MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014638	GGC	2	6	839547	839552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064079
17002	NC_014638	CGA	2	6	839574	839579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17003	NC_014638	GCT	2	6	839583	839588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17004	NC_014638	GCCC	2	8	839589	839596	0 %	0 %	25 %	75 %	311064079
17005	NC_014638	GCA	2	6	839637	839642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17006	NC_014638	CCT	2	6	839652	839657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064079
17007	NC_014638	TGC	2	6	839756	839761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17008	NC_014638	CG	3	6	839791	839796	0 %	0 %	50 %	50 %	311064079
17009	NC_014638	CGA	2	6	839836	839841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17010	NC_014638	GATC	2	8	839866	839873	25 %	25 %	25 %	25 %	311064079
17011	NC_014638	CGG	2	6	839874	839879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064079
17012	NC_014638	CAG	2	6	839899	839904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17013	NC_014638	CTC	2	6	840166	840171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064079
17014	NC_014638	CGC	2	6	840238	840243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064079
17015	NC_014638	AGC	2	6	840263	840268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17016	NC_014638	CCG	2	6	840269	840274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064079
17017	NC_014638	ATG	3	9	840313	840321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064079
17018	NC_014638	TCG	2	6	840336	840341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17019	NC_014638	GCA	2	6	840354	840359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17020	NC_014638	CG	3	6	840386	840391	0 %	0 %	50 %	50 %	311064079
17021	NC_014638	CGGT	2	8	840408	840415	0 %	25 %	50 %	25 %	311064079
17022	NC_014638	TCG	2	6	840416	840421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17023	NC_014638	GGCGAT	2	12	840457	840468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311064079
17024	NC_014638	GCT	3	9	840471	840479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17025	NC_014638	GCC	2	6	840481	840486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064079
17026	NC_014638	TCG	2	6	840545	840550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17027	NC_014638	GTC	2	6	840565	840570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17028	NC_014638	CAT	2	6	840606	840611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064079
17029	NC_014638	CGA	2	6	840615	840620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17030	NC_014638	TGG	2	6	840621	840626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064079
17031	NC_014638	TCC	2	6	840638	840643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064079
17032	NC_014638	ATGCC	2	10	840665	840674	20 %	20 %	20 %	40 %	311064079
17033	NC_014638	ATG	2	6	840727	840732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064079
17034	NC_014638	CAG	2	6	840736	840741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064079
17035	NC_014638	CGC	2	6	840750	840755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064079
17036	NC_014638	GCG	2	6	840764	840769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064079
17037	NC_014638	CCA	2	6	840819	840824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064079
17038	NC_014638	GCG	2	6	840920	840925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064079
17039	NC_014638	CAG	2	6	841119	841124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064080
17040	NC_014638	GCA	2	6	841193	841198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064080
17041	NC_014638	GAT	2	6	841209	841214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064080
17042	NC_014638	GCC	2	6	841216	841221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064080
17043	NC_014638	TGA	2	6	841256	841261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064080
17044	NC_014638	CAG	2	6	841293	841298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064080
17045	NC_014638	CGA	2	6	841304	841309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064080
17046	NC_014638	GCC	2	6	841360	841365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064080
17047	NC_014638	CCA	2	6	841385	841390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064080
17048	NC_014638	GGCCG	2	10	841467	841476	0 %	0 %	60 %	40 %	311064080
17049	NC_014638	TCGCCA	2	12	841574	841585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311064080
17050	NC_014638	GCG	2	6	841614	841619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064080
17051	NC_014638	CGA	2	6	841692	841697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064080
17052	NC_014638	ATG	2	6	842102	842107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064081
17053	NC_014638	CGG	2	6	842140	842145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064081
17054	NC_014638	GATCG	2	10	842242	842251	20 %	20 %	40 %	20 %	311064081
17055	NC_014638	TGC	2	6	842253	842258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064081
17056	NC_014638	AGC	2	6	842262	842267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064081
17057	NC_014638	GAG	2	6	842405	842410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064081
17058	NC_014638	GTC	2	6	842429	842434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064081
17059	NC_014638	GCC	2	6	842447	842452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064081
17060	NC_014638	CAG	2	6	842465	842470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064081
17061	NC_014638	AGG	2	6	842490	842495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064081
17062	NC_014638	GTC	2	6	842501	842506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064081
17063	NC_014638	GGC	2	6	842597	842602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064081
17064	NC_014638	TCC	2	6	842627	842632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064081
