MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014718	GCAAC	2	10	422805	422814	40 %	0 %	20 %	40 %	312602503
8002	NC_014718	GCA	2	6	422820	422825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602503
8003	NC_014718	GCC	2	6	422842	422847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602503
8004	NC_014718	TAA	2	6	422877	422882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602503
8005	NC_014718	A	6	6	422905	422910	100 %	0 %	0 %	0 %	312602503
8006	NC_014718	GCA	2	6	423189	423194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8007	NC_014718	CGT	2	6	423205	423210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8008	NC_014718	CGT	2	6	423245	423250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8009	NC_014718	TGG	2	6	423256	423261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602504
8010	NC_014718	GT	3	6	423268	423273	0 %	50 %	50 %	0 %	312602504
8011	NC_014718	CGCAA	2	10	423343	423352	40 %	0 %	20 %	40 %	312602504
8012	NC_014718	GTT	2	6	423362	423367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602504
8013	NC_014718	TGC	2	6	423386	423391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8014	NC_014718	ACCGC	2	10	423462	423471	20 %	0 %	20 %	60 %	312602504
8015	NC_014718	GC	3	6	423478	423483	0 %	0 %	50 %	50 %	312602504
8016	NC_014718	CAT	2	6	423518	423523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602504
8017	NC_014718	GC	3	6	423619	423624	0 %	0 %	50 %	50 %	312602504
8018	NC_014718	GCC	2	6	423639	423644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602504
8019	NC_014718	GCT	2	6	423668	423673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8020	NC_014718	TGA	2	6	423724	423729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602504
8021	NC_014718	CGGC	2	8	423733	423740	0 %	0 %	50 %	50 %	312602504
8022	NC_014718	TCG	2	6	423745	423750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8023	NC_014718	ATCG	2	8	423755	423762	25 %	25 %	25 %	25 %	312602504
8024	NC_014718	CTG	2	6	423765	423770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8025	NC_014718	CGC	2	6	423776	423781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602504
8026	NC_014718	GGCGT	2	10	423840	423849	0 %	20 %	60 %	20 %	312602504
8027	NC_014718	CGG	2	6	423893	423898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602504
8028	NC_014718	TTTC	2	8	423963	423970	0 %	75 %	0 %	25 %	312602504
8029	NC_014718	GAT	2	6	423989	423994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602504
8030	NC_014718	TGC	2	6	423999	424004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602504
8031	NC_014718	GCG	2	6	424257	424262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602505
8032	NC_014718	AC	3	6	424330	424335	50 %	0 %	0 %	50 %	312602505
8033	NC_014718	AGC	2	6	424361	424366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602505
8034	NC_014718	CGG	2	6	424369	424374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602505
8035	NC_014718	CCG	2	6	424386	424391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602505
8036	NC_014718	TGC	2	6	424393	424398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602505
8037	NC_014718	CCG	2	6	424413	424418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602505
8038	NC_014718	GCGTC	2	10	424459	424468	0 %	20 %	40 %	40 %	312602505
8039	NC_014718	GCT	2	6	424552	424557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602506
8040	NC_014718	CTC	2	6	424596	424601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602506
8041	NC_014718	GAA	2	6	424626	424631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602506
8042	NC_014718	GCGTCT	2	12	424763	424774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602506
8043	NC_014718	GAC	2	6	424815	424820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602506
8044	NC_014718	TCGG	2	8	424843	424850	0 %	25 %	50 %	25 %	312602506
8045	NC_014718	GGC	2	6	424866	424871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602506
8046	NC_014718	GGT	3	9	424917	424925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602506
8047	NC_014718	GCC	2	6	424939	424944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602506
8048	NC_014718	GGC	2	6	425007	425012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602506
8049	NC_014718	GCC	2	6	425013	425018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602506
8050	NC_014718	GCC	2	6	425049	425054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602506
8051	NC_014718	CCA	2	6	425066	425071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602506
8052	NC_014718	CGG	2	6	425105	425110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602506
8053	NC_014718	GGC	2	6	425252	425257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602506
