MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014722	CGT	2	6	627498	627503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13002	NC_014722	CG	3	6	627509	627514	0 %	0 %	50 %	50 %	312795406
13003	NC_014722	AGC	2	6	627576	627581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13004	NC_014722	ATCG	2	8	627601	627608	25 %	25 %	25 %	25 %	312795406
13005	NC_014722	CGA	2	6	627685	627690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13006	NC_014722	GCG	2	6	627717	627722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795406
13007	NC_014722	CGGTGG	2	12	627741	627752	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312795406
13008	NC_014722	TGC	2	6	627804	627809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13009	NC_014722	ACG	2	6	627810	627815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13010	NC_014722	GGA	2	6	627820	627825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795406
13011	NC_014722	TTGC	2	8	627962	627969	0 %	50 %	25 %	25 %	312795406
13012	NC_014722	CGG	2	6	628013	628018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795406
13013	NC_014722	CGG	2	6	628061	628066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795406
13014	NC_014722	CGAT	2	8	628080	628087	25 %	25 %	25 %	25 %	312795406
13015	NC_014722	TCGGC	2	10	628108	628117	0 %	20 %	40 %	40 %	312795406
13016	NC_014722	CAA	2	6	628120	628125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795406
13017	NC_014722	GGC	2	6	628204	628209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795406
13018	NC_014722	GC	3	6	628208	628213	0 %	0 %	50 %	50 %	312795406
13019	NC_014722	CGG	2	6	628220	628225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795406
13020	NC_014722	GGT	2	6	628228	628233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795406
13021	NC_014722	A	6	6	628305	628310	100 %	0 %	0 %	0 %	312795406
13022	NC_014722	GTC	2	6	628391	628396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13023	NC_014722	CGGT	2	8	628422	628429	0 %	25 %	50 %	25 %	312795406
13024	NC_014722	GGCG	2	8	628591	628598	0 %	0 %	75 %	25 %	312795406
13025	NC_014722	ACG	2	6	628641	628646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13026	NC_014722	AGGC	2	8	628698	628705	25 %	0 %	50 %	25 %	312795406
13027	NC_014722	CAA	2	6	628873	628878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795406
13028	NC_014722	GTT	2	6	628882	628887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795406
13029	NC_014722	TCG	2	6	628920	628925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13030	NC_014722	TCA	2	6	628929	628934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795406
13031	NC_014722	TGGC	2	8	628964	628971	0 %	25 %	50 %	25 %	312795406
13032	NC_014722	TCG	2	6	629061	629066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13033	NC_014722	GCA	2	6	629155	629160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
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13035	NC_014722	CGA	2	6	629254	629259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13036	NC_014722	GCG	2	6	629292	629297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795406
13037	NC_014722	GCC	2	6	629299	629304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795406
13038	NC_014722	TGC	2	6	629351	629356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13039	NC_014722	CGA	2	6	629371	629376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
13040	NC_014722	CAT	2	6	629377	629382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795406
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13042	NC_014722	GATG	2	8	629611	629618	25 %	25 %	50 %	0 %	312795406
13043	NC_014722	CGGACC	2	12	629699	629710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795406
13044	NC_014722	CGA	2	6	629749	629754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795406
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13050	NC_014722	TGC	2	6	630340	630345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795407
13051	NC_014722	GCG	2	6	630443	630448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795407
13052	NC_014722	CAG	2	6	630515	630520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795407
13053	NC_014722	TGGACC	2	12	630622	630633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312795407
13054	NC_014722	GTGC	2	8	630774	630781	0 %	25 %	50 %	25 %	312795407
13055	NC_014722	ACG	3	9	630981	630989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795408
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13058	NC_014722	GGC	2	6	631332	631337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795408
13059	NC_014722	GCG	2	6	631340	631345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795408
13060	NC_014722	GAG	2	6	631361	631366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795408
13061	NC_014722	GTT	2	6	631408	631413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795408
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13063	NC_014722	CG	3	6	631477	631482	0 %	0 %	50 %	50 %	312795408
13064	NC_014722	GTT	2	6	631483	631488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795408
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13067	NC_014722	GCC	2	6	631633	631638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795408
13068	NC_014722	ACG	2	6	631679	631684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795408
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13073	NC_014722	GCA	2	6	632108	632113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795408
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13079	NC_014722	TGGC	2	8	632604	632611	0 %	25 %	50 %	25 %	312795410
