MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_014722	ATT	2	6	676386	676391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795453
14003	NC_014722	CGG	2	6	676432	676437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
14004	NC_014722	CCGG	2	8	676438	676445	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
14005	NC_014722	CGGT	2	8	676458	676465	0 %	25 %	50 %	25 %	312795453
14006	NC_014722	CGTTT	2	10	676466	676475	0 %	60 %	20 %	20 %	312795453
14007	NC_014722	TGG	2	6	676591	676596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795454
14008	NC_014722	TTG	2	6	676617	676622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795454
14009	NC_014722	GCG	2	6	676627	676632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
14010	NC_014722	GGC	2	6	676646	676651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
14011	NC_014722	GGC	2	6	676655	676660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
14012	NC_014722	GAC	2	6	676683	676688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795454
14013	NC_014722	CGC	2	6	676691	676696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795454
14014	NC_014722	TGG	2	6	676699	676704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795454
14015	NC_014722	AGG	2	6	676786	676791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795454
14016	NC_014722	GCGCG	2	10	676835	676844	0 %	0 %	60 %	40 %	312795454
14017	NC_014722	TGG	2	6	676846	676851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795454
14018	NC_014722	GC	3	6	676859	676864	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
14019	NC_014722	GCC	2	6	676874	676879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795454
14020	NC_014722	CG	3	6	676968	676973	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
14021	NC_014722	CG	4	8	677054	677061	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
14022	NC_014722	GC	3	6	677077	677082	0 %	0 %	50 %	50 %	312795454
14023	NC_014722	GCG	2	6	677094	677099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
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14025	NC_014722	CGG	2	6	677275	677280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795454
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14027	NC_014722	GC	3	6	677511	677516	0 %	0 %	50 %	50 %	312795455
14028	NC_014722	GTC	2	6	677566	677571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
14029	NC_014722	GGCG	2	8	677646	677653	0 %	0 %	75 %	25 %	312795455
14030	NC_014722	CG	3	6	677711	677716	0 %	0 %	50 %	50 %	312795455
14031	NC_014722	ACA	2	6	677765	677770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795455
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14033	NC_014722	ACG	2	6	677887	677892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
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14052	NC_014722	TCG	2	6	678335	678340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795455
14053	NC_014722	AGTCG	2	10	678342	678351	20 %	20 %	40 %	20 %	312795455
14054	NC_014722	TGGAC	2	10	678383	678392	20 %	20 %	40 %	20 %	312795455
14055	NC_014722	CAA	2	6	678393	678398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795455
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14061	NC_014722	AAG	2	6	678685	678690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795455
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14069	NC_014722	AGC	2	6	679034	679039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795455
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14091	NC_014722	CG	3	6	680376	680381	0 %	0 %	50 %	50 %	312795458
14092	NC_014722	TCA	2	6	680390	680395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795458
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14108	NC_014722	GCGCG	2	10	680999	681008	0 %	0 %	60 %	40 %	312795458
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14116	NC_014722	GATC	2	8	681537	681544	25 %	25 %	25 %	25 %	312795459
14117	NC_014722	CG	3	6	681550	681555	0 %	0 %	50 %	50 %	312795459
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14120	NC_014722	CGG	2	6	681653	681658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795459
14121	NC_014722	GGC	3	9	681675	681683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795459
14122	NC_014722	GC	3	6	681682	681687	0 %	0 %	50 %	50 %	312795459
14123	NC_014722	GGT	2	6	681771	681776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795459
14124	NC_014722	GGCGC	2	10	681789	681798	0 %	0 %	60 %	40 %	312795459
14125	NC_014722	GGT	2	6	681819	681824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795459
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14129	NC_014722	CG	4	8	681924	681931	0 %	0 %	50 %	50 %	312795459
14130	NC_014722	CGG	2	6	682001	682006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795459
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14133	NC_014722	CGG	2	6	682217	682222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795459
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14141	NC_014722	GC	3	6	682565	682570	0 %	0 %	50 %	50 %	312795459
14142	NC_014722	GACG	2	8	682660	682667	25 %	0 %	50 %	25 %	312795459
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14149	NC_014722	GTC	2	6	682898	682903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795460
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14152	NC_014722	TG	4	8	683064	683071	0 %	50 %	50 %	0 %	312795460
14153	NC_014722	ACG	2	6	683079	683084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795460
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14164	NC_014722	GGC	2	6	683359	683364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795460
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14208	NC_014722	GCCGC	2	10	685192	685201	0 %	0 %	40 %	60 %	312795462
