MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014722	CGC	2	6	350081	350086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795115
7003	NC_014722	CGA	2	6	350129	350134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795115
7004	NC_014722	CAC	2	6	350180	350185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795115
7005	NC_014722	GGC	2	6	350196	350201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795115
7006	NC_014722	ACGT	2	8	350226	350233	25 %	25 %	25 %	25 %	312795115
7007	NC_014722	ACCG	2	8	350265	350272	25 %	0 %	25 %	50 %	312795115
7008	NC_014722	T	8	8	350374	350381	0 %	100 %	0 %	0 %	312795116
7009	NC_014722	CGT	2	6	350460	350465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795116
7010	NC_014722	GCA	2	6	350476	350481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795116
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7012	NC_014722	CAG	2	6	350529	350534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795116
7013	NC_014722	GCG	3	9	350541	350549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795116
7014	NC_014722	TC	3	6	350581	350586	0 %	50 %	0 %	50 %	312795116
7015	NC_014722	GC	3	6	350659	350664	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7016	NC_014722	TGCA	2	8	350673	350680	25 %	25 %	25 %	25 %	312795116
7017	NC_014722	GC	4	8	350726	350733	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7018	NC_014722	GCG	3	9	350771	350779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795116
7019	NC_014722	CAG	2	6	350799	350804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795116
7020	NC_014722	CTGC	2	8	350832	350839	0 %	25 %	25 %	50 %	312795116
7021	NC_014722	CGG	2	6	350963	350968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795116
7022	NC_014722	CG	3	6	350982	350987	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7023	NC_014722	TCTG	2	8	351005	351012	0 %	50 %	25 %	25 %	312795116
7024	NC_014722	GGA	2	6	351065	351070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795116
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7026	NC_014722	CGA	2	6	351131	351136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795116
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7028	NC_014722	CGGCGC	2	12	351193	351204	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7029	NC_014722	GCG	2	6	351217	351222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795116
7030	NC_014722	CG	3	6	351239	351244	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7031	NC_014722	GC	3	6	351246	351251	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
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7033	NC_014722	CGGC	2	8	351339	351346	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7034	NC_014722	ATC	2	6	351363	351368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795116
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7040	NC_014722	GC	3	6	351770	351775	0 %	0 %	50 %	50 %	312795116
7041	NC_014722	TGGCG	2	10	351830	351839	0 %	20 %	60 %	20 %	312795116
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7051	NC_014722	TGC	2	6	352183	352188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795116
7052	NC_014722	CGA	2	6	352205	352210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795116
7053	NC_014722	CGT	2	6	352225	352230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795116
7054	NC_014722	GCG	2	6	352270	352275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795116
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7110	NC_014722	GC	4	8	354216	354223	0 %	0 %	50 %	50 %	312795118
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7125	NC_014722	TCA	2	6	354834	354839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795119
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7127	NC_014722	CGA	2	6	354911	354916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795120
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7143	NC_014722	GC	3	6	355333	355338	0 %	0 %	50 %	50 %	312795120
7144	NC_014722	GCGCG	3	15	355341	355355	0 %	0 %	60 %	40 %	312795120
7145	NC_014722	GCG	2	6	355364	355369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795120
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7154	NC_014722	GGC	2	6	355708	355713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795121
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7162	NC_014722	CAGCGC	2	12	356170	356181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795121
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7232	NC_014722	CAA	2	6	358779	358784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795123
7233	NC_014722	CTG	2	6	358804	358809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795123
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7235	NC_014722	CGGG	2	8	358916	358923	0 %	0 %	75 %	25 %	312795123
7236	NC_014722	CG	3	6	358932	358937	0 %	0 %	50 %	50 %	312795123
7237	NC_014722	AGGC	2	8	358939	358946	25 %	0 %	50 %	25 %	312795124
7238	NC_014722	A	6	6	359011	359016	100 %	0 %	0 %	0 %	312795124
7239	NC_014722	TGA	2	6	359052	359057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795125
7240	NC_014722	TGA	2	6	359102	359107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795125
7241	NC_014722	ATT	2	6	359168	359173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795125
7242	NC_014722	CCA	2	6	359289	359294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312795126
7243	NC_014722	TGC	2	6	359333	359338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795126
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7245	NC_014722	CGG	2	6	359430	359435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795126
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7368	NC_014722	CG	3	6	364360	364365	0 %	0 %	50 %	50 %	312795132
7369	NC_014722	AAG	2	6	364490	364495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795132
7370	NC_014722	CGT	2	6	364696	364701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795132
7371	NC_014722	TTC	2	6	364718	364723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795132
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7373	NC_014722	GAA	2	6	364765	364770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795132
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7375	NC_014722	CGA	2	6	364809	364814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795132
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7381	NC_014722	GCGCC	2	10	365009	365018	0 %	0 %	40 %	60 %	312795132
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7387	NC_014722	GC	3	6	365224	365229	0 %	0 %	50 %	50 %	312795133
7388	NC_014722	CGC	2	6	365257	365262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795133
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7392	NC_014722	CTG	2	6	366033	366038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795134
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7398	NC_014722	GC	3	6	366513	366518	0 %	0 %	50 %	50 %	312795135
7399	NC_014722	CGT	3	9	366551	366559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795135
7400	NC_014722	GCC	2	6	366564	366569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795135
7401	NC_014722	TGCA	2	8	366584	366591	25 %	25 %	25 %	25 %	312795135
7402	NC_014722	ACGCA	2	10	366609	366618	40 %	0 %	20 %	40 %	312795135
7403	NC_014722	CG	3	6	366620	366625	0 %	0 %	50 %	50 %	312795135
7404	NC_014722	GCT	2	6	366743	366748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795135
7405	NC_014722	TGT	2	6	366812	366817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312795135
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7407	NC_014722	CGA	2	6	366878	366883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795135
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7428	NC_014722	CGGCA	2	10	367595	367604	20 %	0 %	40 %	40 %	312795136
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7454	NC_014722	ACT	2	6	368956	368961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795138
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7462	NC_014722	TGC	2	6	369292	369297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795138
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7474	NC_014722	ATC	2	6	369876	369881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795138
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7479	NC_014722	CGG	2	6	370160	370165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795138
7480	NC_014722	CTG	2	6	370188	370193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795138
7481	NC_014722	CGGC	2	8	370312	370319	0 %	0 %	50 %	50 %	312795138
7482	NC_014722	AAG	2	6	370320	370325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795138
7483	NC_014722	TGC	2	6	370390	370395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795138
7484	NC_014722	GCG	2	6	370423	370428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795138
7485	NC_014722	A	6	6	370432	370437	100 %	0 %	0 %	0 %	312795138
7486	NC_014722	GTCGAA	2	12	370439	370450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312795138
7487	NC_014722	GCA	2	6	370469	370474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795138
7488	NC_014722	CG	3	6	370502	370507	0 %	0 %	50 %	50 %	312795138
7489	NC_014722	ACA	2	6	370744	370749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312795138
7490	NC_014722	TGC	2	6	370840	370845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795138
7491	NC_014722	GGT	2	6	370859	370864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795138
7492	NC_014722	TGC	2	6	370987	370992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795138
7493	NC_014722	GCGCG	2	10	371009	371018	0 %	0 %	60 %	40 %	312795138
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7499	NC_014722	TGC	2	6	371223	371228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795139
7500	NC_014722	GCG	2	6	371253	371258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795139

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