MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_014638	TGG	2	6	1522835	1522840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064659
31003	NC_014638	GGGT	2	8	1522912	1522919	0 %	25 %	75 %	0 %	311064659
31004	NC_014638	TCG	2	6	1522987	1522992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31005	NC_014638	TCG	2	6	1523200	1523205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31006	NC_014638	CGT	2	6	1523219	1523224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31007	NC_014638	CAG	2	6	1523226	1523231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31008	NC_014638	CGG	2	6	1523267	1523272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064659
31009	NC_014638	CGT	2	6	1523315	1523320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31010	NC_014638	CGA	2	6	1523351	1523356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31011	NC_014638	ACG	2	6	1523395	1523400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31012	NC_014638	TTG	2	6	1523473	1523478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064659
31013	NC_014638	CCTT	2	8	1523548	1523555	0 %	50 %	0 %	50 %	311064659
31014	NC_014638	GACGGC	2	12	1523565	1523576	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	311064659
31015	NC_014638	GAT	2	6	1523640	1523645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064659
31016	NC_014638	GGT	2	6	1523697	1523702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064659
31017	NC_014638	GGC	2	6	1523703	1523708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064659
31018	NC_014638	GCTCCT	2	12	1523729	1523740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	311064659
31019	NC_014638	TCG	2	6	1523756	1523761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31020	NC_014638	CGT	2	6	1523768	1523773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064659
31021	NC_014638	AGA	2	6	1523807	1523812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311064659
31022	NC_014638	GGT	4	12	1523823	1523834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064659
31023	NC_014638	TG	3	6	1523849	1523854	0 %	50 %	50 %	0 %	311064659
31024	NC_014638	ATG	2	6	1523857	1523862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064659
31025	NC_014638	TTG	2	6	1523962	1523967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064660
31026	NC_014638	TCT	2	6	1524065	1524070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064660
31027	NC_014638	CAGC	2	8	1524096	1524103	25 %	0 %	25 %	50 %	311064660
31028	NC_014638	GCGG	2	8	1524123	1524130	0 %	0 %	75 %	25 %	311064660
31029	NC_014638	CGG	2	6	1524172	1524177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064660
31030	NC_014638	GACG	2	8	1524193	1524200	25 %	0 %	50 %	25 %	311064660
31031	NC_014638	TGT	2	6	1524203	1524208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064660
31032	NC_014638	GGTC	2	8	1524242	1524249	0 %	25 %	50 %	25 %	311064660
31033	NC_014638	CTT	2	6	1524300	1524305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064660
31034	NC_014638	TTG	2	6	1524322	1524327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064660
31035	NC_014638	ACG	2	6	1524340	1524345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064660
31036	NC_014638	GATCG	2	10	1524357	1524366	20 %	20 %	40 %	20 %	311064660
31037	NC_014638	GCA	2	6	1524368	1524373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064660
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31039	NC_014638	CTT	2	6	1524422	1524427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064661
31040	NC_014638	GC	3	6	1524481	1524486	0 %	0 %	50 %	50 %	311064661
31041	NC_014638	CACG	2	8	1524487	1524494	25 %	0 %	25 %	50 %	311064661
31042	NC_014638	GCC	2	6	1524530	1524535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064661
31043	NC_014638	GCACGA	2	12	1524538	1524549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064661
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31045	NC_014638	GTG	3	9	1524663	1524671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064661
31046	NC_014638	CGC	2	6	1524688	1524693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064661
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31048	NC_014638	TAG	2	6	1524775	1524780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064661
31049	NC_014638	ATT	2	6	1526020	1526025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311064662
31050	NC_014638	CG	3	6	1526060	1526065	0 %	0 %	50 %	50 %	311064662
31051	NC_014638	CCGACG	2	12	1526152	1526163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311064662
31052	NC_014638	TCG	2	6	1526173	1526178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064662
31053	NC_014638	ACCA	2	8	1526190	1526197	50 %	0 %	0 %	50 %	311064662
31054	NC_014638	GCTC	2	8	1526216	1526223	0 %	25 %	25 %	50 %	311064662
31055	NC_014638	CGT	2	6	1526234	1526239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064662
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31057	NC_014638	CGA	2	6	1526351	1526356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064662
31058	NC_014638	CGA	2	6	1526378	1526383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064662
31059	NC_014638	CCG	3	9	1526545	1526553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064662
31060	NC_014638	GC	3	6	1526623	1526628	0 %	0 %	50 %	50 %	311064662
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31063	NC_014638	AC	3	6	1526836	1526841	50 %	0 %	0 %	50 %	311064662
