MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014722	GC	3	6	533894	533899	0 %	0 %	50 %	50 %	312795312
11002	NC_014722	CG	3	6	533926	533931	0 %	0 %	50 %	50 %	312795312
11003	NC_014722	TGG	2	6	534032	534037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795312
11004	NC_014722	CGG	2	6	534110	534115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795312
11005	NC_014722	TGC	2	6	534120	534125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795312
11006	NC_014722	TCGA	2	8	534178	534185	25 %	25 %	25 %	25 %	312795312
11007	NC_014722	GC	3	6	534206	534211	0 %	0 %	50 %	50 %	312795312
11008	NC_014722	GC	3	6	534217	534222	0 %	0 %	50 %	50 %	312795312
11009	NC_014722	GAA	2	6	534243	534248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795312
11010	NC_014722	TCG	3	9	534323	534331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795312
11011	NC_014722	GCGTG	2	10	534381	534390	0 %	20 %	60 %	20 %	312795312
11012	NC_014722	GCAA	2	8	534443	534450	50 %	0 %	25 %	25 %	312795312
11013	NC_014722	CGG	2	6	534464	534469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795312
11014	NC_014722	GCA	2	6	535057	535062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795313
11015	NC_014722	TGC	2	6	535178	535183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795313
11016	NC_014722	TGCG	2	8	535233	535240	0 %	25 %	50 %	25 %	312795313
11017	NC_014722	CTGG	2	8	535332	535339	0 %	25 %	50 %	25 %	312795313
11018	NC_014722	CAT	2	6	535656	535661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795314
11019	NC_014722	TGG	2	6	535688	535693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795314
11020	NC_014722	TGC	2	6	535724	535729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795314
11021	NC_014722	CGC	2	6	535785	535790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795314
11022	NC_014722	CGT	2	6	535846	535851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795314
11023	NC_014722	CCGAT	2	10	535964	535973	20 %	20 %	20 %	40 %	312795314
11024	NC_014722	TCA	2	6	535979	535984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795314
11025	NC_014722	GTG	2	6	536029	536034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795314
11026	NC_014722	ATC	2	6	536035	536040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795314
11027	NC_014722	CTG	4	12	536068	536079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795314
11028	NC_014722	GC	3	6	536109	536114	0 %	0 %	50 %	50 %	312795314
11029	NC_014722	TCGGC	2	10	536189	536198	0 %	20 %	40 %	40 %	312795314
11030	NC_014722	GCTG	2	8	536199	536206	0 %	25 %	50 %	25 %	312795314
11031	NC_014722	TGGC	2	8	536210	536217	0 %	25 %	50 %	25 %	312795314
11032	NC_014722	TGA	2	6	536219	536224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795314
11033	NC_014722	GCG	2	6	536321	536326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795314
11034	NC_014722	TGG	2	6	536330	536335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795314
11035	NC_014722	G	6	6	536334	536339	0 %	0 %	100 %	0 %	312795314
11036	NC_014722	TGC	2	6	536342	536347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795314
11037	NC_014722	GTG	2	6	536437	536442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795314
11038	NC_014722	CGTC	2	8	536464	536471	0 %	25 %	25 %	50 %	312795314
11039	NC_014722	TTG	2	6	536476	536481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795314
11040	NC_014722	GAG	2	6	536517	536522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795314
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11042	NC_014722	TGC	2	6	536607	536612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795315
11043	NC_014722	GC	3	6	536634	536639	0 %	0 %	50 %	50 %	312795315
11044	NC_014722	GTG	3	9	536729	536737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795315
11045	NC_014722	CTG	2	6	536750	536755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795315
11046	NC_014722	CTG	2	6	536804	536809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795315
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11049	NC_014722	CTG	2	6	536882	536887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795315
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11052	NC_014722	GC	3	6	536937	536942	0 %	0 %	50 %	50 %	312795315
11053	NC_014722	AAC	2	6	537017	537022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795315
11054	NC_014722	CGG	2	6	537088	537093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795315
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11058	NC_014722	CGC	2	6	537259	537264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795315
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11060	NC_014722	CGG	2	6	537328	537333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795315
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11063	NC_014722	CGTG	2	8	537417	537424	0 %	25 %	50 %	25 %	312795315
11064	NC_014722	GGC	2	6	537431	537436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795315
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11075	NC_014722	TGAG	2	8	537730	537737	25 %	25 %	50 %	0 %	312795316
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11080	NC_014722	CG	3	6	537980	537985	0 %	0 %	50 %	50 %	312795316
11081	NC_014722	CGG	2	6	538010	538015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795316
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11089	NC_014722	GCCG	2	8	538271	538278	0 %	0 %	50 %	50 %	312795316
11090	NC_014722	CTG	2	6	538317	538322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795316
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11102	NC_014722	TGT	2	6	538988	538993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795317
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11108	NC_014722	CGCC	2	8	539121	539128	0 %	0 %	25 %	75 %	312795317
11109	NC_014722	GGC	2	6	539139	539144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795317
11110	NC_014722	GTGA	2	8	539240	539247	25 %	25 %	50 %	0 %	312795317
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11112	NC_014722	GCA	2	6	539512	539517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795318
