MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014638	GCC	2	6	113588	113593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063547
2003	NC_014638	GCT	2	6	113619	113624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063547
2004	NC_014638	GCT	2	6	113661	113666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063547
2005	NC_014638	CTG	3	9	113671	113679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063547
2006	NC_014638	GCAA	2	8	113725	113732	50 %	0 %	25 %	25 %	311063547
2007	NC_014638	TGG	3	9	113893	113901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063548
2008	NC_014638	TTCG	2	8	113912	113919	0 %	50 %	25 %	25 %	311063548
2009	NC_014638	ACG	2	6	113977	113982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063548
2010	NC_014638	CGG	2	6	114055	114060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063548
2011	NC_014638	GT	3	6	114121	114126	0 %	50 %	50 %	0 %	311063548
2012	NC_014638	CAT	2	6	114185	114190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063548
2013	NC_014638	TCG	2	6	114208	114213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063548
2014	NC_014638	GAT	2	6	114222	114227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063548
2015	NC_014638	TGA	2	6	114305	114310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063548
2016	NC_014638	TGA	2	6	114409	114414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063548
2017	NC_014638	GCT	2	6	114431	114436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063548
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2023	NC_014638	TGC	2	6	114824	114829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063549
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2025	NC_014638	CAT	2	6	114878	114883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063549
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2033	NC_014638	TGG	2	6	115274	115279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063549
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2063	NC_014638	TCACG	2	10	116465	116474	20 %	20 %	20 %	40 %	311063549
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2106	NC_014638	CG	3	6	118617	118622	0 %	0 %	50 %	50 %	311063551
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2118	NC_014638	GAA	2	6	118971	118976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063551
2119	NC_014638	CGT	2	6	119033	119038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063551
2120	NC_014638	TTGCG	2	10	119123	119132	0 %	40 %	40 %	20 %	311063551
2121	NC_014638	TGA	2	6	119168	119173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063551
2122	NC_014638	GTG	2	6	119176	119181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063551
2123	NC_014638	CGG	2	6	119213	119218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063551
2124	NC_014638	GAT	2	6	119261	119266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063552
2125	NC_014638	GTT	2	6	119279	119284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063552
2126	NC_014638	CGC	3	9	119285	119293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2127	NC_014638	GCA	2	6	119380	119385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
2128	NC_014638	GT	3	6	119419	119424	0 %	50 %	50 %	0 %	311063552
2129	NC_014638	CGC	2	6	119441	119446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2130	NC_014638	GAT	2	6	119453	119458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063552
2131	NC_014638	CAG	2	6	119462	119467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
2132	NC_014638	GCC	2	6	119501	119506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2133	NC_014638	GGC	2	6	119507	119512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063552
2134	NC_014638	GCC	2	6	119558	119563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2135	NC_014638	CAG	2	6	119612	119617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
2136	NC_014638	TGA	2	6	119650	119655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063552
2137	NC_014638	GAT	2	6	119666	119671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063552
2138	NC_014638	CAG	2	6	119672	119677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
2139	NC_014638	CTC	2	6	119717	119722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063552
2140	NC_014638	CCGA	2	8	119724	119731	25 %	0 %	25 %	50 %	311063552
2141	NC_014638	GCCGGT	2	12	119789	119800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311063552
2142	NC_014638	GCC	2	6	119804	119809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2143	NC_014638	GCC	2	6	119849	119854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2144	NC_014638	TCG	2	6	119871	119876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063552
2145	NC_014638	CGA	2	6	120013	120018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
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2147	NC_014638	ATG	2	6	120060	120065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063552
