MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014638	TCGG	2	8	2168902	2168909	0 %	25 %	50 %	25 %	311065138
44002	NC_014638	CGA	2	6	2168915	2168920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44003	NC_014638	CGT	2	6	2168957	2168962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44004	NC_014638	CTC	2	6	2169018	2169023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065138
44005	NC_014638	CCGGTG	2	12	2169070	2169081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311065138
44006	NC_014638	CTT	2	6	2169201	2169206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065138
44007	NC_014638	AAC	2	6	2169252	2169257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065138
44008	NC_014638	TCG	2	6	2169266	2169271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44009	NC_014638	GCG	2	6	2169289	2169294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44010	NC_014638	CAG	3	9	2169312	2169320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44011	NC_014638	TCG	2	6	2169334	2169339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44012	NC_014638	TGA	2	6	2169362	2169367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065138
44013	NC_014638	CGA	2	6	2169374	2169379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44014	NC_014638	ACG	2	6	2169382	2169387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44015	NC_014638	GAT	2	6	2169393	2169398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065138
44016	NC_014638	CG	3	6	2169531	2169536	0 %	0 %	50 %	50 %	311065138
44017	NC_014638	GACG	2	8	2169552	2169559	25 %	0 %	50 %	25 %	311065138
44018	NC_014638	CTT	2	6	2169621	2169626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065138
44019	NC_014638	CGG	2	6	2169680	2169685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44020	NC_014638	CGG	2	6	2169701	2169706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44021	NC_014638	CAC	2	6	2169729	2169734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065138
44022	NC_014638	CGG	2	6	2169755	2169760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44023	NC_014638	GCA	2	6	2169788	2169793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44024	NC_014638	CCT	2	6	2169851	2169856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065138
44025	NC_014638	GATCAG	2	12	2169882	2169893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311065138
44026	NC_014638	GAT	2	6	2169894	2169899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065138
44027	NC_014638	GCA	2	6	2169917	2169922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44028	NC_014638	GCCG	2	8	2169927	2169934	0 %	0 %	50 %	50 %	311065138
44029	NC_014638	GGC	2	6	2169981	2169986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44030	NC_014638	AGC	2	6	2169988	2169993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44031	NC_014638	CTT	2	6	2170029	2170034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065138
44032	NC_014638	GCG	2	6	2170049	2170054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44033	NC_014638	CGG	2	6	2170103	2170108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065138
44034	NC_014638	TTCG	2	8	2170152	2170159	0 %	50 %	25 %	25 %	311065138
44035	NC_014638	CGT	2	6	2170181	2170186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065138
44036	NC_014638	TG	3	6	2170230	2170235	0 %	50 %	50 %	0 %	311065138
44037	NC_014638	GGA	2	6	2170907	2170912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311065139
44038	NC_014638	CGA	2	6	2170998	2171003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065139
44039	NC_014638	CCG	2	6	2171038	2171043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065139
44040	NC_014638	CGC	2	6	2171047	2171052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065139
44041	NC_014638	ATG	2	6	2171163	2171168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065139
44042	NC_014638	ATC	2	6	2171183	2171188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065139
44043	NC_014638	CTG	2	6	2171216	2171221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065139
44044	NC_014638	ATCGC	2	10	2171244	2171253	20 %	20 %	20 %	40 %	311065139
44045	NC_014638	GTC	2	6	2171257	2171262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065139
44046	NC_014638	CGT	2	6	2171275	2171280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065139
44047	NC_014638	TC	3	6	2171309	2171314	0 %	50 %	0 %	50 %	311065139
44048	NC_014638	CAAGGC	2	12	2171341	2171352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065139
44049	NC_014638	GTG	2	6	2171360	2171365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065139
44050	NC_014638	GC	3	6	2171378	2171383	0 %	0 %	50 %	50 %	311065139
44051	NC_014638	ACGC	2	8	2171388	2171395	25 %	0 %	25 %	50 %	311065139
44052	NC_014638	GACC	2	8	2171422	2171429	25 %	0 %	25 %	50 %	311065139
44053	NC_014638	TTCG	2	8	2171451	2171458	0 %	50 %	25 %	25 %	311065139
44054	NC_014638	GCC	3	9	2171459	2171467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065139
44055	NC_014638	CGT	2	6	2171498	2171503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065139