17065	NC_014638	AAG	2	6	842663	842668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311064081
17066	NC_014638	TAC	2	6	842690	842695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064081
17067	NC_014638	GGT	2	6	842738	842743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064081
17068	NC_014638	CATCGA	2	12	842779	842790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	311064081
17069	NC_014638	CAT	2	6	842830	842835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064081
17070	NC_014638	GCC	2	6	842840	842845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064081
17071	NC_014638	TAC	2	6	842846	842851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064081
17072	NC_014638	GCGT	2	8	842958	842965	0 %	25 %	50 %	25 %	311064082
17073	NC_014638	TTC	2	6	842968	842973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311064082
17074	NC_014638	GAGC	2	8	842986	842993	25 %	0 %	50 %	25 %	311064082
17075	NC_014638	CCG	2	6	843114	843119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064082
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17078	NC_014638	CTG	2	6	843233	843238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064082
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17080	NC_014638	CGCC	2	8	843340	843347	0 %	0 %	25 %	75 %	311064082
17081	NC_014638	GC	4	8	843418	843425	0 %	0 %	50 %	50 %	311064082
17082	NC_014638	TCA	2	6	843468	843473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064082
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17085	NC_014638	TCG	2	6	843525	843530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064082
17086	NC_014638	CAT	2	6	843556	843561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064082
17087	NC_014638	CGA	2	6	843565	843570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064082
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17089	NC_014638	GACG	2	8	843721	843728	25 %	0 %	50 %	25 %	311064082
17090	NC_014638	CGA	2	6	843763	843768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064082
17091	NC_014638	CAT	2	6	843787	843792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064082
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17094	NC_014638	CGT	2	6	843910	843915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064082
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17101	NC_014638	GCT	2	6	844075	844080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064082
17102	NC_014638	CGT	2	6	844114	844119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064082
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17107	NC_014638	TTG	2	6	844438	844443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311064083
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17111	NC_014638	TGAG	2	8	844577	844584	25 %	25 %	50 %	0 %	311064083
17112	NC_014638	CGA	2	6	844637	844642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064083
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17115	NC_014638	CGG	2	6	844744	844749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064083
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17117	NC_014638	CGG	2	6	844793	844798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064083
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17235	NC_014638	CTG	2	6	850610	850615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064085
17236	NC_014638	CGA	2	6	850627	850632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064085
17237	NC_014638	CGC	2	6	850645	850650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064085
17238	NC_014638	GCA	2	6	850681	850686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064085
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17241	NC_014638	ACGC	2	8	850819	850826	25 %	0 %	25 %	50 %	311064085
17242	NC_014638	CTG	2	6	850838	850843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064085
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17350	NC_014638	TCG	2	6	856387	856392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064088
17351	NC_014638	CCATG	2	10	856430	856439	20 %	20 %	20 %	40 %	311064088
17352	NC_014638	TCC	2	6	856485	856490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064088
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17472	NC_014638	TGC	2	6	862549	862554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064093
17473	NC_014638	CAC	2	6	862563	862568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064093
17474	NC_014638	TCG	2	6	862615	862620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064093
17475	NC_014638	CGG	2	6	862657	862662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064093
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17477	NC_014638	CGA	2	6	862712	862717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064093
17478	NC_014638	TCG	2	6	862741	862746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064093
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17480	NC_014638	ATC	2	6	862795	862800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064093
17481	NC_014638	CGA	2	6	862802	862807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064093
17482	NC_014638	TCG	2	6	862825	862830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064093
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17484	NC_014638	TG	3	6	862896	862901	0 %	50 %	50 %	0 %	311064093
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17490	NC_014638	TCG	2	6	863110	863115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064093
17491	NC_014638	TCGC	2	8	863142	863149	0 %	25 %	25 %	50 %	311064093
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17498	NC_014638	CA	3	6	863557	863562	50 %	0 %	0 %	50 %	311064093
17499	NC_014638	GAA	2	6	863594	863599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311064093
17500	NC_014638	CTG	2	6	863619	863624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064093

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