MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014638	ACG	2	6	934264	934269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064149
19002	NC_014638	GTG	2	6	934275	934280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064149
19003	NC_014638	GCCGT	2	10	934353	934362	0 %	20 %	40 %	40 %	311064149
19004	NC_014638	CGC	2	6	934400	934405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064149
19005	NC_014638	GACGGC	2	12	934411	934422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	311064149
19006	NC_014638	GTC	2	6	934487	934492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19007	NC_014638	TCG	2	6	934554	934559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19008	NC_014638	CGC	2	6	934594	934599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064150
19009	NC_014638	CCA	2	6	934605	934610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064150
19010	NC_014638	CGA	2	6	934621	934626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19011	NC_014638	CTG	2	6	934649	934654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19012	NC_014638	GCT	2	6	934669	934674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19013	NC_014638	GTTCC	2	10	934675	934684	0 %	40 %	20 %	40 %	311064150
19014	NC_014638	TCG	2	6	934722	934727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19015	NC_014638	TGGG	2	8	934757	934764	0 %	25 %	75 %	0 %	311064150
19016	NC_014638	CGA	2	6	934855	934860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19017	NC_014638	CTG	2	6	934901	934906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19018	NC_014638	GAG	2	6	934907	934912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064150
19019	NC_014638	GCG	2	6	935008	935013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064150
19020	NC_014638	TGC	2	6	935022	935027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19021	NC_014638	CGA	2	6	935050	935055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19022	NC_014638	CAT	2	6	935102	935107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064150
19023	NC_014638	GCT	2	6	935149	935154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19024	NC_014638	CG	3	6	935157	935162	0 %	0 %	50 %	50 %	311064150
19025	NC_014638	GCC	2	6	935168	935173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064150
19026	NC_014638	CGC	2	6	935235	935240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064150
19027	NC_014638	GAC	2	6	935279	935284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064150
19028	NC_014638	CGC	2	6	935287	935292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064150
19029	NC_014638	CGGG	2	8	935299	935306	0 %	0 %	75 %	25 %	311064150
19030	NC_014638	CAC	2	6	935326	935331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064150
19031	NC_014638	TCA	2	6	935435	935440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064151
19032	NC_014638	CCG	3	9	935492	935500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064151
19033	NC_014638	GCT	2	6	935529	935534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064151
19034	NC_014638	CGT	2	6	935583	935588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064151
19035	NC_014638	GGA	2	6	935631	935636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064151
19036	NC_014638	GCCG	2	8	935652	935659	0 %	0 %	50 %	50 %	311064151
19037	NC_014638	CGT	2	6	935712	935717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064151
19038	NC_014638	CTG	2	6	935752	935757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064151
19039	NC_014638	CGG	2	6	935804	935809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064151
19040	NC_014638	GGC	2	6	935841	935846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064151
19041	NC_014638	GAG	2	6	935863	935868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064151
19042	NC_014638	GTG	2	6	935875	935880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064151
19043	NC_014638	CAT	2	6	935961	935966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064151
19044	NC_014638	CGA	2	6	936015	936020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064151
19045	NC_014638	A	7	7	936127	936133	100 %	0 %	0 %	0 %	311064151
19046	NC_014638	CAA	2	6	936134	936139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311064151
19047	NC_014638	AAAC	2	8	936152	936159	75 %	0 %	0 %	25 %	311064151
19048	NC_014638	CTG	2	6	936165	936170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064151
19049	NC_014638	ATA	2	6	936223	936228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311064152
19050	NC_014638	GCA	2	6	936236	936241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19051	NC_014638	ACG	2	6	936280	936285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19052	NC_014638	CGA	2	6	936347	936352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19053	NC_014638	GAC	2	6	936354	936359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19054	NC_014638	GCT	3	9	936503	936511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19055	NC_014638	CGA	2	6	936551	936556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19056	NC_014638	GTC	2	6	936639	936644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19057	NC_014638	CAA	2	6	936740	936745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311064152
19058	NC_014638	GCC	2	6	936752	936757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064152
19059	NC_014638	CATC	2	8	936848	936855	25 %	25 %	0 %	50 %	311064152
19060	NC_014638	ACT	2	6	936898	936903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064152
19061	NC_014638	ACA	2	6	936910	936915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311064152
19062	NC_014638	TTC	2	6	936924	936929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064152
19063	NC_014638	GCG	2	6	936964	936969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064152
19064	NC_014638	ACC	2	6	937006	937011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064152
