 %	0 %	25 %	50 %	312794957
4036	NC_014722	GCG	2	6	197210	197215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794957
4037	NC_014722	GCG	2	6	197539	197544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794958
4038	NC_014722	AGT	2	6	197579	197584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794958
4039	NC_014722	GC	3	6	197655	197660	0 %	0 %	50 %	50 %	312794958
4040	NC_014722	TGT	2	6	197702	197707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794958
4041	NC_014722	CG	3	6	197931	197936	0 %	0 %	50 %	50 %	312794959
4042	NC_014722	G	6	6	197939	197944	0 %	0 %	100 %	0 %	312794959
4043	NC_014722	CG	3	6	197989	197994	0 %	0 %	50 %	50 %	312794959
4044	NC_014722	GCC	2	6	198010	198015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794959
4045	NC_014722	GC	4	8	198057	198064	0 %	0 %	50 %	50 %	312794959
4046	NC_014722	TCGA	2	8	198095	198102	25 %	25 %	25 %	25 %	312794959
4047	NC_014722	GCG	2	6	198104	198109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794959
4048	NC_014722	TGAA	2	8	198127	198134	50 %	25 %	25 %	0 %	312794959
4049	NC_014722	CTG	3	9	198246	198254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794960
4050	NC_014722	GACGC	2	10	198273	198282	20 %	0 %	40 %	40 %	312794960
4051	NC_014722	CGA	2	6	198301	198306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794960
4052	NC_014722	A	7	7	198349	198355	100 %	0 %	0 %	0 %	312794960
4053	NC_014722	CGT	2	6	198424	198429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794960
4054	NC_014722	GAC	3	9	198430	198438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794960
4055	NC_014722	TGC	2	6	198474	198479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794960
4056	NC_014722	CGA	2	6	198484	198489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794960
4057	NC_014722	GT	3	6	198495	198500	0 %	50 %	50 %	0 %	312794960
4058	NC_014722	CG	3	6	198571	198576	0 %	0 %	50 %	50 %	312794960
4059	NC_014722	TCGC	2	8	198643	198650	0 %	25 %	25 %	50 %	312794960
4060	NC_014722	CGC	2	6	198904	198909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794961
4061	NC_014722	TGT	2	6	198936	198941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794961
4062	NC_014722	CCT	2	6	198948	198953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794961
4063	NC_014722	GC	3	6	199126	199131	0 %	0 %	50 %	50 %	312794962
4064	NC_014722	TCA	2	6	199141	199146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794962
4065	NC_014722	CGCGGC	2	12	199170	199181	0 %	0 %	50 %	50 %	312794962
4066	NC_014722	CCG	2	6	199193	199198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794962
4067	NC_014722	AGC	2	6	199308	199313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794962
4068	NC_014722	TCG	2	6	199387	199392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794962
4069	NC_014722	CG	3	6	199391	199396	0 %	0 %	50 %	50 %	312794962
4070	NC_014722	TCA	2	6	199442	199447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794962
4071	NC_014722	T	6	6	199500	199505	0 %	100 %	0 %	0 %	312794962
4072	NC_014722	TTCAA	2	10	199552	199561	40 %	40 %	0 %	20 %	312794962
4073	NC_014722	CCCA	2	8	199596	199603	25 %	0 %	0 %	75 %	312794962
4074	NC_014722	CAA	2	6	199628	199633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794962
4075	NC_014722	TG	3	6	199759	199764	0 %	50 %	50 %	0 %	312794963
4076	NC_014722	GCG	2	6	199785	199790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794963
4077	NC_014722	TTA	2	6	199825	199830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794963
4078	NC_014722	TGC	2	6	199969	199974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794964
4079	NC_014722	T	6	6	200014	200019	0 %	100 %	0 %	0 %	312794964
4080	NC_014722	GGA	2	6	201430	201435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794965
4081	NC_014722	CAAG	2	8	201494	201501	50 %	0 %	25 %	25 %	312794965
4082	NC_014722	AGT	2	6	201576	201581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794965
4083	NC_014722	TCT	2	6	201616	201621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794965
4084	NC_014722	TTATC	2	10	201715	201724	20 %	60 %	0 %	20 %	312794965
4085	NC_014722	TGC	2	6	201795	201800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794965
4086	NC_014722	TA	3	6	201880	201885	50 %	50 %	0 %	0 %	312794965
4087	NC_014722	TGA	2	6	201969	201974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794965
4088	NC_014722	ATT	2	6	202195	202200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794966
4089	NC_014722	GCT	2	6	202396	202401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794966
4090	NC_014722	CGG	2	6	202431	202436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794966
4091	NC_014722	GTT	2	6	202501	202506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794966
4092	NC_014722	TCC	2	6	202530	202535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794966
4093	NC_014722	CGCA	2	8	202571	202578	25 %	0 %	25 %	50 %	312794966
4094	NC_014722	GCC	2	6	202849	202854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794967
4095	NC_014722	AGCAA	2	10	202879	202888	60 %	0 %	20 %	20 %	312794967
4096	NC_014722	A	6	6	202904	202909	100 %	0 %	0 %	0 %	312794967
4097	NC_014722	ATC	2	6	202927	202932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794967
4098	NC_014722	GTC	2	6	203013	203018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794967
4099	NC_014722	ACG	2	6	203157	203162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794968
4100	NC_014722	CGC	2	6	203192	203197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794968
4101	NC_014722	CGT	2	6	203227	203232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794968
4102	NC_014722	CCTT	2	8	203271	203278	0 %	50 %	0 %	50 %	312794968
4103	NC_014722	ATG	2	6	203698	203703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794969
4104	NC_014722	ATA	2	6	203752	203757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794969
4105	NC_014722	TCA	2	6	203762	203767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794969
4106	NC_014722	CGC	2	6	203787	203792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794969
4107	NC_014722	ATG	2	6	203842	203847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794969
4108	NC_014722	GGT	2	6	203895	203900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794969
4109	NC_014722	A	6	6	203925	203930	100 %	0 %	0 %	0 %	312794969
