MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_014722	ATC	2	6	2540510	2540515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797387
52003	NC_014722	CCTTGC	2	12	2540665	2540676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312797388
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52005	NC_014722	CCGC	2	8	2540701	2540708	0 %	0 %	25 %	75 %	312797388
52006	NC_014722	ATCG	2	8	2540709	2540716	25 %	25 %	25 %	25 %	312797388
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52220	NC_014722	CTGG	2	8	2549906	2549913	0 %	25 %	50 %	25 %	312797400
52221	NC_014722	GTCGAC	2	12	2549914	2549925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312797400
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52225	NC_014722	GC	3	6	2550116	2550121	0 %	0 %	50 %	50 %	312797401
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52229	NC_014722	TGC	2	6	2550278	2550283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797401
52230	NC_014722	CG	4	8	2550312	2550319	0 %	0 %	50 %	50 %	312797401
52231	NC_014722	TGC	2	6	2550320	2550325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797401
52232	NC_014722	ATCG	2	8	2550339	2550346	25 %	25 %	25 %	25 %	312797401
52233	NC_014722	CGC	2	6	2550381	2550386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797401
52234	NC_014722	CG	3	6	2550403	2550408	0 %	0 %	50 %	50 %	312797401
52235	NC_014722	TCG	2	6	2550446	2550451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797401
52236	NC_014722	TAT	2	6	2550520	2550525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312797401
52237	NC_014722	GCC	2	6	2550605	2550610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797401
52238	NC_014722	GC	3	6	2550651	2550656	0 %	0 %	50 %	50 %	312797401
52239	NC_014722	CCG	2	6	2550657	2550662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797401
52240	NC_014722	GCC	2	6	2550666	2550671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797401
52241	NC_014722	GC	3	6	2550672	2550677	0 %	0 %	50 %	50 %	312797401
52242	NC_014722	GCG	2	6	2551177	2551182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797402
52243	NC_014722	CGA	2	6	2551223	2551228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797402
52244	NC_014722	GTCACC	2	12	2551242	2551253	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312797402
52245	NC_014722	CG	3	6	2551254	2551259	0 %	0 %	50 %	50 %	312797402
52246	NC_014722	GGC	2	6	2551355	2551360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797402
52247	NC_014722	CAA	2	6	2551421	2551426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312797402
52248	NC_014722	GGT	2	6	2551428	2551433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797402
52249	NC_014722	GCC	2	6	2551475	2551480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797402
52250	NC_014722	GGT	2	6	2551487	2551492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797402
52251	NC_014722	TGG	2	6	2551621	2551626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797402
52252	NC_014722	CG	3	6	2551692	2551697	0 %	0 %	50 %	50 %	312797402
52253	NC_014722	CCG	2	6	2551756	2551761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797402
52254	NC_014722	GAC	2	6	2551778	2551783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797402
52255	NC_014722	TAC	3	9	2551788	2551796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797402
52256	NC_014722	CG	3	6	2551891	2551896	0 %	0 %	50 %	50 %	312797402
52257	NC_014722	GAG	2	6	2551998	2552003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312797402
52258	NC_014722	GAA	2	6	2552012	2552017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312797402
52259	NC_014722	GCA	2	6	2552068	2552073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797402
52260	NC_014722	TGC	2	6	2552086	2552091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797402
52261	NC_014722	TCCGCG	2	12	2552181	2552192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312797402
52262	NC_014722	CCG	2	6	2552257	2552262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797402
52263	NC_014722	GC	3	6	2552290	2552295	0 %	0 %	50 %	50 %	312797402
52264	NC_014722	CGG	2	6	2552320	2552325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797402
52265	NC_014722	CGG	2	6	2552331	2552336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797402
52266	NC_014722	CGG	2	6	2552345	2552350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797402
52267	NC_014722	CGC	2	6	2552365	2552370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797402
52268	NC_014722	TGC	2	6	2552388	2552393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797402
52269	NC_014722	ACG	2	6	2552399	2552404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797403
52270	NC_014722	CTG	2	6	2552410	2552415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797403
52271	NC_014722	CGA	2	6	2552439	2552444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797403
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52275	NC_014722	CGCC	2	8	2552667	2552674	0 %	0 %	25 %	75 %	312797404
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52286	NC_014722	TGA	2	6	2553059	2553064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797404
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52289	NC_014722	CGC	3	9	2553171	2553179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797404
52290	NC_014722	GCA	2	6	2553189	2553194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797404
52291	NC_014722	GC	3	6	2553278	2553283	0 %	0 %	50 %	50 %	312797404
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52300	NC_014722	CGCA	2	8	2553820	2553827	25 %	0 %	25 %	50 %	312797405
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52302	NC_014722	CG	3	6	2553864	2553869	0 %	0 %	50 %	50 %	312797405
52303	NC_014722	ACG	2	6	2553938	2553943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797405
52304	NC_014722	TGC	2	6	2553962	2553967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797405
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52308	NC_014722	AGC	2	6	2554160	2554165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797405
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52313	NC_014722	GTC	2	6	2554255	2554260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797405
52314	NC_014722	CTG	2	6	2554282	2554287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797405
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52317	NC_014722	GCCC	2	8	2554347	2554354	0 %	0 %	25 %	75 %	312797405
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52320	NC_014722	CGT	2	6	2554458	2554463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797405
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52323	NC_014722	CGA	2	6	2554515	2554520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797405
52324	NC_014722	ATC	2	6	2554567	2554572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797405
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52327	NC_014722	TCG	2	6	2554760	2554765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797405
52328	NC_014722	CTG	2	6	2554774	2554779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797405
52329	NC_014722	CGC	2	6	2554780	2554785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797405
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52331	NC_014722	CTC	2	6	2554933	2554938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312797405
52332	NC_014722	CG	3	6	2554971	2554976	0 %	0 %	50 %	50 %	312797405
52333	NC_014722	GCA	2	6	2555085	2555090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797405
52334	NC_014722	CAT	2	6	2555287	2555292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797406
52335	NC_014722	ATG	2	6	2555300	2555305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797406
52336	NC_014722	GC	3	6	2555332	2555337	0 %	0 %	50 %	50 %	312797406
52337	NC_014722	GCCA	2	8	2555362	2555369	25 %	0 %	25 %	50 %	312797406
52338	NC_014722	TTGGG	2	10	2555445	2555454	0 %	40 %	60 %	0 %	312797406
52339	NC_014722	CG	3	6	2555474	2555479	0 %	0 %	50 %	50 %	312797406
52340	NC_014722	GCAGGC	2	12	2555481	2555492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312797406
52341	NC_014722	GCA	2	6	2555498	2555503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797406
52342	NC_014722	TCG	2	6	2555544	2555549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797406
52343	NC_014722	GGCA	2	8	2555624	2555631	25 %	0 %	50 %	25 %	312797407
52344	NC_014722	CGC	2	6	2555632	2555637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797407
52345	NC_014722	CG	3	6	2555737	2555742	0 %	0 %	50 %	50 %	312797407
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52347	NC_014722	GCC	2	6	2555792	2555797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797407
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52465	NC_014722	TCG	2	6	2561856	2561861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797414
52466	NC_014722	GC	3	6	2561885	2561890	0 %	0 %	50 %	50 %	312797414
52467	NC_014722	GC	4	8	2561896	2561903	0 %	0 %	50 %	50 %	312797414
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52469	NC_014722	CG	3	6	2561971	2561976	0 %	0 %	50 %	50 %	312797414
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52500	NC_014722	GCG	2	6	2563795	2563800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797415

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