MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_014722	CGC	2	6	2497293	2497298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797333
51003	NC_014722	TGG	2	6	2497315	2497320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797333
51004	NC_014722	AAC	2	6	2497372	2497377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312797333
51005	NC_014722	ATC	2	6	2497414	2497419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797333
51006	NC_014722	CG	3	6	2497421	2497426	0 %	0 %	50 %	50 %	312797333
51007	NC_014722	GC	3	6	2497492	2497497	0 %	0 %	50 %	50 %	312797333
51008	NC_014722	CGC	2	6	2497517	2497522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797333
51009	NC_014722	CTG	2	6	2497527	2497532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797333
51010	NC_014722	GAA	2	6	2497548	2497553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312797333
51011	NC_014722	TGC	2	6	2497598	2497603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797333
51012	NC_014722	CTCG	2	8	2497604	2497611	0 %	25 %	25 %	50 %	312797333
51013	NC_014722	CCGG	2	8	2497643	2497650	0 %	0 %	50 %	50 %	312797333
51014	NC_014722	GCCAT	2	10	2497690	2497699	20 %	20 %	20 %	40 %	312797333
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51017	NC_014722	GCGCG	2	10	2497958	2497967	0 %	0 %	60 %	40 %	312797334
51018	NC_014722	ATC	2	6	2497970	2497975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797334
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51106	NC_014722	CTCGAG	2	12	2501126	2501137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312797338
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51116	NC_014722	GC	3	6	2501895	2501900	0 %	0 %	50 %	50 %	312797339
51117	NC_014722	GGC	2	6	2501906	2501911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797339
51118	NC_014722	TTC	2	6	2501940	2501945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312797339
51119	NC_014722	CGA	2	6	2501993	2501998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797339
51120	NC_014722	GGA	2	6	2502032	2502037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312797339
51121	NC_014722	TTGA	2	8	2502039	2502046	25 %	50 %	25 %	0 %	312797339
51122	NC_014722	TCA	2	6	2502058	2502063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797339
51123	NC_014722	ATTG	2	8	2502080	2502087	25 %	50 %	25 %	0 %	312797339
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51125	NC_014722	GC	3	6	2502144	2502149	0 %	0 %	50 %	50 %	312797339
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51130	NC_014722	CG	4	8	2502245	2502252	0 %	0 %	50 %	50 %	312797339
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51132	NC_014722	GC	3	6	2502273	2502278	0 %	0 %	50 %	50 %	312797339
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51138	NC_014722	CG	3	6	2502445	2502450	0 %	0 %	50 %	50 %	312797339
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51156	NC_014722	CG	3	6	2503114	2503119	0 %	0 %	50 %	50 %	312797340
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51219	NC_014722	CGA	3	9	2505389	2505397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797343
51220	NC_014722	GAGAAC	2	12	2505656	2505667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312797344
51221	NC_014722	CGC	2	6	2505694	2505699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797344
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51224	NC_014722	GCG	2	6	2505774	2505779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797344
51225	NC_014722	GC	4	8	2505790	2505797	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51226	NC_014722	GCCG	2	8	2505808	2505815	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51227	NC_014722	CGA	2	6	2505820	2505825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
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51230	NC_014722	CGT	2	6	2505864	2505869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51231	NC_014722	GAC	2	6	2505878	2505883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51232	NC_014722	CGA	4	12	2505907	2505918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51233	NC_014722	GCC	2	6	2505922	2505927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797344
51234	NC_014722	GCTGCA	2	12	2505928	2505939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51235	NC_014722	CG	3	6	2506002	2506007	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51236	NC_014722	CG	3	6	2506010	2506015	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51237	NC_014722	GAC	2	6	2506043	2506048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51238	NC_014722	CGA	2	6	2506072	2506077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51239	NC_014722	GCCG	2	8	2506093	2506100	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51240	NC_014722	GCT	2	6	2506141	2506146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51241	NC_014722	GC	3	6	2506175	2506180	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
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51244	NC_014722	GGC	2	6	2506279	2506284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797344
51245	NC_014722	GC	3	6	2506283	2506288	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51246	NC_014722	CGA	2	6	2506324	2506329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51247	NC_014722	CGCA	2	8	2506344	2506351	25 %	0 %	25 %	50 %	312797344
51248	NC_014722	CGCT	2	8	2506358	2506365	0 %	25 %	25 %	50 %	312797344
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51251	NC_014722	CAT	2	6	2506423	2506428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312797344
