MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_014722	GC	3	6	2752788	2752793	0 %	0 %	50 %	50 %	312797629
56502	NC_014722	CCTT	2	8	2752900	2752907	0 %	50 %	0 %	50 %	312797629
56503	NC_014722	AGT	2	6	2752928	2752933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797629
56504	NC_014722	TCT	2	6	2753012	2753017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312797629
56505	NC_014722	TGC	2	6	2753026	2753031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797629
56506	NC_014722	GTC	2	6	2753091	2753096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797629
56507	NC_014722	CGGCG	2	10	2753130	2753139	0 %	0 %	60 %	40 %	312797629
56508	NC_014722	CG	3	6	2753183	2753188	0 %	0 %	50 %	50 %	312797629
56509	NC_014722	ACC	2	6	2753206	2753211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312797629
56510	NC_014722	CCGT	2	8	2753263	2753270	0 %	25 %	25 %	50 %	312797629
56511	NC_014722	ACG	2	6	2753290	2753295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797629
56512	NC_014722	GC	3	6	2753343	2753348	0 %	0 %	50 %	50 %	312797629
56513	NC_014722	GGTTG	2	10	2753393	2753402	0 %	40 %	60 %	0 %	312797629
56514	NC_014722	CCT	2	6	2753414	2753419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312797629
56515	NC_014722	GCC	2	6	2753445	2753450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797629
56516	NC_014722	CGTC	2	8	2753477	2753484	0 %	25 %	25 %	50 %	312797629
56517	NC_014722	CTG	2	6	2753496	2753501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797629
56518	NC_014722	CAC	2	6	2753508	2753513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312797629
56519	NC_014722	GGCG	2	8	2753523	2753530	0 %	0 %	75 %	25 %	312797629
56520	NC_014722	GC	3	6	2753540	2753545	0 %	0 %	50 %	50 %	312797629
56521	NC_014722	GAA	2	6	2753646	2753651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312797629
56522	NC_014722	GAC	2	6	2753697	2753702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797629
56523	NC_014722	GAA	2	6	2753709	2753714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312797629
56524	NC_014722	TGAGC	2	10	2753766	2753775	20 %	20 %	40 %	20 %	312797629
56525	NC_014722	CGG	2	6	2753799	2753804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797629
56526	NC_014722	CGC	2	6	2753816	2753821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797629
56527	NC_014722	CCG	2	6	2753822	2753827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797629
56528	NC_014722	CG	4	8	2753903	2753910	0 %	0 %	50 %	50 %	312797630
56529	NC_014722	CGG	2	6	2754040	2754045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797630
56530	NC_014722	CGA	2	6	2754067	2754072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797630
56531	NC_014722	GTG	2	6	2754100	2754105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797630
56532	NC_014722	CGC	2	6	2754144	2754149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797630
56533	NC_014722	CGCAC	2	10	2754170	2754179	20 %	0 %	20 %	60 %	312797631
56534	NC_014722	GCA	2	6	2754207	2754212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797631
56535	NC_014722	CGAT	2	8	2754254	2754261	25 %	25 %	25 %	25 %	312797631
56536	NC_014722	CCAG	2	8	2754289	2754296	25 %	0 %	25 %	50 %	312797631
56537	NC_014722	CG	4	8	2754361	2754368	0 %	0 %	50 %	50 %	312797631
56538	NC_014722	CTT	2	6	2754376	2754381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312797631
56539	NC_014722	GGC	2	6	2754420	2754425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797631
56540	NC_014722	ACA	2	6	2754429	2754434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312797631
56541	NC_014722	GAGCG	2	10	2754441	2754450	20 %	0 %	60 %	20 %	312797631
56542	NC_014722	CAG	2	6	2754496	2754501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797631
56543	NC_014722	CAG	2	6	2754522	2754527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797631
56544	NC_014722	GCC	2	6	2754590	2754595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797631
56545	NC_014722	GCT	2	6	2754634	2754639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797631
56546	NC_014722	GCC	2	6	2754642	2754647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797631
56547	NC_014722	CG	3	6	2754704	2754709	0 %	0 %	50 %	50 %	312797631
56548	NC_014722	TGA	2	6	2754718	2754723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797631
56549	NC_014722	GCG	2	6	2754776	2754781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797631
56550	NC_014722	ACGG	2	8	2754786	2754793	25 %	0 %	50 %	25 %	312797632
56551	NC_014722	GGA	2	6	2754828	2754833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312797632
56552	NC_014722	GCCGA	2	10	2754889	2754898	20 %	0 %	40 %	40 %	312797632
56553	NC_014722	GCG	2	6	2754944	2754949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797632

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.