2148	NC_014638	ATG	2	6	120093	120098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063552
2149	NC_014638	CTT	2	6	120143	120148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063552
2150	NC_014638	GGT	2	6	120172	120177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063552
2151	NC_014638	GGC	2	6	120188	120193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063552
2152	NC_014638	GAA	3	9	120194	120202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063552
2153	NC_014638	CGG	2	6	120226	120231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063552
2154	NC_014638	CCG	2	6	120246	120251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063552
2155	NC_014638	CAG	3	9	120311	120319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
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2157	NC_014638	CA	3	6	120397	120402	50 %	0 %	0 %	50 %	311063552
2158	NC_014638	CCGA	2	8	120441	120448	25 %	0 %	25 %	50 %	311063552
2159	NC_014638	GC	3	6	120470	120475	0 %	0 %	50 %	50 %	311063552
2160	NC_014638	ATC	2	6	120477	120482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063552
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2162	NC_014638	CTGG	2	8	120527	120534	0 %	25 %	50 %	25 %	311063552
2163	NC_014638	GCA	3	9	120550	120558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
2164	NC_014638	GC	3	6	120580	120585	0 %	0 %	50 %	50 %	311063552
2165	NC_014638	CAG	2	6	120596	120601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
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2167	NC_014638	CAG	3	9	120683	120691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063552
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2170	NC_014638	GCT	2	6	120808	120813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063553
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2172	NC_014638	GAC	2	6	120902	120907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063553
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2179	NC_014638	TCG	2	6	121322	121327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063553
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2181	NC_014638	GGCT	2	8	121448	121455	0 %	25 %	50 %	25 %	311063553
2182	NC_014638	GCG	3	9	121466	121474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063553
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2184	NC_014638	CGC	2	6	121567	121572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063553
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2186	NC_014638	TGC	2	6	121665	121670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063553
2187	NC_014638	GCT	2	6	121695	121700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063553
2188	NC_014638	TCC	2	6	121709	121714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063553
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2190	NC_014638	TCC	2	6	121754	121759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063553
2191	NC_014638	CGC	2	6	121764	121769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063553
2192	NC_014638	CGGT	2	8	121796	121803	0 %	25 %	50 %	25 %	311063553
2193	NC_014638	GGC	2	6	121810	121815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063553
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2196	NC_014638	GCA	2	6	121983	121988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063553
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2203	NC_014638	CAT	2	6	122137	122142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063553
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2209	NC_014638	TA	3	6	122529	122534	50 %	50 %	0 %	0 %	311063554
2210	NC_014638	GAG	2	6	122549	122554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063554
2211	NC_014638	TCG	3	9	122561	122569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063554
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2219	NC_014638	GCCGG	2	10	122738	122747	0 %	0 %	60 %	40 %	311063554
2220	NC_014638	CG	3	6	122776	122781	0 %	0 %	50 %	50 %	311063554
2221	NC_014638	CGG	2	6	122789	122794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063554
2222	NC_014638	CAG	2	6	122875	122880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063554
2223	NC_014638	GATGGT	2	12	123001	123012	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	311063555
2224	NC_014638	CAG	2	6	123022	123027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063555
2225	NC_014638	CGGC	2	8	123033	123040	0 %	0 %	50 %	50 %	311063555
2226	NC_014638	ACGT	2	8	123056	123063	25 %	25 %	25 %	25 %	311063555
2227	NC_014638	CG	4	8	123084	123091	0 %	0 %	50 %	50 %	311063555
2228	NC_014638	GGTCA	2	10	123106	123115	20 %	20 %	40 %	20 %	311063555
2229	NC_014638	TCG	2	6	123146	123151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063555
2230	NC_014638	GGT	3	9	123256	123264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063555
2231	NC_014638	TCC	2	6	123332	123337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063555
2232	NC_014638	CGA	2	6	123360	123365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063555
