MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014722	AAAG	2	8	123629	123636	75 %	0 %	25 %	0 %	312794875
2503	NC_014722	AGCG	2	8	123796	123803	25 %	0 %	50 %	25 %	312794876
2504	NC_014722	GGA	2	6	123821	123826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794876
2505	NC_014722	AATGC	2	10	123894	123903	40 %	20 %	20 %	20 %	312794876
2506	NC_014722	CTG	2	6	123925	123930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794876
2507	NC_014722	ACG	2	6	123943	123948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794876
2508	NC_014722	ATA	2	6	123964	123969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794876
2509	NC_014722	ATT	2	6	124039	124044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794877
2510	NC_014722	GGC	2	6	124107	124112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794877
2511	NC_014722	GCC	2	6	124131	124136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794877
2512	NC_014722	TGGGC	2	10	124142	124151	0 %	20 %	60 %	20 %	312794877
2513	NC_014722	CGT	2	6	124216	124221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794878
2514	NC_014722	CGC	2	6	124234	124239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794878
2515	NC_014722	CAT	2	6	124255	124260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794878
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2517	NC_014722	TGC	2	6	124515	124520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794879
2518	NC_014722	ACATG	2	10	124552	124561	40 %	20 %	20 %	20 %	312794879
2519	NC_014722	TCAA	2	8	124642	124649	50 %	25 %	0 %	25 %	312794880
2520	NC_014722	GTT	2	6	124699	124704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794880
2521	NC_014722	GCG	2	6	124741	124746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794880
2522	NC_014722	TGC	2	6	124758	124763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794880
2523	NC_014722	GTC	2	6	124783	124788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794880
2524	NC_014722	GCC	2	6	124852	124857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794880
2525	NC_014722	TGGA	2	8	124960	124967	25 %	25 %	50 %	0 %	312794881
2526	NC_014722	CGA	2	6	125016	125021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794881
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2529	NC_014722	ATCG	2	8	125088	125095	25 %	25 %	25 %	25 %	312794881
2530	NC_014722	AAATG	2	10	125146	125155	60 %	20 %	20 %	0 %	312794881
2531	NC_014722	GCA	2	6	125224	125229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794881
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2533	NC_014722	CGGC	2	8	125325	125332	0 %	0 %	50 %	50 %	312794882
2534	NC_014722	CGGCG	2	10	125347	125356	0 %	0 %	60 %	40 %	312794882
2535	NC_014722	GTT	2	6	125368	125373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794882
2536	NC_014722	ACG	2	6	125385	125390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794882
2537	NC_014722	T	6	6	125392	125397	0 %	100 %	0 %	0 %	312794882
2538	NC_014722	TCA	2	6	125422	125427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794882
2539	NC_014722	GGC	2	6	125544	125549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794883
2540	NC_014722	GCTT	2	8	125573	125580	0 %	50 %	25 %	25 %	312794883
2541	NC_014722	TGC	2	6	125605	125610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794883
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2543	NC_014722	TGGG	2	8	125704	125711	0 %	25 %	75 %	0 %	312794883
2544	NC_014722	CG	4	8	125791	125798	0 %	0 %	50 %	50 %	312794883
2545	NC_014722	GGC	2	6	125822	125827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794883
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2551	NC_014722	GA	3	6	126068	126073	50 %	0 %	50 %	0 %	312794883
2552	NC_014722	CAC	2	6	126109	126114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794883
2553	NC_014722	CG	3	6	126254	126259	0 %	0 %	50 %	50 %	312794883
2554	NC_014722	ATC	2	6	126270	126275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794883
2555	NC_014722	GAC	2	6	126416	126421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794883
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2559	NC_014722	GCA	2	6	126695	126700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794883
2560	NC_014722	GTC	2	6	126879	126884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794883
2561	NC_014722	CGG	2	6	126982	126987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794883
2562	NC_014722	GTTGC	2	10	126996	127005	0 %	40 %	40 %	20 %	312794883
2563	NC_014722	TTG	2	6	127044	127049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794883
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2565	NC_014722	CAAGT	2	10	127146	127155	40 %	20 %	20 %	20 %	312794883
2566	NC_014722	AGATCG	2	12	127159	127170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312794883
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2570	NC_014722	A	7	7	127422	127428	100 %	0 %	0 %	0 %	312794883
2571	NC_014722	GGC	2	6	127436	127441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794883
