MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_014722	GCAA	2	8	2517172	2517179	50 %	0 %	25 %	25 %	312797355
51502	NC_014722	CTG	2	6	2517192	2517197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51503	NC_014722	CGG	2	6	2517215	2517220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797355
51504	NC_014722	GTA	2	6	2517222	2517227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797355
51505	NC_014722	CG	6	12	2517228	2517239	0 %	0 %	50 %	50 %	312797355
51506	NC_014722	AGC	2	6	2517247	2517252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51507	NC_014722	ATC	2	6	2517270	2517275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797355
51508	NC_014722	CGC	2	6	2517282	2517287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797355
51509	NC_014722	TGA	2	6	2517310	2517315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797355
51510	NC_014722	CAT	2	6	2517317	2517322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797355
51511	NC_014722	CGTG	2	8	2517343	2517350	0 %	25 %	50 %	25 %	312797355
51512	NC_014722	GAC	2	6	2517357	2517362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51513	NC_014722	GCGCG	2	10	2517413	2517422	0 %	0 %	60 %	40 %	312797355
51514	NC_014722	CGA	2	6	2517497	2517502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51515	NC_014722	CTG	2	6	2517582	2517587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51516	NC_014722	CGC	2	6	2517609	2517614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797355
51517	NC_014722	GCT	2	6	2517688	2517693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51518	NC_014722	CG	3	6	2517718	2517723	0 %	0 %	50 %	50 %	312797355
51519	NC_014722	TCG	2	6	2518006	2518011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797356
51520	NC_014722	TCTCGA	2	12	2518014	2518025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312797356
51521	NC_014722	TGC	3	9	2518049	2518057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797356
51522	NC_014722	ACC	2	6	2518070	2518075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312797356
51523	NC_014722	TGC	2	6	2518091	2518096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797356
51524	NC_014722	CGG	2	6	2518178	2518183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797356
51525	NC_014722	GGC	2	6	2518195	2518200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797356
51526	NC_014722	CACG	2	8	2518206	2518213	25 %	0 %	25 %	50 %	312797356
51527	NC_014722	TGCC	2	8	2518237	2518244	0 %	25 %	25 %	50 %	312797356
51528	NC_014722	CGC	2	6	2518346	2518351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797356
51529	NC_014722	CTGC	2	8	2518390	2518397	0 %	25 %	25 %	50 %	312797356
51530	NC_014722	TCG	2	6	2518426	2518431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797356
51531	NC_014722	GCCG	2	8	2518443	2518450	0 %	0 %	50 %	50 %	312797356
51532	NC_014722	GCA	2	6	2518483	2518488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797356
51533	NC_014722	CAT	2	6	2518503	2518508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797356
51534	NC_014722	CGA	2	6	2518541	2518546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797356
51535	NC_014722	CGA	2	6	2518746	2518751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797357
51536	NC_014722	TGC	2	6	2518808	2518813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797357
51537	NC_014722	GTG	2	6	2518849	2518854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797357
51538	NC_014722	TTC	2	6	2518867	2518872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312797357
51539	NC_014722	ATCC	2	8	2518887	2518894	25 %	25 %	0 %	50 %	312797357
51540	NC_014722	ATG	2	6	2518904	2518909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797357
51541	NC_014722	GCC	2	6	2518920	2518925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797357
51542	NC_014722	GCG	2	6	2518949	2518954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797357
51543	NC_014722	GCA	2	6	2519004	2519009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797357
51544	NC_014722	ATCGGC	2	12	2519026	2519037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312797357
51545	NC_014722	GC	5	10	2519063	2519072	0 %	0 %	50 %	50 %	312797357
51546	NC_014722	CCG	2	6	2519110	2519115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797357
51547	NC_014722	AGG	2	6	2519120	2519125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312797357
51548	NC_014722	AGC	2	6	2519126	2519131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797357
51549	NC_014722	CG	3	6	2519200	2519205	0 %	0 %	50 %	50 %	312797357