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11116	NC_014722	CG	4	8	539650	539657	0 %	0 %	50 %	50 %	312795318
11117	NC_014722	CGCT	2	8	539676	539683	0 %	25 %	25 %	50 %	312795318
11118	NC_014722	CGA	2	6	539728	539733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795318
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11120	NC_014722	GCC	2	6	539789	539794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795318
11121	NC_014722	TCG	2	6	539823	539828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795318
11122	NC_014722	CCG	2	6	539859	539864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795318
11123	NC_014722	ATG	2	6	539883	539888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795318
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11127	NC_014722	CG	3	6	539983	539988	0 %	0 %	50 %	50 %	312795318
11128	NC_014722	TGC	2	6	540003	540008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795318
11129	NC_014722	CG	3	6	540016	540021	0 %	0 %	50 %	50 %	312795318
11130	NC_014722	GCG	2	6	540145	540150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795318
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11143	NC_014722	CGCTG	2	10	540936	540945	0 %	20 %	40 %	40 %	312795319
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11210	NC_014722	CTT	2	6	543972	543977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795324
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11212	NC_014722	GCT	2	6	544043	544048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795324
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11223	NC_014722	CGC	2	6	544835	544840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795324
11224	NC_014722	GCG	2	6	544865	544870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795324
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11226	NC_014722	TCA	2	6	544892	544897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795324
11227	NC_014722	CCA	3	9	545122	545130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795325
11228	NC_014722	CGG	3	9	545205	545213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795325
11229	NC_014722	ATC	2	6	545216	545221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795325
11230	NC_014722	TGG	2	6	545231	545236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795325
11231	NC_014722	GT	3	6	545267	545272	0 %	50 %	50 %	0 %	312795325
11232	NC_014722	TCA	2	6	545273	545278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795325
11233	NC_014722	GC	3	6	545293	545298	0 %	0 %	50 %	50 %	312795325
11234	NC_014722	GTG	2	6	545378	545383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795325
11235	NC_014722	TACG	2	8	545386	545393	25 %	25 %	25 %	25 %	312795325
11236	NC_014722	GATG	2	8	545427	545434	25 %	25 %	50 %	0 %	312795325
11237	NC_014722	TCG	2	6	545444	545449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795325
11238	NC_014722	AGC	2	6	545453	545458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795325
11239	NC_014722	CGT	2	6	545467	545472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795325
11240	NC_014722	GGC	2	6	545484	545489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795325
11241	NC_014722	CG	3	6	545505	545510	0 %	0 %	50 %	50 %	312795325
11242	NC_014722	TGC	2	6	545552	545557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795325
11243	NC_014722	GTGC	2	8	545559	545566	0 %	25 %	50 %	25 %	312795325
11244	NC_014722	GGT	2	6	545582	545587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795325
11245	NC_014722	GCT	2	6	545691	545696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795325
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11251	NC_014722	TGGGC	2	10	546220	546229	0 %	20 %	60 %	20 %	312795326
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11272	NC_014722	GCA	2	6	547198	547203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795326
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11281	NC_014722	AGGT	2	8	548479	548486	25 %	25 %	50 %	0 %	312795328
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11284	NC_014722	GCCCAG	2	12	548601	548612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795328
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11339	NC_014722	CGA	2	6	551462	551467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795330
11340	NC_014722	CGGG	2	8	551516	551523	0 %	0 %	75 %	25 %	312795330
11341	NC_014722	GGC	2	6	551536	551541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795330
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11348	NC_014722	GCCA	2	8	551788	551795	25 %	0 %	25 %	50 %	312795330
11349	NC_014722	CGT	2	6	551806	551811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795330
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11352	NC_014722	AGC	2	6	551877	551882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795331
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11354	NC_014722	GCG	2	6	551918	551923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795331
11355	NC_014722	GT	3	6	551932	551937	0 %	50 %	50 %	0 %	312795331
11356	NC_014722	GCC	2	6	551957	551962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795331
11357	NC_014722	GCA	2	6	552112	552117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795331
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11359	NC_014722	GC	3	6	552237	552242	0 %	0 %	50 %	50 %	312795331
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11479	NC_014722	GCA	2	6	557354	557359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
11480	NC_014722	GCA	2	6	557366	557371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795336
11481	NC_014722	GAA	3	9	557430	557438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795336
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11483	NC_014722	CG	3	6	557538	557543	0 %	0 %	50 %	50 %	312795336
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11486	NC_014722	CAG	2	6	557631	557636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795337
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