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2588	NC_014722	CGCT	2	8	128046	128053	0 %	25 %	25 %	50 %	312794884
2589	NC_014722	CAGGC	2	10	128065	128074	20 %	0 %	40 %	40 %	312794884
2590	NC_014722	GCGT	2	8	128097	128104	0 %	25 %	50 %	25 %	312794884
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2594	NC_014722	CG	3	6	128252	128257	0 %	0 %	50 %	50 %	312794885
2595	NC_014722	ACG	2	6	128344	128349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794885
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2600	NC_014722	ACG	2	6	128537	128542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794885
2601	NC_014722	GC	3	6	128591	128596	0 %	0 %	50 %	50 %	312794885
2602	NC_014722	CGA	2	6	128608	128613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794885
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2605	NC_014722	ATC	2	6	128725	128730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794885
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2607	NC_014722	CAG	2	6	128872	128877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794885
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2610	NC_014722	GAT	3	9	129126	129134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794886
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2616	NC_014722	GCAGC	2	10	129370	129379	20 %	0 %	40 %	40 %	312794886
2617	NC_014722	ATT	2	6	129388	129393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794886
2618	NC_014722	CG	3	6	129412	129417	0 %	0 %	50 %	50 %	312794886
2619	NC_014722	CGA	2	6	129435	129440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794886
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2622	NC_014722	GCT	2	6	129555	129560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794886
2623	NC_014722	CGA	2	6	129561	129566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794886
2624	NC_014722	CACG	2	8	129576	129583	25 %	0 %	25 %	50 %	312794886
2625	NC_014722	CTG	2	6	129631	129636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794886
2626	NC_014722	GGCG	2	8	129678	129685	0 %	0 %	75 %	25 %	312794886
2627	NC_014722	GGT	2	6	129756	129761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794886
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2630	NC_014722	GAG	3	9	129877	129885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794886
2631	NC_014722	CGCGA	2	10	130003	130012	20 %	0 %	40 %	40 %	312794886
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2633	NC_014722	TGCAA	2	10	130051	130060	40 %	20 %	20 %	20 %	312794887
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2636	NC_014722	TGA	2	6	130267	130272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794887
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2639	NC_014722	GCT	2	6	130415	130420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794887
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2643	NC_014722	TCGT	2	8	130596	130603	0 %	50 %	25 %	25 %	312794887
2644	NC_014722	TTGCGC	2	12	130615	130626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794887
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2654	NC_014722	TGC	2	6	130906	130911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794887
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2742	NC_014722	CAAG	2	8	135227	135234	50 %	0 %	25 %	25 %	312794893
2743	NC_014722	GCT	3	9	135257	135265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794893
2744	NC_014722	CGT	2	6	135267	135272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794893
2745	NC_014722	GCGG	2	8	135332	135339	0 %	0 %	75 %	25 %	312794893
2746	NC_014722	TCT	2	6	135493	135498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794893
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2985	NC_014722	CTGG	2	8	147901	147908	0 %	25 %	50 %	25 %	312794902
2986	NC_014722	TGC	2	6	147952	147957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794902
2987	NC_014722	CAC	2	6	148762	148767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794903
2988	NC_014722	CGA	2	6	148783	148788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
2989	NC_014722	AAG	2	6	148809	148814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794903
2990	NC_014722	CGC	2	6	148836	148841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
2991	NC_014722	C	6	6	148901	148906	0 %	0 %	0 %	100 %	312794903
2992	NC_014722	CGAAC	2	10	148954	148963	40 %	0 %	20 %	40 %	312794903
2993	NC_014722	GAC	2	6	148964	148969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
2994	NC_014722	TGC	2	6	149019	149024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
2995	NC_014722	GCG	2	6	149027	149032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
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2998	NC_014722	GCC	2	6	149101	149106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
2999	NC_014722	GC	3	6	149155	149160	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3000	NC_014722	CGG	2	6	149170	149175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903

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