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14211	NC_014722	CGG	2	6	685249	685254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795462
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14219	NC_014722	CAG	2	6	685644	685649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795463
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14222	NC_014722	GT	3	6	685888	685893	0 %	50 %	50 %	0 %	312795463
14223	NC_014722	CG	3	6	685916	685921	0 %	0 %	50 %	50 %	312795463
14224	NC_014722	ATC	2	6	685929	685934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795463
14225	NC_014722	CG	5	10	686013	686022	0 %	0 %	50 %	50 %	312795463
14226	NC_014722	GC	3	6	686067	686072	0 %	0 %	50 %	50 %	312795463
14227	NC_014722	GCC	2	6	686079	686084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795463
14228	NC_014722	CG	3	6	686144	686149	0 %	0 %	50 %	50 %	312795463
14229	NC_014722	CGC	2	6	686262	686267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795463
14230	NC_014722	GTC	2	6	686278	686283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795463
14231	NC_014722	AAG	2	6	686347	686352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795464
14232	NC_014722	TCGC	2	8	686458	686465	0 %	25 %	25 %	50 %	312795464
14233	NC_014722	AGC	2	6	686488	686493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795464
14234	NC_014722	GC	3	6	686500	686505	0 %	0 %	50 %	50 %	312795464
14235	NC_014722	GTT	2	6	686510	686515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795464
14236	NC_014722	CGG	2	6	686549	686554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795464
14237	NC_014722	CAATGC	2	12	686561	686572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312795464
14238	NC_014722	CCGG	2	8	686603	686610	0 %	0 %	50 %	50 %	312795464
14239	NC_014722	GAT	2	6	686721	686726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795464
14240	NC_014722	CCAGA	2	10	686811	686820	40 %	0 %	20 %	40 %	312795464
14241	NC_014722	TCT	2	6	686824	686829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795464
14242	NC_014722	AAC	2	6	686842	686847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795464
14243	NC_014722	TGCGT	2	10	686852	686861	0 %	40 %	40 %	20 %	312795464
14244	NC_014722	GGT	2	6	686895	686900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795464
14245	NC_014722	GAT	2	6	686958	686963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795464
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14265	NC_014722	T	6	6	687734	687739	0 %	100 %	0 %	0 %	312795465
14266	NC_014722	CACC	2	8	687740	687747	25 %	0 %	0 %	75 %	312795465
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14269	NC_014722	CG	4	8	687904	687911	0 %	0 %	50 %	50 %	312795465
14270	NC_014722	GGCG	2	8	687994	688001	0 %	0 %	75 %	25 %	312795465
14271	NC_014722	GCGCT	2	10	688002	688011	0 %	20 %	40 %	40 %	312795465
14272	NC_014722	CCG	2	6	688012	688017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795465
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14274	NC_014722	GCCC	2	8	688084	688091	0 %	0 %	25 %	75 %	312795465
14275	NC_014722	CAT	2	6	688095	688100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795465
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14347	NC_014722	AGGC	2	8	691309	691316	25 %	0 %	50 %	25 %	312795468
14348	NC_014722	TGC	2	6	691427	691432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795468
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14352	NC_014722	CGGCTG	2	12	691554	691565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312795468
14353	NC_014722	GCGGT	2	10	692044	692053	0 %	20 %	60 %	20 %	312795469
14354	NC_014722	GAAG	2	8	692055	692062	50 %	0 %	50 %	0 %	312795469
14355	NC_014722	CGG	2	6	692093	692098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795469
14356	NC_014722	GCT	2	6	692205	692210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795469
14357	NC_014722	CG	3	6	692223	692228	0 %	0 %	50 %	50 %	312795469
14358	NC_014722	AGC	2	6	692231	692236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795469
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14360	NC_014722	GGC	2	6	692356	692361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795469
14361	NC_014722	CGG	2	6	692388	692393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795469
14362	NC_014722	CGG	2	6	692420	692425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795469
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14466	NC_014722	TGCA	2	8	698188	698195	25 %	25 %	25 %	25 %	312795477
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14469	NC_014722	CGT	2	6	698391	698396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795478
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14472	NC_014722	GCT	2	6	698500	698505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795478
14473	NC_014722	GC	3	6	698506	698511	0 %	0 %	50 %	50 %	312795478
14474	NC_014722	TGG	2	6	698519	698524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795478
14475	NC_014722	GCG	2	6	698535	698540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795478
14476	NC_014722	GCG	2	6	698549	698554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795478
14477	NC_014722	TGCGC	2	10	698632	698641	0 %	20 %	40 %	40 %	312795478
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14479	NC_014722	TAC	2	6	698696	698701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795478
14480	NC_014722	TTGAT	2	10	698706	698715	20 %	60 %	20 %	0 %	312795478
14481	NC_014722	GTC	2	6	698726	698731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795478
14482	NC_014722	GC	3	6	698781	698786	0 %	0 %	50 %	50 %	312795478
14483	NC_014722	ACG	2	6	698808	698813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795478
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