MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014722	TGGT	2	8	652589	652596	0 %	50 %	50 %	0 %	312795429
13502	NC_014722	CA	3	6	652607	652612	50 %	0 %	0 %	50 %	312795429
13503	NC_014722	CTG	2	6	652672	652677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13504	NC_014722	GCC	2	6	652797	652802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795429
13505	NC_014722	GGCGC	2	10	652807	652816	0 %	0 %	60 %	40 %	312795429
13506	NC_014722	GCT	2	6	652839	652844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13507	NC_014722	GGGC	2	8	652871	652878	0 %	0 %	75 %	25 %	312795429
13508	NC_014722	CGC	3	9	652891	652899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795429
13509	NC_014722	ACT	2	6	652907	652912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795429
13510	NC_014722	CGA	2	6	652923	652928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13511	NC_014722	GACG	2	8	652950	652957	25 %	0 %	50 %	25 %	312795429
13512	NC_014722	CTCG	2	8	652971	652978	0 %	25 %	25 %	50 %	312795429
13513	NC_014722	CAG	2	6	652987	652992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13514	NC_014722	TCC	2	6	653044	653049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795429
13515	NC_014722	TGG	2	6	653072	653077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795429
13516	NC_014722	CGC	2	6	653115	653120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795429
13517	NC_014722	CGG	2	6	653211	653216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795429
13518	NC_014722	GCG	2	6	653270	653275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795429
13519	NC_014722	TGC	2	6	653276	653281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13520	NC_014722	TCGCT	2	10	653363	653372	0 %	40 %	20 %	40 %	312795429
13521	NC_014722	TGC	2	6	653388	653393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13522	NC_014722	GCGCC	2	10	653394	653403	0 %	0 %	40 %	60 %	312795429
13523	NC_014722	GAGC	2	8	653406	653413	25 %	0 %	50 %	25 %	312795429
13524	NC_014722	GC	3	6	653472	653477	0 %	0 %	50 %	50 %	312795429
13525	NC_014722	GATG	2	8	653511	653518	25 %	25 %	50 %	0 %	312795429
13526	NC_014722	TGACGA	2	12	653604	653615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312795429
13527	NC_014722	CG	5	10	653618	653627	0 %	0 %	50 %	50 %	312795429
13528	NC_014722	TGC	2	6	653655	653660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13529	NC_014722	GC	3	6	653683	653688	0 %	0 %	50 %	50 %	312795429
13530	NC_014722	ACGC	2	8	653772	653779	25 %	0 %	25 %	50 %	312795429
13531	NC_014722	GCT	2	6	653832	653837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13532	NC_014722	GCT	2	6	653853	653858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795429
13533	NC_014722	GC	3	6	653882	653887	0 %	0 %	50 %	50 %	312795429
13534	NC_014722	GCG	2	6	653944	653949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795429
13535	NC_014722	TCA	2	6	653982	653987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795429
13536	NC_014722	CGG	2	6	654021	654026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795430
13537	NC_014722	CGG	2	6	654066	654071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795430
13538	NC_014722	TGA	2	6	654111	654116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795430
13539	NC_014722	GCC	2	6	654123	654128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795430
13540	NC_014722	GCG	2	6	654132	654137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795430
13541	NC_014722	GCA	2	6	654267	654272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795430
13542	NC_014722	CGAGC	2	10	654274	654283	20 %	0 %	40 %	40 %	312795430
13543	NC_014722	GC	3	6	654282	654287	0 %	0 %	50 %	50 %	312795430
13544	NC_014722	CGT	2	6	654377	654382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795430
13545	NC_014722	CG	4	8	654625	654632	0 %	0 %	50 %	50 %	312795431
13546	NC_014722	GAT	2	6	654724	654729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795431
13547	NC_014722	GCG	2	6	654747	654752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795431
13548	NC_014722	GAA	2	6	654773	654778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795431
13549	NC_014722	CTC	2	6	654836	654841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795431
13550	NC_014722	GCT	2	6	654928	654933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13551	NC_014722	GGT	2	6	655022	655027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795432
13552	NC_014722	CGT	2	6	655061	655066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13553	NC_014722	GAC	2	6	655070	655075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13554	NC_014722	GC	4	8	655102	655109	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13555	NC_014722	GT	3	6	655116	655121	0 %	50 %	50 %	0 %	312795432
13556	NC_014722	CG	4	8	655124	655131	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13557	NC_014722	CGC	2	6	655150	655155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795432
13558	NC_014722	GGAT	2	8	655185	655192	25 %	25 %	50 %	0 %	312795432