8054	NC_014718	TGAA	2	8	425272	425279	50 %	25 %	25 %	0 %	312602506
8055	NC_014718	CGCC	2	8	425315	425322	0 %	0 %	25 %	75 %	312602506
8056	NC_014718	ACG	2	6	425347	425352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602506
8057	NC_014718	CG	3	6	425360	425365	0 %	0 %	50 %	50 %	312602506
8058	NC_014718	GGC	2	6	425445	425450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602506
8059	NC_014718	GGC	2	6	425454	425459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602506
8060	NC_014718	TGT	2	6	425509	425514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602507
8061	NC_014718	GCGG	2	8	425599	425606	0 %	0 %	75 %	25 %	312602507
8062	NC_014718	TGC	2	6	425732	425737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602507
8063	NC_014718	GCA	2	6	425743	425748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602507
8064	NC_014718	CACC	2	8	425882	425889	25 %	0 %	0 %	75 %	312602507
8065	NC_014718	GCT	2	6	425905	425910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602507
8066	NC_014718	CG	3	6	425972	425977	0 %	0 %	50 %	50 %	312602507
8067	NC_014718	GC	3	6	426051	426056	0 %	0 %	50 %	50 %	312602507
8068	NC_014718	GGT	2	6	426140	426145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602507
8069	NC_014718	GCA	2	6	426156	426161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602507
8070	NC_014718	GAG	2	6	426171	426176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602507
8071	NC_014718	CTT	2	6	426193	426198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602508
8072	NC_014718	ATC	2	6	426215	426220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602508
8073	NC_014718	ATC	2	6	426228	426233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602508
8074	NC_014718	GTTGC	2	10	426250	426259	0 %	40 %	40 %	20 %	312602508
8075	NC_014718	CA	3	6	426292	426297	50 %	0 %	0 %	50 %	312602508
8076	NC_014718	GCTC	2	8	426301	426308	0 %	25 %	25 %	50 %	312602508
8077	NC_014718	TCGA	2	8	426368	426375	25 %	25 %	25 %	25 %	312602508
8078	NC_014718	CGA	2	6	426385	426390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602508
8079	NC_014718	AGCG	2	8	426509	426516	25 %	0 %	50 %	25 %	312602509
8080	NC_014718	GCCA	2	8	426522	426529	25 %	0 %	25 %	50 %	312602509
8081	NC_014718	TCG	2	6	426531	426536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602509
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8083	NC_014718	CTG	2	6	427189	427194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602510
8084	NC_014718	TG	3	6	427193	427198	0 %	50 %	50 %	0 %	312602510
8085	NC_014718	T	7	7	427220	427226	0 %	100 %	0 %	0 %	312602510
8086	NC_014718	CCG	2	6	427337	427342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602510
8087	NC_014718	CAG	2	6	427427	427432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602510
8088	NC_014718	CAG	2	6	427473	427478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602510
8089	NC_014718	TCG	2	6	427483	427488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602510
8090	NC_014718	CCAA	2	8	427542	427549	50 %	0 %	0 %	50 %	312602510
8091	NC_014718	GTC	2	6	427550	427555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602510
8092	NC_014718	GTCA	2	8	427564	427571	25 %	25 %	25 %	25 %	312602510
8093	NC_014718	GCT	2	6	427576	427581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602510
8094	NC_014718	GATG	2	8	427588	427595	25 %	25 %	50 %	0 %	312602510
8095	NC_014718	GCA	2	6	427615	427620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602510
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8104	NC_014718	CG	3	6	428244	428249	0 %	0 %	50 %	50 %	312602510
8105	NC_014718	TGC	2	6	428289	428294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602510
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8112	NC_014718	GCCGC	2	10	428579	428588	0 %	0 %	40 %	60 %	312602512
8113	NC_014718	GC	3	6	428607	428612	0 %	0 %	50 %	50 %	312602512
8114	NC_014718	ATCG	2	8	428732	428739	25 %	25 %	25 %	25 %	312602512
8115	NC_014718	GC	4	8	428800	428807	0 %	0 %	50 %	50 %	312602512
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8119	NC_014718	GCC	2	6	429075	429080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602512
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8122	NC_014718	GCA	2	6	429214	429219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602512
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8244	NC_014718	CGC	2	6	435027	435032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602517
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8362	NC_014718	GCAAC	2	10	441003	441012	40 %	0 %	20 %	40 %	312602523
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