MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus atrophaeus 1942 chromosome

Total Repeats: 75095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014639	TCTT	2	8	287	294	0 %	75 %	0 %	25 %	311066970
2	NC_014639	TAG	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066970
3	NC_014639	CAA	2	6	365	370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066970
4	NC_014639	ATG	2	6	432	437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066970
5	NC_014639	AGT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066970
6	NC_014639	TAT	2	6	501	506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311066970
7	NC_014639	ATGAA	2	10	520	529	60 %	20 %	20 %	0 %	311066970
8	NC_014639	ATC	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311066970
9	NC_014639	ATA	2	6	574	579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066970
10	NC_014639	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066970
11	NC_014639	GAAT	2	8	702	709	50 %	25 %	25 %	0 %	311066970
12	NC_014639	A	7	7	724	730	100 %	0 %	0 %	0 %	311066970
13	NC_014639	TG	3	6	731	736	0 %	50 %	50 %	0 %	311066970
14	NC_014639	ATA	2	6	764	769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066970
15	NC_014639	TAAA	2	8	771	778	75 %	25 %	0 %	0 %	311066970
16	NC_014639	AGA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066970
17	NC_014639	ATC	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311066971
18	NC_014639	T	7	7	1318	1324	0 %	100 %	0 %	0 %	311066971
19	NC_014639	ATC	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311066971
20	NC_014639	GA	3	6	1346	1351	50 %	0 %	50 %	0 %	311066971
21	NC_014639	CT	3	6	1433	1438	0 %	50 %	0 %	50 %	311066971
22	NC_014639	CTTT	2	8	1472	1479	0 %	75 %	0 %	25 %	311066971
23	NC_014639	AAC	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066971
24	NC_014639	GAA	2	6	1764	1769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066971
25	NC_014639	TG	3	6	1775	1780	0 %	50 %	50 %	0 %	311066971
26	NC_014639	CTT	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066971
27	NC_014639	ATG	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066971
28	NC_014639	TGA	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066971
29	NC_014639	GGT	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311066971
30	NC_014639	GT	3	6	1961	1966	0 %	50 %	50 %	0 %	311066971
31	NC_014639	GAA	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066971
32	NC_014639	ATG	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066971
33	NC_014639	ATGAA	2	10	2116	2125	60 %	20 %	20 %	0 %	311066971
34	NC_014639	TCT	2	6	2188	2193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066971
35	NC_014639	TGA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066971
36	NC_014639	GAAA	3	12	2231	2242	75 %	0 %	25 %	0 %	311066971
37	NC_014639	GT	3	6	2371	2376	0 %	50 %	50 %	0 %	311066971
38	NC_014639	ATG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066971
39	NC_014639	A	6	6	2445	2450	100 %	0 %	0 %	0 %	311066971
40	NC_014639	GCTG	2	8	2555	2562	0 %	25 %	50 %	25 %	311066971
41	NC_014639	C	7	7	2664	2670	0 %	0 %	0 %	100 %	311066972
42	NC_014639	G	6	6	2680	2685	0 %	0 %	100 %	0 %	311066972
43	NC_014639	A	7	7	2701	2707	100 %	0 %	0 %	0 %	311066972
44	NC_014639	ATG	2	6	2770	2775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066972
45	NC_014639	ATT	2	6	2784	2789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311066972
46	NC_014639	TTC	2	6	2797	2802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066972
47	NC_014639	ACA	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066972
48	NC_014639	CTT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066972
49	NC_014639	GAA	2	6	2975	2980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066972
50	NC_014639	CTT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066972
51	NC_014639	TGCA	2	8	3006	3013	25 %	25 %	25 %	25 %	311066972
52	NC_014639	TTCA	2	8	3023	3030	25 %	50 %	0 %	25 %	311066972
53	NC_014639	TGA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066972
54	NC_014639	AAAG	2	8	3089	3096	75 %	0 %	25 %	0 %	311066972
55	NC_014639	ATCT	2	8	3154	3161	25 %	50 %	0 %	25 %	311066972
56	NC_014639	AT	3	6	3186	3191	50 %	50 %	0 %	0 %	311066972
57	NC_014639	AGA	2	6	3272	3277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066972
58	NC_014639	TAA	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066972
59	NC_014639	TGA	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066972
60	NC_014639	AG	3	6	3432	3437	50 %	0 %	50 %	0 %	311066972
61	NC_014639	T	6	6	3454	3459	0 %	100 %	0 %	0 %	311066972
62	NC_014639	TGA	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066972
63	NC_014639	A	7	7	3654	3660	100 %	0 %	0 %	0 %	311066972
64	NC_014639	ATG	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066973
65	NC_014639	TGA	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066973
66	NC_014639	AGA	2	6	4084	4089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066973
67	NC_014639	CAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066973
68	NC_014639	A	7	7	4105	4111	100 %	0 %	0 %	0 %	311066973
69	NC_014639	TGA	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066973
70	NC_014639	ATA	2	6	4302	4307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066974