2233	NC_014638	TTCG	2	8	123484	123491	0 %	50 %	25 %	25 %	311063555
2234	NC_014638	GAC	2	6	123905	123910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063556
2235	NC_014638	ATG	2	6	123916	123921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063556
2236	NC_014638	GCG	2	6	123970	123975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063556
2237	NC_014638	CCGCGA	2	12	123985	123996	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311063556
2238	NC_014638	CG	3	6	124011	124016	0 %	0 %	50 %	50 %	311063556
2239	NC_014638	CA	3	6	124088	124093	50 %	0 %	0 %	50 %	311063556
2240	NC_014638	TGC	2	6	124102	124107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063556
2241	NC_014638	TGC	2	6	124123	124128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063556
2242	NC_014638	TGA	2	6	124139	124144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063556
2243	NC_014638	TGCC	2	8	124153	124160	0 %	25 %	25 %	50 %	311063556
2244	NC_014638	GAG	2	6	124161	124166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063556
2245	NC_014638	GC	3	6	124181	124186	0 %	0 %	50 %	50 %	311063556
2246	NC_014638	GGC	2	6	124194	124199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063556
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2340	NC_014638	ACC	2	6	128024	128029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063557
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2342	NC_014638	GCG	2	6	128076	128081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063557
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2348	NC_014638	TCGT	2	8	128480	128487	0 %	50 %	25 %	25 %	311063557
2349	NC_014638	ACATCA	2	12	128490	128501	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	311063557
2350	NC_014638	GAT	2	6	128602	128607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063557
2351	NC_014638	CTT	2	6	128614	128619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063557
2352	NC_014638	TGC	2	6	128715	128720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063557
2353	NC_014638	CTGAAC	2	12	128780	128791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	311063557
2354	NC_014638	CGG	2	6	128804	128809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063557
2355	NC_014638	TGA	3	9	128826	128834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063557
2356	NC_014638	CCG	2	6	128923	128928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063557
2357	NC_014638	CG	3	6	128930	128935	0 %	0 %	50 %	50 %	311063557
2358	NC_014638	TTC	2	6	128942	128947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063557
2359	NC_014638	CTG	2	6	128984	128989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063557
2360	NC_014638	TGC	2	6	128994	128999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063557
2361	NC_014638	CTG	2	6	129017	129022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063557
2362	NC_014638	GAC	2	6	129052	129057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063557
2363	NC_014638	ATC	3	9	129074	129082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063557
2364	NC_014638	CG	3	6	129124	129129	0 %	0 %	50 %	50 %	311063557
2365	NC_014638	TGC	2	6	129177	129182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063557
2366	NC_014638	CGC	2	6	129228	129233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063557
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2368	NC_014638	GAC	2	6	129266	129271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063557
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2370	NC_014638	GCC	2	6	129308	129313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063557
2371	NC_014638	GGC	2	6	129398	129403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063557
2372	NC_014638	GAG	2	6	129416	129421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063557
2373	NC_014638	ACC	2	6	129434	129439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063557
2374	NC_014638	CCGC	2	8	129449	129456	0 %	0 %	25 %	75 %	311063557
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2378	NC_014638	GCCAC	2	10	129533	129542	20 %	0 %	20 %	60 %	311063558
2379	NC_014638	ATC	2	6	129559	129564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063558
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2382	NC_014638	CGC	2	6	129615	129620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063558
2383	NC_014638	CGT	2	6	129729	129734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
2384	NC_014638	GC	3	6	129744	129749	0 %	0 %	50 %	50 %	311063558
2385	NC_014638	TCG	2	6	129773	129778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
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2390	NC_014638	TAC	2	6	129904	129909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063558
2391	NC_014638	CGC	2	6	129935	129940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063558
2392	NC_014638	CTG	2	6	130036	130041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