51550	NC_014722	ATG	2	6	2519206	2519211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797357
51551	NC_014722	CGG	2	6	2519250	2519255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797357
51552	NC_014722	GC	3	6	2519302	2519307	0 %	0 %	50 %	50 %	312797357
51553	NC_014722	TCA	2	6	2519318	2519323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797357
51554	NC_014722	GC	3	6	2519324	2519329	0 %	0 %	50 %	50 %	312797357
51555	NC_014722	AC	3	6	2519397	2519402	50 %	0 %	0 %	50 %	312797358
51556	NC_014722	AC	3	6	2519407	2519412	50 %	0 %	0 %	50 %	312797358
51557	NC_014722	TCG	2	6	2519419	2519424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797358
51558	NC_014722	GATC	2	8	2519456	2519463	25 %	25 %	25 %	25 %	312797358
51559	NC_014722	AGAT	2	8	2519464	2519471	50 %	25 %	25 %	0 %	312797358
51560	NC_014722	TCG	2	6	2519536	2519541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797358
51561	NC_014722	ATC	2	6	2519545	2519550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797358
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51564	NC_014722	GTCCG	2	10	2519654	2519663	0 %	20 %	40 %	40 %	312797358
51565	NC_014722	ATTGAT	2	12	2519898	2519909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312797359
51566	NC_014722	GCA	2	6	2519943	2519948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797359
51567	NC_014722	CGCA	2	8	2519998	2520005	25 %	0 %	25 %	50 %	312797359
51568	NC_014722	TTG	2	6	2520029	2520034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312797359
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51582	NC_014722	GC	3	6	2520627	2520632	0 %	0 %	50 %	50 %	312797360
51583	NC_014722	CGG	2	6	2520655	2520660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797360
51584	NC_014722	CCG	2	6	2520684	2520689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797360
51585	NC_014722	GC	4	8	2520785	2520792	0 %	0 %	50 %	50 %	312797360
51586	NC_014722	CAC	2	6	2520808	2520813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312797360
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51588	NC_014722	CG	3	6	2520825	2520830	0 %	0 %	50 %	50 %	312797360
51589	NC_014722	CCAG	2	8	2520903	2520910	25 %	0 %	25 %	50 %	312797360
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51597	NC_014722	GC	3	6	2521109	2521114	0 %	0 %	50 %	50 %	312797360
51598	NC_014722	ATTC	2	8	2521137	2521144	25 %	50 %	0 %	25 %	312797360
51599	NC_014722	GCC	2	6	2521171	2521176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797360
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51601	NC_014722	GC	3	6	2521183	2521188	0 %	0 %	50 %	50 %	312797360
51602	NC_014722	AGCC	3	12	2521189	2521200	25 %	0 %	25 %	50 %	312797360
51603	NC_014722	GC	3	6	2521242	2521247	0 %	0 %	50 %	50 %	312797360
51604	NC_014722	CTG	2	6	2521546	2521551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797361
51605	NC_014722	CACCGG	2	12	2521573	2521584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312797361
51606	NC_014722	GC	3	6	2521630	2521635	0 %	0 %	50 %	50 %	312797361
51607	NC_014722	CTC	2	6	2521649	2521654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312797361
51608	NC_014722	CAGC	2	8	2521668	2521675	25 %	0 %	25 %	50 %	312797361
51609	NC_014722	GCG	2	6	2521764	2521769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797361
51610	NC_014722	CAT	2	6	2521771	2521776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797361
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51612	NC_014722	C	7	7	2521855	2521861	0 %	0 %	0 %	100 %	312797361
51613	NC_014722	CGT	2	6	2521889	2521894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797361
51614	NC_014722	ACC	2	6	2521905	2521910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312797361
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51616	NC_014722	GGCAT	2	10	2521962	2521971	20 %	20 %	40 %	20 %	312797361
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51851	NC_014722	GCA	2	6	2533625	2533630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797378
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51952	NC_014722	ACG	2	6	2538233	2538238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797384
51953	NC_014722	CAG	4	12	2538267	2538278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797384
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51966	NC_014722	GCT	2	6	2538896	2538901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797385
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52000	NC_014722	TGAT	2	8	2540452	2540459	25 %	50 %	25 %	0 %	312797387

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