4110	NC_014722	GGC	2	6	204009	204014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794969
4111	NC_014722	GACC	2	8	204117	204124	25 %	0 %	25 %	50 %	312794970
4112	NC_014722	CAG	2	6	204150	204155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794970
4113	NC_014722	ACG	2	6	204165	204170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794970
4114	NC_014722	CTG	2	6	204191	204196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794970
4115	NC_014722	CTG	2	6	204331	204336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794971
4116	NC_014722	TGC	2	6	204859	204864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794973
4117	NC_014722	CGT	2	6	204873	204878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794973
4118	NC_014722	AAC	2	6	204886	204891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794973
4119	NC_014722	ACG	2	6	204922	204927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794973
4120	NC_014722	CGA	2	6	204975	204980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794973
4121	NC_014722	G	6	6	205165	205170	0 %	0 %	100 %	0 %	312794974
4122	NC_014722	GCA	2	6	205201	205206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794974
4123	NC_014722	GC	3	6	205240	205245	0 %	0 %	50 %	50 %	312794974
4124	NC_014722	TG	3	6	205311	205316	0 %	50 %	50 %	0 %	312794974
4125	NC_014722	GCGG	2	8	205323	205330	0 %	0 %	75 %	25 %	312794974
4126	NC_014722	CGG	2	6	205382	205387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794974
4127	NC_014722	CAG	2	6	205388	205393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794974
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4130	NC_014722	GCA	2	6	205642	205647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794974
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4132	NC_014722	CGG	2	6	205739	205744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794974
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4135	NC_014722	TTG	2	6	205943	205948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794974
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4142	NC_014722	GTCA	2	8	206297	206304	25 %	25 %	25 %	25 %	312794974
4143	NC_014722	GTC	2	6	206313	206318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794974
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4146	NC_014722	TGCT	2	8	206396	206403	0 %	50 %	25 %	25 %	312794974
4147	NC_014722	G	6	6	206447	206452	0 %	0 %	100 %	0 %	312794974
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4152	NC_014722	GCC	2	6	207052	207057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794976
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4154	NC_014722	GCC	2	6	207142	207147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794976
4155	NC_014722	TGGGCG	2	12	207243	207254	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312794976
4156	NC_014722	CGTCG	2	10	207280	207289	0 %	20 %	40 %	40 %	312794976
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4190	NC_014722	TCGAC	2	10	209314	209323	20 %	20 %	20 %	40 %	312794978
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4228	NC_014722	ATTGG	2	10	211488	211497	20 %	40 %	40 %	0 %	312794981
4229	NC_014722	GC	3	6	211515	211520	0 %	0 %	50 %	50 %	312794981
4230	NC_014722	CGCC	2	8	211644	211651	0 %	0 %	25 %	75 %	312794981
4231	NC_014722	CG	3	6	211778	211783	0 %	0 %	50 %	50 %	312794981
4232	NC_014722	T	7	7	211798	211804	0 %	100 %	0 %	0 %	312794981
4233	NC_014722	GAT	2	6	211847	211852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794981
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4236	NC_014722	GCAA	2	8	212157	212164	50 %	0 %	25 %	25 %	312794981
4237	NC_014722	ATC	2	6	212165	212170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794981
4238	NC_014722	GC	3	6	212173	212178	0 %	0 %	50 %	50 %	312794981
4239	NC_014722	GAA	2	6	212185	212190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794981
4240	NC_014722	GGC	2	6	212207	212212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794981
4241	NC_014722	CGA	2	6	212233	212238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794981
4242	NC_014722	T	6	6	212280	212285	0 %	100 %	0 %	0 %	312794981
4243	NC_014722	CGGC	2	8	212307	212314	0 %	0 %	50 %	50 %	312794981
4244	NC_014722	AAT	2	6	212378	212383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794981
4245	NC_014722	GATG	2	8	212401	212408	25 %	25 %	50 %	0 %	312794981
4246	NC_014722	GAT	2	6	212428	212433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794981
4247	NC_014722	CGG	2	6	212506	212511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794981
4248	NC_014722	GTCC	2	8	212561	212568	0 %	25 %	25 %	50 %	312794981
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4349	NC_014722	TTTG	2	8	217963	217970	0 %	75 %	25 %	0 %	312794989
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4356	NC_014722	ACCC	2	8	218451	218458	25 %	0 %	0 %	75 %	312794989
4357	NC_014722	GTG	2	6	218568	218573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794989
4358	NC_014722	AAT	2	6	218614	218619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794989
4359	NC_014722	AT	3	6	218680	218685	50 %	50 %	0 %	0 %	312794989
4360	NC_014722	GCG	2	6	218686	218691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794989
4361	NC_014722	CGC	2	6	218770	218775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794989
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4363	NC_014722	GGC	2	6	218862	218867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794989
4364	NC_014722	TGC	2	6	219610	219615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794990
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4366	NC_014722	GCA	2	6	219658	219663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794990
4367	NC_014722	CA	3	6	219676	219681	50 %	0 %	0 %	50 %	312794990
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4489	NC_014722	CGA	2	6	226035	226040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794997
4490	NC_014722	GCG	2	6	226104	226109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794997
4491	NC_014722	TGA	2	6	226125	226130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794997
4492	NC_014722	CGT	2	6	226140	226145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794997
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