2393	NC_014638	TCG	2	6	130099	130104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
2394	NC_014638	TCG	2	6	130108	130113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
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2399	NC_014638	AAAG	2	8	130233	130240	75 %	0 %	25 %	0 %	311063558
2400	NC_014638	CGGC	2	8	130256	130263	0 %	0 %	50 %	50 %	311063558
2401	NC_014638	CGA	2	6	130298	130303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063558
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2423	NC_014638	TC	3	6	130965	130970	0 %	50 %	0 %	50 %	311063558
2424	NC_014638	GCT	2	6	131007	131012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
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2431	NC_014638	CGGA	2	8	131235	131242	25 %	0 %	50 %	25 %	311063558
2432	NC_014638	TGC	2	6	131270	131275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
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2434	NC_014638	GGCT	2	8	131458	131465	0 %	25 %	50 %	25 %	311063558
2435	NC_014638	GC	3	6	131468	131473	0 %	0 %	50 %	50 %	311063558
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2442	NC_014638	CGATG	2	10	131649	131658	20 %	20 %	40 %	20 %	311063558
2443	NC_014638	GCT	2	6	131736	131741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063558
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2453	NC_014638	ACG	2	6	132136	132141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063559
2454	NC_014638	GCC	3	9	132174	132182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063559
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2463	NC_014638	GCC	2	6	132573	132578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063559
2464	NC_014638	GCGA	2	8	132666	132673	25 %	0 %	50 %	25 %	311063559
2465	NC_014638	CAG	2	6	132696	132701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063559
2466	NC_014638	CGA	2	6	132707	132712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063559
2467	NC_014638	CGTGC	2	10	132774	132783	0 %	20 %	40 %	40 %	311063559
2468	NC_014638	TGC	2	6	132820	132825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063559
2469	NC_014638	AGG	2	6	132883	132888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063559
2470	NC_014638	CTT	2	6	132998	133003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063559
2471	NC_014638	GCCG	2	8	133108	133115	0 %	0 %	50 %	50 %	311063560
2472	NC_014638	CAT	2	6	133137	133142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063560
2473	NC_014638	TGC	2	6	133164	133169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063560
2474	NC_014638	GTGCTG	2	12	133178	133189	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	311063560
2475	NC_014638	TGCG	2	8	133274	133281	0 %	25 %	50 %	25 %	311063560
2476	NC_014638	CGGC	2	8	133290	133297	0 %	0 %	50 %	50 %	311063560
2477	NC_014638	GTT	2	6	133300	133305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063560
2478	NC_014638	GGTGC	2	10	133346	133355	0 %	20 %	60 %	20 %	311063560
2479	NC_014638	CGAC	2	8	133357	133364	25 %	0 %	25 %	50 %	311063560
2480	NC_014638	TGC	2	6	133377	133382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063560
2481	NC_014638	CGC	2	6	133387	133392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063560
2482	NC_014638	CTG	2	6	133484	133489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063560
2483	NC_014638	TG	3	6	133504	133509	0 %	50 %	50 %	0 %	311063560
2484	NC_014638	GGCGT	2	10	133550	133559	0 %	20 %	60 %	20 %	311063560
2485	NC_014638	GGA	2	6	133592	133597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063560
2486	NC_014638	CGG	2	6	133662	133667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063560
2487	NC_014638	CAT	2	6	133726	133731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063560
2488	NC_014638	GC	3	6	133782	133787	0 %	0 %	50 %	50 %	311063560
2489	NC_014638	TGC	2	6	133809	133814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063560
2490	NC_014638	CGC	2	6	133927	133932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063560
2491	NC_014638	CCG	2	6	133941	133946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063560
2492	NC_014638	CGGTG	2	10	133957	133966	0 %	20 %	60 %	20 %	311063560
2493	NC_014638	TCG	2	6	133983	133988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063560
2494	NC_014638	TGA	2	6	133995	134000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063560
2495	NC_014638	CATG	2	8	134292	134299	25 %	25 %	25 %	25 %	311063561
2496	NC_014638	TGT	2	6	134382	134387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063561
2497	NC_014638	GGC	2	6	134410	134415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063561
2498	NC_014638	GCG	2	6	134494	134499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063561
2499	NC_014638	TCG	3	9	134507	134515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063561
2500	NC_014638	CAT	2	6	134517	134522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063561

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