19065	NC_014638	ATC	2	6	937026	937031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064152
19066	NC_014638	CCG	2	6	937054	937059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064152
19067	NC_014638	ACC	2	6	937155	937160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064152
19068	NC_014638	GCT	2	6	937175	937180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
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19070	NC_014638	GCC	2	6	937272	937277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064152
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19072	NC_014638	TTC	2	6	937320	937325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064152
19073	NC_014638	TCG	2	6	937330	937335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
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19075	NC_014638	TGCG	2	8	937458	937465	0 %	25 %	50 %	25 %	311064152
19076	NC_014638	TCA	2	6	937576	937581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064152
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19085	NC_014638	CAG	2	6	937827	937832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19086	NC_014638	CAA	3	9	937835	937843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311064152
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19088	NC_014638	CTG	2	6	937908	937913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19089	NC_014638	TGC	2	6	937957	937962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19090	NC_014638	CTT	2	6	937973	937978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064152
19091	NC_014638	CGA	2	6	938008	938013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064152
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19093	NC_014638	ACGC	2	8	938076	938083	25 %	0 %	25 %	50 %	311064152
19094	NC_014638	GAT	2	6	938090	938095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064152
19095	NC_014638	GACT	2	8	938126	938133	25 %	25 %	25 %	25 %	311064152
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19097	NC_014638	AAG	2	6	938229	938234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311064152
19098	NC_014638	GCT	2	6	938240	938245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
19099	NC_014638	GAGCT	2	10	938274	938283	20 %	20 %	40 %	20 %	311064152
19100	NC_014638	GC	3	6	938313	938318	0 %	0 %	50 %	50 %	311064152
19101	NC_014638	CTG	2	6	938325	938330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064152
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19105	NC_014638	GCG	2	6	938611	938616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064153
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19116	NC_014638	GTC	2	6	939162	939167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064153
19117	NC_014638	GGT	2	6	939168	939173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064153
19118	NC_014638	CGG	2	6	939179	939184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064153
19119	NC_014638	GAA	2	6	939204	939209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311064153
19120	NC_014638	GCA	2	6	939212	939217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064153
19121	NC_014638	TCA	2	6	939239	939244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064153
19122	NC_014638	CGA	2	6	939272	939277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064153
19123	NC_014638	CAT	2	6	939333	939338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064153
19124	NC_014638	GA	3	6	939370	939375	50 %	0 %	50 %	0 %	311064153
19125	NC_014638	CGC	2	6	939384	939389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064153
19126	NC_014638	CGA	2	6	939424	939429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064153
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19128	NC_014638	GCG	2	6	939502	939507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064153
19129	NC_014638	CGT	2	6	939541	939546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064153
19130	NC_014638	CAT	2	6	939591	939596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064153
19131	NC_014638	CGCT	2	8	939648	939655	0 %	25 %	25 %	50 %	311064153
19132	NC_014638	CGT	2	6	940376	940381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064154
19133	NC_014638	GAG	2	6	940432	940437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064154
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19135	NC_014638	TCC	2	6	940534	940539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064154
19136	NC_014638	GCCG	2	8	940542	940549	0 %	0 %	50 %	50 %	311064154
19137	NC_014638	GTC	2	6	940629	940634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064154
19138	NC_014638	CCAT	2	8	940645	940652	25 %	25 %	0 %	50 %	311064154
19139	NC_014638	TTC	2	6	940711	940716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064154
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19141	NC_014638	CGT	2	6	940745	940750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064154
19142	NC_014638	GC	3	6	940774	940779	0 %	0 %	50 %	50 %	311064154
19143	NC_014638	CAG	2	6	940860	940865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064154
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19145	NC_014638	GTC	3	9	940941	940949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064154
19146	NC_014638	GCC	2	6	941547	941552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064155
19147	NC_014638	AGT	2	6	941563	941568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064155
19148	NC_014638	GC	3	6	941585	941590	0 %	0 %	50 %	50 %	311064155
19149	NC_014638	CGA	2	6	941618	941623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064155
19150	NC_014638	GCC	2	6	941632	941637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064155
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19153	NC_014638	ATG	2	6	941767	941772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064155
19154	NC_014638	AGC	2	6	941827	941832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064155