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51253	NC_014722	GCA	2	6	2506521	2506526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51254	NC_014722	AGC	2	6	2506541	2506546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51255	NC_014722	GC	3	6	2506574	2506579	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51256	NC_014722	TCG	2	6	2506638	2506643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51257	NC_014722	T	7	7	2506657	2506663	0 %	100 %	0 %	0 %	312797344
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51259	NC_014722	G	6	6	2506831	2506836	0 %	0 %	100 %	0 %	312797344
51260	NC_014722	CG	3	6	2506859	2506864	0 %	0 %	50 %	50 %	312797344
51261	NC_014722	CTG	2	6	2506931	2506936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797344
51262	NC_014722	AGATA	2	10	2507072	2507081	60 %	20 %	20 %	0 %	312797344
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51272	NC_014722	CGGCT	2	10	2507979	2507988	0 %	20 %	40 %	40 %	312797346
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51338	NC_014722	CG	6	12	2510883	2510894	0 %	0 %	50 %	50 %	312797349
51339	NC_014722	GC	3	6	2510924	2510929	0 %	0 %	50 %	50 %	312797349
51340	NC_014722	CGT	2	6	2510937	2510942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797349
51341	NC_014722	TGC	2	6	2510954	2510959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797349
51342	NC_014722	CTG	2	6	2510968	2510973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797349
51343	NC_014722	AGC	2	6	2511011	2511016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797349
51344	NC_014722	CGG	2	6	2511096	2511101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797350
51345	NC_014722	CACC	2	8	2511111	2511118	25 %	0 %	0 %	75 %	312797350
51346	NC_014722	GT	3	6	2511164	2511169	0 %	50 %	50 %	0 %	312797350
51347	NC_014722	CCG	2	6	2511206	2511211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797350
51348	NC_014722	CG	5	10	2511220	2511229	0 %	0 %	50 %	50 %	312797350
51349	NC_014722	CGG	2	6	2511289	2511294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797350
51350	NC_014722	AGC	2	6	2511305	2511310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797350
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51462	NC_014722	CG	4	8	2515378	2515385	0 %	0 %	50 %	50 %	312797353
51463	NC_014722	CGAC	2	8	2515393	2515400	25 %	0 %	25 %	50 %	312797353
51464	NC_014722	GCCG	2	8	2515404	2515411	0 %	0 %	50 %	50 %	312797353
51465	NC_014722	CCA	2	6	2515512	2515517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312797353
51466	NC_014722	C	6	6	2515578	2515583	0 %	0 %	0 %	100 %	312797353
51467	NC_014722	TGC	2	6	2515603	2515608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797353
51468	NC_014722	GCC	2	6	2515657	2515662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797353
51469	NC_014722	CTGGA	2	10	2515704	2515713	20 %	20 %	40 %	20 %	312797354
51470	NC_014722	TGC	2	6	2515720	2515725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797354
51471	NC_014722	CGA	2	6	2515739	2515744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797354
51472	NC_014722	GCG	2	6	2515809	2515814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797354
51473	NC_014722	GCT	2	6	2515817	2515822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797354
51474	NC_014722	ACAGC	2	10	2515826	2515835	40 %	0 %	20 %	40 %	312797354
51475	NC_014722	ATCGAC	2	12	2515857	2515868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312797354
51476	NC_014722	CGG	3	9	2515895	2515903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797354
51477	NC_014722	GCT	2	6	2515925	2515930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797354
51478	NC_014722	GGC	2	6	2515948	2515953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797354
51479	NC_014722	TTC	2	6	2516013	2516018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312797354
51480	NC_014722	GCAC	2	8	2516082	2516089	25 %	0 %	25 %	50 %	312797354
51481	NC_014722	TGG	2	6	2516095	2516100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312797354
51482	NC_014722	TCCGA	2	10	2516137	2516146	20 %	20 %	20 %	40 %	312797354
51483	NC_014722	ACA	2	6	2516215	2516220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312797354
51484	NC_014722	CG	4	8	2516330	2516337	0 %	0 %	50 %	50 %	312797354
51485	NC_014722	GCA	2	6	2516370	2516375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797354
51486	NC_014722	CAG	2	6	2516381	2516386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797354
51487	NC_014722	GCAA	2	8	2516405	2516412	50 %	0 %	25 %	25 %	312797354
51488	NC_014722	CGC	2	6	2516494	2516499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797354
51489	NC_014722	GGCAA	2	10	2516784	2516793	40 %	0 %	40 %	20 %	312797355
51490	NC_014722	CGA	2	6	2516887	2516892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51491	NC_014722	TGA	2	6	2516911	2516916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312797355
51492	NC_014722	GC	3	6	2516936	2516941	0 %	0 %	50 %	50 %	312797355
51493	NC_014722	CGGA	2	8	2516948	2516955	25 %	0 %	50 %	25 %	312797355
51494	NC_014722	CGG	2	6	2516959	2516964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312797355
51495	NC_014722	CCG	2	6	2516996	2517001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312797355
51496	NC_014722	GC	3	6	2517012	2517017	0 %	0 %	50 %	50 %	312797355
51497	NC_014722	GTC	2	6	2517036	2517041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797355
51498	NC_014722	TTC	2	6	2517114	2517119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312797355
51499	NC_014722	ACA	2	6	2517133	2517138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312797355
51500	NC_014722	TGC	2	6	2517154	2517159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312797355

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