MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_014638	GCG	2	6	183782	183787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3503	NC_014638	CGG	2	6	183803	183808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3504	NC_014638	CCGA	2	8	183847	183854	25 %	0 %	25 %	50 %	311063600
3505	NC_014638	CGGA	2	8	183902	183909	25 %	0 %	50 %	25 %	311063600
3506	NC_014638	GCG	2	6	183914	183919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3507	NC_014638	CTCG	2	8	183936	183943	0 %	25 %	25 %	50 %	311063600
3508	NC_014638	TTC	2	6	183958	183963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063600
3509	NC_014638	CGAC	2	8	184025	184032	25 %	0 %	25 %	50 %	311063600
3510	NC_014638	CGA	2	6	184047	184052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3511	NC_014638	GAAC	2	8	184116	184123	50 %	0 %	25 %	25 %	311063600
3512	NC_014638	CGC	2	6	184143	184148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063600
3513	NC_014638	AGA	2	6	184151	184156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063600
3514	NC_014638	CGA	2	6	184194	184199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3515	NC_014638	GCAGAT	2	12	184203	184214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311063600
3516	NC_014638	GGA	2	6	184227	184232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063600
3517	NC_014638	ACC	2	6	184261	184266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063600
3518	NC_014638	CA	3	6	184290	184295	50 %	0 %	0 %	50 %	311063600
3519	NC_014638	AGC	2	6	184313	184318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3520	NC_014638	GCA	2	6	184383	184388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3521	NC_014638	GC	3	6	184433	184438	0 %	0 %	50 %	50 %	311063600
3522	NC_014638	GC	3	6	184484	184489	0 %	0 %	50 %	50 %	311063600
3523	NC_014638	CA	3	6	184554	184559	50 %	0 %	0 %	50 %	311063600
3524	NC_014638	CCA	2	6	184631	184636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063600
3525	NC_014638	AGC	2	6	184682	184687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
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3527	NC_014638	CAG	2	6	184702	184707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3528	NC_014638	GCC	2	6	184732	184737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063600
3529	NC_014638	CAGT	2	8	184818	184825	25 %	25 %	25 %	25 %	311063600
3530	NC_014638	AGC	3	9	184832	184840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3531	NC_014638	CGA	2	6	184848	184853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3532	NC_014638	CGC	2	6	184857	184862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063600
3533	NC_014638	CGG	2	6	184896	184901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3534	NC_014638	GCTC	2	8	184907	184914	0 %	25 %	25 %	50 %	311063600
3535	NC_014638	AATC	2	8	184937	184944	50 %	25 %	0 %	25 %	311063600
3536	NC_014638	TTG	2	6	184973	184978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063600
3537	NC_014638	TGA	2	6	184985	184990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063600
3538	NC_014638	GAG	2	6	185017	185022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063600
3539	NC_014638	CGC	2	6	185097	185102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063600
3540	NC_014638	GCCT	2	8	185107	185114	0 %	25 %	25 %	50 %	311063600
3541	NC_014638	CGG	3	9	185118	185126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3542	NC_014638	CGT	2	6	185159	185164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3543	NC_014638	CTG	3	9	185167	185175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3544	NC_014638	TCG	3	9	185255	185263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3545	NC_014638	GTC	2	6	185269	185274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3546	NC_014638	GTC	2	6	185281	185286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3547	NC_014638	GC	4	8	185351	185358	0 %	0 %	50 %	50 %	311063600
3548	NC_014638	CCGC	2	8	185376	185383	0 %	0 %	25 %	75 %	311063600
3549	NC_014638	GGC	3	9	185387	185395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
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3551	NC_014638	CG	3	6	185418	185423	0 %	0 %	50 %	50 %	311063600
3552	NC_014638	GCC	2	6	185444	185449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063600
3553	NC_014638	TGA	2	6	185453	185458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063600
3554	NC_014638	CGG	2	6	185463	185468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3555	NC_014638	TG	3	6	185493	185498	0 %	50 %	50 %	0 %	311063600
3556	NC_014638	TCG	2	6	185573	185578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3557	NC_014638	GCG	2	6	185582	185587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3558	NC_014638	CGATG	2	10	185598	185607	20 %	20 %	40 %	20 %	311063600
3559	NC_014638	GCTCG	2	10	185611	185620	0 %	20 %	40 %	40 %	311063600
3560	NC_014638	GCG	2	6	185666	185671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
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3565	NC_014638	CGG	2	6	185987	185992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
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3588	NC_014638	CGT	2	6	186685	186690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063601
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3591	NC_014638	GCG	2	6	186762	186767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063601
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3593	NC_014638	CCTT	2	8	186852	186859	0 %	50 %	0 %	50 %	311063601
3594	NC_014638	TCT	2	6	186904	186909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063601
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3600	NC_014638	GTGG	2	8	187469	187476	0 %	25 %	75 %	0 %	311063602
3601	NC_014638	GCC	2	6	187490	187495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063602