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44057	NC_014638	CGG	3	9	2171638	2171646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065139
44058	NC_014638	TCG	2	6	2171691	2171696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065139
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44060	NC_014638	CGCCCG	2	12	2171830	2171841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065139
44061	NC_014638	AGC	2	6	2171848	2171853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065139
44062	NC_014638	GCC	2	6	2171858	2171863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065139
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44064	NC_014638	ATC	3	9	2172028	2172036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065140
44065	NC_014638	TCG	2	6	2172065	2172070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065140
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44068	NC_014638	GGCC	2	8	2172186	2172193	0 %	0 %	50 %	50 %	311065140
44069	NC_014638	GAA	2	6	2172232	2172237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311065140
44070	NC_014638	CGA	2	6	2172321	2172326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065140
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44073	NC_014638	CG	3	6	2172465	2172470	0 %	0 %	50 %	50 %	311065140
44074	NC_014638	TCC	2	6	2172494	2172499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065140
44075	NC_014638	TTG	2	6	2172548	2172553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065140
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44083	NC_014638	GC	3	6	2172960	2172965	0 %	0 %	50 %	50 %	311065140
44084	NC_014638	GAC	2	6	2173035	2173040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065140
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44087	NC_014638	CAG	2	6	2173213	2173218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065140
44088	NC_014638	GGC	2	6	2173282	2173287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065140
44089	NC_014638	GACG	2	8	2173342	2173349	25 %	0 %	50 %	25 %	311065140
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44099	NC_014638	CTC	2	6	2173635	2173640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065141
44100	NC_014638	CGGG	2	8	2173655	2173662	0 %	0 %	75 %	25 %	311065141
44101	NC_014638	ACA	2	6	2173663	2173668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311065141
44102	NC_014638	TTG	2	6	2173771	2173776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065141
44103	NC_014638	GA	3	6	2173796	2173801	50 %	0 %	50 %	0 %	311065141
44104	NC_014638	GTG	2	6	2173855	2173860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065141
44105	NC_014638	CGC	2	6	2173887	2173892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065141
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44107	NC_014638	CGT	2	6	2173916	2173921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065141
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44109	NC_014638	CAT	2	6	2174003	2174008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065141
44110	NC_014638	GCAA	2	8	2174056	2174063	50 %	0 %	25 %	25 %	311065141
44111	NC_014638	CGG	3	9	2174183	2174191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065141
44112	NC_014638	GCA	2	6	2174200	2174205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065141
44113	NC_014638	GC	3	6	2174208	2174213	0 %	0 %	50 %	50 %	311065141
44114	NC_014638	CCG	2	6	2174266	2174271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065142
44115	NC_014638	TGA	2	6	2174272	2174277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065142
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44229	NC_014638	CGTG	2	8	2179875	2179882	0 %	25 %	50 %	25 %	311065144
44230	NC_014638	GAC	2	6	2179945	2179950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065144
44231	NC_014638	CGCA	2	8	2180080	2180087	25 %	0 %	25 %	50 %	311065144
44232	NC_014638	CATC	2	8	2180106	2180113	25 %	25 %	0 %	50 %	311065144
44233	NC_014638	CCG	2	6	2180159	2180164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065144
44234	NC_014638	CGA	2	6	2180217	2180222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065144
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44238	NC_014638	CAAG	2	8	2180475	2180482	50 %	0 %	25 %	25 %	311065144
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44245	NC_014638	CCG	2	6	2180660	2180665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065144
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44265	NC_014638	GATT	2	8	2181274	2181281	25 %	50 %	25 %	0 %	311065144
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44303	NC_014638	GCA	2	6	2182775	2182780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065144
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44310	NC_014638	CGTTGC	2	12	2183205	2183216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065144
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44313	NC_014638	TTG	2	6	2183348	2183353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065144
44314	NC_014638	CAC	2	6	2183359	2183364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065144
44315	NC_014638	GTA	2	6	2183410	2183415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065144
