MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_014638	TGC	2	6	2193973	2193978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44502	NC_014638	GAC	3	9	2194007	2194015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44503	NC_014638	TTG	2	6	2194045	2194050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065150
44504	NC_014638	GAA	2	6	2194106	2194111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311065150
44505	NC_014638	GAC	2	6	2194172	2194177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44506	NC_014638	TCG	2	6	2194201	2194206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44507	NC_014638	CAA	2	6	2194292	2194297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065150
44508	NC_014638	CTC	2	6	2194325	2194330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065150
44509	NC_014638	GCA	2	6	2194336	2194341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44510	NC_014638	GAT	2	6	2194362	2194367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065150
44511	NC_014638	AAC	2	6	2194386	2194391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065150
44512	NC_014638	AAC	2	6	2194398	2194403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065150
44513	NC_014638	CAA	2	6	2194487	2194492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065150
44514	NC_014638	CGG	2	6	2194493	2194498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065150
44515	NC_014638	CAA	2	6	2194514	2194519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065150
44516	NC_014638	GCA	2	6	2194549	2194554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44517	NC_014638	CCG	2	6	2194582	2194587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065150
44518	NC_014638	CTGC	2	8	2194740	2194747	0 %	25 %	25 %	50 %	311065150
44519	NC_014638	GAC	2	6	2194782	2194787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065150
44520	NC_014638	ATCC	2	8	2194911	2194918	25 %	25 %	0 %	50 %	311065151
44521	NC_014638	GCC	2	6	2194943	2194948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065151
44522	NC_014638	GCC	2	6	2194961	2194966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065151
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44524	NC_014638	CCG	2	6	2195100	2195105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065151
44525	NC_014638	CCG	2	6	2195198	2195203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065151
44526	NC_014638	ACAT	2	8	2195234	2195241	50 %	25 %	0 %	25 %	311065151
44527	NC_014638	TCA	2	6	2195268	2195273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065151
44528	NC_014638	CGG	2	6	2195298	2195303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065151
44529	NC_014638	CGA	3	9	2195320	2195328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065151
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44531	NC_014638	ATC	2	6	2195375	2195380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065151
44532	NC_014638	GCT	2	6	2195386	2195391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065151
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44534	NC_014638	AGAA	2	8	2195433	2195440	75 %	0 %	25 %	0 %	311065151
44535	NC_014638	GC	3	6	2195484	2195489	0 %	0 %	50 %	50 %	311065151
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44538	NC_014638	CAGC	2	8	2195671	2195678	25 %	0 %	25 %	50 %	311065151
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44541	NC_014638	CGA	2	6	2195779	2195784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065151
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44543	NC_014638	GCA	2	6	2195818	2195823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065151
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44545	NC_014638	GCCC	2	8	2196030	2196037	0 %	0 %	25 %	75 %	311065152
44546	NC_014638	AT	3	6	2196073	2196078	50 %	50 %	0 %	0 %	311065152
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44550	NC_014638	GCG	2	6	2196305	2196310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065152
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44553	NC_014638	CGC	2	6	2196393	2196398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065152
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44559	NC_014638	GCG	2	6	2196662	2196667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065152
44560	NC_014638	GCC	2	6	2196679	2196684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065152
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44566	NC_014638	CGC	3	9	2196972	2196980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065153
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44590	NC_014638	CAG	3	9	2198413	2198421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065154
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44599	NC_014638	TCG	2	6	2198903	2198908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065154
44600	NC_014638	GCA	2	6	2198952	2198957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065154
44601	NC_014638	CACG	2	8	2198964	2198971	25 %	0 %	25 %	50 %	311065154
44602	NC_014638	GCC	2	6	2198974	2198979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065154
44603	NC_014638	TGC	2	6	2199187	2199192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065155
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44605	NC_014638	CGGG	2	8	2199323	2199330	0 %	0 %	75 %	25 %	311065155
44606	NC_014638	CGT	2	6	2199351	2199356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065155
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44608	NC_014638	CGGC	2	8	2199393	2199400	0 %	0 %	50 %	50 %	311065155
44609	NC_014638	CGA	2	6	2199412	2199417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065155
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44611	NC_014638	CG	3	6	2199439	2199444	0 %	0 %	50 %	50 %	311065155
44612	NC_014638	CGC	2	6	2199507	2199512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065155
44613	NC_014638	CCG	2	6	2199519	2199524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065155
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44615	NC_014638	GGT	2	6	2199562	2199567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065155
44616	NC_014638	CCA	2	6	2199579	2199584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065155
44617	NC_014638	CCAG	2	8	2199606	2199613	25 %	0 %	25 %	50 %	311065155
44618	NC_014638	CAT	2	6	2199632	2199637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065155
44619	NC_014638	CGG	2	6	2199655	2199660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065155
44620	NC_014638	GAT	2	6	2199722	2199727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065155
