MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_014718	GCGG	2	8	634008	634015	0 %	0 %	75 %	25 %	312602701
12002	NC_014718	CGA	2	6	634036	634041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602701
12003	NC_014718	GAT	2	6	634099	634104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602701
12004	NC_014718	CAA	2	6	634120	634125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602701
12005	NC_014718	TCC	2	6	634147	634152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602701
12006	NC_014718	GC	3	6	634153	634158	0 %	0 %	50 %	50 %	312602702
12007	NC_014718	ACCAGC	2	12	634180	634191	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312602702
12008	NC_014718	GCCA	2	8	634207	634214	25 %	0 %	25 %	50 %	312602702
12009	NC_014718	CAT	2	6	634227	634232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602702
12010	NC_014718	GCG	2	6	634250	634255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602702
12011	NC_014718	TGCCA	2	10	635009	635018	20 %	20 %	20 %	40 %	312602703
12012	NC_014718	CGTC	2	8	635092	635099	0 %	25 %	25 %	50 %	312602703
12013	NC_014718	AACG	2	8	635160	635167	50 %	0 %	25 %	25 %	312602703
12014	NC_014718	CG	3	6	635191	635196	0 %	0 %	50 %	50 %	312602703
12015	NC_014718	GCG	2	6	635211	635216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602703
12016	NC_014718	CGA	2	6	635240	635245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602703
12017	NC_014718	GCCA	2	8	635271	635278	25 %	0 %	25 %	50 %	312602703
12018	NC_014718	ACG	2	6	635281	635286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602703
12019	NC_014718	GC	3	6	635309	635314	0 %	0 %	50 %	50 %	312602703
12020	NC_014718	GC	3	6	635352	635357	0 %	0 %	50 %	50 %	312602703
12021	NC_014718	GCC	2	6	635361	635366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602703
12022	NC_014718	GTTG	2	8	635534	635541	0 %	50 %	50 %	0 %	312602704
12023	NC_014718	AAGA	2	8	635596	635603	75 %	0 %	25 %	0 %	312602704
12024	NC_014718	GTCG	2	8	635619	635626	0 %	25 %	50 %	25 %	312602704
12025	NC_014718	CCGC	2	8	635650	635657	0 %	0 %	25 %	75 %	312602704
12026	NC_014718	GGC	2	6	635662	635667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602704
12027	NC_014718	CGA	2	6	635685	635690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602704
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12029	NC_014718	GCG	2	6	636081	636086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602705
12030	NC_014718	CTCA	2	8	636094	636101	25 %	25 %	0 %	50 %	312602705
12031	NC_014718	GCC	2	6	636125	636130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602705
12032	NC_014718	GC	4	8	636132	636139	0 %	0 %	50 %	50 %	312602705
12033	NC_014718	GCA	2	6	636195	636200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602705
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12039	NC_014718	CAG	2	6	636592	636597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602706
12040	NC_014718	ACG	2	6	636638	636643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602706
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12043	NC_014718	GGCC	2	8	636730	636737	0 %	0 %	50 %	50 %	312602706
12044	NC_014718	TAC	2	6	636758	636763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602706
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12047	NC_014718	CG	3	6	636845	636850	0 %	0 %	50 %	50 %	312602706
12048	NC_014718	GCG	2	6	636855	636860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602706
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12051	NC_014718	TGC	2	6	636980	636985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602706
12052	NC_014718	CGTT	2	8	637009	637016	0 %	50 %	25 %	25 %	312602706
12053	NC_014718	CGG	2	6	637035	637040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602706
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12055	NC_014718	GC	3	6	637107	637112	0 %	0 %	50 %	50 %	312602706
12056	NC_014718	TCG	2	6	637124	637129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602706
12057	NC_014718	GCG	2	6	637137	637142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602706
12058	NC_014718	CAG	2	6	637159	637164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602706
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12064	NC_014718	GC	4	8	637466	637473	0 %	0 %	50 %	50 %	312602707
12065	NC_014718	GCG	2	6	637482	637487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602707
12066	NC_014718	GCA	2	6	637554	637559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602707
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12068	NC_014718	GC	3	6	637599	637604	0 %	0 %	50 %	50 %	312602707
12069	NC_014718	AGC	2	6	637876	637881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602708
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12081	NC_014718	GC	3	6	639081	639086	0 %	0 %	50 %	50 %	312602710
12082	NC_014718	CG	3	6	639103	639108	0 %	0 %	50 %	50 %	312602710
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12085	NC_014718	TCGG	2	8	639231	639238	0 %	25 %	50 %	25 %	312602710
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12093	NC_014718	GTT	2	6	639732	639737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602712
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12105	NC_014718	CA	3	6	640408	640413	50 %	0 %	0 %	50 %	312602713
12106	NC_014718	GTTC	2	8	640485	640492	0 %	50 %	25 %	25 %	312602713
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12113	NC_014718	CGAA	2	8	640828	640835	50 %	0 %	25 %	25 %	312602713
12114	NC_014718	T	6	6	640838	640843	0 %	100 %	0 %	0 %	312602713
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12120	NC_014718	TTAA	2	8	641015	641022	50 %	50 %	0 %	0 %	312602713
12121	NC_014718	CTT	2	6	641094	641099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602713
12122	NC_014718	AGC	2	6	641209	641214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602713