13559	NC_014722	GCG	2	6	655232	655237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795432
13560	NC_014722	GC	3	6	655243	655248	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13561	NC_014722	CGG	2	6	655299	655304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795432
13562	NC_014722	CG	3	6	655315	655320	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13563	NC_014722	TGC	2	6	655426	655431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13564	NC_014722	CG	3	6	655446	655451	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13565	NC_014722	AAT	2	6	655516	655521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312795432
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13568	NC_014722	CGA	2	6	655736	655741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13569	NC_014722	TGC	2	6	655758	655763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13570	NC_014722	GGC	2	6	655913	655918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795432
13571	NC_014722	GTT	2	6	655985	655990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795432
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13573	NC_014722	CGC	2	6	656120	656125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795432
13574	NC_014722	GCC	2	6	656129	656134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795432
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13576	NC_014722	TGA	2	6	656326	656331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795432
13577	NC_014722	GCG	2	6	656405	656410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795432
13578	NC_014722	CGATCA	2	12	656416	656427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312795432
13579	NC_014722	GCCG	2	8	656549	656556	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13580	NC_014722	AC	3	6	656600	656605	50 %	0 %	0 %	50 %	312795432
13581	NC_014722	GTT	3	9	656624	656632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795432
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13583	NC_014722	TTCG	2	8	656675	656682	0 %	50 %	25 %	25 %	312795432
13584	NC_014722	GCC	2	6	656702	656707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795432
13585	NC_014722	TCGA	2	8	656802	656809	25 %	25 %	25 %	25 %	312795432
13586	NC_014722	CG	3	6	656810	656815	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13587	NC_014722	ATC	2	6	656817	656822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795432
13588	NC_014722	ACC	2	6	656928	656933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795432
13589	NC_014722	GAC	2	6	656993	656998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13590	NC_014722	CACG	2	8	657065	657072	25 %	0 %	25 %	50 %	312795432
13591	NC_014722	AC	3	6	657084	657089	50 %	0 %	0 %	50 %	312795432
13592	NC_014722	CG	3	6	657127	657132	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13593	NC_014722	CG	3	6	657188	657193	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13594	NC_014722	TCGCG	2	10	657259	657268	0 %	20 %	40 %	40 %	312795432
13595	NC_014722	GAT	2	6	657271	657276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795432
13596	NC_014722	CGTAGC	2	12	657286	657297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13597	NC_014722	ACG	2	6	657315	657320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13598	NC_014722	TGCG	2	8	657438	657445	0 %	25 %	50 %	25 %	312795432
13599	NC_014722	CGT	2	6	657470	657475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13600	NC_014722	AGG	2	6	657478	657483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795432
13601	NC_014722	CGG	2	6	657495	657500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795432
13602	NC_014722	CGC	2	6	657593	657598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795432
13603	NC_014722	GC	3	6	657597	657602	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13604	NC_014722	TGCC	2	8	657613	657620	0 %	25 %	25 %	50 %	312795432
13605	NC_014722	CGT	2	6	657694	657699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795432
13606	NC_014722	CG	3	6	657716	657721	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13607	NC_014722	CACC	2	8	657744	657751	25 %	0 %	0 %	75 %	312795432
13608	NC_014722	TCAT	2	8	657774	657781	25 %	50 %	0 %	25 %	312795432
13609	NC_014722	GCG	2	6	657807	657812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795432
13610	NC_014722	CG	3	6	657811	657816	0 %	0 %	50 %	50 %	312795432
13611	NC_014722	TCA	2	6	657821	657826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795432
13612	NC_014722	GCA	2	6	657961	657966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795433
13613	NC_014722	GCA	2	6	657985	657990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795433
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13615	NC_014722	GC	6	12	658007	658018	0 %	0 %	50 %	50 %	312795433
13616	NC_014722	CCGCG	2	10	658054	658063	0 %	0 %	40 %	60 %	312795433
13617	NC_014722	GCC	2	6	658175	658180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795433
13618	NC_014722	ACG	2	6	658188	658193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795433