44621	NC_014638	GAT	2	6	2199798	2199803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065155
44622	NC_014638	CTT	2	6	2199870	2199875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065156
44623	NC_014638	CAT	2	6	2199879	2199884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065156
44624	NC_014638	GGCC	2	8	2199927	2199934	0 %	0 %	50 %	50 %	311065156
44625	NC_014638	ATGGCG	2	12	2199943	2199954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311065156
44626	NC_014638	GAC	2	6	2199981	2199986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065156
44627	NC_014638	GC	3	6	2200129	2200134	0 %	0 %	50 %	50 %	311065156
44628	NC_014638	AAG	2	6	2200225	2200230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311065156
44629	NC_014638	CGG	2	6	2200250	2200255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065156
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44632	NC_014638	ACCGT	2	10	2200379	2200388	20 %	20 %	20 %	40 %	311065156
44633	NC_014638	ATC	2	6	2200434	2200439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065156
44634	NC_014638	CCG	2	6	2200465	2200470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065156
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44638	NC_014638	GGC	3	9	2200594	2200602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065156
44639	NC_014638	GCA	2	6	2200610	2200615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065156
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44642	NC_014638	CGA	2	6	2200641	2200646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065156
44643	NC_014638	ATC	2	6	2200671	2200676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065156
44644	NC_014638	CG	3	6	2200688	2200693	0 %	0 %	50 %	50 %	311065156
44645	NC_014638	ATG	2	6	2200697	2200702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065156
44646	NC_014638	CGC	2	6	2200707	2200712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065156
44647	NC_014638	GCCG	2	8	2200812	2200819	0 %	0 %	50 %	50 %	311065156
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44653	NC_014638	CGGC	2	8	2201093	2201100	0 %	0 %	50 %	50 %	311065156
44654	NC_014638	GAGC	2	8	2201115	2201122	25 %	0 %	50 %	25 %	311065156
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44719	NC_014638	CGGC	2	8	2204092	2204099	0 %	0 %	50 %	50 %	311065157
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44723	NC_014638	CGTC	2	8	2204164	2204171	0 %	25 %	25 %	50 %	311065157
44724	NC_014638	CAC	2	6	2204215	2204220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065157
44725	NC_014638	CAG	2	6	2204236	2204241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065157
44726	NC_014638	ACT	2	6	2204256	2204261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065157
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44728	NC_014638	TCA	3	9	2204386	2204394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065157
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44730	NC_014638	TGC	2	6	2204473	2204478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065157
44731	NC_014638	GCA	2	6	2204483	2204488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065157
44732	NC_014638	GGT	2	6	2204504	2204509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065157
44733	NC_014638	CTGGCG	2	12	2204532	2204543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311065157
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44831	NC_014638	CTG	2	6	2209927	2209932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065160
44832	NC_014638	CA	3	6	2210090	2210095	50 %	0 %	0 %	50 %	311065160
44833	NC_014638	TGA	2	6	2210102	2210107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065160
44834	NC_014638	CGG	2	6	2210124	2210129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065160
44835	NC_014638	CTTC	2	8	2210189	2210196	0 %	50 %	0 %	50 %	311065160
44836	NC_014638	TTG	2	6	2210203	2210208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065160
44837	NC_014638	GTT	2	6	2210464	2210469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065160
44838	NC_014638	GTC	2	6	2210470	2210475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065160
44839	NC_014638	CGC	2	6	2210483	2210488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065160
44840	NC_014638	CAT	2	6	2210603	2210608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065160
44841	NC_014638	ACG	2	6	2211171	2211176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065161
44842	NC_014638	GCAC	2	8	2211222	2211229	25 %	0 %	25 %	50 %	311065161
44843	NC_014638	GTG	2	6	2211407	2211412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065161
44844	NC_014638	CGAT	2	8	2211420	2211427	25 %	25 %	25 %	25 %	311065161
44845	NC_014638	AAT	2	6	2211449	2211454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311065161
44846	NC_014638	ACG	2	6	2211506	2211511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065161
44847	NC_014638	AC	3	6	2211535	2211540	50 %	0 %	0 %	50 %	311065161
44848	NC_014638	GCAT	2	8	2211547	2211554	25 %	25 %	25 %	25 %	311065161
44849	NC_014638	CCG	2	6	2211579	2211584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065161
44850	NC_014638	GCG	2	6	2211654	2211659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065161
44851	NC_014638	GAT	2	6	2211683	2211688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065161
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44856	NC_014638	CAT	2	6	2211966	2211971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065162
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44871	NC_014638	CTT	3	9	2212460	2212468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065163
44872	NC_014638	TTC	2	6	2212473	2212478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065163
44873	NC_014638	GCT	2	6	2212486	2212491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065163
44874	NC_014638	AGC	2	6	2212517	2212522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065163
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44878	NC_014638	GTT	2	6	2212694	2212699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065163
44879	NC_014638	ATG	2	6	2212734	2212739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065163
44880	NC_014638	CTG	2	6	2212781	2212786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065163
44881	NC_014638	TGT	2	6	2212837	2212842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065163
44882	NC_014638	CATG	2	8	2212859	2212866	25 %	25 %	25 %	25 %	311065163
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