3602	NC_014638	CTG	2	6	187571	187576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063602
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3604	NC_014638	CGG	2	6	187621	187626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063602
3605	NC_014638	GAT	2	6	187685	187690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063602
3606	NC_014638	GGGGC	2	10	187692	187701	0 %	0 %	80 %	20 %	311063602
3607	NC_014638	CGA	2	6	187753	187758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063602
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3618	NC_014638	TGCG	2	8	188528	188535	0 %	25 %	50 %	25 %	311063604
3619	NC_014638	CTT	2	6	188545	188550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063604
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3621	NC_014638	GGT	2	6	188616	188621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063604
3622	NC_014638	TGT	2	6	188706	188711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063604
3623	NC_014638	GGT	2	6	188731	188736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063604
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3654	NC_014638	TGG	2	6	189722	189727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063605
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3662	NC_014638	AGCT	2	8	189930	189937	25 %	25 %	25 %	25 %	311063605
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3728	NC_014638	CT	3	6	193935	193940	0 %	50 %	0 %	50 %	311063608
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3743	NC_014638	CAT	2	6	194931	194936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063609
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3745	NC_014638	CGA	2	6	195207	195212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063609
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3846	NC_014638	ATC	2	6	201332	201337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063613
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3853	NC_014638	ATC	2	6	201611	201616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063613
3854	NC_014638	GGCT	2	8	201632	201639	0 %	25 %	50 %	25 %	311063613
3855	NC_014638	GGC	2	6	201656	201661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063613
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3857	NC_014638	ACGC	2	8	201713	201720	25 %	0 %	25 %	50 %	311063613
3858	NC_014638	AGC	2	6	201764	201769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063613
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3860	NC_014638	CTTCAT	2	12	201808	201819	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	311063613
3861	NC_014638	CAC	2	6	201820	201825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063613
3862	NC_014638	CGG	2	6	201867	201872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063613
3863	NC_014638	GGT	2	6	201892	201897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063613
3864	NC_014638	GGC	2	6	201901	201906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063613
3865	NC_014638	CGGT	2	8	201950	201957	0 %	25 %	50 %	25 %	311063613
3866	NC_014638	CTG	2	6	201971	201976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063613
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3892	NC_014638	ACGT	2	8	203095	203102	25 %	25 %	25 %	25 %	311063615
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3962	NC_014638	TGG	2	6	208472	208477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063620
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3975	NC_014638	GAC	2	6	209119	209124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063620
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3977	NC_014638	CGA	2	6	209178	209183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3978	NC_014638	CTGG	2	8	209280	209287	0 %	25 %	50 %	25 %	311063620
3979	NC_014638	TCG	2	6	209309	209314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3980	NC_014638	CGG	2	6	209337	209342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063620
3981	NC_014638	CTG	2	6	209368	209373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3982	NC_014638	GCC	2	6	209406	209411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063620
3983	NC_014638	TTC	2	6	209419	209424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063620
3984	NC_014638	CAT	2	6	209445	209450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063620
3985	NC_014638	GAA	2	6	209466	209471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063620
3986	NC_014638	CGA	2	6	209472	209477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3987	NC_014638	CGA	2	6	209544	209549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3988	NC_014638	CGC	2	6	209553	209558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063620
3989	NC_014638	CCG	2	6	209603	209608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063620
3990	NC_014638	CAG	2	6	209655	209660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3991	NC_014638	GA	4	8	209682	209689	50 %	0 %	50 %	0 %	311063620
3992	NC_014638	CGC	2	6	209700	209705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063620
3993	NC_014638	GA	3	6	209738	209743	50 %	0 %	50 %	0 %	311063620
3994	NC_014638	TCG	2	6	209771	209776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063620
3995	NC_014638	GAGCAT	2	12	210544	210555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311063621
3996	NC_014638	AGA	2	6	210654	210659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063621
3997	NC_014638	TAT	2	6	210713	210718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311063621
3998	NC_014638	GAAA	2	8	210774	210781	75 %	0 %	25 %	0 %	311063621
3999	NC_014638	GAA	2	6	210824	210829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063621
4000	NC_014638	CAT	2	6	210902	210907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063621

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