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13620	NC_014722	GCC	2	6	658268	658273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795433
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13622	NC_014722	GCC	2	6	658310	658315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795433
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13736	NC_014722	C	6	6	665341	665346	0 %	0 %	0 %	100 %	312795442
13737	NC_014722	GCC	2	6	665385	665390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795442
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13739	NC_014722	GTC	2	6	665438	665443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795442
13740	NC_014722	GCT	2	6	665479	665484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795442
13741	NC_014722	GCG	2	6	665500	665505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795442
13742	NC_014722	CGC	2	6	665536	665541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795442
13743	NC_014722	GCCCAG	2	12	665564	665575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795442
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13745	NC_014722	CGT	2	6	665684	665689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795442
13746	NC_014722	CCG	2	6	665778	665783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795442
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13750	NC_014722	CTG	2	6	665872	665877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795442
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13760	NC_014722	GC	3	6	666291	666296	0 %	0 %	50 %	50 %	312795443
13761	NC_014722	GC	3	6	666299	666304	0 %	0 %	50 %	50 %	312795443
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13768	NC_014722	CGC	3	9	666747	666755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795443
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13770	NC_014722	GCG	2	6	666859	666864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795444
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13772	NC_014722	CGA	2	6	667036	667041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795445
13773	NC_014722	CTTCCA	2	12	667042	667053	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312795445
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13777	NC_014722	CGA	2	6	667267	667272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795445
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13783	NC_014722	CGG	2	6	667436	667441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795445
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13832	NC_014722	CGGG	2	8	669540	669547	0 %	0 %	75 %	25 %	312795448
13833	NC_014722	CGCAGG	2	12	669624	669635	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312795448
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13843	NC_014722	GCCG	2	8	670113	670120	0 %	0 %	50 %	50 %	312795448
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13850	NC_014722	GCA	2	6	670336	670341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795448
13851	NC_014722	CGA	2	6	670384	670389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795448
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13855	NC_014722	CGG	2	6	670480	670485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795448
13856	NC_014722	CGC	2	6	670621	670626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795448
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13858	NC_014722	CGA	2	6	670840	670845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795448
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13860	NC_014722	ATGT	2	8	670861	670868	25 %	50 %	25 %	0 %	312795448
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13968	NC_014722	GCCT	2	8	675156	675163	0 %	25 %	25 %	50 %	312795453
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13975	NC_014722	GTT	2	6	675370	675375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795453
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13979	NC_014722	GCT	2	6	675634	675639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795453
13980	NC_014722	TGG	2	6	675654	675659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795453
13981	NC_014722	GGC	2	6	675668	675673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
13982	NC_014722	GGT	2	6	675679	675684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795453
13983	NC_014722	CGTGCA	2	12	675754	675765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312795453
13984	NC_014722	GGC	2	6	675777	675782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795453
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13986	NC_014722	GC	3	6	675807	675812	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
13987	NC_014722	GCCGG	2	10	675823	675832	0 %	0 %	60 %	40 %	312795453
13988	NC_014722	TCG	3	9	675834	675842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795453
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13991	NC_014722	GC	3	6	675882	675887	0 %	0 %	50 %	50 %	312795453
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