31064	NC_014638	CGA	2	6	1526857	1526862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064662
31065	NC_014638	CGA	2	6	1526983	1526988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064662
31066	NC_014638	CGA	2	6	1526990	1526995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064662
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31082	NC_014638	CG	3	6	1527880	1527885	0 %	0 %	50 %	50 %	311064663
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31097	NC_014638	CCCGGA	2	12	1528776	1528787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311064664
31098	NC_014638	CGA	2	6	1529167	1529172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064664
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31100	NC_014638	TCT	2	6	1529305	1529310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064664
31101	NC_014638	GAC	2	6	1529315	1529320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31102	NC_014638	ATC	2	6	1529331	1529336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064664
31103	NC_014638	CGT	2	6	1529434	1529439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064664
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31105	NC_014638	TGC	2	6	1529647	1529652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31106	NC_014638	GACGT	2	10	1529658	1529667	20 %	20 %	40 %	20 %	311064664
31107	NC_014638	CTG	2	6	1529723	1529728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31108	NC_014638	CGA	2	6	1529806	1529811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31109	NC_014638	TCG	2	6	1529830	1529835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31110	NC_014638	ACCG	2	8	1529882	1529889	25 %	0 %	25 %	50 %	311064664
31111	NC_014638	CGC	2	6	1529914	1529919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064664
31112	NC_014638	CGGCAT	2	12	1530067	1530078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311064664
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31114	NC_014638	AGT	2	6	1530127	1530132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064664
31115	NC_014638	TGG	2	6	1530178	1530183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064664
31116	NC_014638	GAC	2	6	1530186	1530191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31117	NC_014638	CGG	2	6	1530229	1530234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064664
31118	NC_014638	GAC	2	6	1530284	1530289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064664
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31121	NC_014638	TGC	2	6	1530418	1530423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064664
31122	NC_014638	TCG	2	6	1530465	1530470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064664
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31218	NC_014638	CG	3	6	1534849	1534854	0 %	0 %	50 %	50 %	311064666
31219	NC_014638	GCT	3	9	1534866	1534874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064666
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31223	NC_014638	GAG	2	6	1534996	1535001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064666
31224	NC_014638	GAG	2	6	1535005	1535010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064666
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31227	NC_014638	CCTG	2	8	1535478	1535485	0 %	25 %	25 %	50 %	311064667
31228	NC_014638	GCGAC	2	10	1535492	1535501	20 %	0 %	40 %	40 %	311064667
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31342	NC_014638	GAGC	2	8	1541194	1541201	25 %	0 %	50 %	25 %	311064670
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31459	NC_014638	CAC	2	6	1547715	1547720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064676
31460	NC_014638	CGC	2	6	1547742	1547747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064676
31461	NC_014638	TCA	2	6	1547750	1547755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064676
31462	NC_014638	GCA	2	6	1547763	1547768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064676
31463	NC_014638	TCG	2	6	1547789	1547794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064676
31464	NC_014638	TCG	2	6	1547822	1547827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064676
31465	NC_014638	CGC	2	6	1547835	1547840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064676
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31470	NC_014638	CGC	2	6	1548030	1548035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064676
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31475	NC_014638	GC	3	6	1548231	1548236	0 %	0 %	50 %	50 %	311064676
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31484	NC_014638	TCA	2	6	1548611	1548616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064676
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31488	NC_014638	CCT	2	6	1548704	1548709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064676
31489	NC_014638	TCC	2	6	1548719	1548724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064676
31490	NC_014638	ACC	2	6	1548733	1548738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064676
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31492	NC_014638	GCCG	2	8	1549063	1549070	0 %	0 %	50 %	50 %	311064677
31493	NC_014638	TCA	2	6	1549101	1549106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064677
31494	NC_014638	GCT	2	6	1549107	1549112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064677
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