12123	NC_014718	TTA	2	6	641279	641284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602713
12124	NC_014718	TCG	2	6	641364	641369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602713
12125	NC_014718	ATC	2	6	641383	641388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602713
12126	NC_014718	TTG	2	6	641406	641411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602713
12127	NC_014718	CTG	2	6	641415	641420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602713
12128	NC_014718	TTGCGT	2	12	641434	641445	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312602713
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12130	NC_014718	AGA	2	6	641525	641530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602713
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12132	NC_014718	ACTGC	2	10	641898	641907	20 %	20 %	20 %	40 %	312602714
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12134	NC_014718	CCTG	2	8	641988	641995	0 %	25 %	25 %	50 %	312602714
12135	NC_014718	CAT	2	6	642021	642026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602714
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12137	NC_014718	CAT	2	6	642081	642086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602714
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12140	NC_014718	T	6	6	642173	642178	0 %	100 %	0 %	0 %	312602714
12141	NC_014718	TAA	2	6	642222	642227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602714
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12144	NC_014718	CTT	2	6	642285	642290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602714
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12151	NC_014718	ATGC	2	8	642598	642605	25 %	25 %	25 %	25 %	312602714
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12154	NC_014718	CAA	2	6	642790	642795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602714
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12157	NC_014718	GTC	2	6	642823	642828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602714
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12231	NC_014718	A	6	6	646844	646849	100 %	0 %	0 %	0 %	312602715
12232	NC_014718	AGC	2	6	646881	646886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12234	NC_014718	ATC	2	6	646919	646924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602715
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12241	NC_014718	CG	3	6	647351	647356	0 %	0 %	50 %	50 %	312602715
12242	NC_014718	GCT	2	6	647399	647404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
12243	NC_014718	CGT	2	6	647443	647448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12245	NC_014718	CTG	2	6	647672	647677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12265	NC_014718	CGC	2	6	648631	648636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602715
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12271	NC_014718	TCT	2	6	648918	648923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602715
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12333	NC_014718	CTG	2	6	652070	652075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12335	NC_014718	AGC	2	6	652125	652130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12344	NC_014718	CGT	2	6	652721	652726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12350	NC_014718	GC	3	6	653150	653155	0 %	0 %	50 %	50 %	312602715
12351	NC_014718	CGG	2	6	653161	653166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602715
12352	NC_014718	CAGCG	2	10	653217	653226	20 %	0 %	40 %	40 %	312602715
12353	NC_014718	GCA	2	6	653293	653298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12355	NC_014718	TGC	2	6	653339	653344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
12356	NC_014718	GCT	2	6	653431	653436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602715
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12478	NC_014718	TCG	2	6	659879	659884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12479	NC_014718	GC	3	6	659897	659902	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12480	NC_014718	GAT	2	6	659922	659927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12481	NC_014718	GCG	2	6	660068	660073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602716
12482	NC_014718	CGGCG	2	10	660085	660094	0 %	0 %	60 %	40 %	312602716
12483	NC_014718	CGC	2	6	660160	660165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12484	NC_014718	TCG	3	9	660185	660193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12485	NC_014718	A	6	6	660234	660239	100 %	0 %	0 %	0 %	312602716
12486	NC_014718	GCA	2	6	660259	660264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12487	NC_014718	ATC	2	6	660300	660305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602716
12488	NC_014718	GC	3	6	660318	660323	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12489	NC_014718	CGC	2	6	660339	660344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602716
12490	NC_014718	CGT	2	6	660363	660368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12491	NC_014718	GCT	2	6	660386	660391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12492	NC_014718	TGC	2	6	660451	660456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12493	NC_014718	CGGT	3	12	660465	660476	0 %	25 %	50 %	25 %	312602716
12494	NC_014718	CAG	2	6	660486	660491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716
12495	NC_014718	CG	3	6	660513	660518	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12496	NC_014718	AGT	2	6	660521	660526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602716
12497	NC_014718	TCGC	2	8	660543	660550	0 %	25 %	25 %	50 %	312602716
12498	NC_014718	CG	3	6	660632	660637	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12499	NC_014718	GC	3	6	660647	660652	0 %	0 %	50 %	50 %	312602716
12500	NC_014718	AGC	2	6	660712	660717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602716

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