44316	NC_014638	CCA	2	6	2183466	2183471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065144
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44318	NC_014638	CGGC	2	8	2183669	2183676	0 %	0 %	50 %	50 %	311065144
44319	NC_014638	T	7	7	2183705	2183711	0 %	100 %	0 %	0 %	311065144
44320	NC_014638	GT	3	6	2183790	2183795	0 %	50 %	50 %	0 %	311065144
44321	NC_014638	CGG	2	6	2183839	2183844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065144
44322	NC_014638	TCA	2	6	2183940	2183945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065144
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44324	NC_014638	CTG	2	6	2183983	2183988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065144
44325	NC_014638	GAC	2	6	2184043	2184048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065144
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44327	NC_014638	GGCT	2	8	2184123	2184130	0 %	25 %	50 %	25 %	311065144
44328	NC_014638	GTT	2	6	2184199	2184204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065144
44329	NC_014638	AGT	2	6	2184294	2184299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065144
44330	NC_014638	CAG	2	6	2184379	2184384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065144
44331	NC_014638	GA	3	6	2184434	2184439	50 %	0 %	50 %	0 %	311065144
44332	NC_014638	CGT	2	6	2184474	2184479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065144
44333	NC_014638	CCAC	2	8	2184480	2184487	25 %	0 %	0 %	75 %	311065144
44334	NC_014638	TTG	2	6	2184530	2184535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065144
44335	NC_014638	CTT	2	6	2184550	2184555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065144
44336	NC_014638	CGCA	2	8	2184568	2184575	25 %	0 %	25 %	50 %	311065144
44337	NC_014638	GCT	3	9	2184576	2184584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065144
44338	NC_014638	TGACC	2	10	2184627	2184636	20 %	20 %	20 %	40 %	311065144
44339	NC_014638	GCC	2	6	2184649	2184654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065144
44340	NC_014638	CAG	2	6	2185476	2185481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065145
44341	NC_014638	CTA	2	6	2185578	2185583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065145
44342	NC_014638	GCC	2	6	2185658	2185663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065145
44343	NC_014638	CGC	2	6	2185703	2185708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065145
44344	NC_014638	CAT	2	6	2185722	2185727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065145
44345	NC_014638	CCG	2	6	2185728	2185733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065145
44346	NC_014638	TGCC	2	8	2185735	2185742	0 %	25 %	25 %	50 %	311065145
44347	NC_014638	ATC	2	6	2185753	2185758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065145
44348	NC_014638	TCG	2	6	2185790	2185795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065145
44349	NC_014638	CGCC	2	8	2185838	2185845	0 %	0 %	25 %	75 %	311065145
44350	NC_014638	CGA	2	6	2185857	2185862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065145
44351	NC_014638	GCT	2	6	2185863	2185868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065145
44352	NC_014638	ACAA	2	8	2185880	2185887	75 %	0 %	0 %	25 %	311065145
44353	NC_014638	CTA	2	6	2186091	2186096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065146
44354	NC_014638	GATCTT	2	12	2186148	2186159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	311065146
44355	NC_014638	GTG	2	6	2186206	2186211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065146
44356	NC_014638	CAT	2	6	2186229	2186234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065146
44357	NC_014638	TGA	2	6	2186264	2186269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065146
44358	NC_014638	CGA	2	6	2186381	2186386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065146
44359	NC_014638	GCC	2	6	2186394	2186399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065146
44360	NC_014638	TTG	2	6	2186416	2186421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065146
44361	NC_014638	CGG	2	6	2186429	2186434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065146
44362	NC_014638	GAC	2	6	2186475	2186480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065146
44363	NC_014638	CGA	2	6	2186525	2186530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065146
44364	NC_014638	TCGG	2	8	2186557	2186564	0 %	25 %	50 %	25 %	311065146
44365	NC_014638	CTG	2	6	2186574	2186579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065146
44366	NC_014638	TGA	2	6	2186594	2186599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065146
44367	NC_014638	GTG	2	6	2186656	2186661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065146
44368	NC_014638	ACGA	2	8	2186766	2186773	50 %	0 %	25 %	25 %	311065146
44369	NC_014638	CGCTGA	2	12	2186794	2186805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311065146
44370	NC_014638	CTTC	2	8	2186891	2186898	0 %	50 %	0 %	50 %	311065146
44371	NC_014638	TGT	2	6	2186930	2186935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065146
44372	NC_014638	GTG	2	6	2187010	2187015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065146