71	NC_014639	AGA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066974
72	NC_014639	GT	3	6	4400	4405	0 %	50 %	50 %	0 %	311066974
73	NC_014639	GAT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066974
74	NC_014639	ATG	2	6	4434	4439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066974
75	NC_014639	TAA	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066974
76	NC_014639	ATA	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066974
77	NC_014639	GA	3	6	4542	4547	50 %	0 %	50 %	0 %	311066974
78	NC_014639	CAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066974
79	NC_014639	T	6	6	4627	4632	0 %	100 %	0 %	0 %	311066974
80	NC_014639	CTT	2	6	4661	4666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066974
81	NC_014639	GTTT	2	8	4692	4699	0 %	75 %	25 %	0 %	311066974
82	NC_014639	TCG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311066974
83	NC_014639	AG	3	6	4779	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	311066974
84	NC_014639	T	6	6	4888	4893	0 %	100 %	0 %	0 %	311066975
85	NC_014639	TAA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066975
86	NC_014639	ATTG	2	8	5203	5210	25 %	50 %	25 %	0 %	311066976
87	NC_014639	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	311066976
88	NC_014639	GGA	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311066976
89	NC_014639	TGA	2	6	5344	5349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066976
90	NC_014639	ACT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311066976
91	NC_014639	T	6	6	5455	5460	0 %	100 %	0 %	0 %	311066977
92	NC_014639	TCA	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311066977
93	NC_014639	AGA	3	9	5718	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066978
94	NC_014639	A	7	7	5731	5737	100 %	0 %	0 %	0 %	311066978
95	NC_014639	A	8	8	5765	5772	100 %	0 %	0 %	0 %	311066978
96	NC_014639	AGA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066978
97	NC_014639	AAAGA	2	10	5899	5908	80 %	0 %	20 %	0 %	311066978
98	NC_014639	A	6	6	5925	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	311066978
99	NC_014639	AT	3	6	5971	5976	50 %	50 %	0 %	0 %	311066978
100	NC_014639	TA	3	6	5995	6000	50 %	50 %	0 %	0 %	311066978
101	NC_014639	AGT	2	6	6001	6006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066978
102	NC_014639	TTC	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311066978
103	NC_014639	GAG	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311066978
104	NC_014639	ATA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066978
105	NC_014639	TAT	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311066978
106	NC_014639	T	6	6	6104	6109	0 %	100 %	0 %	0 %	311066978
107	NC_014639	TGA	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066978
108	NC_014639	AAGG	2	8	6261	6268	50 %	0 %	50 %	0 %	311066978
109	NC_014639	GAG	2	6	6337	6342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311066978
110	NC_014639	CCTAT	2	10	6360	6369	20 %	40 %	0 %	40 %	311066978
111	NC_014639	AT	3	6	6389	6394	50 %	50 %	0 %	0 %	311066978
112	NC_014639	GAT	2	6	6412	6417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066978
113	NC_014639	GTT	2	6	6807	6812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311066979
114	NC_014639	ATTGC	2	10	6820	6829	20 %	40 %	20 %	20 %	311066979
115	NC_014639	CAA	2	6	6835	6840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066979
116	NC_014639	TAA	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311066979
117	NC_014639	GCT	2	6	6960	6965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311066979
118	NC_014639	GTTG	2	8	7175	7182	0 %	50 %	50 %	0 %	311066980
119	NC_014639	TAT	2	6	7330	7335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311066980
120	NC_014639	A	6	6	7342	7347	100 %	0 %	0 %	0 %	311066980
121	NC_014639	GAA	2	6	7360	7365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066980
122	NC_014639	A	6	6	7461	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	311066981
123	NC_014639	AGG	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311066981
124	NC_014639	A	6	6	7583	7588	100 %	0 %	0 %	0 %	311066982
125	NC_014639	T	6	6	7598	7603	0 %	100 %	0 %	0 %	311066982
126	NC_014639	AGA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066982
127	NC_014639	CAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066982
128	NC_014639	A	6	6	7821	7826	100 %	0 %	0 %	0 %	311066982
129	NC_014639	CTG	3	9	7836	7844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311066982
130	NC_014639	TCA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311066982
131	NC_014639	ATGTGA	2	12	7875	7886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311066982
132	NC_014639	AGG	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311066982
133	NC_014639	TGAAGA	2	12	7963	7974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	311066982
134	NC_014639	TA	3	6	8028	8033	50 %	50 %	0 %	0 %	311066982
135	NC_014639	AAG	2	6	8040	8045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066982
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137	NC_014639	AGA	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311066982
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399	NC_014639	CAA	2	6	21633	21638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311066996
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