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19165	NC_014638	CGGA	2	8	942290	942297	25 %	0 %	50 %	25 %	311064156
19166	NC_014638	CGAA	2	8	942311	942318	50 %	0 %	25 %	25 %	311064156
19167	NC_014638	ACGAT	2	10	942320	942329	40 %	20 %	20 %	20 %	311064156
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19169	NC_014638	GCA	2	6	942416	942421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064156
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19171	NC_014638	TGA	2	6	942512	942517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064156
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19174	NC_014638	CGGC	2	8	942795	942802	0 %	0 %	50 %	50 %	311064156
19175	NC_014638	ATG	2	6	942830	942835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064156
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19179	NC_014638	TGA	2	6	943041	943046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064156
19180	NC_014638	GTC	2	6	943102	943107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064156
19181	NC_014638	ACCTG	2	10	943110	943119	20 %	20 %	20 %	40 %	311064156
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19184	NC_014638	CTG	2	6	943213	943218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064156
19185	NC_014638	GC	4	8	943241	943248	0 %	0 %	50 %	50 %	311064156
19186	NC_014638	TCGC	2	8	943357	943364	0 %	25 %	25 %	50 %	311064156
19187	NC_014638	GGA	2	6	943494	943499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064156
19188	NC_014638	GGTGA	2	10	943540	943549	20 %	20 %	60 %	0 %	311064156
19189	NC_014638	CGC	2	6	943584	943589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064156
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19193	NC_014638	TCG	2	6	943892	943897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064157
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19220	NC_014638	CGA	2	6	944939	944944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064157
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19222	NC_014638	TGA	2	6	945354	945359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064158
19223	NC_014638	TTG	2	6	945401	945406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064158
19224	NC_014638	GCA	2	6	945414	945419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064158
19225	NC_014638	GGA	2	6	945442	945447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064158
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19227	NC_014638	CGT	2	6	945522	945527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064158
19228	NC_014638	TGG	2	6	945540	945545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064158
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19230	NC_014638	TGGA	2	8	945578	945585	25 %	25 %	50 %	0 %	311064158
19231	NC_014638	CGA	2	6	945588	945593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064158
19232	NC_014638	CGA	2	6	945639	945644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064158
19233	NC_014638	CGG	2	6	945732	945737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064158
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19235	NC_014638	TGA	2	6	945870	945875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064158
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19350	NC_014638	CCGGG	2	10	954166	954175	0 %	0 %	60 %	40 %	311064162
19351	NC_014638	CAGG	2	8	954202	954209	25 %	0 %	50 %	25 %	311064162
19352	NC_014638	GC	3	6	954228	954233	0 %	0 %	50 %	50 %	311064162
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19354	NC_014638	TGG	2	6	954309	954314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064162
19355	NC_014638	CGC	3	9	954337	954345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064162
19356	NC_014638	CGA	2	6	954352	954357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064162
19357	NC_014638	GAT	2	6	954470	954475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064162
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19359	NC_014638	GTC	2	6	954524	954529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064162
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19469	NC_014638	CAT	2	6	959626	959631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064164
19470	NC_014638	ATGC	2	8	959777	959784	25 %	25 %	25 %	25 %	311064165
19471	NC_014638	GGC	2	6	959787	959792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064165
19472	NC_014638	CTG	2	6	959797	959802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064165
19473	NC_014638	CTG	2	6	959836	959841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064165
19474	NC_014638	CGA	2	6	959850	959855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064165
19475	NC_014638	GCATC	2	10	959859	959868	20 %	20 %	20 %	40 %	311064165
19476	NC_014638	GGC	2	6	959874	959879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064165
19477	NC_014638	ATG	2	6	959899	959904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064165
19478	NC_014638	TCA	2	6	959924	959929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064165
19479	NC_014638	GAC	2	6	959944	959949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064165
19480	NC_014638	CG	3	6	959952	959957	0 %	0 %	50 %	50 %	311064165
19481	NC_014638	AGC	2	6	959962	959967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064165
19482	NC_014638	ACCG	2	8	959983	959990	25 %	0 %	25 %	50 %	311064165
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19492	NC_014638	GGC	2	6	960510	960515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064166
19493	NC_014638	CGA	2	6	960542	960547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064166
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19499	NC_014638	GCCG	2	8	960669	960676	0 %	0 %	50 %	50 %	311064166
19500	NC_014638	CAC	2	6	960714	960719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064166

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