44373	NC_014638	CAT	2	6	2187017	2187022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065146
44374	NC_014638	TTG	2	6	2187046	2187051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065146
44375	NC_014638	GGCC	2	8	2187062	2187069	0 %	0 %	50 %	50 %	311065146
44376	NC_014638	ATC	2	6	2187153	2187158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065146
44377	NC_014638	GC	4	8	2187770	2187777	0 %	0 %	50 %	50 %	311065147
44378	NC_014638	CGC	2	6	2187844	2187849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065147
44379	NC_014638	ACC	2	6	2187862	2187867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065147
44380	NC_014638	GAT	2	6	2187936	2187941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065147
44381	NC_014638	CCT	2	6	2187983	2187988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065147
44382	NC_014638	TGC	2	6	2188015	2188020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065147
44383	NC_014638	GGA	2	6	2188027	2188032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311065147
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44388	NC_014638	GC	3	6	2188238	2188243	0 %	0 %	50 %	50 %	311065147
44389	NC_014638	CCA	2	6	2188247	2188252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065147
44390	NC_014638	ATAC	2	8	2188288	2188295	50 %	25 %	0 %	25 %	311065147
44391	NC_014638	GCT	2	6	2188375	2188380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065147
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44400	NC_014638	GAA	2	6	2189384	2189389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311065148
44401	NC_014638	ATC	2	6	2189395	2189400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065148
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44404	NC_014638	CGC	2	6	2189495	2189500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065148
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44409	NC_014638	GTC	2	6	2189780	2189785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065148
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44413	NC_014638	GCA	2	6	2189935	2189940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065148
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44420	NC_014638	CCG	2	6	2190246	2190251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065148
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44422	NC_014638	CGGA	2	8	2190349	2190356	25 %	0 %	50 %	25 %	311065148
44423	NC_014638	TCT	2	6	2190399	2190404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065148
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44427	NC_014638	CGA	2	6	2190592	2190597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065148
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44431	NC_014638	ACCATG	2	12	2190726	2190737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	311065148
44432	NC_014638	CCG	2	6	2190738	2190743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065148
44433	NC_014638	CAG	2	6	2190753	2190758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065148
44434	NC_014638	TGA	2	6	2190773	2190778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065148
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44438	NC_014638	GGCA	2	8	2190905	2190912	25 %	0 %	50 %	25 %	311065148
44439	NC_014638	CGC	2	6	2190943	2190948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065148
44440	NC_014638	CGC	2	6	2190953	2190958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311065148
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44442	NC_014638	GCT	2	6	2191022	2191027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065148
44443	NC_014638	GCTG	2	8	2191030	2191037	0 %	25 %	50 %	25 %	311065148
44444	NC_014638	CTG	3	9	2191035	2191043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065148
44445	NC_014638	CGG	2	6	2191091	2191096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065148
44446	NC_014638	CA	4	8	2191097	2191104	50 %	0 %	0 %	50 %	311065148
44447	NC_014638	CAT	2	6	2191127	2191132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065148
44448	NC_014638	CGCTGG	2	12	2191201	2191212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311065148
44449	NC_014638	GGC	2	6	2191272	2191277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065148
44450	NC_014638	CAT	2	6	2191295	2191300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065148
44451	NC_014638	TCTGGC	2	12	2191328	2191339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065148
44452	NC_014638	GCG	2	6	2191347	2191352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065148
44453	NC_014638	ATC	2	6	2191362	2191367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065148
44454	NC_014638	TGC	2	6	2191393	2191398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065148
44455	NC_014638	GGCACC	2	12	2191404	2191415	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311065148
44456	NC_014638	GCG	2	6	2191447	2191452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065148
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44458	NC_014638	TGG	2	6	2191599	2191604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311065148
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