MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_014638	GTC	2	6	1869555	1869560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064928
38003	NC_014638	GAT	2	6	1869599	1869604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064928
38004	NC_014638	GGT	2	6	1869631	1869636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064928
38005	NC_014638	TGCG	2	8	1869705	1869712	0 %	25 %	50 %	25 %	311064928
38006	NC_014638	CA	3	6	1869727	1869732	50 %	0 %	0 %	50 %	311064928
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38008	NC_014638	GACC	2	8	1869763	1869770	25 %	0 %	25 %	50 %	311064928
38009	NC_014638	GCA	2	6	1869810	1869815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064928
38010	NC_014638	GAT	2	6	1869845	1869850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064928
38011	NC_014638	CCA	2	6	1869887	1869892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064928
38012	NC_014638	GT	3	6	1870012	1870017	0 %	50 %	50 %	0 %	311064928
38013	NC_014638	GTC	2	6	1870031	1870036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064928
38014	NC_014638	CGA	2	6	1870066	1870071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064928
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38016	NC_014638	GGT	2	6	1870103	1870108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064928
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38018	NC_014638	GAT	2	6	1870163	1870168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064928
38019	NC_014638	GTC	2	6	1870169	1870174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064928
38020	NC_014638	CCG	2	6	1870200	1870205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064928
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38025	NC_014638	CTCGA	2	10	1870380	1870389	20 %	20 %	20 %	40 %	311064928
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38035	NC_014638	GTGCA	2	10	1870836	1870845	20 %	20 %	40 %	20 %	311064928
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38105	NC_014638	CGT	2	6	1874629	1874634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064931
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38112	NC_014638	ACG	2	6	1875297	1875302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064932
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38114	NC_014638	GAT	2	6	1875467	1875472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064932
38115	NC_014638	CGT	3	9	1875526	1875534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064932
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38229	NC_014638	ACG	2	6	1881498	1881503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064933
38230	NC_014638	ACG	2	6	1881601	1881606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064933
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38320	NC_014638	GAT	3	9	1886283	1886291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064938
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38324	NC_014638	GGGC	2	8	1886358	1886365	0 %	0 %	75 %	25 %	311064938
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38328	NC_014638	CG	3	6	1886500	1886505	0 %	0 %	50 %	50 %	311064938
38329	NC_014638	GCA	2	6	1886549	1886554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38330	NC_014638	GCT	2	6	1886573	1886578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38331	NC_014638	GAC	2	6	1886652	1886657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
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38333	NC_014638	AGC	2	6	1886671	1886676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38334	NC_014638	GCC	2	6	1886718	1886723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064938
38335	NC_014638	CGA	2	6	1886759	1886764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
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38337	NC_014638	CAG	2	6	1886793	1886798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38338	NC_014638	TTG	2	6	1886818	1886823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064938
38339	NC_014638	GAT	2	6	1886916	1886921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064938
38340	NC_014638	GCA	2	6	1886927	1886932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38341	NC_014638	CGC	2	6	1886933	1886938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064938
38342	NC_014638	CCG	2	6	1886944	1886949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064938
38343	NC_014638	GCC	2	6	1886964	1886969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064938
38344	NC_014638	GAC	2	6	1886970	1886975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38345	NC_014638	TGT	2	6	1886984	1886989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064938
38346	NC_014638	GTC	2	6	1887034	1887039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38347	NC_014638	GAT	2	6	1887069	1887074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064938
38348	NC_014638	CTTGCG	2	12	1887111	1887122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064938