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13083	NC_014722	TGAAG	2	10	633505	633514	40 %	20 %	40 %	0 %	312795412
13084	NC_014722	AAGC	2	8	633529	633536	50 %	0 %	25 %	25 %	312795412
13085	NC_014722	ATGT	2	8	633590	633597	25 %	50 %	25 %	0 %	312795412
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13089	NC_014722	GAC	2	6	633798	633803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795413
13090	NC_014722	GGGC	2	8	633804	633811	0 %	0 %	75 %	25 %	312795413
13091	NC_014722	CGC	2	6	633871	633876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795413
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13095	NC_014722	GTT	2	6	634014	634019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795413
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13097	NC_014722	GAA	2	6	634056	634061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795413
13098	NC_014722	CG	3	6	634136	634141	0 %	0 %	50 %	50 %	312795413
13099	NC_014722	GCTG	2	8	634209	634216	0 %	25 %	50 %	25 %	312795413
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13102	NC_014722	GCCG	2	8	634339	634346	0 %	0 %	50 %	50 %	312795413
13103	NC_014722	TGTA	2	8	634389	634396	25 %	50 %	25 %	0 %	312795413
13104	NC_014722	GTT	2	6	634435	634440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795413
13105	NC_014722	CG	3	6	634477	634482	0 %	0 %	50 %	50 %	312795413
13106	NC_014722	GGT	2	6	634507	634512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795413
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13109	NC_014722	TCA	2	6	635061	635066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795414
13110	NC_014722	CGT	2	6	635120	635125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795414
13111	NC_014722	GCAC	2	8	635130	635137	25 %	0 %	25 %	50 %	312795414
13112	NC_014722	GCA	2	6	635148	635153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795414
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13114	NC_014722	GCT	2	6	635249	635254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795414
13115	NC_014722	GC	3	6	635330	635335	0 %	0 %	50 %	50 %	312795414
13116	NC_014722	TCGG	2	8	635383	635390	0 %	25 %	50 %	25 %	312795414
13117	NC_014722	CG	3	6	635439	635444	0 %	0 %	50 %	50 %	312795414
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13119	NC_014722	CGG	2	6	635548	635553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795415
13120	NC_014722	CGA	2	6	635585	635590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795415
13121	NC_014722	G	7	7	635656	635662	0 %	0 %	100 %	0 %	312795415
13122	NC_014722	GCA	2	6	635665	635670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795415
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13223	NC_014722	TGCC	2	8	641483	641490	0 %	25 %	25 %	50 %	312795419
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13236	NC_014722	GC	3	6	641978	641983	0 %	0 %	50 %	50 %	312795420
13237	NC_014722	ATCT	2	8	641985	641992	25 %	50 %	0 %	25 %	312795420
13238	NC_014722	AGC	2	6	642062	642067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795420
13239	NC_014722	GAC	2	6	642068	642073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795420
13240	NC_014722	GC	3	6	642087	642092	0 %	0 %	50 %	50 %	312795420
13241	NC_014722	GGC	2	6	642118	642123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795420
13242	NC_014722	GCGG	2	8	642160	642167	0 %	0 %	75 %	25 %	312795420
13243	NC_014722	AGC	2	6	642182	642187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795420
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13251	NC_014722	GCG	2	6	642483	642488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795421
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13253	NC_014722	AGC	2	6	642493	642498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795421
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13271	NC_014722	TGGC	2	8	643219	643226	0 %	25 %	50 %	25 %	312795421
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13320	NC_014722	CG	3	6	645428	645433	0 %	0 %	50 %	50 %	312795423
13321	NC_014722	TGC	2	6	645453	645458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795423
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13346	NC_014722	ACG	2	6	646786	646791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795424
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13349	NC_014722	CGC	2	6	646937	646942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795424
13350	NC_014722	TGA	2	6	646943	646948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795424
13351	NC_014722	CAG	2	6	646968	646973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795424
13352	NC_014722	TCAT	2	8	647011	647018	25 %	50 %	0 %	25 %	312795424
13353	NC_014722	GC	3	6	647202	647207	0 %	0 %	50 %	50 %	312795425
13354	NC_014722	CGTTG	2	10	647248	647257	0 %	40 %	40 %	20 %	312795425
13355	NC_014722	CG	3	6	647259	647264	0 %	0 %	50 %	50 %	312795425
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13357	NC_014722	GAT	2	6	647371	647376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795425
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13466	NC_014722	GTGCG	2	10	651184	651193	0 %	20 %	60 %	20 %	312795428
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13473	NC_014722	TTCG	2	8	651492	651499	0 %	50 %	25 %	25 %	312795428
13474	NC_014722	GCGTG	2	10	651541	651550	0 %	20 %	60 %	20 %	312795428
13475	NC_014722	GGC	2	6	651554	651559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795428
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