MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014718	TCG	3	9	660727	660735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12502	NC_014718	AGCGC	2	10	660932	660941	20 %	0 %	40 %	40 %	312602716
12503	NC_014718	CGCA	2	8	661005	661012	25 %	0 %	25 %	50 %	312602716
12504	NC_014718	TGC	2	6	661075	661080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12505	NC_014718	CG	3	6	661106	661111	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12506	NC_014718	CCG	3	9	661166	661174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12507	NC_014718	CAGC	2	8	661181	661188	25 %	0 %	25 %	50 %	312602716
12508	NC_014718	TCA	2	6	661247	661252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602716
12509	NC_014718	CAG	2	6	661263	661268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12510	NC_014718	GCC	2	6	661275	661280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12511	NC_014718	AAG	2	6	661288	661293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602716
12512	NC_014718	TCG	2	6	661340	661345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12513	NC_014718	CGT	2	6	661350	661355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12514	NC_014718	GCG	2	6	661370	661375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602716
12515	NC_014718	AGTG	2	8	661505	661512	25 %	25 %	50 %	0 %	312602716
12516	NC_014718	TGCG	2	8	661519	661526	0 %	25 %	50 %	25 %	312602716
12517	NC_014718	GCT	2	6	661541	661546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12518	NC_014718	CCA	2	6	661559	661564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12519	NC_014718	CAA	2	6	661571	661576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602716
12520	NC_014718	CAC	2	6	661608	661613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12521	NC_014718	CAA	2	6	661709	661714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602716
12522	NC_014718	TGT	2	6	661978	661983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602716
12523	NC_014718	GGT	2	6	662010	662015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602716
12524	NC_014718	CG	3	6	662060	662065	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12525	NC_014718	CCA	2	6	662107	662112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12526	NC_014718	TGA	2	6	662227	662232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12527	NC_014718	ATG	2	6	662256	662261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12528	NC_014718	GCC	2	6	662280	662285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12529	NC_014718	GTAAC	2	10	662286	662295	40 %	20 %	20 %	20 %	312602716
12530	NC_014718	CAAACG	2	12	662324	662335	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312602716
12531	NC_014718	CAC	2	6	662403	662408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12532	NC_014718	ACC	2	6	662545	662550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12533	NC_014718	AGCGC	2	10	662578	662587	20 %	0 %	40 %	40 %	312602716
12534	NC_014718	CAC	2	6	662684	662689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12535	NC_014718	CAC	2	6	662748	662753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12536	NC_014718	GCTGC	2	10	662871	662880	0 %	20 %	40 %	40 %	312602716
12537	NC_014718	TGA	2	6	662899	662904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12538	NC_014718	TGG	2	6	662911	662916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602716
12539	NC_014718	GTC	2	6	662932	662937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12540	NC_014718	AGC	2	6	662953	662958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12541	NC_014718	GCC	2	6	663016	663021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12542	NC_014718	TCG	2	6	663065	663070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12543	NC_014718	AAC	2	6	663079	663084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602716
12544	NC_014718	CGAAC	2	10	663149	663158	40 %	0 %	20 %	40 %	312602716
12545	NC_014718	CGG	2	6	663276	663281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602716
12546	NC_014718	CGT	2	6	663339	663344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
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12548	NC_014718	GCA	2	6	663445	663450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
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12550	NC_014718	GC	3	6	663504	663509	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12551	NC_014718	CGT	2	6	663549	663554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12552	NC_014718	CAG	2	6	663672	663677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12553	NC_014718	CGT	2	6	663696	663701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12554	NC_014718	AGT	2	6	663707	663712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12555	NC_014718	ATG	2	6	663885	663890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12556	NC_014718	TG	3	6	663892	663897	0 %	50 %	50 %	0 %	312602716
12557	NC_014718	GCAC	2	8	663899	663906	25 %	0 %	25 %	50 %	312602716
12558	NC_014718	CG	3	6	663956	663961	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12559	NC_014718	GCCG	2	8	664065	664072	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12560	NC_014718	CAA	2	6	664074	664079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602716
12561	NC_014718	AGCGC	2	10	664118	664127	20 %	0 %	40 %	40 %	312602716
12562	NC_014718	GC	3	6	664134	664139	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12563	NC_014718	TTG	2	6	664158	664163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602716
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12566	NC_014718	GCT	2	6	664259	664264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12567	NC_014718	GCC	2	6	664284	664289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12568	NC_014718	CAC	2	6	664350	664355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12569	NC_014718	GC	3	6	664418	664423	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12570	NC_014718	TCA	2	6	664433	664438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602716
12571	NC_014718	A	6	6	664473	664478	100 %	0 %	0 %	0 %	312602716
12572	NC_014718	ATG	2	6	664572	664577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
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12575	NC_014718	TCGGC	2	10	664736	664745	0 %	20 %	40 %	40 %	312602716
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12579	NC_014718	GT	3	6	665114	665119	0 %	50 %	50 %	0 %	312602716
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12586	NC_014718	CAC	2	6	665262	665267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12587	NC_014718	TTGA	2	8	665343	665350	25 %	50 %	25 %	0 %	312602716
12588	NC_014718	GCC	2	6	665449	665454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
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12591	NC_014718	ATC	2	6	665529	665534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602716
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12593	NC_014718	CG	3	6	665572	665577	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12594	NC_014718	GCA	2	6	665658	665663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
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12596	NC_014718	CAA	2	6	665778	665783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602716
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12598	NC_014718	GC	3	6	665830	665835	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12599	NC_014718	CCA	3	9	665885	665893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
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12602	NC_014718	TGA	2	6	666070	666075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12603	NC_014718	AGG	2	6	666095	666100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602716
12604	NC_014718	TCG	2	6	666104	666109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12605	NC_014718	AGC	2	6	666124	666129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12606	NC_014718	CTG	2	6	666219	666224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12607	NC_014718	CA	3	6	666235	666240	50 %	0 %	0 %	50 %	312602716
12608	NC_014718	CAC	2	6	666261	666266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602716
12609	NC_014718	CAT	2	6	666296	666301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602716
12610	NC_014718	GCCGC	2	10	666383	666392	0 %	0 %	40 %	60 %	312602716
12611	NC_014718	CCG	2	6	666434	666439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12612	NC_014718	CGC	2	6	666443	666448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12613	NC_014718	GCGA	2	8	666466	666473	25 %	0 %	50 %	25 %	312602716
12614	NC_014718	CATGTT	2	12	666476	666487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312602716
12615	NC_014718	GC	3	6	666504	666509	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12616	NC_014718	GT	3	6	666566	666571	0 %	50 %	50 %	0 %	312602716
12617	NC_014718	AAC	2	6	666625	666630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602716
12618	NC_014718	GCT	2	6	666650	666655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
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12978	NC_014718	GC	3	6	685270	685275	0 %	0 %	50 %	50 %	312602731
12979	NC_014718	TCG	2	6	685283	685288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602731
12980	NC_014718	ATC	2	6	685297	685302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602731
12981	NC_014718	GC	3	6	685309	685314	0 %	0 %	50 %	50 %	312602731
12982	NC_014718	GT	3	6	685344	685349	0 %	50 %	50 %	0 %	312602731
12983	NC_014718	CG	3	6	685376	685381	0 %	0 %	50 %	50 %	312602731
12984	NC_014718	GCG	2	6	685389	685394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602731
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