38349	NC_014638	TGCG	2	8	1887188	1887195	0 %	25 %	50 %	25 %	311064938
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38353	NC_014638	CGC	2	6	1887398	1887403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064939
38354	NC_014638	GCA	2	6	1887427	1887432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064939
38355	NC_014638	GCA	2	6	1887547	1887552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064939
38356	NC_014638	ATC	2	6	1887564	1887569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064939
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38408	NC_014638	GC	3	6	1890097	1890102	0 %	0 %	50 %	50 %	311064941
38409	NC_014638	AGC	2	6	1890104	1890109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064941
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38412	NC_014638	GCCGT	2	10	1890245	1890254	0 %	20 %	40 %	40 %	311064941
38413	NC_014638	GCA	2	6	1890264	1890269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064941
38414	NC_014638	AGC	2	6	1890278	1890283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064941
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38423	NC_014638	CCGC	2	8	1890650	1890657	0 %	0 %	25 %	75 %	311064942
38424	NC_014638	CGTCAT	2	12	1890662	1890673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	311064942
38425	NC_014638	CG	3	6	1890725	1890730	0 %	0 %	50 %	50 %	311064942
38426	NC_014638	CCG	2	6	1890748	1890753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064942
38427	NC_014638	GGCCA	2	10	1890780	1890789	20 %	0 %	40 %	40 %	311064942
38428	NC_014638	GCC	2	6	1890798	1890803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064942
38429	NC_014638	GATGCC	2	12	1890873	1890884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38430	NC_014638	CGT	2	6	1890948	1890953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38431	NC_014638	CGA	2	6	1890983	1890988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38432	NC_014638	TTC	2	6	1890991	1890996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064942
38433	NC_014638	ATG	2	6	1891027	1891032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064942
38434	NC_014638	TCG	2	6	1891051	1891056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38435	NC_014638	CGG	2	6	1891061	1891066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064942
38436	NC_014638	CGC	2	6	1891091	1891096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064942
38437	NC_014638	CG	3	6	1891158	1891163	0 %	0 %	50 %	50 %	311064942
38438	NC_014638	CAC	2	6	1891164	1891169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064942
38439	NC_014638	TGCGC	2	10	1891184	1891193	0 %	20 %	40 %	40 %	311064942
38440	NC_014638	GC	4	8	1891217	1891224	0 %	0 %	50 %	50 %	311064942
38441	NC_014638	CG	3	6	1891261	1891266	0 %	0 %	50 %	50 %	311064942
38442	NC_014638	CGGC	2	8	1891282	1891289	0 %	0 %	50 %	50 %	311064942
38443	NC_014638	CCG	2	6	1891316	1891321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064942
38444	NC_014638	AGC	2	6	1891342	1891347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38445	NC_014638	GCT	2	6	1891424	1891429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38446	NC_014638	CGT	2	6	1891436	1891441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064942
38447	NC_014638	TGA	2	6	1891442	1891447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064942
38448	NC_014638	CGG	2	6	1891520	1891525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064942
38449	NC_014638	CGAG	2	8	1891568	1891575	25 %	0 %	50 %	25 %	311064942
38450	NC_014638	CCA	2	6	1891610	1891615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064942
38451	NC_014638	CTC	2	6	1892201	1892206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064943
38452	NC_014638	GC	3	6	1892233	1892238	0 %	0 %	50 %	50 %	311064943
38453	NC_014638	GCG	2	6	1892268	1892273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064943
38454	NC_014638	CGA	2	6	1892356	1892361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064943
38455	NC_014638	AGT	2	6	1892362	1892367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064943
38456	NC_014638	GAT	2	6	1892378	1892383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064943
38457	NC_014638	GAT	2	6	1892387	1892392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064943
38458	NC_014638	CAG	2	6	1892435	1892440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064943
38459	NC_014638	GTC	2	6	1892444	1892449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064943
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38481	NC_014638	GTGG	2	8	1893157	1893164	0 %	25 %	75 %	0 %	311064944
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38485	NC_014638	CG	3	6	1893187	1893192	0 %	0 %	50 %	50 %	311064944
38486	NC_014638	CGT	2	6	1893195	1893200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064944
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38490	NC_014638	TGC	3	9	1893335	1893343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064944
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